Legionella lytica: J2N86_05370
Help
Entry
J2N86_05370 CDS
T08304
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
lly
Legionella lytica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
HDA2-3
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USQ14734
UniProt:
A0ABY4YB56
LinkDB
All DBs
Position
1210234..1213500
Genome browser
AA seq
1088 aa
AA seq
DB search
MLNEALSKMPEAFEAKILLRGQEYFENGHVLNIRFSEGLLKGRVKGSSSQIYDVHMDLKA
WPGKRASCTCASQINCKHAAACLFALRAQTNPVSQPANKLDKRLDSWLKNLRAQEAAVVK
THESTHHLTYLLELRIDGYEHKVIVKLALAKLLKRGGYGKMIPFNSLAESKKQHFIGDDN
ELVAQLLFKCGVTGWFDSLSIRNSELLARILATGRAFFAHDHEHAIHMGEIYNGTCQWVL
AQNGSQNLLLMHDDEAVKPLLLDESWYFDYDEGVMGYLKTPYPIKQLGHLLEAPPISIEQ
APLLAKKMEQTCPEFPVPQVFTIQETRQVTPMPVLILDAVSEENEGPSWFDDEEELKVLF
IARVFFNYDQSRIAVNEDCETVVTQEDGILIHYQRDKKFEAEKLIELHQILKLRAPKGWE
RAQWDKTKQADFILENITRAADLEFLYSQAVPLLSHRGWQVDMISSLYQQVVSADDVEWF
SDLHEGSGTDFFSYQLGILVEGKPVSIVPLVAELIQHYKGGELDGLPDEQLVKLPLDDGR
ALQLEMGRIKPLVRLLLQFGLRHIDENQHLQINKYQLILMQEAELALAATKSRWQGAEML
RNELKRLVKLTDIPEVPIPQGLQAQLRDYQRQGLNWIQFLRTSSFSGILADDMGLGKTIQ
TLTHLLYEKEQGRTRTATLIIAPTSLVGNWEAEARRFTPALKVLVYHGSERHLDDFDDYD
LVISTYGLIHRDKEKFVSYPFYYLILDEAQFIKNARTKTTQIIQQLHAAHRLCLTGTPLE
NHLGELWSLFHFLMPGLLGDTKQFRLWFRNPIEKHADVHRREVLVNRVKPFILRRTKNQV
ARELPPKTEMTRTIEIVGPQRDLYEAIRMSMEKKVRDAIVKQGLGKSHIIILDALLKLRQ
ICCDPRLLSLPEATIAHGTSAKLETLMELLDNLVEEGRRVLVFSQFTSMLQLIEDELHAR
NYDYLKLTGQTQNRQALVERFQEGKTPVFLISLKAGGTGLNLTRADTVIHYDPWWNPAVE
DQATDRTHRIGQVNPVFVYKLITSGTVEEAILGMQERKRLLVDGILSADPAKAISLSEED
IEQFFAPL
NT seq
3267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaatgaagcactatcaaaaatgccagaagcgtttgaggccaaaatattattgcga
gggcaagaatattttgagaatggccatgtgctgaatattcgtttcagtgaggggctatta
aaaggacgcgttaaaggcagttccagccagatttacgatgtgcacatggatttaaaagct
tggcctggaaagcgtgcgagttgcacctgtgcctcacaaatcaactgcaaacatgctgct
gcctgtttattcgctttacgcgcccaaaccaaccctgtgtcacagcccgcaaataagcta
gataagcgcctagatagctggttaaaaaatctgcgcgctcaagaagctgcggtggttaag
acccatgagtctacccatcatttaacttatctacttgaacttagaattgatggttatgag
cataaggtaattgttaaactggccttagctaaattattaaaacggggtggttatggaaag
atgatcccctttaacagtcttgctgagtctaagaagcaacactttattggcgatgataat
gaattggtcgcgcaattactttttaaatgcggtgttacgggttggtttgattcattaagt
atccgtaacagtgaattattagcacgtattcttgctacgggcagggctttttttgctcat
gatcatgaacatgccattcatatgggtgaaatctataatggcacttgccagtgggttttg
gcacaaaatggcagccaaaatctattgttgatgcatgatgacgaagccgttaaacctttg
ttactagatgagagttggtattttgattatgacgaaggagttatggggtatctaaaaacc
ccatacccaataaaacagcttgggcatttattagaagctcctcctatttctattgagcaa
gctccattattggcgaaaaaaatggaacaaacttgccctgaattcccagtaccacaggtg
tttaccattcaagagacacgtcaagttactcctatgccggtactgattcttgatgcggta
agcgaagagaatgagggaccatcttggtttgatgatgaggaggagttgaaagtcttattt
attgcgcgcgtttttttcaattatgaccaatcaaggattgcggttaatgaagattgtgaa
acggtggtaacccaagaagatggcattttaattcactaccagcgtgataaaaagtttgaa
gcggaaaagctgatcgaattacatcagatccttaaattgagagcgcctaaaggttgggaa
agggcgcagtgggataaaaccaagcaagctgattttatattagaaaatattacccgagct
gcagacttagaatttctttacagccaagcagtacctttattaagtcatcggggctggcaa
gtagacatgataagctcattatatcagcaagtagttagcgctgatgatgtagaatggttt
tctgatttacatgaaggaagtggcacagacttcttttcctatcaattaggtatcttagta
gaaggcaagccagtcagtattgttccgttggttgctgagttaattcagcattacaaaggg
ggggagttggatggccttccggatgagcaattagttaaattacctttggatgatggacgg
gctttacagttagaaatggggcgtattaaacctttggtacgtttactgttgcaatttggt
ctacgtcatatagatgaaaatcaacatctacaaattaacaaataccagttgatattgatg
caggaagctgaattagcgcttgcagctacgaagtcacgttggcaaggtgctgaaatgtta
cgcaatgagttaaagcgccttgttaagctaactgatattcctgaagttccgattcctcaa
gggctgcaagcacagttaagagattatcaacgccaaggattaaattggatacagttcctg
cgtaccagtagttttagcggtattttagctgatgacatgggcttaggaaaaaccattcaa
accttgacgcacttgctttatgaaaaagagcaaggacgtacacgaactgccacattaatt
attgcgcccaccagtttggttggcaattgggaggcagaggcacggcgttttactcctgca
ttaaaagttttagtttatcatggcagtgaacgccatctggatgattttgatgattatgat
ttagttatttccacgtatggactcattcatcgagataaagaaaaatttgtgagttatccc
ttttattatcttattttggatgaggcacaatttattaaaaatgcacgtactaaaacaacg
cagatcattcagcaattgcacgcggcgcatcgtttatgtctcacgggtacacccctggaa
aatcatttaggggagttatggtcattattccactttttaatgcctggtttattgggtgat
accaaacaatttaggctgtggtttagaaatcctatagagaaacatgctgatgtgcatcga
cgtgaggttttagttaaccgagtaaaaccttttattctcaggcgaacaaaaaaccaggtt
gctcgtgaattaccgccgaaaacggaaatgactcgtactattgaaattgttgggccacaa
cgtgatctttatgaagcgattcgcatgagcatggagaaaaaagttcgtgatgccattgtg
aaacaaggcttaggtaaaagtcatattattattcttgatgccttattgaagctgcgtcag
atttgctgtgatccacgtttattatcattacctgaggcaacaattgctcatggaacttcg
gctaaactcgaaaccttgatggaactgcttgataatttagtggaagaggggcggcgggta
cttgttttctctcaatttacgtccatgctgcaattaattgaagatgagttgcatgcacgt
aattatgattatttaaagcttaccggacaaacacaaaatagacaggctttagttgagagg
tttcaagaaggaaagacccctgtatttttaattagcttaaaagctgggggaactggattg
aacttaacgcgtgcggataccgtaattcattacgatccttggtggaatccggcggtagag
gatcaggctacggataggacgcatcgtattggtcaggtaaatcctgtgtttgtttataag
ttgattacttcaggtacggttgaagaagccattttaggtatgcaagagcgtaaacgcctg
ctggtggatggaattttatctgcagatcctgctaaggcgataagtttaagtgaagaggat
atagagcagttttttgcgccattatag
DBGET
integrated database retrieval system