Secundilactobacillus malefermentans: FGL90_02110
Help
Entry
FGL90_02110 CDS
T06836
Name
(GenBank) LPXTG cell wall anchor domain-containing protein
Organism
lmae
Secundilactobacillus malefermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG
KxYKxGKxW_sig
Gram_pos_anchor
Big_3
Amelogenin
DUF3107
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEA31050
LinkDB
All DBs
Position
complement(406873..411663)
Genome browser
AA seq
1596 aa
AA seq
DB search
MRRNNLIRAEEDTKEHYKMYKVGRRWVFAGMTIITFGSALLMGQVTANASDEQSTESTDA
TTATSTQSSNSQNKQVTLSNSSSSTSESGDSSESESEVSASPTSQTNSSSEPTSKKADLE
TNQGTTGTDTVATNNGSSIDSKTKSNNENESNESNESNESSEVTPNKEKTTTPKLDATIK
KSQLRKSTRMGLSDATIAKLNESVNDSLVDSTNVTRAATNSGITMAAADSSFTLSSDKIG
YGSDGNGIKVTFTFSGNKGDIYEILIPADTAAYSLQSVPVMPSTMGTTTTTKNADGSMLI
TNTLLTSASYSQVLKLNQINNYQGQAAPMDEIGTTIKTITTTKNGVIQSEASFTQTITPN
ADISDPVRTNPSSTAINNLLPSTDYVYEVDMNEADGVLNNDYTSNRVNSAANYGGTTVTI
PVPASFKLNVDLTSSLNSLTSGDGTTITQPDGEGGDIIITVAPGKGSQNFNGLPAYKIAG
SYDLEQTDQPQTLTANGNVKMTQVINANGDVLTAESKNPWTETILSVGNDDGTPTDSTAK
LVAYGNSSVADTKLLLDTDESNNPDYLNSFGFTTSTAAGIRDAQITINIPDGLDATSFKV
PDGGASTVAYLEGTTSYGYSVVLADGTTETGIVQAGGTVTPKSNSAIRTIVLTPNYLAPG
ATTGTTTSQRIIVYGKLSDEYDNGNPVQSGDELKSSISLSSKNAGIVSTDDTSSVTQTVI
TPADTVAKATGYVHQTNKAAGATSAGLVSLAMSGNTNQTANSIYEPIYYFVLPASTTVSS
MTNVPDGGVISESVANDGREVVKVDYTGTGQSISTQETYLISIELDNNSDALPGSYPTTM
YVTSPVTQLQNKTAVIDTSLTDGDDKAVLMGNGQWLIENVTAVFGSTFAKGNEDVIPVMS
GESLRNGDPTLTFYDSITNTNASPATNLISVVNLPTVGDAAGSEYTFKMSGAVNLPTTYQ
TADGTVEMTDGQTLTAMYSTQLADLVDGEPDLSSYVTADQVTDWSAVRSIVFKVSSLPAS
ATTGRIAIEGTTDNFAVNTPEPTQIGYLETGFSADNYNYSYADPSQNASITIRNYVTPSA
ELNSQSFAYDGTTKASDEDDLTATISFSDGRPQAVVSLNKEDVTFAKDGTAVGSYDYSLS
STGVTKIENTIGMTINTSGVLGAVIITPIKTTVTLNDGGFNFDGKTFASEATGLTATVTL
PDGTKSMSLTTADITVTGDGTAVGPYTYTLSDAGLAKLKALLNDSNYQLDAIDAKGTITI
APSTLEVTLTGKETEIFNGTTQSPQSSNYQVTLPDGTTLKLEDSDIELASASDGLHPGTY
EVVLSQKGRNKVQEALSDASSVIYKQDATLSITPAKASEVLVNSATIAYGTPTPTFTSSF
GKGLDAVPLTNSDYEFYDVTGQLLSGIPTAVGVYTVKLNQAAQDRTAAANIDYSFSNLTF
VSGMFTILPTDPTEPGGGGETTEPGTPTIPENPTTPENPTTPENPTTPENPSVPGNPENP
VKPGDGGLGGNSGQGGSNEPNSQKPGNQNPDVTGQKVSAGQADLMTTNTKQSVGNQSQAE
KLPQTSERSENPFVLLGLSLMSVLGLLGLARRKKQE
NT seq
4791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagaaacaatttaattagggctgaggaagacactaaggaacattacaaaatgtat
aaggtaggtcgaagatgggtctttgccggtatgacgataatcacttttggatcagcatta
ttaatgggacaagtgaccgcaaatgctagtgatgagcaatccacagaaagcacagacgca
actactgccacgagtacacagagctcaaatagtcaaaataaacaggttaccttgagtaat
agtagttcctcaacttcggaaagtggggattcctcagaatctgagagtgaagtttctgct
tcacctacaagtcagacaaattcatccagcgagccaacttcgaaaaaagctgatttagag
acgaatcaaggtacgactggaacggatacagtagctacgaataatggctcaagcatagac
tcaaaaactaaatctaataatgaaaatgagtctaatgagtctaatgagtctaatgagtca
agcgaagtgacacctaataaggaaaaaacaactacacctaagttggatgcaactatcaaa
aagagtcagttaagaaaatcaactagaatgggactctctgacgcaacaattgctaaatta
aatgaaagcgttaatgattctttagttgatagtacaaatgtgacacgagctgcaacaaac
tcaggaattacgatggccgctgctgattctagcttcactttatcttcagataagattggt
tacggatcagatggaaatggtattaaagtaaccttcacttttagtggtaacaaaggtgat
atttatgaaattttaataccagcagatacagctgcttatagtttacaatcagttccagtg
atgccaagcacaatggggacaacgacaacaacgaaaaatgccgacggatcaatgctaatt
acgaataccttgctgacgtcagcaagttacagccaagttttaaaactgaatcaaattaat
aactatcaaggtcaagccgctccaatggatgaaattggtacgactattaaaacaattaca
acaactaaaaatggcgttattcagtcagaggctagtttcacgcaaacgattacgcccaat
gcagatatttcagatccagtccggacaaatccgagttccactgcaattaacaacctattg
ccgagcacggattatgtttatgaggttgacatgaatgaagcagatggggtcttaaataac
gactatacgtcaaatagagtcaattctgcggcaaactatggtggaactactgtcacgatt
ccagtaccagcaagctttaaattgaacgtggatttgacatcaagcctgaatagcttgacg
agtggagatggaacaaccatcacccagccagatggtgagggcggtgatattatcattact
gtggcaccaggtaaaggaagccaaaattttaacgggttaccagcctataaaattgctggt
agttatgatttagagcaaactgatcagccgcaaacattgaccgcaaatggtaacgttaag
atgactcaggtcattaatgcaaacggagatgtcctgactgcggaaagtaagaatccttgg
actgaaaccattctctccgttggaaatgacgatggaacacctactgactccaccgccaaa
ctcgttgcatatggaaatagtagcgttgcagatacaaaactattactggatacagatgaa
agtaataatccggactatctaaatagctttggttttaccacctcaaccgctgccggtatt
agagatgcacagattaccatcaatattcctgatgggctggatgcaacaagcttcaaggtg
ccagatggtggtgcttcgacagttgcgtacctagagggaaccacgtcatatggatacagt
gtcgttttggcagatggcaccacagaaacaggtattgtccaagctggaggaacggttact
cctaaatcaaattctgctattcggacaattgttttaacaccaaattacttagcaccagga
gcaacaactggcacgactacaagtcaaagaatcattgtttacggtaaattgtctgatgaa
tacgataatggaaatccagttcaaagtggtgatgaactaaagtcatcaatttcgctttct
tctaaaaatgcaggaattgtctcaactgacgatacatcatcagttacacaaacagttatt
actccggccgacacggttgccaaggctactggttacgtgcaccagaccaataaagctgct
ggagcaacatctgctggtttagtgtcattggcaatgtctggaaacacgaatcaaactgca
aattcaatttacgaaccaatatactactttgtattgccagcaagcacaaccgtttcaagt
atgactaacgttcctgatggcggtgtgatttcagagtcagttgctaacgatggtcgagaa
gtcgtaaaagttgactacactggaacaggtcagtcgatttctactcaagaaacctacctt
atttctatcgagctggacaataatagtgacgcattgccgggcagttatccgacaacaatg
tacgttacttccccagtaacgcaacttcaaaataaaacagcagtgattgatacttcactt
actgatggggatgacaaagccgttttaatgggtaatggccaatggctgattgaaaatgta
acggccgtatttggttctaccttcgcaaagggcaatgaagatgttatcccagtaatgtct
ggtgagtcacttcgaaatggcgatccaacgttgaccttctacgattcaatcacgaataca
aatgcttcaccagcgactaatttaatttcagtcgttaatttgccaacagtcggtgatgca
gctggttctgaatatacgtttaaaatgagtggtgctgtaaatctaccaactacttaccaa
acggccgatggaactgttgaaatgacggatggtcaaacgctcactgcgatgtattcgacc
caattggcggatttagtagatggtgagccagatctttccagctatgtgactgctgatcaa
gttacagattggagtgcggtgcgttcaatcgtattcaaagttagctcactgccagcatca
gcaacaactggtagaatcgcaattgaagggacaacggataattttgccgttaatacacca
gagccaacccaaattggatatcttgaaacgggcttctctgctgataactataattattcc
tacgctgatccttctcaaaacgcctcgattacaatcagaaattatgtaacaccaagtgct
gaattaaatagtcaatcatttgcctatgatgggacaaccaaggccagtgatgaagatgat
ttaacagccacaatttcattttcagatggtagaccacaggctgtggttagcctgaataag
gaagatgtcacctttgcaaaagatggtactgcagttggctcatatgattactcgctgagt
tcaactggggtaaccaagattgaaaacacaattgggatgacgattaatacaagtggcgtc
ttgggtgcggtcatcatcacaccaatcaagacaacggttactttgaatgacggtggattt
aattttgatggtaagacctttgctagtgaagctacaggtttaacagcaacggtaacacta
ccagatggtacgaagtcaatgtctctcacgacagctgatattacggttactggtgacgga
actgcagttggaccatatacctatacgctaagtgatgctggtttagcaaagttaaaagcg
ttgcttaacgactcaaattaccaactcgatgcgattgatgcaaaggggactattacgatt
gccccttccaccttggaagtaacgttaacagggaaagaaaccgaaatattcaatggtacg
actcaatcaccacaatcaagtaactatcaggtaactttgcctgatggaacgacgctgaag
ctggaagattcagatattgagttagccagtgccagtgatggattacatccaggtacttat
gaagttgtcttgtcacaaaaaggacgaaacaaggttcaggaagcactttccgatgcatct
agtgttatctacaaacaagatgcaactttatcaattacgccggctaaagcaagtgaggtt
cttgtcaatagtgcaactattgcatatggaacgccaacgccaacgtttaccagttcattt
ggcaaaggattggatgccgtaccgctaacaaatagtgactatgaattctatgatgtaact
ggtcaattattaagtggaattcccactgcagtaggtgtttacacggttaaattaaatcaa
gcagctcaggaccggactgcagctgcaaatattgactatagttttagtaatctgacattt
gtatccggtatgttcactattttgccgactgatcctaccgaacccggtggcggtggtgaa
actactgaacctggaacaccaacgattcctgagaatccaacgactcccgagaatccaaca
actcccgagaatccaacgactcctgagaatccaagtgttcccggaaacccagaaaatcct
gttaaaccaggagatgggggattgggcggcaattcaggtcaaggtggctcgaatgaacca
aattctcaaaaacctgggaatcagaatcctgatgttactggtcaaaaggtaagtgctgga
caagctgacttaatgactactaacactaagcaatcagtaggcaatcaatcacaggccgaa
aagttgccacaaacgtctgaaagaagcgagaatccatttgtcctacttggattaagtttg
atgagtgttcttggactcttaggacttgcaagacgtaaaaagcaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system