Leptotrichia mesophila: AB8B23_05605
Help
Entry
AB8B23_05605 CDS
T10902
Name
(GenBank) autotransporter-associated N-terminal domain-containing protein
Organism
lmes Leptotrichia mesophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDU65630
UniProt:
A0AB39VDL1
LinkDB
All DBs
Position
1093365..1099319
Genome browser
AA seq
1984 aa
AA seq
DB search
MANDLQSLRKGLKSFAKRCKDFKYTESALLTFLLCGTIVSNNLFSAEVKKQTSVGSNTQA
LNNFVKNEKLKIKTSRSRHKKLLNGLNSELIELMEQGEHVTKSPWSSWQFAINEFSNDWN
GTYKGRGDKTGGFIYAREVGKAKYTQKTNNNRYGTTRLNLIDTAEPKVPIHMNASINPRV
LTKGRITPPDKTVNVPTLPETVEFTPVSPSIPTITPSTITITPITLSAIWNSSGLDTVGL
NRDVTIPGSYDLLPTTKARNQTDPGGKNWNGARIAETIMDIGGTPGKGFTIAAGVTINIQ
RDGTRAAVIDAGNWGLSTPQTTSVTNNGKINLYNQTTAGLEVQGNPLVGDFSLINNGEII
GHGSKQVALTLTPEQPNAHGSIQTLKNNTKIDMAGSQSVGLNIVNRKLYQSTENAALNKI
YPGGFYNDLKTVAINSSGAKITLGGTNSYGIAFGALGHDSQLTEGSVFQNSGDINVNNDS
SGGIAVKAAKYWVDVSGKDKTFTATDTISATLENTSTGKITVKGTNSFGIYSEEINGTNH
GAINIEGSKDYSIALRANKTGTVIPTLTNNGTVSISSTGKENIGFYTKNAKVVNNAGKTV
SITAGQNIGMAVYGTSKTDYGEGTNAGTITANSAGSIGVITSNYGKVTNTGTIGVTGGNT
SDNNKGTVAVIVGKNSTIDSSNGTINATVTDNKSIGVYSDGTLKLGTGTISADAGAINYF
ADNNGEIEVVSGKTSTATTGQKSLLFYNGTNGTGKVKISGTLNATVAGGTDATNRGTAFY
YVPSTTSATGSAVGYNNTVNYGAFGASDISGYFATTFSGTIANLNLTMQNDSRLFLASKV
KMNLSDTNISSVPGGPTITGSNYKNFMLYLSEVKVDNAVDLDNATDLYNTLEISNSSIIN
QNKISGNDDGRVAMAQENKTVSKPAVTLMNDTAGTIELNGKNALAIYAKYGNVVNRGQIT
LNGKDSTGLYGVENSKVINESTGKITLDGESGAAMYYTNTSATKLTSEIMQNDGTIDGES
DSSIGMIYDAGKLDASVSSGTATLVKNTGTISLTGDKNVGIFTKPDTLNKGYVTENSGNI
ILTGDSATLSNPNVGIYTTGKNNTIKTNAGSKIETGAKTVGIFGYAVENSGDITVGSGGV
AIYSQNGDIALSDGTIKTGNDEAVGLYLVGENQNAHVNVNAKFDLGDNSFGIVNANATGN
NYITSSATSVELGSRAVYAYSADKLGVIANYTDISTKNATSRENFGIYSSGRVDNHGNIN
FENGIGNVGIYVTGTDGKAFNLNGGTITISKSDVVGNNYSIGMAAKNGAVAENEGIINVT
GDNGIGMYASGPGSKVINKATGVINLSGDSTIGMYLDDYAVGENYGTIQTTPNSTGEGIM
GVYALNNAVIKNYGTIRINAVDGVGVYVGRNAELEGNTSTNDISATGTDSEHIYRTSRTD
TSKGVKGIRFSLPHLGSLTADVIRNDVNVTPTLVDTDIATPSPNYVHLAAGDINLNTFDP
LFTQNNGGGSSIGMYVDTSGVRYTNPIQGLENLTRLRKINLIFGIEATQYTDSKDIQIGN
NIIAPYNAAIMSVSHVNPAAKWEIFSSSLLWIATATQNPDQTIANVYLSKIPFNSFAEDG
DIDNYNFLTGLEEKEALKDVTERKIFNKLNGLGKGEAHILAQAVDEMKGHQYSNIQQRIY
ETGNTLSKEFKYLQEEWRNPSKQSNKIKAFGNKGELKTNTAGVIDYTNNAYGVAYVHEDE
AIKLGNSSGWYAGVANNQFKLKDIGHSRENQTMIKAGIFKTMAPKQDHNGSLTWRISAET
FAGRGNMKRKYWVVDDTYEAKGDYNIYGVALKNEIGKTIRTTEKTSIRPYGLLNMEYGKY
SNIKESGPMALEIKGNDYFSVKPEAGLAFNFKQTLGARSNLKINVTAAYENELGKLNNVQ
NKARFRGTQSEYYNLHGDKENRKGNGKFDLNLGWDNTLFGITVNAGYDTTGKNFRSGIGF
RAIY
NT seq
5955 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatgatttacagagtttacggaaaggattaaaaagctttgcgaaaaggtgtaag
gattttaagtatacagaatctgcattacttacgtttttattatgtgggacaatagtgtca
aataatttattttcggctgaagttaagaaacagacaagtgttggaagtaatacacaagca
ttgaataattttgttaaaaatgaaaaattgaaaataaaaacatcgaggtcaagacataaa
aaactattaaatggattgaattcagaattaattgagcttatggaacaaggggaacatgta
acaaaaagtccatggagcagctggcaatttgcaataaatgaattttctaatgattggaat
ggaacttataaaggtcgtggagataaaacaggaggatttatttatgctagagaagtagga
aaagcaaaatatactcaaaaaacgaataacaatcgttatggaacaacaagattaaattta
atagatacggctgaaccaaaagtaccaatacatatgaatgcttcgataaatccaagagtt
ctaacaaaaggacggataacaccacctgataaaacagtgaatgttccgactttaccagaa
actgttgaatttacaccagttagtccaagtattccgacaataactccgtcaacaattaca
atcacaccgattacattatcagcaatttggaatagtagtggattggatactgtaggattg
aatagagatgtaacaattcctggtagttatgatttacttccgactacaaaagcaagaaat
cagacggatcctggtgggaagaattggaatggagcaagaatagcagaaacaattatggat
ataggaggtactccaggaaaaggctttactattgctgcaggagtaactataaatatacaa
agagatggaacaagagctgcagttattgatgcaggaaattggggactaagtacaccacaa
acaacatcagtaactaataatggaaaaattaatctttataaccaaactactgcaggtcta
gaggtacaaggtaatccactagttggtgatttttcattgataaataatggagaaataatc
ggacatgggagtaagcaagtcgctttaacattgacaccagagcaaccaaatgcacacgga
agtattcaaactttgaaaaataatactaaaattgatatggctggaagtcagtcggtagga
ttaaatattgttaatcgaaaactttatcaaagtacagagaatgcggcattaaataaaatt
tatccgggtggtttttataatgatttaaaaacagtagcaataaatagcagtggtgctaaa
ataacacttggtggaacaaatagttatggtattgcttttggagcattgggtcatgatagt
caattaactgaaggctcagtatttcaaaattcaggagatataaatgttaataatgatagt
tcaggtggaattgctgtaaaagctgctaaatattgggttgatgtttcaggaaaagataaa
acatttacggcgacagatactatttctgcaacgcttgaaaatacttctactggaaaaatt
actgtaaaaggaacaaattcatttggaatttattctgaagagataaatggaacaaatcat
ggagctataaatatagaaggcagtaaagattactcaatagctcttcgtgcgaataaaact
ggaactgtgataccaacattaactaacaatggtacagtttctatttcaagtactggaaag
gaaaatattggtttttatacgaagaatgcgaaagttgttaataacgctggaaaaacagtc
agtataactgctggtcaaaatattggaatggcggtttatgggactagtaagactgattat
ggagaaggaactaatgctggaacgattacagctaattcggctggatctattggagttata
acttctaattatgggaaagtaacaaatacaggaactataggtgttactggtggaaatacg
tcagataataacaaaggtactgttgcggtaattgttgggaaaaattcaacgattgatagt
agtaatggaacgattaatgcaactgtaactgataacaaatctattggggtttattctgat
ggaacattaaaattaggtactggaacgatttcggctgatgcaggagcgattaactatttt
gctgataataatggagaaattgaagttgtaagtggaaaaacatctacagctacgactggt
caaaaatcattgttattttacaatggtacaaatggaactgggaaagttaaaataagtggg
actttgaatgcaacagttgctggtgggacagatgcaactaatagagggactgcattttac
tatgtaccaagtacgacttcagctactggaagtgcggttggatataataatactgtaaat
tacggtgcttttggagcttctgatattagtggttattttgctactacttttagtggaaca
attgcaaatcttaatttaacaatgcaaaatgattcaagattgtttttagcttcaaaagtt
aagatgaatttaagtgatacgaatatttcatctgtgcctggtggtccaactataacagga
agtaactataaaaatttcatgctttatttaagtgaagttaaagtagacaatgcagttgat
cttgataatgctacagatctgtataatactttggaaatttctaattcatcaataattaac
caaaacaagataagcggaaatgatgacggtcgtgttgcaatggctcaagaaaataaaaca
gtatcaaaaccagcagtaactctaatgaatgacacagcaggaacgattgaactaaatggg
aaaaatgcgcttgcaatttatgcgaaatacggaaatgtagttaatagagggcaaattacg
ctaaatggaaaggattcgacaggactttacggtgttgaaaactcaaaagtaattaatgaa
tcaactggaaaaattacattagacggtgaatctggagctgcaatgtactatacaaataca
tctgcaactaaattaacttctgaaataatgcaaaatgatggaacaattgatggagaaagt
gattcttcaatcggaatgatttacgatgcaggaaaattagatgcgtcagtttcaagtgga
acagcaacattagtaaaaaatacaggaacaatctcactaacaggagataaaaatgtagga
atctttacaaaaccagatacattaaacaaagggtatgtaactgaaaatagtggaaatatt
atattaacaggagattctgcaacattaagtaatccaaatgttggaatttatacaactgga
aaaaacaatacaattaaaacgaatgcaggctctaaaattgagacaggagcgaaaacagtt
ggaatatttggatatgcagtggaaaactctggagatataacagttggaagtggtggagtt
gcaatttattcacaaaatggtgatattgcattaagtgatggaacgataaaaactggaaat
gatgaggctgtaggactttatttggtgggagaaaatcaaaatgctcatgtcaatgtcaat
gcaaaatttgatcttggagataattcatttggaattgtaaatgccaacgcaactggaaat
aactatattacgagtagtgcgacaagtgttgaattaggaagtagagctgtttacgcatat
tcagctgataaacttggagtaattgccaattacacagatattagtacaaaaaatgcaaca
agtagagaaaactttggtatttattcatcaggaagagttgataatcatggaaatattaac
tttgagaacggtattggaaatgtcggaatttatgtaactggaacagatgggaaagccttt
aacttaaatggtggaacaataacaataagtaaatctgatgttgttggaaacaattattca
ataggaatggcagctaaaaatggtgcagttgctgaaaatgaaggaataatcaatgttaca
ggtgacaatggaattggaatgtatgcaagtgggcctggttctaaagttataaataaggca
actggagtaataaacttatctggagatagcacaatcggaatgtatcttgatgattatgca
gttggagaaaattatggaacgatccaaactacaccaaattctactggtgaaggaattatg
ggagtttacgcgcttaataatgcagttattaaaaactatggtacaattagaattaatgca
gttgatggagtaggagtttatgtaggaagaaatgcagaattagaaggaaatacgtcaaca
aatgatattagtgctacaggaactgattcagaacatatttatagaacaagcagaactgat
acttcaaaaggtgttaaaggaataagatttagtttgcctcatttaggctcattaacagcc
gatgtaattagaaatgatgtaaatgtaactccaacattagtcgacacagatatagcgaca
ccttctccaaattatgttcatttagcagcaggagatattaatttgaatacttttgatcca
ttgtttactcaaaataacggtggaggttcaagtattggaatgtatgtagatacttctggt
gtaagatacactaatccaattcaagggttagaaaatctaacaagattgagaaaaataaac
ttaatttttggaatagaagcaacgcagtatactgactctaaagatatacaaattggaaat
aacattatagcaccttataatgcagcaataatgagtgtcagccatgtaaatccagctgca
aaatgggaaattttttcaagtagtttattatggatagcaactgcaacacaaaatccagat
caaacaattgcaaatgtatatctatcaaaaataccatttaattcatttgcagaagatgga
gatatagataactataatttcctaacaggtttagaagaaaaagaagctttaaaagatgtt
acagaaagaaagatattcaataaattaaatggattaggaaaaggagaggcccacatctta
gcacaagcagttgacgaaatgaaagggcaccaatattcaaatattcaacaaagaatatac
gaaactggaaatactttaagtaaagagtttaagtatttacaagaagaatggagaaatcct
tcaaaacaaagtaataaaataaaagcctttggaaataaaggagaattaaaaactaataca
gcaggagtaattgactatacaaataatgcttatggtgtagcgtatgttcacgaagatgaa
gcaattaaacttggaaattcaagtggatggtatgcaggagtggcaaacaaccaattcaag
ttaaaagacataggacattcacgtgaaaatcaaacaatgataaaagcaggaatatttaaa
acaatggcaccaaaacaagatcacaacggttcattaacttggagaatttccgcagaaaca
tttgcaggacgtggaaatatgaagcgtaagtactgggttgtagacgatacttatgaagct
aaaggtgattacaacatttacggagtcgcattaaaaaatgaaattggaaaaacgatcaga
acaactgaaaaaacaagtataagaccatatggattattaaatatggaatacggaaaatac
tcaaacattaaagaatctggtccaatggcacttgaaataaaaggaaacgattatttttca
gtaaaaccagaagcaggacttgcatttaacttcaaacaaacactaggagcaagaagtaat
ctaaaaataaacgtaacagcagcctatgaaaatgaattaggaaaattaaacaatgttcaa
aacaaagctagatttagagggacacaatcagaatactacaatcttcacggagataaagaa
aatcgaaaaggaaatggtaaatttgatttaaatttaggatgggataacacattgtttgga
attacagttaatgctggatatgatacgactgggaagaattttagaagtggaataggattt
agagcaatttattaa
DBGET
integrated database retrieval system