Listeria monocytogenes FSL R2-561: LMKG_02971
Help
Entry
LMKG_02971 CDS
T01985
Name
(GenBank) peptidoglycan linked protein
Organism
lmg
Listeria monocytogenes FSL R2-561
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Big_3_4
Bact_surface_Ig-like
PKD
Big_13
PKD_4
DUF4625
HYR
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEO26013
LinkDB
All DBs
Position
complement(1737570..1742705)
Genome browser
AA seq
1711 aa
AA seq
DB search
MKSKFFIGMMTFLLSLICLTGMKAEAKSVGDISPDDISPEISDNRFQSAEGKVLPNFEVD
MSISDQNNGKLSIDEDFELTSDGDIILIGTVQGQYIQGTPILNENGQLNKIPNRDQGIIM
RVDRTTKKVEWARVVNYEDGNYNSQYAADKWFSSYKSITTNSSKSTFYVGGEVVNYYGDS
GGGSTLIVKSIDANGNFQIAHKSYVSYGVPSRSDLTYAYFMDIQMEGNTLTMSASARYAA
QGKQFIRYTLEPASLSITKNEFNPLDNTFWAKYQRTDVLKVDNKGLMAYNADVNGANQLK
MSIRESENNYKEITLFDSVPEILANSSPYIFMEDRGDGNVFVVMSTPTTWYIALVNIASE
QVVETKKMTMNSSTTLNSVIYSEGKGLLLGGSTHAEESIFGSEPLNKNNGYYLALGNDLN
VTDSQILRTNQHNSLTTIINGVGNKVDGFFSYDGLNNDGYIQNVEYPNTYDVNPNGAMIF
AEFNLQPAPVLDTGNPILAFYQGERRADFDELEGVKAYSGIDSSDVTKSITKNTFDLYTV
GVQQQLYQIEYLPGSGNKTTGTRNVQLIHPLETPKLEKSYADSHGAFKVGEVVPANAIHA
FNGLDSANNVTYVVTAVDDEKITVDASIKRTEGTKTAVINKEITLMTSTADETAVIDVTS
VALAAGKYTSLTDVRNEGHFHIYAETMDSVSIDPKYVKLTEDPENPVDWNAPGVYYVTAS
LDPASGYTAKDVKVSVAVVDVGSPKVISVNMKPYNPTTALVVAEDDINGAGVYKINWAIK
DANGLIIQQGVEESGATIRVQTPVPIDLSTLNDGNYTLSVSAADRIGHTSEASEKAFTVD
RQAPVVTADDKITYEINTKKTEEEFLNDVNVKTEAGAVIKTNFDTMVRMDSPGDYTVLVE
ATDAAGNQSDPIYVIVTVEDTVAPIISADEAISYNQGNIRTEALFLTDIHATTDEPATIT
SDFADQVKFDTPGVYAVTLKANDISGNQAIPRTVNVTIKDVTAPVITADEAIIYEKGITK
SATDFLTDIHATTNDGSAITSNFATVVDLNTPGDYDVTLSSTDTGGNISDPVTITVTVRD
TTPPVITADTTITYEKGTTKTAAAFLTDVNATTNDGSAVTSNFNPISLKQVGTYQVTLSS
VDENGNYALPVKVTVVVQDTQKPVISSSATSITYERGEKKQETGFFLDLAIKTDDGTPVT
SDFDTAVNLDTAGTYTVTLNSEDESGNKADPVTITVTVADTEKPIITADTTITYAKGTTK
TVAQFLTDIHATTNDGSTIISNFDPTVLAQEGTYTVVLNAKDESNNEADPVTVTITVVDT
KGPIINALNAITYERTINKNEADFLADIEATTDDGSTITTDFNSKDLDTVGTYIVTLNAE
DASGNKATPVKVTIKVEDTIPPIITADQSITYERGITKTEQAFYTDIKAATSDNSPISSD
FSKIDLTKTGNYEVLLRATDQSGNKALPLKINVLVQDTIAPVIKTTSREITAERGTPMTE
QQLLAKIGANTDDGSKITTDYNPAIVNTSGDYLVHLYAVDAAGNQAIPVEITIHVKDTTA
PIIKADKKISYPVGTVKTVTEFLQDIHATTDDGSKITTDFDPNMLKTPGKYTIHLNAVDA
DGNKAKTIDVSLTVEEKVTPPKPPTPDDGGNNTNGSNGTNGSNTDITVNPTKQNTTATNE
SIPALGDTKSTIPVIVGMFLLATSLVLIRRK
NT seq
5136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaattttttataggcatgatgacttttttgctatcattaatttgtcttact
ggaatgaaagcagaagcaaaatcggtgggagatatttctccagatgatatttcaccggag
atttcagataatcgctttcaatctgcagaagggaaagttttgcctaattttgaggtggat
atgtcgattagtgatcaaaataacgggaaattatcgattgatgaggattttgagttaacc
tcagatggcgatattattttgattggaacagtgcaaggtcaatacatacaaggaaccccc
attttaaatgaaaatgggcaattaaataaaattccaaaccgtgatcaagggattattatg
cgtgtcgatcgaaccacaaaaaaagtggagtgggcacgtgttgttaactatgaggacggt
aattacaattcacaatatgcagctgacaaatggtttagttcgtataaatcgattacaacc
aactcgagtaaatcgactttttatgttggtggggaagtagtcaattactacggagactca
ggtggaggtagtactttaattgtaaaatcaattgatgcaaatggtaacttccaaatagcc
cataaatcatacgttagttacggtgttccatcaagatcagatctaacctatgcctatttt
atggatattcaaatggaaggtaatacattaaccatgtcagcttcagctcggtatgctgcg
caaggtaaacagtttattcgttatactttagaaccagcctcattatccattacaaaaaat
gaatttaacccattagataatactttctgggccaaatatcaacggacagatgtccttaaa
gtagataataaaggtctgatggcttataacgcggatgtaaatggtgccaaccaacttaaa
atgtccattcgtgaatcagaaaataattataaagaaattacattgtttgattctgttcct
gaaattttagcaaactcttccccttatatatttatggaagatcgtggcgatgggaatgtg
tttgtggtcatgtcaacacccactacctggtatatcgcgcttgttaatatcgcgtcagaa
caagtagttgagactaaaaaaatgacgatgaactcctccacgacgctaaatagtgtgatt
tacagtgaaggaaaaggtctgcttttaggtggtagtacacacgcggaagaaagcattttt
ggtagtgagccattaaacaaaaataacggatattatttagcgcttggaaatgatttgaac
gtaacggatagccagattttaagaacgaatcaacataattcattgacaactattattaat
ggcgtcggcaataaagtagatggtttctttagctacgatggattaaataatgatggatat
atccaaaatgtagaatatcctaacacctatgatgtgaacccgaatggggcgatgatattt
gcagaatttaatttgcaaccagctccagtactagatacaggtaatccaatcttagcattt
taccaaggggaacgtcgtgcagattttgatgaactagaaggggtgaaagcgtactctgga
attgattcatctgatgtaacaaaatctattacaaaaaatacgtttgatttatatactgta
ggcgtacaacagcaactttatcaaattgaatatttgccaggaagtggtaataaaaccact
ggtacgcgaaatgtccaattgattcacccacttgagactccaaaactagagaaaagctac
gcagatagccatggggcttttaaagttggcgaagtagtccctgcaaatgctattcatgca
tttaatggtttagatagtgctaataatgtgacttatgtagttaccgcagtagatgatgag
aaaataactgtagatgcttcaattaagcgaacagaaggaacgaaaacagctgtaattaat
aaggaaattacacttatgacttcgactgctgacgaaactgcagtaatcgatgtgacgagt
gtagctctagcagctggaaagtatacatccttaacagatgttcgaaatgaagggcatttt
catatttatgcagaaacaatggatagcgtgtccatcgatcctaagtacgttaaactaaca
gaagaccctgaaaacccagttgactggaatgcgccaggtgtttattatgtgactgcatca
cttgacccggcgagtggatatacagcgaaagatgtgaaagtaagtgttgctgtagttgat
gttggaagtccgaaagttatttctgtaaacatgaaaccgtacaatccaacaaccgctctt
gtcgttgcggaagatgatattaatggcgcaggagtgtataaaatcaactgggcaattaaa
gatgcaaatggacttattatccagcaaggtgtggaagagagtggtgctaccattcgagtt
caaaccccagttccaattgatctctctacattaaatgatggaaattatacattgtcagta
tcagcggctgacagaattggtcatacatcagaagcttcagaaaaagcgttcacagtagac
agacaagcgccagttgtgacagctgacgacaagatcacgtatgaaataaatacaaagaaa
acggaagaggaatttttaaacgatgtaaatgtaaaaacagaagccggcgcggtgattaaa
accaattttgatacgatggtgagaatggattcgccaggtgattatacggttttagtggaa
gctaccgatgcagctggtaaccaatctgatcccatttatgtcatcgtaacagtggaagat
acggtagcgccgattataagtgcagatgaagcgattagttataatcaaggaaatatacga
acagaagcactattcctgactgatattcatgcaacgacagatgaaccagcaacgattaca
agtgattttgcggatcaagtgaaatttgacacaccgggagtctacgcagtcacattaaag
gcaaacgatattagtggaaaccaagcaatcccaagaacagtaaatgtcacaataaaagat
gtgaccgcaccagtaatcactgctgatgaagccattatttacgaaaaaggcataaccaaa
tctgctactgatttcttaacggatatccatgctactacaaacgatggctcagcaataact
tctaattttgcaactgtagtagatttaaatacacccggggattacgatgtgacacttagc
tctaccgacacaggtggtaatatatccgatccagtcaccataacagttaccgtacgtgat
acaaccccaccagttattacagcagatacaactatcacatacgaaaaaggaaccacgaag
actgcagctgcctttttaacggatgtaaatgcaacaacgaatgacggttcagcagtaact
tctaacttcaacccaattagtttgaagcaagtagggacttatcaagtaacattaagttct
gttgatgaaaatggtaactatgctttgccagtaaaagtaaccgtcgttgttcaagataca
caaaaaccagtaatctcatccagcgcaacaagcattacctatgagcgaggagaaaagaaa
caagaaacaggcttcttccttgatttagctattaaaacagatgacggcactccggttaca
agtgattttgacacagccgtaaatctggacacggcaggaacttatacggtaacactgaat
tcagaagatgaaagtggcaataaagcagacccagtcactattactgtgaccgttgctgat
acagaaaaaccaattatcacagcagacacaaccataacctacgcaaaagggacaaccaaa
actgtcgcacaatttttaacagatattcatgctacaactaatgatggatcaaccatcatt
agtaattttgacccaaccgttcttgcgcaagaaggaacctacacagtcgtattaaatgca
aaagatgagagcaacaatgaagcagatccggtaactgttacgattacagtggtagataca
aaaggaccgattatcaatgcattaaatgcaatcacctatgaaagaactatcaataaaaac
gaagctgatttcttagcagatattgaggcaactacagatgatggatctacaatcacaacg
gattttaatagtaaagatcttgatacggttggaacctatatcgtcacattaaatgcagag
gatgcaagtggcaataaagcaacacccgtaaaagtgacaataaaagtagaggataccatc
cctccaatcattacagccgaccaatcaatcacttacgaaagaggcattacaaaaacagag
caagctttctacacagatattaaagccgcaacaagcgacaatagcccaatcagctctgat
ttttcgaaaattgatctaacaaaaaccgggaattatgaagtcttactccgagcaacggat
caaagtggaaacaaagcattgccacttaaaattaatgtgctagtccaagatactatcgct
ccggttataaaaacaaccagccgagaaataacggccgaacgtggcacgccaatgaccgaa
caacaactactcgcaaaaattggcgccaatacagatgatggctccaaaataacaactgat
tataacccggcaattgtcaacacatcaggagattatttagttcatctatacgctgttgac
gctgctggcaatcaagcaataccggtagaaataactattcatgtaaaagatacaactgca
ccaataattaaggcagataaaaaaattagttacccggtcggaacggttaagacagtaacg
gaatttttacaagacattcatgctaccacggacgatggttctaaaatcacgacagatttt
gacccgaatatgttaaaaacgccaggaaaatatactatccacttaaatgcagtagatgca
gacgggaataaagctaaaacaatcgatgtaagtcttacagtagaagagaaggtgacgccg
cctaaaccaccgacaccagatgatggcggaaataatacgaatggcagcaatgggacaaat
ggtagtaacaccgatataacggtaaatcctaccaagcaaaatactacggctacaaatgaa
agcatcccagcattaggtgatacaaaatcaactattccagttatcgttggtatgttcctt
ttagctacttcactcgttcttattagacgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
