Listeria monocytogenes HCC23 (serotype 4a): LMHCC_2280
Help
Entry
LMHCC_2280 CDS
T00801
Name
(GenBank) internalin-A
KO
K13730
internalin A
Organism
lmh
Listeria monocytogenes HCC23 (serotype 4a)
Pathway
lmh05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lmh00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
LMHCC_2280
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Flg_new
LRR_4
LRR_adjacent
Internalin_N
LRR_8
Flg_new_2
LRR_EndoS
LRR_9
LRR_14
LRR_LRWD1
LRR_Zer-1
InlJ_IG
LRR_R13L1-DRL21
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK40618
LinkDB
All DBs
Position
complement(2254799..2256568)
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MKSKGRLFLYVVLALSIVIGTNVFIKIDAHAAAAPPAAISQIFPDNALATEIQTTLGKSS
TAEVVTQTDLDTINSLTLTSKGISSLEGMNYLTNLGTLILSGNQVSDISPLKGLTNLTML
QLSGNPISDISALSNLKNLQALDINDAQITDITPLSGLTNLKGLGLYDNQLENLSGVNNL
HQLRSLNVSKNKLTNLDELQALSNLGVLYANENQIDNLQGISALNNLFLLDLSANQIVDT
TPLAGLTNVQTLYVSNNQISDVTGLSSLINLDWLDISQNKISNIRPLNSLTKLTIIQMTN
QLIVNEPISFESTITIPNLIKNIAEQTIDPDTISDNGVYANESVTWNLPTYIPKVSYTFI
ERDTVGNATGNFSGTVEQPLVQYFKATFNIDGQETTENVETGTLLQEPPTPVKEGYTFNG
WYDAETGGTKWDFTADTMPANDITLYAQFSINSYTATFDVDGVISTQTVDYQGLLEEPPA
PTKEGYTFKGWYDAKSGGTKWDFTNNQMPAKDITLYAQFSKDAASGGDDGGTDEGGGNSE
NSTEGAPNTSDIDTINHIVLPATGDDHVLFPIFIGTFLTSLALLTLRRK
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatccaaagggagactgtttttgtacgttgttttggcgttgtcgattgttattggg
acgaatgtatttataaaaatagacgcacacgcagccgctgcaccaccagctgcaatcagc
cagatttttcccgataatgctttagcgacagaaattcaaactacactcggaaagtcgagt
acagcagaggttgtcactcaaacagatttagatactattaattcattaacccttacatct
aaaggtattagctccctagaaggtatgaactatttgaccaatttaggaactttaatttta
tcaggtaatcaagtaagtgatatttcgccacttaagggattaactaacttgaccatgctt
cagctaagtggaaatccgattagcgacattagcgcacttagtaacttgaaaaacttacaa
gctctagatattaacgacgcgcaaattactgacatcacgccactgagcggtttaacaaat
ctaaagggtttaggcttatatgataatcaattggagaaccttagtggagtaaataattta
caccaactccgctccttaaatgttagtaaaaataagcttacaaatctagatgagctacaa
gcactaagcaatttaggcgttctatatgcaaatgaaaaccaaattgacaatcttcagggg
ataagtgctttaaataaccttttcttgcttgatttatcagcgaaccaaattgtggatact
actccactcgctggcttaaccaatgtacaaacattatacgtatcaaacaatcaaattagt
gatgtaactggtctttcgagtttaataaatctagattggctcgatataagtcaaaataaa
attagtaatattagacctttaaacagtttaacgaaattaacaattattcaaatgactaat
caattaatcgtaaacgaaccgataagtttcgaaagcaccataactattcctaatttaata
aaaaacattgcggaacaaacgattgatccagatacaattagtgataatggtgtgtatgcg
aatgaatcggttacatggaatttgcctacttatattccaaaagtcagctatacctttatt
gaacgtgatacggttgggaatgcaactggtaatttcagtgggactgtagaacaaccattg
gtgcaatattttaaagcaactttcaatattgacgggcaagaaacaacggaaaatgtcgaa
acagggacacttttacaagaaccaccaaccccagtcaaagagggttatacatttaacggg
tggtatgatgctgaaacaggtggaacaaaatgggattttacagccgatacgatgccagca
aatgatataactttatatgctcagtttagtattaatagttataccgcaacttttgatgta
gatggcgtcatttctactcaaacggtagactatcaaggtttactggaagaaccaccagcg
ccaactaaagagggttatacatttaaaggttggtatgatgccaaatctggtggaacaaaa
tgggacttcacaaacaatcaaatgccagcgaaagatataaccttgtatgcccagtttagt
aaagatgcagcttctggtggggacgatggaggaaccgatgaaggcggaggtaactctgaa
aatagtacagagggagctcctaatacgagtgatatagatactataaaccacatcgtacta
ccagcaacaggagatgaccatgtgctttttccaatctttattggaacatttcttacgagt
ttagcattacttacacttagaagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
