Listeria monocytogenes EGD-e (serotype 1/2a): lmo0842
Help
Entry
lmo0842 CDS
T00066
Name
(RefSeq) peptidoglycan binding protein
Organism
lmo
Listeria monocytogenes EGD-e (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3
Bact_surface_Ig-like
SdrD_B
DUF4573
Amelogenin
Ribosomal_L18A
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
985337
NCBI-ProteinID:
NP_464368
Pasteur:
LMO00842
UniProt:
Q8Y8Q4
LinkDB
All DBs
Position
875721..881855
Genome browser
AA seq
2044 aa
AA seq
DB search
MIKATRARHYLMLLMAFFLVLGQLNLTALNVFAKENGNDELTYEVQSKLTEDKKSADLTI
KVTPKSDQVKILTIETPDGEKREGQEVSYKAEKNGTTNFLINYQNTSEEKAETKTYTASY
EVSDIVSEDGVNKDSDTEKATEKEDANIQPPSTTNNTKNIKSLKSGQTTVELKIPDYDQT
AWANGDIKEVTATVNFGDSTSTGKKVNFTLPDGMRFVSLPVPSNYQAGTNEDTGVLSYLG
ASDPLGIAITSVEVPNKETAYSQATFGTVSYELSPGTEKASFKFSVRVDAAKYYGPTDLA
DPIKTEVYKGEASTPVASADQAIRAEGNKVVGYADQNHVKTMFRTWYNDQRLSEVLASTD
TTDSYNYTKSYSVVNGSNSLDSRGAAVYIAKNIEVTLYYPEGMEFVNVVNNAGTVLKENS
NVTITNYPSENKVVINNKHLNNSATSNSIYGVKYKVPKGTPAGTYSTAKAPHAVITTYDG
EVFESDALTTNPNDLTTIAPLDTCKVVDTTENKMTLTTANGQLNPNNETWAGSIQINNKK
SAGVKKNQMYQIKFDPNWEAYMVNIPFDSTISGNKISEVQYKTNLNDAFRTFDGALIKNN
NQMYRLDAKAVGLEEGEYFTEVKANVGDFAPGYQSTEASATYRWNSTASYGKIKPGVTSV
QYEGAIWDADDESNTKVSGISTYKVSSAESTVANGTAAFYNKAGTKVKTASAGETINTKA
TLVLHDYPYGTRTVLNDPEVYLHALEGTTIQPSSIKLTDQGGKDVNFTVEQETANNGDKV
YALKTTDVSVGVYVGYPTKHKYLNISYDTTFDVTLNKSINMDAQQVIAWGANVTPATGTN
TFSDLGLDVNKNGRDNDKLLSVNSSTLSIPKQDTVTVETFLSVAGEGDKAAYMEGEDSTV
SYFSPGTDADYTVKITNTSSGNASTFELYIPIPKTGQDFGSKFQSEPFKWDMKLNGALPV
SAEQQDQFDVSYATTATGDNYDSTDIYSNTVADYEKVNMVRIKVKTQINAGETQTFKVPL
KVDETFDSATEGNKIGERDIYNPYYRVITNTFAGSLSGTKVGAELVIGEVAGMLFNDKDV
NGSYEKDKGDEPLANETVELYKWNVSTSEYEPAKVGDKNITATTDSNGKYSFDYSDGVGY
GNYAVKFPDKAGYQYTLKNIGKDTSLNSDVPYSGADRGWAKQINPTLPSSQYTNAGYYAY
NPTQDLKVNLDEKQVQMGRSLEITLPKVASTTGQAAEDTIEPSFFKNIKATTNGYKWTVA
DTKVATVQTLADGSAAVVGVSTNNKTIDVTDLTITIQDIFGTEKSSKAPVYVTGTDGTVA
QQDGYTMGATDFSLEYKEATDLTKAQALTLAKTAAFEEVKDGVNSSAEDRLDQVQVNQTQ
LDAIKNGSNQGGVYPLTYTITKDSKTVSVTIQVTVAKDLTAVNAHDSTIYLGDTWDAEDN
FDSAANKEGDTNVAFSDVTVTGSVNTAVAGSYPVTYTYNGVSKKINVTVKDKLTAVNAHD
STIYTGDTWNAGDNFDSALDKDGNSVAFADITVTGTVNTNQAGTNTITYSYDGVSKTITV
TVLENKEGISAHDSTIYVGDAWNAKDNFDSAFDKDGNAVDLEDVTVTEKPTVDTTKAGAY
EVTYKYGKVSKKITLTVKAKLTAVNAHDSAIYIGDTWSAEDNFDSALDKDGNSVAFADIE
VKGTVDTDKVGTYPVTYTYDGVSKTINIQVKDILTAVNAHDSEIYIGDNWNAKDNFDSAK
DKDGNTVNWKDINVSENPAVDLETVGVYQVTYSYGGVSKTINLTVHPRKTSLEVHDSTMY
TGDKWKAEDNFDNATDKKGDQIPFKDVTVTGQVDSKTAGTYEITYIYDGLKKVARITVIQ
NQAQITVKDSVIPYGGKWEAEANFIGATNRDGVAIPFSKIKVDGTVDVNKAGTYKVIYTY
DPNEGTVDAGKKQLSVTANIQVEAEIVKPIKPIKPIKPIKPVDPSKPIDPKKPVKSSNPT
KPSTEKTPLKVVDNKQHTRTYEEAKPLPKTGDQTNTWVIWTGVCLLSMSLLLWVVMRGRK
KNYQ
NT seq
6135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaagcaactagagcgcgacattatttaatgctgttaatggcatttttcctagta
ttaggacaattaaatttaacagcccttaatgtgtttgcaaaagaaaatgggaatgacgaa
ctaacttatgaagttcagtctaaattgacagaagataaaaaatcagctgatttaaccatt
aaagtaacaccaaaaagcgatcaggtgaaaatcttgactattgaaacacctgatggagag
aagagagagggccaagaagtaagctataaagccgaaaaaaatggcacaactaacttttta
attaattatcaaaatacaagcgaagaaaaagcagaaactaaaacatatactgcttcttat
gaagtatctgacatagtttctgaagatggagtaaataaagattctgacacagagaaggca
actgaaaaagaagatgctaatattcagcctccttctactacaaataatactaaaaatata
aaatcacttaaatctggacaaacaacagttgaactaaaaataccagattatgaccaaaca
gcatgggcaaatggtgatattaaagaagtaacagcgacagtgaactttggcgacagtact
tctactggcaaaaaagtgaatttcactttaccagatggaatgcgttttgtttctttgcca
gtaccgagtaattatcaggctggtacgaatgaagatacaggcgttttgagttatttagga
gcaagtgatccactaggaatagccattacttcggtggaagtacctaataaagaaacagca
tatagtcaagctacgtttggaacagtaagttatgagctaagtccaggaactgaaaaagcg
agctttaaattttcagtacgggtagatgcagcaaaatattacggaccaactgacttagca
gatccaattaaaacagaagtatataaaggagaggcaagtacacctgttgcttctgcagat
caagcaattcgtgcggaaggaaataaagttgtagggtatgccgatcaaaatcatgtgaaa
actatgtttcgaacttggtataatgatcaaagactatcagaagtccttgcaagtacagat
actaccgactcttataactatacaaaatcatactctgtcgtgaatggatcgaatagttta
gacagtcgtggagcagcagtatacattgctaaaaatatcgaagtaacactttattacccg
gaaggaatggagtttgtaaatgttgtaaataatgctggcacagtgctgaaggaaaattct
aacgtaactattactaattatccaagtgaaaataaagttgtcattaataataagcactta
aacaacagcgccactagtaattctatttatggagtcaaatataaagtacctaaaggaact
cctgcaggaacatacagcacagcaaaagctcctcatgcagttatcacaacatatgatgga
gaagtatttgaatcagatgcactgacaactaatcctaacgatttaactactatagcacct
ctagacacttgtaaagttgttgatactaccgaaaataaaatgactttgactacagcaaat
ggtcaacttaatccaaataacgaaacttgggctggtagcattcaaataaataataaaaaa
agtgctggtgtgaaaaaaaatcaaatgtatcaaattaaatttgaccctaactgggaagct
tatatggtcaatatcccttttgatagcactatttcaggaaacaaaatcagtgaagtacag
tataaaacaaatttaaacgacgcttttcgaacatttgatggagcgcttattaaaaataat
aaccaaatgtatcgactagatgcaaaagcagttgggcttgaagaaggggaatatttcaca
gaagtaaaagcaaatgtgggagattttgcgcctggatatcagagcacagaagcttcggct
acttatcgttggaactctactgcttcatacggtaaaatcaagccaggcgttacatctgtc
caatatgaaggcgcaatatgggacgcggatgatgagtccaatacgaaagtatctggcata
tcaacctataaagtttcaagtgcagaaagtacagtagcaaatggtacagcagctttctat
aataaagctggtacaaaggtgaaaacagctagcgcaggagaaacaattaacacaaaagcg
acattagtgttacatgattacccttatggaacaagaacggtcctcaatgatccagaagtt
tatttacatgctctagaaggtacaacaattcaaccttcttccattaaactaacggatcaa
ggtggaaaagatgttaatttcacagttgaacaagaaacggcaaataatggagataaagta
tacgccttaaaaacaacggatgtgtcagtgggagtatatgttggctatccaactaaacat
aaatatctaaatatcagttacgatacaacgtttgatgtaactctaaataaaagtattaat
atggatgcgcaacaggtcattgcatggggagcaaatgttactccggcaacgggaactaat
actttttcggatttagggctagatgtaaataaaaatggcagagacaatgataaattactt
tctgtcaacagtagtactttaagtattccaaaacaagacacagttactgtagaaaccttc
ttaagcgtggctggagaaggcgataaagcagcttatatggaaggagaagacagtacagtt
tcctacttctcaccaggaacagatgctgattatacagtcaagattacgaacacttctagt
gggaacgcaagtacatttgagctttatatcccaattccaaaaactggtcaagacttcgga
tctaaattccaaagcgagccgttcaagtgggatatgaaactaaatggagcgctacctgtt
agtgcagaacaacaagaccaattcgatgtaagttacgcaacaaccgcaacaggagacaat
tatgattccaccgacatatactcaaatactgttgctgattatgaaaaagtaaatatggtt
cgaatcaaagttaaaacacaaattaatgcaggcgaaacacaaaccttcaaagtgccactt
aaagtagatgaaacatttgattcagcaacagaaggcaacaaaattggtgaacgtgatatt
tacaacccatattaccgtgtaattactaatacgttcgctggttcattatctggaacaaaa
gttggtgctgaactagtaattggtgaagtagcaggtatgctatttaatgataaagatgtt
aacggttcgtatgaaaaagataaaggcgatgaaccattagcgaatgaaacagttgagtta
tacaaatggaatgtatccacatctgaatatgaacccgccaaagtaggcgacaaaaatata
actgccacaacagatagcaatggtaaatacagttttgattatagtgatggtgttggttat
ggtaattatgcagtgaaattcccagacaaagctggctaccaatatacattaaaaaatatt
ggtaaagatacttctctaaatagtgatgtaccttacagcggagcagatagaggttgggcg
aaacaaatcaatccaactttaccaagctcacaatatacaaatgcaggttattatgcttat
aatccgacgcaagatttaaaagttaacctagatgaaaaacaagttcaaatgggtcgtagt
ttagaaatcactttaccaaaagtagcctcaacgactggacaagctgccgaagataccatt
gaaccaagcttctttaaaaatattaaagcaacaacaaatggctacaaatggactgttgca
gatacaaaagtggcaacagtacaaacgctagcagatggttcagcagctgtagtcggcgtt
tccacaaataataaaacaattgatgtaacagatttaacgattaccatccaagatattttt
ggaacagaaaaaagttccaaagctccagtatatgttactggaacagatggaacggttgcg
caacaagacggttacaccatgggtgcgactgacttttcattggaatataaagaagccact
gatttaacgaaagcacaggcactaactcttgcgaaaacagccgcttttgaagaagtaaaa
gacggcgttaattcaagcgcagaagatcgtttagaccaagttcaagtaaaccaaacacaa
ttagacgccataaaaaatggttctaatcaaggtggcgtgtatccattaacttacacgata
acaaaagatagcaaaacggtttcagttactattcaagtaactgtagcaaaagatttaacc
gcagtgaacgcacatgattctactatttatttaggagacacatgggatgcggaggacaac
tttgatagtgcagcaaataaagaaggcgacactaatgtagcgtttagcgatgtaacagtt
acaggaagcgtgaataccgcagtagctggttcgtatccagtaacttacacatataatggt
gtctctaaaaaaattaatgttactgtcaaagataaattaacagcagttaacgcacatgat
tccacaatctatacaggtgacacatggaatgcgggagacaactttgatagtgcgctagat
aaagatggtaattctgtcgcttttgctgatattacagtgacaggaactgttaatacaaat
caagctggtactaataccatcacttatagctatgatggagtttcgaaaactattacagtt
accgtcttagaaaataaggaaggtatcagtgctcatgactctactatttatgtaggagat
gcatggaatgccaaagataacttcgatagtgcttttgataaagatggaaacgcggttgac
ctagaagacgtaacagtcacagaaaaaccaactgtagatacgacaaaagcaggtgcttac
gaagtcacttacaagtatggaaaagtatcgaaaaaaatcactttaacagtgaaagctaaa
ttaacagcagtcaacgcacatgattccgcgatttacatcggagatacgtggagtgcagaa
gataactttgacagtgcgctggataaagatggcaattccgtcgcttttgctgatatcgaa
gttaaaggaaccgttgatacagacaaagttggaacatatccagtcacgtacacatatgac
ggtgtctcaaaaacaattaatatccaagtaaaagacatcttaacagcagtgaacgcgcat
gattctgaaatttatataggggacaactggaatgccaaagataattttgacagtgccaaa
gataaagacggaaatacagtaaattggaaagacatcaatgtttcggaaaatccagcagtt
gatttagaaacagttggtgtttaccaagtgacttatagttatggcggtgtttcgaagaca
attaatctgactgtccatccaagaaaaacaagtttagaagttcatgactccacaatgtat
acaggagataaatggaaagcagaagacaactttgataatgctacagataaaaaaggtgac
caaattcctttcaaagatgtcactgtaaccggacaagttgattctaaaacagcaggcacg
tatgaaataacctatatctatgatggattgaaaaaagtagcacgaattactgtaatccaa
aatcaagcacaaatcactgtaaaagatagcgtcattccatatggcggaaaatgggaagca
gaagctaactttataggtgcgacaaaccgagatggtgtagcaattcctttctccaaaatt
aaggtagatggtacagtagatgtaaataaagctggtacgtacaaagtgatttacacgtat
gatccaaatgaaggaacagtagatgcaggtaagaaacaactttctgtcacagcaaatatt
caagtagaagcagaaattgtaaaacctataaaacctataaaacctataaaacctataaaa
ccagttgatccatcaaaaccaatagatcctaaaaaaccagtaaaatcatcaaatccaaca
aaaccatcaacagaaaaaacaccattaaaagtagttgataacaagcaacatacaagaaca
tatgaagaagcaaaaccattaccaaaaacaggtgaccaaacaaatacttgggtaatatgg
acaggcgtatgcttgctaagtatgagcttgcttctatgggtggtaatgagaggaagaaag
aaaaactatcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
