Listeria monocytogenes EGD-e (serotype 1/2a): lmo2178
Help
Entry
lmo2178 CDS
T00066
Name
(RefSeq) peptidoglycan binding protein
Organism
lmo
Listeria monocytogenes EGD-e (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Collagen_bind
SdrD_B
CarboxypepD_reg
MucBP
Cupredoxin_1
Big_8
Gram_pos_anchor
SSSPR-51
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
984662
NCBI-ProteinID:
NP_465702
Pasteur:
LMO02178
UniProt:
Q8Y591
LinkDB
All DBs
Position
complement(2259753..2264591)
Genome browser
AA seq
1612 aa
AA seq
DB search
MKNIRHWKKLVIAMVIGLLVFQNVSPVLATMTDDETANTTLKIIKEDKDTKEKINGSTFE
IKNKETSETSDLTISANGEATMDSLLPGDYLVKEKVAAKGYALDEKEYSVTLTEKEEVIT
SVSAKVQEETTKEAATPVKKATQNANLKAAITDNIFNKVTLKDGNGDEINTSDRIQNGSG
VVLNMNFAFSGKNYKAGDTFTTVLPDAFNFGNKNLSGNFLPSTEAEWSLDVTTRELTITF
LKDGIQEGDYDVNISTAFKVFTSTEETIQEVVFKTAGKDTIYQIEVVPVVNYPTTVAITA
NPGVVNPTKGQVDAKFNLTKEKDAKGELKLTDYTSGGTTTIDKDSIKVYSSDVSAGGTFI
GTKKLLVEGTDYTLTYSATSLTVTLNGGLAGKGYQVTYDRTINKPSDSLSYMSTQAYTVG
DAGTLSSNSAYVYLTMTNYKHLEKKATYNGSTQSIDWKINFNFDQDEISPSTVLTDVLAD
NDVEYVADSLKIKRVTFNATNGSPIVGSDASSDWTTSAISANGNFNLTYKNTNTNAYEIT
YSTKITDFSDRKIKNEITDENGVSADATIAIQPDLLKKEAGTIDYFNNTMTWKITANSDR
IKMGNLNITDEFSTGVKALKSYTVRAYTDNTNSVLLTEGKDYTIDKDVTPAGFYIQLIGD
YASTDKKIVVDFVTDIDLSDVTKTIDNKASISYYDGGIIKYVDEVTASMTPDPGMMTNGG
KYGSYNSTTGNIDWIVSVNAMAKNYDNLIFDDAIPTGLTYVEGSLQYRNVASTSEMMNLY
IPLNSVGTVAKTGDKNYPTKVDTTGNKLHLEFANLENSRVFIKYSTKPNENWYFYSYVQN
TAKVSDNGVGEKSYSYQAYASKLFNAMTKTATIDPSFDNKVNWIVTLNNISADRPINNPT
ITDTMKTGTTGAQVVKSSFKVMNETTGEDIDSKYYDITYTDNNFTIQFKDYKATAPIKVT
YSTISLMSGLVSNTATTASPDYGSLPMTYKSRTTSISPAFTIGSGSGTATIGSLEITKVD
KKDNSKKLTGAKFQLYTLEGDKAGQEATTDSDGKIVMDGLQSGKYKLVETEAPTGYTISD
EYKDGKEITVTADIATSVTIENTEQTGSVVLLKEDSATKDAIAGAEFELQNADGTKVADN
LVSNADGKIEVTDLAPGDYQFVETKAPTGYVLDGAPTKFTVEFNQEAAVIVTKENTAKTG
SVVLTKEDSVSKATLSGAEFELQNATGTKVKDNLTTNADGKLEVTDLAPGDYKFVETKAP
TGYELDATPVTFTIEFNQATAVNVTKENVAKTGSVVLTKLDSKSRSNLAGAEFELQTKLG
VSLKDKVVTEANGQLQIDNLAPGDYQLVETKAPTGYDLDATPVEFTIEFNQKAPIQVTKT
NTMSTGSVVLTKTDGETKALLANATFKLVDEDNNVTENLTTDASGKLEITNLAPGDYQLI
ETKAPAGYELDTVPVDVKITFDQKETLQVTKTNLKTVVSGKVIAEFVDTKGNVLAEKEIH
TGIVGDKYATKAKDIKGYKLTKQPTNKEGVFKETEQKVTFVYEKNKAPIVVNPDKPVTPV
KPTKPVDPAKKPTVKTSLPSTGDESPYGIIFTGLFASFMGLFLLRKSKKIND
NT seq
4839 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaatatcagacactggaagaagctagttattgcaatggttataggattactagta
ttccaaaacgtttcacctgtactagctacaatgacagacgatgaaacagcaaacacaaca
ttaaaaataatcaaagaagataaagatacaaaagaaaaaatcaatggttctacctttgag
ataaagaataaagaaacaagtgaaacaagtgatttaaccatcagtgcaaatggtgaagcg
actatggattctcttttacctggtgattatctagttaaagaaaaagttgcagcaaaaggc
tacgcgctagatgaaaaagaatatagtgtaactttaacagaaaaagaagaagtgattact
tctgtttcagcgaaagtgcaagaagaaacaacaaaagaagcagcaacaccggttaaaaaa
gcaacacaaaatgcaaatctaaaagctgctattacagacaatattttcaacaaagtaaca
ctgaaagacggcaatggcgatgaaatcaatacttcggaccgaattcaaaatggtagcgga
gttgtgcttaacatgaactttgcattttcagggaaaaattataaagcgggagatacattt
actaccgttttaccagatgctttcaactttggaaataaaaatttaagtgggaacttcttg
ccttcaacagaagcagaatggtcacttgatgttacaacgcgtgaacttacgattactttc
ttaaaagatggtattcaagaaggcgattatgatgtgaatatcagtaccgcttttaaagta
tttacatcaacagaagaaacgatacaagaagttgttttcaagacagctgggaaagatact
atttatcaaattgaagttgtaccagtagttaactatccaactactgtagcaattacagca
aatcctggggtagtgaatccaactaaagggcaagtggatgccaagttcaacttaacaaaa
gaaaaagatgctaaaggtgagctgaaacttactgattatacttccggtggcacaacaact
attgataaagatagcatcaaagtatattcgagtgatgttagtgctgggggaaccttcatt
ggtacgaaaaaattacttgtagaaggcacggactatacgttaacttattccgcaacttct
ctaactgttacgttaaacggtgggcttgctgggaaaggctaccaagtaacatatgaccgt
acaatcaataaaccaagtgattcactttcttacatgtctacacaagcttacacagtaggc
gatgcagggacattatcaagcaactctgcttatgtttacctgacgatgactaattataag
catctggagaaaaaagctacttacaacggctcaacacaaagtattgattggaaaattaac
tttaactttgatcaagacgaaatatctccttcaacagtgcttaccgatgttttagcggat
aacgatgtcgaatatgtagcagattcacttaaaattaaacgagtaacttttaacgcaact
aacgggtcgccaatcgttggaagtgacgcttcaagtgattggacaacctcagcaatctca
gcaaatgggaattttaatttaacgtataaaaacactaataccaacgcatatgaaatcact
tattctacgaaaatcaccgactttagtgatcgtaaaattaaaaatgaaattacagatgaa
aatggtgtttccgctgacgcaacgatcgcgattcaaccagatttactgaaaaaagaagct
ggaacaattgactattttaataacacgatgacatggaaaattactgctaactccgacaga
attaagatggggaatcttaatattacggatgaattttctactggggtaaaagccctcaag
agttacactgtccgcgcctatacagataataccaatagcgtattactaacagaaggcaaa
gattatacgattgataaagatgtgacgccagctggtttttatatccaacttatcggcgat
tatgcttcgacagacaaaaaaattgttgttgatttcgtcacagatattgacctttctgat
gtaacaaaaacaattgataataaagcatccatttcttattacgatggcgggattatcaag
tatgttgatgaggtaactgcttcaatgacaccagatccaggcatgatgacaaatggtggt
aagtacggatcatacaattcaactacggggaatatcgattggattgtatctgtaaatgct
atggcgaaaaactacgacaacttgatttttgacgatgctattccaactggcttaacatac
gtagaaggttcactacaatatcgtaatgtggcttccacaagtgagatgatgaatctatat
atcccacttaactctgttggaacagtagccaaaacaggtgacaaaaactatccaacaaaa
gtcgatacaactgggaataaattacatttagaatttgctaacttggagaattcacgcgta
tttattaaatacagtaccaaaccaaacgaaaactggtatttctactcctacgtacaaaac
actgcgaaggtgagcgataatggagtaggcgaaaaatcatatagttaccaagcatacgca
agcaaactttttaatgcgatgaccaaaacagctacgatcgatccatcttttgataataaa
gttaactggattgtaacacttaacaacatctcagcagatcgtcctattaacaacccaaca
attacagatacaatgaaaacaggaacaactggagcacaagtagtaaaaagtagctttaaa
gtaatgaatgaaacgacaggcgaagatattgactcaaaatattatgacatcacttacaca
gacaataatttcactatccaattcaaagactataaagcaactgcaccaattaaagtaacc
tatagtacaatcagcttaatgtccgggctagttagtaacacagcgacaactgcttctcct
gactacggtagtttaccaatgacgtataaatcaagaacaacaagcatatcgccagccttc
actattggtagtggtagcgggacggcgacaattggttcacttgaaattaccaaagttgat
aaaaaggataattcaaaaaaactaacaggagccaaattccagctttatacgcttgaagga
gacaaagcagggcaagaggcaacaacagattcggacgggaaaatcgttatggatggtctt
caatccggaaaatataaacttgttgaaacagaagcaccaacaggatatacaattagtgat
gaatacaaagatggtaaagaaatcacggttaccgccgatatagcgacgagtgtgactatt
gaaaacacagaacaaactggtagcgtagttcttttaaaagaagatagcgcaacaaaagat
gctatcgcaggagcagaattcgaattgcaaaatgcagacggtacaaaagttgctgataac
ttagtatctaatgcagatggtaaaatcgaagtaacggacttagcgccaggcgattaccaa
tttgtagaaacaaaagcgccaactggctatgttttggatggggcgccaacgaaatttacg
gttgaatttaaccaagaagcggctgtaattgttacaaaagaaaacacagcgaaaacgggt
agtgtagttttaacgaaagaagatagtgtttcaaaagctactttatcaggagcagaattt
gaattacaaaatgccactggaactaaagtaaaagataatttaacaacgaatgcggatggt
aagctagaagtaacagatttagcgccaggtgattacaagttcgttgaaacaaaagcacca
acaggctatgagttggacgcaacaccggttacctttaccatcgaatttaaccaagcaact
gcagtaaatgtaactaaagaaaatgttgcgaaaactggtagtgtggtcttaactaagcta
gatagtaaatcaagaagtaatttagctggtgcagaatttgaactacaaacaaaacttggg
gtaagtttgaaagacaaagtagtgacagaagcaaatggtcaactgcaaattgataacttg
gcaccaggtgattatcaattagtagaaacgaaagctccaacaggttatgatttagatgct
acaccagttgaattcaccatcgagttcaaccaaaaagcaccaattcaagtgacaaaaaca
aacacgatgtctactggatctgttgtactaactaaaacagatggtgagacgaaagcactt
cttgcaaatgcaacgttcaaattagtagatgaagataataatgttacagaaaacttaact
acggatgcatctgggaaactagaaataactaatttagcacctggagattatcaattgatt
gaaacaaaagcaccagcaggctatgaattagatacagttcctgttgatgtgaaaatcact
ttcgatcaaaaagaaacgttgcaagtaacaaaaacgaacctaaaaacagttgtgagcgga
aaagtcatcgcagaatttgttgacacaaaaggcaatgtattagcagagaaagaaattcac
actggcatcgttggcgataaatatgcaacgaaagcaaaagatatcaaaggttataaatta
acaaaacaacctacgaacaaagagggcgtattcaaagaaacggaacaaaaagtaaccttt
gtatacgagaaaaacaaagcgccaatcgtggtaaatccagataaaccagtcacaccggta
aaaccaactaaaccggtagacccggcgaagaaacctacagtaaaaacaagtcttccttca
acaggagatgagtctccatatggaataatctttactggattattcgctagcttcatggga
ctattcttattgagaaaatcaaaaaaaataaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
