Listeria monocytogenes 6179 (serotype 1/2a): LM6179_01790
Help
Entry
LM6179_01790 CDS
T03159
Name
(GenBank) tape measure protein
Organism
lmoq
Listeria monocytogenes 6179 (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TMP_3
DUF3175
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USB78476
LinkDB
All DBs
Position
complement(2029367..2034751)
Genome browser
AA seq
1794 aa
AA seq
DB search
MSDGSVVIEISLDDTKADKQLDTFEKDLAKAGTNAGAALDKAYREAVSDIASQSKRLKDT
FVNAFKSMGNAGSNALKASLSFMRELPANVGSALSKLASTVKTGFVNAAKASITAVKNLG
TSIKNTAVNIKNGFFSIAKTVQSSIMSAVKISINVIKSIPSAIKSAGSSIKSALVSSLHA
AKTAAISFAQTTVKVIKSIPGAAKTAATAVKNSFVVAYKAVVVAAYMSVKGTISAVKAIP
SVAKSAALAISSAMKTAFSAVVSAAKTTGTTVKTALTTGFSAIKSGAKTAGQVGMSALKG
LGNVAKSTGSLIKNGLVSGFNAARSAAKGAGAGMREALKNSVEKPAEQARFSILRLAAAF
GLIAATKNVVGSAIGRVDTIDTATKSLTVLTGSAKDAQLVMTDLTAAIDGTPIALDAVAL
GAKKMVAAGMQAANVKPVFTAIADAAYGVGNGSESIDQMTDAISALQASGVAYSDDINRL
VDAGVPAWQILANSTGKSVGEMKKYVSEGSLESTKAIAMLTKGIEEGTTGMAGNTAKMAG
LAKTAGNTISGSFANMKTAAVKSLANIAENLKGPIIQALDVAKNAFKQFAAVTASPEFQK
KLSDMIQKIKELIPVMVKLAPTILKVVSAMLALQAVSSVYVAFSNIGKMFVPLKNGLFVI
ATGFMKLAKTIRHPITAIKNLAFAIKYFIVTSGAVIAIVGAVIAVLYGMYAAFKENTANI
KGFLSGMWEAVKNSFGKIVDVFKQIVSALKPVGSGFKDVLKYIGVGVWVAFGIVLATVVD
IIQVLARIVLVAIKGLQGLYYAIKAAFQALSGDLKGAKKSLEQSKDAFVDAGSTIKDAFN
KDNYALTGTIESLKEMGGEAEKTGTKAETSNKKISSSLKLVESTAKQTEATVSKSNQAID
TMLEGGIDQYGNKLSEKTKSFLNSAKDLYSKYQESTQKSQEKYTSAMEKAQSLEGEKRKK
AIADANKTLVDETTKNNSTLLALQSDYSNMLKTNRWADGQELTAQQKKFLQQQTTDIQTE
LAKQNQLYVEANLLRLEQGKSLNEKERNTSLEVQKSLYEEKKKAVETGEKSLADLKKKKA
DASTETEKANYQIQIDEQTKKNQTLSTNLKNWASEMNSIIANGGTLNAQTFANGLSQLGN
ISDEQLSALWQNFVSTSTSIDNTLAGLAGIMGQRGGEGVQAFVTALQSGDYTTAALNINN
DVLSTISSLPNGMFLNGENGKNQFLTAIKSGDFQGAGKYLVDGVKMGTDSIDSEMKTKGQ
TGGQNFADGVKGKEGAAKSAGSAVKNKAKEGATDPNAFKAVGSKDSAGFNNGVMGGKGGA
YSAGSSVGNSAKSGAGSVDSSGVGSDFASGYVNGILSGMGAVGRAAASLANKALAAVQKK
QDSHSPAKKSKKLGGDFGSGYSLGIASKTKAVNKAASNLVAGALGTESQIKKLSSTLKDK
ISSAIDAGLHSKNKSSGQLKQAKALNSIEGYIVQQTNRLAATAKKRDKVVAQLKAANTKM
ADLTKQSKEYAASITEKMQSYGSISNVDPENPQSIQAEMQKRLKEIKAFQANVEKLRKKG
VSKDIINDILEAGVENGSSYAQALAKSDAKTIKAINSTQNQINSASKSMGNTAANAMYSA
GINAARGLINGLNSQKKQLEKTAKSIANTITNSVKKALKIHSPSRVAIELGKFFTGGLGN
GVLAGAKGAVQSTNKMVDKVVNAASNMTVPAINLPKISAEKALGLKSVDLNRTITVKTII
DNKTKESSNADLIKAIQQSGDRPINFYVDGKDLADNTNNHLGSSTSLAFYGKGL
NT seq
5385 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatggatcagtagtaattgagattagtttagacgatacaaaagcagacaaacag
cttgatacgttcgaaaaagatttggcaaaagcggggactaacgcgggggcggcattagat
aaagcatacagagaagcggtatctgatattgcaagtcaatcaaaacgattaaaagacacg
tttgtaaatgcgtttaaatcgatgggaaatgctggatcaaatgctttaaaagctagttta
agctttatgcgtgaattgcctgcaaatgttggttctgcattatccaaactcgcctcaact
gtcaaaactgggttcgtaaacgctgctaaagcatctattacagcggttaaaaatcttgga
acgagtatcaaaaacacagcagttaatatcaaaaacggcttcttttcaattgctaagaca
gtgcaaagtagtattatgtcagctgttaaaatatcaattaatgtcattaaatccatccct
agcgctattaaaagtgctggaagtagtattaaatcagcattagtaagtagtttgcatgca
gctaaaacggctgctatttcttttgcccaaacaactgtaaaagttattaaaagtattcca
ggagcagctaaaacagcggctacagcagtgaaaaacagtttcgtagtagcttacaaagcg
gtggtagttgctgcttatatgagcgtaaaaggaactattagcgctgtgaaagctattcct
tccgttgctaagtcagcagcgttggctataagtagcgcaatgaaaacagcgtttagcgca
gtagtaagtgcagcgaaaacgacaggaacaaccgtaaaaacagcattaacaactggtttt
agtgcaattaaatctggagcgaaaacagctggacaagttgggatgtcagcacttaaaggc
ctaggaaatgtcgctaaaagtacgggttcactaattaaaaacggtttagtaagcggattt
aacgcagctaggtcagcagcgaaaggcgccggcgctggaatgcgtgaagcgcttaaaaat
tcagtcgaaaaaccagcggaacaagctcgttttagtattctcagattagcggcagcattc
ggattaattgcagcaacaaaaaacgtggtaggtagcgcaatcggtcgtgttgatacgatt
gatacagcgactaaatcactaacagtccttactggttcggcaaaagatgcgcagttagtt
atgacagacctaacagcagctattgacggcacgccaattgcgctcgatgctgtcgcatta
ggcgctaagaaaatggtagccgctggtatgcaagccgcaaatgtaaaacctgtattcact
gctattgctgatgcggcgtacggcgttggtaacggttcggaatcaatagaccagatgaca
gatgctatttcagctttacaagcatctggtgtcgcttattccgatgatattaacagatta
gtagacgccggtgttccggcttggcaaattttagcaaactcgacaggaaaaagcgttgga
gaaatgaaaaaatatgtttctgaaggatcattggaatcaactaaagctattgcaatgcta
acgaaaggtatcgaagaaggtactacaggaatggctggtaatactgcaaaaatggcggga
cttgcaaaaacagcaggcaatactattagcgggtcatttgcaaacatgaaaacagcagca
gttaaaagcttggccaacattgcagaaaatttaaaaggcccgattattcaagcgctagat
gttgctaaaaacgcatttaaacaatttgcagcggtaaccgctagtccagaatttcagaaa
aagctttctgatatgattcagaaaataaaagaattaatacctgttatggtaaagcttgcc
ccaactatcttgaaagtagtaagcgctatgttggctttgcaagctgtttctagtgtatat
gtagctttttcaaatatagggaaaatgtttgttcctttgaagaacggtctttttgttatt
gctacaggtttcatgaaactagcaaaaactattagacaccctatcactgctataaaaaac
ctagcctttgcaataaaatattttattgtaacttctggcgcagtaatagctattgtaggt
gcagtaattgcagttctatatggcatgtatgcagcttttaaagaaaatacagcaaatatt
aaaggctttctatctggcatgtgggaagcggtgaaaaactctttcggcaagatagtagat
gtttttaaacaaatagtatcggcgttgaagcctgtcggaagcggatttaaagatgttcta
aaatatattggtgttggcgtttgggtcgcttttggtattgtcttagcaacagtcgtagat
attattcaggtactggctagaattgttctggttgcgattaaaggtttacaggggctttat
tatgctattaaagcggcgtttcaagcactcagtggtgacttaaagggggctaagaaaagc
cttgagcagtcaaaagatgcttttgtagatgctggttctacaattaaagacgcattcaat
aaagataattatgccctaactgggacaattgaatcgctcaaagaaatgggaggagaagca
gaaaagactggaacaaaagcggaaacgtcgaataaaaaaatatctagtagcttgaaatta
gttgaatcaacagcaaagcagacagaagcaactgtttcaaaatcaaatcaagctatcgac
actatgttggaaggtggaattgatcaatacggaaataaacttagcgaaaaaactaagtca
ttcttaaattctgctaaagacctatatagcaagtatcaagagtcaacgcagaaatcacaa
gaaaaatacacatctgctatggaaaaagcgcaaagcttagaaggcgaaaaacgcaagaaa
gcaattgccgatgcaaataaaacactggtagacgaaacgacaaaaaataatagcacatta
ctagctttacaaagcgattactctaatatgctaaaaacaaatcgttgggccgatgggcaa
gagttaacagctcagcagaagaagtttttacaacaacaaactactgatattcaaacagaa
ttagcgaaacaaaatcagctatatgttgaagcaaatttactacgactagaacaaggtaaa
agcttaaatgaaaaggaaagaaatacgagcttagaagttcaaaagagcttatatgaagaa
aagaaaaaagctgttgaaactggcgagaaatcgcttgctgatttgaaaaagaaaaaagcg
gacgcttcaactgaaaccgaaaaagcgaactatcaaatccaaatcgacgaacaaacaaag
aaaaatcaaacattgtctactaaccttaaaaattgggcatctgaaatgaactcaattatt
gcgaatggcggaactttaaacgcacaaacattcgcaaacggtttgtctcagcttggaaat
attagtgatgaacagttatccgctttatggcaaaactttgtttctacaagcacatcaatt
gataatacgttagcaggattagctggcataatgggtcagcgtggcggagaaggagtacaa
gcttttgtcacagcgcttcaaagcggtgattatactacagcagctttaaatattaataat
gatgttctaagtactatttctagcttaccaaacggcatgtttttgaatggggaaaacgga
aaaaatcaatttttaactgctatcaaatccggcgattttcagggagctggcaaatattta
gtcgatggcgtaaaaatgggcactgactctattgactcggaaatgaaaacaaaaggtcaa
actggcggacagaactttgcggacggtgtaaaaggtaaagaaggcgctgctaaatcagct
ggttcagcagttaaaaataaagcaaaagaaggcgcgacagacccgaacgcattcaaagca
gttggttcaaaagacagcgcgggctttaacaatggagttatgggaggaaaaggcggcgct
tattcagctgggtcaagcgtggggaattctgctaaatctggtgctggttcggttgattct
agtggagttggttctgattttgcttctggatacgtaaacggcattttgagtggtatgggc
gcggttggtagagcggctgcttctttggcaaataaagcactagcggcagttcagaaaaaa
caagactcgcattcacctgctaaaaaatctaaaaaattaggtggagacttcggctctggt
tactcattaggtattgccagcaagacgaaagcagtcaataaagccgcaagtaatctcgtt
gctggggcgcttggaactgaatcgcaaatcaaaaaactatctagtacgttgaaagacaaa
atatcatcagcgattgacgcgggattgcattctaagaataagagcagtggccaactcaaa
caagctaaggccctgaatagtattgaaggttacattgttcaacaaacaaacagattagca
gcgacagctaagaaacgtgataaagtagtcgctcaattaaaagctgctaatactaaaatg
gcggacttgacgaagcagagtaaagagtatgcagcttcaattactgaaaaaatgcaaagt
tatggatctattagcaatgtagacccagaaaatccgcaatcaatccaagcagaaatgcag
aaacgcttaaaagaaattaaagcttttcaagcaaatgttgaaaaattgcgtaaaaaaggt
gttagcaaagacattataaacgacattctggaggcgggagtagaaaatggttcatcttat
gcgcaagctcttgctaagtctgacgctaaaactatcaaagcgattaatagcacgcagaat
caaatcaattcagcatctaagtcaatgggaaacacagcggctaatgcgatgtattctgct
ggtattaacgcagcaagaggtttaataaacggactaaacagtcagaaaaaacaactagaa
aaaacagctaagagcattgctaacacaatcactaattcagtgaaaaaggcgcttaaaatt
cattctccttcacgtgtggccatcgaactcggaaaattcttcacgggaggccttggaaat
ggagtcttagctggcgctaaaggagctgttcaatcaactaacaaaatggttgataaagta
gtaaacgccgcttctaatatgacggtaccggctatcaatctcccgaaaatctctgcagaa
aaagcattgggcctaaaaagcgtagatttaaacagaactatcaccgtcaaaacaattatt
gacaacaaaacaaaagagtctagcaacgctgatttaatcaaagctattcaacaatctggc
gatagacctattaacttttatgttgacggcaaggatcttgcagataatacaaataatcac
ttaggaagttctacatcactagcattctatgggaaggggctataa
DBGET
integrated database retrieval system