Listeria monocytogenes 6179 (serotype 1/2a): LM6179_02417
Help
Entry
LM6179_02417 CDS
T03159
Symbol
lapB
Name
(GenBank) surface-anchored adhesin LapB
Organism
lmoq
Listeria monocytogenes 6179 (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Big_3_4
Bact_surface_Ig-like
PKD
Big_13
PKD_4
DUF4625
HYR
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USB80639
LinkDB
All DBs
Position
complement(1241081..1246216)
Genome browser
AA seq
1711 aa
AA seq
DB search
MKSKFFIGMMTFLLSLICLTGMKAEAKSVGDISPDDISPEISDNRFQSAEGKVLPNFEVD
MSISDQNNGKLSIDEDFELTSDGDIILIGTVQGQYIQGTPILNENGQLNKIPNRDQGIIM
RVDRTTKKVEWARVVNYEDGNYNSQYAADKWISSYKSITTNSSKSTFYVGGEVVNYYGDS
GGGSTLIVKSIDANGNFQIAHKSYVSYGIPSRSDLTYAYFMDIQMEGNTLTMSASARYAA
QGKQFIRYTLEPASLSITKNEFNPLDNTFWAKYQRTDVLKVDNKGLMAYNADVNGINQLK
MSIRESENNYKEITLFDSVPEILANSSPYIFMEDRGDGNVFVVMSTPTTWYIALVNIASE
QVVETKKMTMNSSTTLNSVIYSEGKGLLLGGSTHAEESIFGSEPLNKNNGYYLALGNDLN
VTDSQILRTNQHNSLTTIINGVGNKVDGFFSYDGLNNDGYIQNVEYPNTYDVNPNGAMIF
AEFNLQPAPVLDTGNPILAFYQGERRADFDELEGVKAYSGIDSSDVTKSITKNTFDLYTV
GVQQQLYQIEYLPGSGNKTTGTRNVQLIHPLETPKLEKSYADSHGAFKVGEVVPANAIHA
FNGLDSANNVTYVVTAVDDEKITVDASIKRTEGTKTAVINKEITLMTSTADETAVIDVTS
VALVAGKYTSLTDVRNEGHFHIYAETMDSVSIDPKYVKLTEDPENPVDWNAPGVYYVTAS
LDPASGYTAKDVKVSVAVVDVGSPKVISVNMKPYNPTTALVVAEDDINGAGVYKINWAIK
DANGLIIQQGVEESGATIRVQTPVPIDLSTLNDGNYTLSVSAADRIGHTSEASEKAFTVD
RQAPVVTADDKITYEINTKKTEEEFLNDVNVKTEAGAVIKTNFDTMVRMDSPGDYTVLVE
ATDAAGNQSDPIYVIVTVEDTVAPIISADEAISYNQGNIRTEAQFLTDIHATTDEPATIT
SDFADQVKFDTPGVYAVTLKANDISGNQAIPRTVNVTIKDVTAPVITADEAIIYEKGITK
SATDFLTDIHATTNDGSAITSNFATVVDLNTPGDYDVTLSSTDTGGNISDPVTITVTVRD
TTPPVITADTTITYEKGTTKTAAAFLTDVNATTNDGSAVTSNFNPISLKQVGTYQVTLSS
VDENGNYALPVKVTVVVQDTQKPVISSSATSITYERGEKKQETGFFLDLAIKTDDGTPVT
SDFDTAVNLDTAGTYTVTLNSEDESGNKADPVTITVTVADTEKPIITADTTITYAKGTTK
TVAQFLTDIHATTNDGSTIISNFDPTVLAQEGTYTVVLNAKDESNNEADPVTVTITVVDT
KGPIINALNAITYERTINKNEADFLADIEATTDDGSTITTDFNSKDLDTVGTYIVTLNAE
DASGNKATPVKVTMKVEDTIPPIITADQSITYERGITKTEQAFYTDIKAATSDNSPISSD
FSKIDLTKTGNYEVLLRATDQSGNKALPLKINVLVQDTIAPVIKTTSREITAERGTPMTE
QQLLAKIGANTDDGSKITTDYNPAIVNTSGEYLVHLYAVDAAGNQAIPVEITIHVKDTTA
PIITADKKISYPVGTVKTVTGFLQDIHAATDDGSKIMTDFDPNMLKTPGKYTIHLNAVDA
DGNKAKTIDVSLTVEEKMTPPKPPTPDDGGNNTNGSNGTNGSNTDITVNPTKQNTTATNE
SIPALGDTKSTIPVIVGMFLLATSLVLIRRK
NT seq
5136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaattttttataggcatgatgacttttttgctatcattaatttgtcttact
ggaatgaaagcagaagcaaaatcggtgggagatatttctccagatgatatttcaccggag
atttcagataatcgctttcaatctgcagaagggaaagttttgcctaattttgaggtggat
atgtcgattagtgatcaaaataacgggaaattatcgattgatgaggattttgagttaacc
tcagatggcgatattattttgattggaacagtgcaaggtcaatacatacaaggaaccccc
attttaaatgaaaatgggcaattaaataaaattccaaaccgtgatcaagggattattatg
cgtgtcgatcgaaccacaaaaaaagtggagtgggcacgtgttgttaactatgaggacggt
aattacaactcacaatacgcagctgacaaatggataagttcatataaatcgattacaacc
aactcgagtaaatcgactttttatgtaggtggcgaagtagtcaattactacggagactca
ggtggaggtagtactttaattgtaaaatcaattgatgcaaatggtaactttcaaatagct
cataaatcttatgttagttacggtattccatcaagatcagatctaacatatgcctatttt
atggatattcaaatggaaggtaatacattaaccatgtcagcttcagctcgttatgctgcg
caaggtaaacagtttattcgttatactttagaaccagcttcattatcgattaccaaaaat
gaatttaacccattagataatactttctgggccaaatatcaacggacagatgtccttaaa
gtagataataaaggtctgatggcttataacgcggatgtaaacggtatcaaccaacttaaa
atgtccattcgtgaatcagaaaataattataaagaaattacattgtttgattctgttcct
gaaattttagcaaactcttccccttatatatttatggaagatcgtggcgatgggaatgtg
tttgtggtcatgtcaacacccactacctggtatatcgcgcttgttaatatcgcgtcagaa
caagtagttgagactaaaaaaatgacgatgaactcctccacgacgctaaatagtgtgatt
tacagtgaaggaaaaggtctgcttttaggtggtagtacacacgcggaagaaagcattttt
ggtagtgagccattaaacaaaaataacggatattatttagcgcttggaaatgatttgaac
gtaacggatagccagattttaagaacgaatcaacataattcattgacaactattattaat
ggcgtcggcaataaagtagatggtttctttagctacgatggattaaataatgatggatat
atccaaaatgtagaatatcctaacacctatgatgtgaacccgaatggggcgatgatattt
gcagaatttaatttgcaaccagctccagtactagatacaggtaatccaatcttagcattt
taccaaggggaacgtcgtgcagattttgatgaactagaaggggtgaaagcgtactctgga
attgattcatctgatgtaacaaaatctattacaaaaaatacgtttgatttatatactgta
ggcgtacaacagcaactttatcaaattgaatatttgccaggaagtggtaataaaaccact
ggtacgcgaaatgtccaattgattcacccgcttgagactccaaaactagagaaaagctac
gcagatagccatggggcttttaaagttggcgaagtagtccctgcaaatgctattcatgca
tttaatggtttagatagtgctaataatgtgacttatgtagttaccgcagtagatgatgag
aaaataactgtagatgcttcaattaagcgaacagaaggaacgaaaacagctgtaattaat
aaggaaattacacttatgacttcgactgctgacgaaactgcagtaatcgatgtgacgagt
gtagctctagtagctggaaagtatacatccttaacagatgttcgaaatgaagggcatttt
catatttatgcagaaacaatggatagcgtgtccatcgatcctaagtacgttaaactaaca
gaagaccctgaaaacccagttgactggaatgcgccaggtgtttattatgtgactgcatca
cttgacccggcgagtggatatacagcgaaagatgtgaaagtaagtgttgctgtagttgat
gttggaagtccgaaagttatttctgtaaacatgaaaccgtacaatccaacaaccgctctt
gtcgttgcggaagatgatattaatggcgcaggagtgtataaaatcaactgggcaattaaa
gatgcaaatggacttattatccagcaaggtgtggaagagagtggtgctaccattcgagtt
caaaccccagttccaattgatctctctacattgaatgatggaaattatacattgtcagta
tcagcggctgacagaattggtcatacatcagaagcttcagaaaaagcgttcacagtagac
agacaagcgccagttgtgacagctgacgacaagatcacgtatgaaataaatacaaagaaa
acagaagaggaatttttaaacgatgtaaatgtaaaaacggaagccggcgcggtgattaaa
accaattttgatacgatggtgagaatggattcgccaggtgattatacggttttagtggaa
gctaccgatgcagcgggtaaccaatctgatcccatttatgtcatcgtaacagtggaagat
acggtagcgccgattataagtgcagatgaagcgattagttataatcaaggaaatatacga
acagaagcacaattcctgactgatattcatgcaacgacagatgaaccagcaacgattaca
agtgattttgcggatcaagtgaaatttgacacaccgggagtctacgcagtcacattaaag
gcaaacgatattagtggaaaccaagcaatcccaagaacagtaaatgtcacaataaaagat
gtgaccgcaccagtaatcactgctgatgaagccattatttacgaaaaaggcataaccaaa
tctgctactgatttcttaacggatatccatgctactacaaacgatggctcagcaataact
tctaattttgcaactgtagtagatttaaatacacccggggattacgatgtgacacttagc
tctaccgacacaggtggtaatatatccgatccagtcaccataacagttaccgtacgtgat
acaaccccaccagttattacagcagatacaactatcacatacgaaaaaggaaccacgaag
actgcagctgcctttttaacggatgtaaatgcaacaacgaatgacggttcagcagtaact
tctaacttcaacccaattagtttgaagcaagtagggacttatcaagtaacattaagttct
gttgatgaaaatggtaactatgctttgccagtaaaagtaaccgtcgtcgttcaagataca
caaaaaccagtaatctcatctagcgcaacaagcattacctatgagcgaggagaaaagaaa
caagaaacaggcttcttccttgatttagctattaaaacagatgacggcactccggttaca
agtgattttgacacagccgtaaatctggacacagcaggaacttatacggtaacactgaat
tcagaagatgaaagtggcaataaagcagacccagtcactattactgtgaccgttgctgat
acagaaaaaccaattatcacagcagacacaaccataacctacgcaaaagggacaaccaaa
actgtcgcacaatttttaacagatattcatgctacaactaatgatggatcaaccatcatt
agtaattttgacccaaccgttcttgcgcaagaaggaacctacacagtcgtattaaatgca
aaagatgagagcaacaatgaagcagatccggtaactgttacgattacagtggtagataca
aaaggaccgattatcaatgcattaaatgcaatcacctatgaaagaactatcaataaaaac
gaagctgatttcttagcagatattgaggcaactacagatgatggatctacaatcacaacg
gattttaatagtaaagatcttgatacggttggaacctatatcgtcacattaaatgcagag
gatgcaagtggcaataaagcaacacccgtaaaagtgacaatgaaagtagaggataccatc
cctccaatcattacagccgaccaatcaatcacttacgaaagaggcattacaaaaacagag
caagctttctacacagatattaaagccgcaacaagcgacaatagcccaatcagctctgat
ttttcgaaaattgatctaacaaaaaccgggaattatgaagtcttactccgagcaacggat
caaagtggaaacaaagcattgccacttaaaattaatgtgctagtccaagatactatcgct
ccggttataaaaacaaccagccgagaaataacggccgaacgtggcacgccaatgaccgaa
caacaactactcgcaaaaattggtgccaatacagatgatggctccaaaataacaactgat
tataacccggcaattgtcaacacatcaggagaatatctagttcatctgtacgctgttgac
gctgctggcaatcaagcaataccggtagaaataactattcatgtaaaagatacaactgca
ccaataattacggcagataaaaaaattagttaccctgttggaacggttaagacagtaacg
ggatttttacaagacattcatgctgccaccgacgatggttctaaaatcatgacagatttt
gacccgaatatgttaaaaacaccaggaaaatatactatccacttaaatgcagtagatgca
gacgggaataaagctaaaacaatcgatgtaagtcttacagtagaagagaagatgacgccg
cctaaaccaccgacaccagatgatggcggaaataatacgaatggcagcaatgggacaaat
ggtagtaacaccgatataacggtaaatcctaccaagcaaaatactacggctacaaatgaa
agcatcccagcattaggtgatacaaaatcaactattccagttatcgttggtatgttcctt
ttagctacctcacttgttctcattagacgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system