Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a): LMOSLCC7179_0314
Help
Entry
LMOSLCC7179_0314 CDS
T02224
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain protein (LPXTG motif)
Organism
lmos
Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MucBP
SSSPR-51
LRR_14
LRR_8
LRR_LRWD1
LRR_4
Arteri_env
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY59520
LinkDB
All DBs
Position
343989..347930
Genome browser
AA seq
1313 aa
AA seq
DB search
MNNNEPFIKEIETETGKTRANITQTDLEAITALRVTGASDIPANIDMLTHLTLLKAVQGT
ISSVPNSVGNLKELKILNLNTNHLSTFPTIVYQLPKLEELQLNDGTIEEIPATITNMASH
LKFLTVNNNRLVKVPTIIFSTNWSNSSTGELDLFTTGNQIVTDIPANYVSNFNNGQNMLE
FYDGQFQKQDQLTTTPGYTIDVPVGTDFNQLTPDKTKLALTSGRTLLAQHEFEYYDDGSS
SLIHNGVAAAPGQATIFIKSKFSTQSNKFARTQVTVNIAALNGGPITVKHEDTKGQELAP
PVILNGKDGDPYTTTQKTFPGYTLVATPANQNGTFTLNPATVNYVYSANDYKLTSTFKDA
QGQELKAPVVDTKDYHIQDNYTTTAATIPGYSLVSTPANQNGTFGAGNVTVNYVYKKDDY
TLTSTYKDTNGQELKAPVVDATTYHYQDTYTTTAAVFPGYTLVATPTNATGTFGSSNITV
NYVYQANGYQLTSTFKDQQGKTISPDDVDTKTYHVNDPYTTTAKTIPGYTLVTTPANNQG
NFGTSDITVDYVYKAEDYTLTSTYKDAQGKELKAPVVDSKKYHIQDNYSTSAATIPGYTL
VATPANHAGTFQTSDVTVNYVYKLTDLKLTSTYKDAQGTELKAPVVDSKTYHIQDNYATT
AAVIPGYTLVATPANQSGTFGSTDIQVNYVYQAVAYKLTSTYKDQQGNDLALPKVDSKTY
HIQDGYTTSDIAIPGYTLVAAPTNQTGTFGASDVTVNYVYKANDYTLTSTYKDAQGKELK
TPVIDSQKYHINNTYTTTGATIPGYTLVAAPANQSGTFGAANVTVNYVYKADDYTLTSTY
KDANGKELKAPVVDSKTYHTKDNYSTSAATIPGYTLVAAPANQTGTFNTSNVTVNYVYKA
NEYTLTATFKNVQGTELKPAIVKKGFIIKDGYATSGVTIPGYTLVATPSNKKGTFGASNV
TVNYVYKANGYALITTYKDTQGNDLKPLAIDTKTYNINDPYTATALNIPGYTLTTTPANE
KGVFGASDETVNYVYKANDYTLTTTYKDANGKELQAPKVDAKTYHIQDTYKTTAAVIPGY
TLVATPKNDQGTFGANNVTVNYVYQTNDYTLTSTFKDAQGNELKAAEIDAQKYHIHDTYT
TKAAVIPGYTLEKTPTNETGTFNASDIQVNYVYKANDYQLTSTFKDQQGNEIALPTVDAK
TYHIHDAYTTKARLIPGYSLVAAPTNQIGAFGTSDVTVNYVYKKDAIIKPITPAKPTILT
IKTPASKVVKTKVVKQTLPKTGDDDAGLLNLLRLIGLVLILCVFLAVGSKKLR
NT seq
3942 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataatgaaccgtttataaaagagattgaaactgaaactggtaagacgagagcg
aatattacacagacagatttagaagcaataactgccttgcgagtaacaggggcaagtgat
atcccggcaaatatcgatatgttaactcatttaaccctgttaaaagcggtacaagggacg
atatcttcagtgcctaactctgtgggtaatttaaaagagctaaaaatcttaaatcttaat
actaatcatttaagtacctttccgacgattgtttatcaactgcctaagttagaagaatta
caacttaatgatggaacgattgaagagattcctgcaacaataacgaatatggcgagccat
ttaaagtttttaactgtaaataataaccgcttagtgaaagttccaactataatattctca
acgaattggtcaaactcatctacgggagaattagatttatttaccactggaaatcagatt
gtaacggatattcctgccaactatgtaagtaactttaataatggacaaaacatgttagaa
ttttacgatggtcaatttcaaaaacaagaccaactaactacaacacctggatataccatt
gatgtacctgttggaactgattttaatcaattaacaccagacaaaacgaaactcgcacta
acatctggacgaactttactcgcgcaacacgaattcgagtattatgatgatggttcaagt
tcactaatccacaatggcgtggcagcagcaccgggtcaagcgaccattttcatcaaaagc
aagttttccacgcaatcgaacaaatttgccagaacacaagttacagtaaacatcgctgcg
ctaaacggcggacctattaccgtgaaacatgaagatacaaaagggcaagaacttgcacca
cctgtcattttaaatggtaaagacggggatccttatacaacgacacaaaaaactttccca
ggttacactttagttgcaacaccagccaatcaaaatggtacattcaccttgaacccagct
acagtcaactatgtatacagcgcaaatgattacaaactaacatctactttcaaagatgcc
caaggtcaagaactgaaagcgccagttgtggatacaaaagattaccatatccaagacaac
tatactacaacagcagcaaccattcctggctattctttagtttccacacctgctaatcag
aacggcacttttggagctgggaatgttacggttaattatgtatacaaaaaagatgattat
acccttacttccacttacaaagatacgaatggtcaagaactaaaagcaccagtggtagat
gcgacaacgtatcattatcaagacacgtatacaacaacagccgcagttttcccaggttat
acgttagtagcaacaccaactaacgctactgggacatttggttcgtcaaacatcactgtc
aattacgtatatcaagcaaatggctatcaattaacgtctacatttaaagatcaacaaggg
aagacgatctcaccagatgatgtcgatactaaaacatatcacgtgaacgatccctataca
acaactgctaaaacaatcccgggttacacattagtgacaacgcctgcgaacaaccaaggt
aattttggaacaagcgatattacggttgattatgtttacaaagcagaagattatacatta
acttcgacttataaagatgctcaaggtaaagaattaaaagcacccgttgtagatagtaaa
aaatatcatattcaagacaactattctacaagtgcagcaaccattccaggttatacgcta
gtagcgacaccagcgaaccacgccggaaccttccaaacgagcgatgttacggttaattat
gtgtataaattaacggacttaaaattaacttcgacatataaagatgcgcaaggaacggag
ttaaaagcacccgttgtggatagcaaaacgtatcatattcaagataactatgctacaact
gcagccgtgattcctggctacacactagtcgcaacaccagcgaatcaatcaggtactttt
ggtagtacggatattcaagtgaattatgtgtaccaagcagttgcttataaactaacttcg
acgtataaagaccaacaagggaacgatttagctttaccaaaagtagattcgaaaacgtac
catattcaggatggttatacaacgagcgacatcgctattccaggttatacattagtcgcg
gctccaacgaatcaaacaggtacatttggcgcgagtgatgtaacggtgaattatgtctac
aaagccaatgactacacactaacgtcaacatataaagatgcacaaggtaaggaattaaaa
acgccagtcatagacagtcaaaaatatcacattaacaacacttatactacgactggagct
actattccaggttacacattagtcgcagcaccagcgaatcaatccggtacatttggcgcg
gcgaatgtaacagtcaactatgtctacaaagccgatgattacacattaacttcgacctac
aaagatgcaaacggcaaagaattaaaagcgccagttgtagacagcaaaacttaccataca
aaagataactattctactagcgcagcaaccattcctggctacacactagtggcagcacca
gcaaatcaaacaggtacatttaatacgagcaatgtgacagtcaattatgtttacaaagcg
aatgaatataccttaactgccactttcaaaaatgtacaaggaacagaactaaaaccagct
atcgtgaaaaaaggatttattattaaggatggctatgcgactagtggcgtaacaattcca
ggctatacattagtggcaacaccatcgaacaaaaaaggaacatttggtgctagtaatgta
acagttaattatgtatataaagcgaatggttatgcattaatcacaacatataaagacaca
caaggtaacgacttaaaaccactagccattgatacaaaaacatacaatattaacgaccca
tacactgcaacagcgctgaacatcccaggttacacattaacaactacaccagccaatgaa
aaaggtgtatttggcgcaagtgatgaaacagttaattacgtatataaagcaaatgattat
acgttaacaactacctacaaagacgcaaacggcaaagaactacaagcacctaaagtagac
gcgaaaacttatcatatccaagacacatacaaaacaactgcagcagtcattcctggatat
acattagttgcaacacctaagaatgaccaaggtacttttggagcgaacaatgtaactgtg
aattacgtgtaccaaacaaatgattacacgctaacttcgacatttaaagatgctcaagga
aacgaattaaaagcagcagaaatagacgcacaaaaataccatattcatgacacttacaca
acgaaagcagccgtgattccgggttacactttagaaaaaacaccaacgaacgaaacgggt
acttttaatgcaagtgatattcaagtaaattatgtgtataaagcaaatgattatcaactt
acttctacttttaaagatcaacaaggcaacgaaatagcattaccaacagttgatgcaaaa
acttatcacattcatgacgcgtatacaacgaaagctcgcttgattccagggtatagccta
gtagctgcaccaacaaaccaaataggtgcttttggaacaagtgatgtaacagtcaattat
gtgtataaaaaagatgctattatcaaacctattactccagcgaaaccaactattcttaca
ataaaaacacctgcaagcaaagtagttaagactaaagtagttaagcaaactcttcctaaa
acaggggatgacgatgccggactattaaacctgctaagacttataggactcgttttaatt
ttatgcgtatttttggcagtcggaagtaaaaaattaagataa
DBGET
integrated database retrieval system