Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a): LMOSLCC7179_1081
Help
Entry
LMOSLCC7179_1081 CDS
T02224
Name
(GenBank) putative type II restriction enzyme
Organism
lmos
Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
N6_Mtase
HSDR_N
MmeI_Mtase
Eco57I
MmeI_hel
FANCI_HD1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY60287
LinkDB
All DBs
Position
1095583..1098531
Genome browser
AA seq
982 aa
AA seq
DB search
MQFIEEKEALLTLINRFRNDYSEYKDSKSVFNEQMTRQQYIDPFLKLLGWDIANSKGVSF
YDREVVAEEYANRKDRPDYTIRIHGAPIFFVEAKKVNVAIESDKNSALQARRYGWNAGHS
ISVLTNFDYLAIYQTYENPSESDESSTFRYKLYHFEEYLDKFEEIYSLLSYKSVRNGDFQ
KWISDITPEDATKLTLDSVFLKDLNRWRVTIASDLIQSENKYFADKGNLNEAVQQFLNQI
VFLRFAEDNHLEDSEILKKLLNKKLDAASFLFQLDKKYNSGIFNDSRVVGNLSDTTLNDI
IMSLYFPQSSYDFSVIDLSILSRIYENFLQEEINIVDGTPKLEKTRDAKIKSVVSTPDEL
VKLMVQKVLEPKINGKNPSEILLLKIVDLAVGSGIFLIEAYNYLENYLADWYGKEMGESP
SSLLIPYKDKSKLIESVLYGFDINFQAVQLTRFSLILRVLLNENSNRLTELPILPNLNKN
IIHGNALIDETDVDMNNLNIEDIVEIVPFNTDENRVLLYDVVIGNPPYLTTEDIKKSTPT
TEINVYKEKYFSAYKQFDKYFLFIEKALEILNDDGKVSVLVPNKFVTIASGIKIRQLIKE
KQALVSIVDFGVTQLFHGITNYVSIVEMSKNHNNSFTYSRIGSIAEAYEKQEFEYDTHKL
SEKAWFLTNDLKFKKQYEFAANHFPSIKEEINTPNGIQTSKNSFYVIDKKYIVADLGDIL
KFEKNGESFYLEKGIVRDFYQSSGRVQGKSYQSLSADKLVIFPYENSKLIRIEQMLVKYP
NAWEYFQKHKEELLPKQLGGSRDVQNNPSESNWYQYGRTQFLTESTEDKIIVGVMSNQPN
FNIDRNGYLFASGGTAGYISIFMRDESLYCLEYIQAWLSHPFTDKIFRILGSDFDNGFYS
HGTYLYDEIPILPVDFDNKQQALIYSNIVTVVKKIEKINSTIMNEVNRQKLISLERQKVA
MILSVNSQIDSLLSERMGDLYE
NT seq
2949 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaatttatagaagaaaaggaagctttgttaactctaattaatagatttagaaatgat
tatagtgaatataaagattccaaatctgtatttaatgagcagatgacgcgacaacagtat
atagatccatttttaaagcttttgggatgggatattgccaattcaaaaggagtttctttt
tatgaccgagaagttgtagcagaagagtatgcgaataggaaagatcgtcctgattatacg
attcgtatccatggggcaccaatttttttcgttgaggctaaaaaggtgaatgtagctatt
gaatcagataaaaattcagctttacaggcacgccgatatggttggaatgctggacattca
atttctgtgctcactaattttgactatctggcaatttatcaaacatatgaaaatccctct
gaatcagatgaatcatcaacctttagatataaattgtatcattttgaggagtatttggat
aagtttgaagaaatatattctctgttatcctataaatctgtgcgtaatggagatttccaa
aaatggatttccgatataacaccagaagatgcgactaaattaacccttgattcagttttc
ttgaaggatttaaatagatggcgagttacaattgcaagcgatttaattcaatcagaaaac
aagtacttcgccgataagggaaatttaaatgaagccgtgcaacaatttttaaaccaaatt
gtctttcttcgtttcgcagaagataatcatctagaggattcagagatactaaagaaatta
ctgaataaaaaattggatgctgcaagttttcttttccaattagataaaaaatataactcg
ggtatatttaatgattctagggtagttggtaatttatcagatactacactaaatgacatt
ataatgagtctttattttccacaaagctcctatgatttttcagttattgatttgtctata
cttagtcgaatctatgagaattttttgcaagaggaaattaacatagttgatggaactcca
aaattagaaaagacaagagatgcaaaaatcaaatcagttgtttctacacctgatgaattg
gttaagctcatggttcaaaaagtcttagagccaaaaatcaatgggaaaaatccatctgaa
atattattactaaaaattgtcgacttagctgtgggatcaggtatatttttaattgaagct
tacaactatttggaaaattatttagcagattggtatgggaaagagatgggggaaagtcca
tcgtctttacttataccttataaagacaaaagtaagttaattgagtctgttttgtatgga
tttgatataaattttcaagcagtacaattgactcggttttcgctcattttaagagtgtta
ttaaatgaaaatagtaatcgtttaacggaattaccaatactcccaaatttaaacaaaaat
attatacatggaaatgcgctaattgatgaaactgatgttgatatgaataatttgaacata
gaagatatagttgaaatagtaccttttaatactgacgaaaatagggtactactatatgat
gtagttattggaaacccaccgtacttaacaaccgaagatatcaagaaatctactccaact
acagaaataaatgtttataaagaaaaatatttttcggcgtataaacaattcgataaatat
tttttgtttatagagaaagcattggaaatattaaatgatgatggtaaagtttcagtttta
gttccaaataaatttgttactatagcatcggggataaagattcgacagttgataaaagaa
aagcaagcacttgtaagtattgttgattttggtgttacccagttatttcatggtataaca
aactatgtttctattgtggaaatgagcaaaaatcataataatagctttacttactcaaga
ataggctctattgccgaggcctatgaaaaacaagagtttgagtatgatacacataagcta
tcagaaaaagcatggtttttaacaaacgatctaaaatttaaaaaacaatatgaatttgca
gcgaatcattttccatccataaaagaagaaattaatacaccaaatggtattcaaaccagt
aaaaattctttctatgttattgataaaaagtatatagttgctgacttaggggatatttta
aaatttgagaaaaatggtgaatctttttacttagaaaagggaattgtacgtgatttttac
caaagcagtggacgtgttcaaggaaaatcatatcaatctttatctgctgataaacttgtg
attttcccgtatgaaaacagcaaattaattcgaattgaacaaatgctagtaaagtaccca
aatgcttgggagtatttccaaaaacataaggaggaattgttaccaaaacaattgggtggg
tctcgggatgttcaaaataatccgagtgaaagcaactggtatcaatatgggagaacacaa
tttttaacagaatcaactgaggacaaaataattgtaggggttatgtctaatcagccaaac
tttaatatcgatagaaatggttacttatttgcctcaggtggaacagcaggttatatttca
atattcatgcgtgatgaatcactatattgtttagaatatattcaagcatggttaagtcat
ccatttacggataaaatttttcgtattttgggaagtgattttgataatgggttttattca
catggaacttatctatatgacgagattcccattcttcctgtagactttgataataaacaa
caagctttgatatattccaatatagtaacagtagtgaagaaaattgaaaaaattaatagt
acaatcatgaatgaagtgaatcgccaaaagctaatctcattagaaagacaaaaagtggct
atgattttaagtgttaatagtcaaatagatagtttattaagtgagcgaatgggagacctg
tatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
