Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a): LMOSLCC7179_2516
Help
Entry
LMOSLCC7179_2516 CDS
T02224
Name
(GenBank) putative bacteriophage tape-measure protein
Organism
lmos
Listeria monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TMP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY61722
LinkDB
All DBs
Position
complement(2581495..2586858)
Genome browser
AA seq
1787 aa
AA seq
DB search
MSDGSVVIEISLDNKKADKQLDAFEKDLAKAGTNAGAALDKAYREAVSDIASQSKRLKDT
FVNVFKSMGNAGSNALKASLNFIRELPSNVQAALSKLASTVKTGFVNAAKASITAVKNLG
TSIKNTAVNIKNGFFSIAKTVQSSIVSAVKVSINVIKSIPSAIKSAGSSIKSALVSSLQA
AKMAAISFAQTSVNVIKSIPGAAKTAAVAVKDSFVVAYKAVVVAAYMSVKGTISAVKAIP
SATKSAALAVSSAMKTAFSAVASAAKTTGTTVKSALKKGFSAVKSGAKAAGQAGISALKG
LGNIAKSTGSLIKSGLVSGFNAAKAAAKGAGAGMREALKNSVEKPAEQARFSVLRLAAAF
GLIAATKNVVGSAIGRVDTIDTATKSLTVLTGSAKDAQLVMTDLTAAIDGTPIALDAVAL
GAKKMVAAGMKAANVKPVFTAIADAAYGVGNGSESIDQMTDAISALQASGVAYADDINRL
VDAGVPAWQILANSTGKSVGEMKKYVSEGSLESTKAIAMLTKGIEEGTTGMAGNTAKMAG
LAKTAGNTISGSFANMKTAAVKSLANIAENLKGPIIQALDVAKNAFKQFAAVTASPEFQK
KLSDLIQKIKEFIPVLIEWAPVLAKVAAGFVAFNIISSVYSKVAGLVMAFRGLASSGTLL
GGIVNTVKGSFLALKVALGSAAAAFGVIIAVIGAVIAVAYGMYVSFKENTANIKGFLSTM
WDGVKNSFGKIVDVFKQIVAALKPVGSGFKDVLKYVGVAIWASLGLVLAAVVDIIQVLAR
IVLVAIKALQGLYYAIKSAFQALSGDLKGAKKSLEQSKDAFVEAGSAIKDAFNKDNYALT
GTVEAFKQMGGEAENTAKKTETSGKKIKDTLKLVETTAKQTETTVSKSNQAIDTMLSGGV
DQYGNKLSEKTKSFLNAAKDLYGQYQESAKKSQDKYSAAMEKAQDLEGDKRKKAIADANA
TLVAEIDKNNGTLLTLQADYAKLLKGNKWVDGTELTAQQKKFLQQQTADIQAELAKQNQL
YIEGNLLKLSNGKTLNEKERSTSIEVQKSLYADRKKAVETGEKELADLKKKKSDATTETE
KANYQIQIDEQTKKNKTLAENLQKWASEMNTIIANGGTLNAETFAKGLSEMGNISDEQLS
AVWQDFVKVSGSIDNTLAGLGAIMSQRGGEGVQAFVTALQSGDYTTAALNINNDVLSTIS
SLPNGMFLNGESGKNQFLTAIKSGDFQGAGKYLVDGVKMGTDSIDSEMKTKGQTGGQNFA
DGVKGKEDAAKSAGSAVKNKAKEGATDPNAFKAVGSKDSAGFNNGVMGGKGGAYSAGSNV
GNSAKSGAASVDSSGVGSDFSSGYVNGILSGMGAVGEAAASLASKALAAVQKKQDSHSPS
KESKKLGGDFGTGYSLGIADKNKAVTKAANNLVASALGTESQIKKLSSTLKDKISSAIDA
GLHSKNKSRGQLKQAKALNSIEGYIVQQTNRLAATAKKRDKVVAQLKAANTKMADLTKQS
KEYAASITEKMKSYGSISNVDPENPKSIQAEMQKRLKEIKAFQANVEKLRKKGVSKDIIN
DILESGVENGSSYAQALAKSDAKTIKAINSTQNQINSASKAMGNTAANAMYSAGINAAKG
LINGLNSQKKQLEKTAKSIANTITNSVKKALKIHSPSRVAIELGKFFTGGLGNGVLAGAK
GAVQSTNKMVDKVVNAASNMTVPTINLPKISAEKALGLKSVDLNRTITVKTIIDNKTKES
SNADLIKAIQESGDRPINFYVDGKDIADNTNNHLGSSTSLAFYGKGL
NT seq
5364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgatggatcagtagtaattgagattagtttagacaataaaaaagcagataaacaa
cttgatgcgtttgaaaaagatttagcgaaagcaggcacaaatgcaggggcggcattagat
aaagcatacagagaagcagtgtctgatattgctagtcaatcaaaacgattaaaagacaca
tttgttaatgtgtttaaaagcatgggaaacgcaggctcaaatgctttaaaagctagttta
aactttatacgtgagttaccttctaatgtacaagcggcactatctaaacttgcatccact
gtaaaaactgggttcgtaaacgctgctaaagcatctattacagcggttaaaaatctagga
acaagtatcaaaaacacggcggttaatatcaaaaacggcttcttttcaattgctaagaca
gtacaaagtagtattgtgtcggctgttaaagtatcaattaatgtcattaaatccatccct
agcgctattaaaagtgctggaagtagtattaaatcagcattagtaagtagtttacaagca
gctaaaatggctgctatttcttttgctcaaacttctgtaaatgtaattaaaagcatacca
ggcgcggcaaaaacagcagctgttgcggtaaaagatagttttgttgtagcttacaaagcg
gtggtagttgctgcttatatgagcgtaaaaggaactattagcgctgtgaaagctattcct
agtgctacaaaatcagcagcgttagcagtaagtagtgcaatgaaaacagcttttagcgct
gtagcaagcgcggcgaaaacgacaggaacaacagtgaaatcagcattaaaaaaaggcttt
agcgctgtgaaatccggagctaaagcggcaggccaagctggtatttcagcattaaaaggc
ctaggaaacattgcgaaaagcactggttctttaattaaaagtggattagtaagcggattt
aacgcagcgaaagcggcggcgaaaggcgcaggcgctggaatgcgtgaagcgcttaaaaat
tcagtcgaaaaaccagcggaacaagctcgttttagtgttctcagattagcggcagcgttc
ggattaattgccgctactaaaaacgtcgtaggcagcgctattggtcgtgttgatacgatt
gatacagcgactaaatcgttaacagtccttactggttcagcaaaagatgcgcaactagtt
atgacagaccttacagcggctatcgatggtacaccaattgcgctcgatgccgtcgcttta
ggcgctaaaaaaatggttgcggcaggcatgaaagcggcgaatgtaaaacctgtatttacc
gctattgctgacgctgcctatggggtcggaaacggttcagaatcaattgaccagatgaca
gatgcaatttctgcgttacaagcgtctggcgttgcttatgcggatgatattaatcgctta
gttgacgcgggtgttcctgcatggcaaattttagctaactccacagggaaaagcgttgga
gaaatgaaaaaatatgtttccgaaggatctttagaatcaacaaaagctatcgcaatgttg
acaaaaggcatcgaagaaggaacgactggaatggctgggaacacggctaaaatggcaggt
ctagcaaaaacagcaggtaacactatcagcggttcatttgcgaacatgaaaacggcagct
gttaagagtcttgcaaatatcgccgaaaacctaaaaggcccgataattcaagcgctagat
gtagctaaaaatgcattcaaacagtttgcggcagtaacagcaagtcctgaattccagaaa
aaactatctgatttaattcaaaaaatcaaagagtttataccagttttgattgaatgggcg
ccagttttggcaaaagtagccgctggatttgtagcatttaatattattagtagtgtatat
tctaaagttgctggtttggtaatggcattcagaggtttagcaagtagcggtacgttgctt
ggtgggattgttaataccgtgaaagggtctttcttggcgcttaaagtcgcgctaggttca
gctgccgccgcgttcggagtaataattgcagtcattggtgcagttatagctgttgcatac
ggcatgtatgtatcattcaaagaaaacactgcgaatattaaaggctttttatcaactatg
tgggatggcgtgaaaaattctttcggtaagatagtagacgtgttcaaacagatagttgcc
gcattaaaaccagtaggtagtggatttaaagatgtacttaaatatgttggtgttgctatt
tgggcgtctcttggtctagttctagctgctgtagttgatattattcaagtattagcgcga
attgtgttagtagctattaaagcgctacaagggctgtattacgcgataaaatcggcattt
caagcacttagcggagatttaaaaggtgctaagaaaagcttagagcaatcaaaagatgcg
tttgttgaagcaggttcagccattaaagatgcttttaataaagataactatgcgttaact
ggaaccgttgaagcgttcaaacaaatgggcggagaagccgaaaatacagcgaagaaaacc
gaaacatctggcaagaagataaaagacacattaaaactggtagaaacaactgccaaacaa
actgaaacaactgtttcgaagtcaaatcaagcaatagatacgatgctgagcggcggagtg
gaccaatacggaaacaaacttagcgagaaaactaagtcattcttaaatgcagccaaagac
ctttacggacaatatcaagaatccgctaaaaagtcgcaagataaatatagtgccgctatg
gaaaaagctcaggaccttgaaggagataagcgtaaaaaagctatagcagatgcaaacgcg
acgttagtagcagagattgacaaaaacaatggtacccttttaacccttcaagcagattat
gcgaaattactaaaagggaataaatgggtcgacggtacagaattaactgcacaacaaaag
aaatttttacaacaacaaactgcggatattcaagcagagttagcaaaacaaaatcaactt
tatatagaaggaaacttgctaaaattatcaaatggcaagacgttaaatgaaaaagaacga
tctacaagtatagaagtgcaaaaaagcttatatgcagatagaaaaaaagcggtcgaaaca
ggcgaaaaagaactagctgatttgaaaaagaaaaaaagcgatgctacaaccgaaactgaa
aaagcaaactatcaaattcaaattgacgagcaaacgaagaagaacaaaacattagctgaa
aacttacaaaaatgggctagtgaaatgaatactattatcgcgaatggcgggactttaaat
gcagaaacttttgcaaaaggcttgtcagaaatgggaaacattagcgacgaacaactaagc
gcagtttggcaagactttgtaaaagtgagcggttctattgacaacacactagcaggatta
ggcgctattatgagccaacgcggtggggaaggtgttcaagcgtttgttacagcacttcaa
agcggagattatacaacagctgcattaaatattaacaatgatgttctaagtactatttct
agcttaccgaacggcatgtttttgaacggagaaagtggaaaaaatcaatttttaactgct
atcaaatccggtgactttcagggagctggcaaatatttagttgatggcgtaaaaatgggc
actgactctattgactcggaaatgaaaacaaaaggtcaaactggtgggcagaactttgcg
gacggtgtaaaaggtaaagaagacgctgctaaatcagctggttcagcagttaaaaataaa
gcaaaagaaggcgcaacagatccgaacgcattcaaagcagttggttcgaaagacagcgcg
ggctttaacaatggagttatgggaggaaaaggcggcgcttattcagctggttcaaacgtg
gggaattctgctaaaagtggtgcggcttcagttgattctagcggggtcggttcagatttt
tcgtctggatatgtgaatggtattttgagtggtatgggcgcggttggagaggcggctgct
tctttggcaagcaaagcactagcagcagttcagaaaaaacaagactcgcattcaccttcc
aaagagtcgaaaaaactaggtggagacttcggaactggttattcattaggtatcgcagac
aaaaataaagcagtgacaaaagcggcaaataatctagtagctagtgcgctaggtactgaa
tcacaaattaagaaactatccagtacgttgaaagacaaaatatcctcagcgattgacgcg
ggattgcattctaagaataagagtcgtggtcaactcaaacaagctaaagcattgaatagc
attgaaggttacattgttcaacaaacaaatagattagctgcaacagctaagaaacgtgat
aaagtcgtcgctcaattaaaagccgctaatactaaaatggcggacttgacgaaacaaagt
aaagagtatgctgcttcaatcactgaaaaaatgaaaagttatggatcaattagcaatgta
gacccagaaaatccaaaatcaatccaagcagaaatgcagaaacgcttaaaagaaattaaa
gcttttcaagcaaatgttgaaaaattgcgtaaaaaaggcgttagcaaagatattataaac
gacattttggaatcgggagtagagaatggttcatcttatgcgcaagctcttgctaagtct
gacgctaagactatcaaagcgattaacagcacgcagaatcaaatcaattcagcatctaag
gcgatgggaaatacagcggctaatgcaatgtattctgctggtattaacgcagcaaaaggt
ttaataaacggactaaacagtcagaaaaaacaactagaaaaaacagctaagagcattgct
aacacaatcactaattcagtgaaaaaggcgcttaaaattcattcgccttctcgcgtggcc
atagagcttgggaagttttttaccggcggcctcggaaatggtgtcttagctggcgctaaa
ggcgctgttcaatcaactaacaaaatggttgataaagtagtaaatgctgcttctaatatg
actgttccgaccatcaatttgccgaagatttccgctgaaaaagcgctgggcctcaaaagc
gtagatttaaacagaactatcaccgtcaaaacaattattgacaacaaaacaaaagagtct
agcaacgctgatttaatcaaagctattcaagaatctggtgatagacctattaacttttat
gttgacggcaaggatattgcagataatacaaataatcatctgggaagttctacatcacta
gcattctatgggaaggggctataa
DBGET
integrated database retrieval system