Listeria monocytogenes R479a (serotype 1/2a): LMR479A_0643
Help
Entry
LMR479A_0643 CDS
T03180
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function
Organism
lmr
Listeria monocytogenes R479a (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
Mga
HTH_11
HTH_DeoR
PuR_N
HTH_Mga
MraZ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM15865
LinkDB
All DBs
Position
649550..651580
Genome browser
AA seq
676 aa
AA seq
DB search
MLSGRMVLIIKYLEGKSESSIRGISKKLEISERKVRYDIDNINDALTLNQLKPILKEGKG
RLVIPADLAKLALEEKETYIFAPQERINILQYLLFFNVKKVNLEHLSKWMNVSRTTIKKD
LLLIEEQLQKLNLQLVYKQGYRLIGNENALLNERVRILRDYIDFIPSEDIETNFYRKCML
GEMKVSLKNIDINGVNKWSKQLLKQMGWILNDESYYWYLANILVFCWYIKNDVTNPLKDA
KLVLPIFNSQLIQGMEVILDYELSQEQLNILVGFVFFTNKYASLNEEMDLITTETIVNSL
ITSMSEELNLPFLEDAILYKGLLNHVAPLIERVRGNVQIYEDTFDVIPTEFLYILQATSK
VVKTIPLLESVENESEISLLAIHFLASIQRNQREEKLHVLLVCGLGYGAIAMMKDTLNSE
YQIAFVATIPEYMLKDFTAWEEVDLVITTAKVTTPLPKSTVKVSPVLKECDLVELEKQGL
KKKNILTSYFAINKRLSFLDSTVKQQVISVIKEELGYGHVSIPNRKLGLSDLIGIDAIQI
TSESLTWQTAIQRATKLLSDNHFVLPAYAENIKQIQEELGFYSVKDEEFALFHGNDSQLV
QMNSMALLINEQPVMFGEKQAKVIFILASKDKKEQIPAIITLTKMTYQTDFISKLEQAKN
PIDADRIIKKYEEEVR
NT seq
2031 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaagtggcagaatggtactaatcataaagtatttagaaggcaaaagtgagtcgagt
attcgtggtatcagtaaaaagcttgaaatatctgagcggaaagttagatatgatatcgac
aatataaatgacgcacttacgcttaatcaattaaaaccaattttgaaggaggggaaagga
aggttagttataccagctgatttggccaaattagcactggaggaaaaagaaacttatatt
tttgctccgcaggaaagaatcaacattttacagtatttgctattttttaatgttaaaaag
gtgaacttggaacatttaagtaaatggatgaatgtatcgcgaacaacgattaaaaaagat
ttattgttaattgaagaacagttgcaaaagttgaatcttcaattggtttataaacaaggc
tatagattgattggtaatgaaaacgctctcttgaatgaacgtgtccggattttgcgagat
tacattgattttatcccaagtgaagatatagaaacaaacttttatagaaaatgtatgtta
ggcgagatgaaagtatcacttaaaaacattgatataaatggcgtgaataagtggtctaag
caacttttgaaacaaatgggttggattttaaatgatgaatcgtattactggtatttagcg
aatattttagtcttttgctggtatataaaaaatgatgtcactaatccacttaaagatgca
aagctggtacttccaatttttaattcccaattaattcaagggatggaagtgattttagat
tacgagcttagtcaggagcagttaaatattctagtcggctttgtttttttcacgaacaag
tatgcaagcttgaatgaagaaatggacttaattacaacagaaacgatagtaaattcgcta
atcacatccatgagtgaagaacttaatttgccttttttagaagatgcgattttgtataaa
ggattactaaatcatgtagctccactgattgaaagagtgagagggaatgtgcaaatttac
gaagatacttttgatgttattccaactgaatttctctatattttacaagcaacaagcaag
gtggttaaaactataccgttacttgagagcgtcgaaaatgagagtgaaatatctttgttg
gcgattcattttttagcgagtattcagcgtaatcagcgtgaggagaagttgcatgtatta
cttgtttgtggtcttggctacggagcaattgcaatgatgaaagatacactaaatagcgag
tatcaaatcgcttttgtcgcaactatccccgaatatatgttaaaagattttactgcttgg
gaagaggtggatttagtcattacaacagcaaaagtgacaaccccactaccaaaatcgact
gtcaaagtaagcccagttttaaaagagtgtgatttagtggagttagagaagcaaggctta
aaaaagaagaatattttgactagttactttgcaattaataagcggcttagcttccttgat
agcactgtgaagcagcaagttattagcgtcattaaggaagaactaggatatgggcatgtt
agtattccgaatcgaaagttaggattaagtgatttgattggaatagatgcgattcagatt
acatcagagagtttaacatggcaaactgctattcagcgagctacaaagctactatctgat
aatcatttcgtacttccagcttatgcggagaatatcaaacaaattcaagaagaactgggt
ttttattccgttaaagacgaggaatttgctttgtttcacgggaatgacagccagttagtt
cagatgaatagtatggctcttttgattaatgaacagccggttatgtttggggagaagcaa
gccaaagtcatttttattctcgccagtaaagataaaaaagagcaaattccagcaattatt
acactcactaaaatgacctatcaaacagattttatttctaaattagaacaagcaaaaaat
ccaattgatgcggatagaattataaaaaaatatgaagaggaggttagataa
DBGET
integrated database retrieval system
