Listeria monocytogenes R479a (serotype 1/2a): LMR479A_1765
Help
Entry
LMR479A_1765 CDS
T03180
Name
(GenBank) Peptidoglycan linked protein (LPXTG)
Organism
lmr
Listeria monocytogenes R479a (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Big_3_4
Bact_surface_Ig-like
Y_Y_Y
Big_13
PKD_4
DUF4959
PKD
HYR
DUF4625
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM16987
LinkDB
All DBs
Position
complement(1727390..1732525)
Genome browser
AA seq
1711 aa
AA seq
DB search
MKSKFFIGMMTFLLSLICLTGMKAEAKSVGDISPDDISPEISDNRFQSAEGKVLPNFEVD
MSISDQNNGKLSIDEDFELTSDGDIILIGTVQGQYIQGTPILNENGQLNKIPNRDQGIIM
RVDRTTKKVEWARVVNYEDGNYNSQYAADKWISSYKSITTNSSKSTFYVGGEVVNYYGDS
GGGSTLIVKSIDANGNFQIAHKSYVSYGIPSRSDLTYAYFMDIQMEGNTLTMSASARYAA
QGKQFIRYTLEPASLSITKNEFNPLDNTFWAKYQRTDVLKVDNKGLMAYNADVNGINQLK
MSIRESENNYKEITLFDSVPEILANSSPYIFMEDRGDGNVFVVMSTPTTWYIALVNIASE
QVVETKKMTMNSSTTLNSVIYSEGKGLLLGGSTHAEESIFGSEPLNKNNGYYLALGNDLN
VTDSQILRTNQHNSLTTIINGVGNKVDGFFSYDGLNNDGYIQNVEYPNTYDVNPNGAMIF
AEFNLQPAPVLDTGNPILAFYQGERRADFDELEGVKAYSGIDSSDVTKSITKNTFDLYTV
GVQQQLYQIEYLPGSGNKTTGTRNVQLIHPLETPKLEKSYADSHGAFKVGEVVPANAIHA
FNGLDSANNVTYVVTAVDDEKITVDASIKRTEGTKTAVINKEITLMTSTADETAVIDVTS
VALAAGKYTSLTDVRNEGHFHIYAETMDSVSIDPKYVKLTEDPENPVDWNAPGVYYVTAS
LDPASGYTAKDVKVSVAVVDVGSPKVISVNMKPYNPTTALVVAEDDINGAGVYKINWAIK
DANGLIIQQGVEESGATIRVQTPVPIDLSTLNDGNYTLSVSAADRIGHTSEASEKAFTVD
RQAPVVTADDKITYEINTKKTEEEFLNDVNVKTEAGAVIKTNFDTMVRMDSSGDYTVLVE
ATDAAGNQSDPIYVIVTVEDTVAPIISADEAISYNQGNIRTEAQFLTDIHATTDEPATIT
SDFADQVKFDTPGVYAVTLKANDISGNQAIPRTVNVTIKDVTAPVITADEAIIYEKGITK
SATDFLTDIHATTNDGSAITSNFATVVDLNTTGDYDVTLSSTDTGGNISDPVTITVTVRD
TTPPVITADTTITYEKGTTKTAAAFLTDVNATTNDGSAVTSNFNPISLKQVGTYQVTLSS
VDENGNYALPVKVTVVVQDTQKPVISSSATSITYERGEKKQETGFFLDLAIKTDDGTPVT
SDFDTAVNLDTAGTYTVTLNSEDESGNKADPVTITVTVADTEKPIITADTTITYAKGTTK
TVAQFLTDIHATTNDGSTIISNFDPTVLAQEGTYTVVLNAKDESNNEADPVTVTITVVDT
KGPIINALNAITYERTINKNEADFLADIEATTDDGSTITTDFNSKDLDTVGTYTVTLNAE
DASGNKATPVKVTMKVEDTIPPIITADQSITYERGITKTEQAFYTDIKAATSDNSPINSD
FSKIDLTKTGNYEVLLQATDQSGNKALPLRINVLVQDTIAPVIKTTSREIMAERGTPMTE
QQLLAKIGANTDDGSKITTDYNPAIVNTSGDYLVHLYAVDAAGNQAIPVEITIHVKDTTA
PIITADKKISYPVGTVKTVTGFLQDIHAATDDGSKIMTDFDPNMLKTPGKYTIHLNAVDA
DGNKAKTIDVSLTVEEKVTPPKPPTPDDGGNNTNGSNGTNGSNTDITVNPTKQNTTATNE
SIPALGDTKSTIPVIVGMFLLATSLVLIRRK
NT seq
5136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaattttttataggcatgatgacttttttgctatcattaatttgtcttact
ggaatgaaagcagaagcaaaatcggtgggagatatttctccagatgatatttcaccggag
atttcagataatcgctttcaatctgcagaagggaaagttttgcctaattttgaggtggat
atgtcgattagtgatcaaaataacgggaaattatcgattgatgaggattttgagttaacc
tcagatggcgatattattttgattggaacagtgcaaggtcaatacatacaaggaaccccc
attttaaatgaaaatgggcaattaaataaaattccaaaccgtgatcaagggattattatg
cgtgtcgatcgaaccacaaaaaaagtggagtgggcacgtgttgttaactatgaggacggt
aattacaactcacaatacgcagctgacaaatggataagttcatataaatcgattacaacc
aactcgagtaaatcgactttttatgtaggtggcgaagtagtcaattactacggagactca
ggtggaggtagtactttaattgtaaaatcaattgatgcaaatggtaactttcaaatagct
cataaatcttatgttagttacggtattccatcaagatcagatctaacatatgcctatttt
atggatattcaaatggaaggtaatacattaaccatgtcagcttcagctcggtatgctgcg
caaggtaaacagtttattcgttatactttagaaccagcttcattatcgattaccaaaaat
gaatttaacccattagataatactttctgggccaaatatcaacggacagatgtccttaaa
gtagataataaaggtctgatggcttataacgcggatgtaaacggtatcaaccaacttaaa
atgtccattcgtgaatcagaaaataattataaagaaattacattgtttgattctgttcct
gaaattttagcaaactcttccccttatatatttatggaagatcgtggcgatgggaatgtg
tttgtggtcatgtcaacacccactacctggtatatcgcgcttgttaatatcgcgtcagaa
caagtagttgagactaaaaaaatgacgatgaactcctccacgacgctaaatagtgtgatt
tacagtgaaggaaaaggtctgcttttaggtggtagtacacacgcggaagaaagcattttt
ggtagtgagccattaaacaaaaataacggatattatttagcgcttggaaatgatttgaac
gtaacggatagccagattttaagaacgaatcaacataattcattgacaactattattaat
ggcgtcggcaataaagtagatggtttctttagctacgatggattaaataatgatgggtat
atccaaaatgtagaatatcctaacacctatgatgtgaacccgaatggggcgatgatattt
gcagaatttaatttgcaacctgctccagtactcgatacaggtaatccaatcttagcattt
taccaaggggaacgtcgtgcagattttgatgaactagaaggggtgaaagcgtactctgga
attgattcatctgatgtaacaaaatctattacaaaaaatacgtttgatttatatactgta
ggcgtacaacagcaactttatcaaattgaatatttgccaggaagtggtaataaaaccact
ggtacgcgaaatgtccaattgattcacccacttgagactccaaaactagagaaaagctac
gcagatagccatggggcttttaaagttggcgaagtagtccctgcaaatgctattcatgca
tttaatggtttagatagtgctaataatgtgacttatgtagttaccgcagtagatgatgag
aaaataactgtagatgcttcaattaagcgaacagaaggaacgaaaacagctgtaattaat
aaggaaattacacttatgacttcgactgctgacgaaactgcagtaatcgatgtgacgagt
gtagctctagcagctggaaagtatacatccttaacagatgttcgaaatgaagggcatttt
catatttatgcagaaacaatggatagcgtgtccatcgatcctaagtacgttaaactaaca
gaagaccctgaaaacccagttgactggaatgcgccaggtgtttattatgtgactgcatca
cttgacccggcgagtggatatacagcgaaagatgtgaaagtaagtgttgctgtagttgat
gttggaagtccgaaagttatttctgtaaacatgaaaccgtacaatccaacaaccgctctt
gtcgttgcggaagatgatattaatggcgcaggagtgtataaaatcaactgggcaattaaa
gacgcaaatggacttattatccagcaaggtgtggaagagagtggtgctaccattcgagtt
caaaccccagttccaattgatctctctacattgaatgatggaaattatacattgtcagta
tcagcggctgacagaattggtcatacatcagaagcttcagaaaaagcgttcacagtagac
agacaagcgccagttgtgacagctgacgacaagatcacgtatgaaataaatacaaagaaa
acagaagaggaatttttaaacgatgtaaatgtaaaaacggaagccggcgcggtgattaaa
accaattttgatacgatggtgagaatggattcgtcaggtgattatacggttttagtggaa
gctaccgatgcagcgggtaaccaatctgatcccatttatgtcatcgtaacagtggaagat
acggtagcgccgattataagtgcagatgaagcgattagttataatcaaggaaatatacga
acagaagcacaattcctgactgatattcatgcaacgacagatgaaccagcaacgattaca
agtgattttgcggatcaagtgaaatttgacacaccgggagtctacgcagtcacattaaag
gcaaacgatattagtggaaaccaagcaatcccaagaacagtaaatgtcacaataaaagat
gtgaccgcaccagtaatcactgctgatgaagccattatttacgaaaaaggcataaccaaa
tctgctactgatttcttaacggatatccatgctactacaaacgatggctcagcaataact
tctaattttgcaactgtagtagatttaaatacaaccggggattacgatgtgacacttagc
tctaccgacacaggtggtaatatatccgatccagtcaccataacagttaccgtacgtgat
acaaccccaccagttattacagcagatacaactatcacatacgaaaaaggaaccacgaag
actgcagctgcctttttaacggatgtaaatgcaacaacgaatgacggttcagcagtaact
tctaacttcaacccaattagtttgaagcaagtagggacttatcaagtaacattaagttct
gttgatgaaaatggtaactatgctttgccagtaaaagtaaccgtcgttgttcaagataca
caaaaaccagtaatctcatccagcgcaacaagcattacctatgagcgaggagaaaagaaa
caagaaacaggcttcttccttgatttagctattaaaacagatgacggcactccggttaca
agtgattttgacacagccgtaaatctggatacagcaggaacttatacggtaacactgaat
tcagaagatgaaagtggcaataaagcagacccagtcactattactgtgaccgttgctgat
acagaaaaaccaattatcacagcagacacaaccataacctacgcaaaagggacaaccaaa
actgtcgcacaatttttaacagatattcatgctacaactaatgatggatcaaccatcatt
agtaattttgacccaaccgttcttgcgcaagaaggaacctacacagtcgtattaaatgca
aaagatgagagcaacaatgaagcagatccggtaactgttacgattacagtagtagataca
aaaggaccgattatcaatgcattaaatgcaatcacctatgaaagaactatcaataaaaac
gaagctgatttcttagcagatattgaggcaactacagatgatggatctacaatcacaacg
gattttaatagtaaagatcttgatacggttggaacctatacagtcacattaaatgcagag
gatgcaagtggtaataaagccactcctgtaaaagtgacgatgaaagtagaggataccatt
cctccaatcattacagctgatcaatcaattacttacgaaagaggcattacaaaaacagaa
caagctttctacacagatattaaagccgcaacaagcgataatagcccaatcaactctgat
ttttcgaaaattgatctaacaaaaacaggaaattatgaagtcttactccaagcgacagat
caaagtgggaacaaagcattgccacttagaatcaacgtgttagtccaagatactatcgct
ccggtcataaaaacaactagccgagaaataatggccgaacgtggtacgccaatgacagaa
caacaactactcgcaaaaattggcgccaatacagatgatggctccaaaataacaactgat
tataacccggcaattgtcaacacatcaggagattatttagttcatctatacgctgttgac
gctgctggcaatcaagcaataccggtagaaataactattcatgtaaaagatacaactgca
ccaataattacggcagataaaaaaattagttaccctgttggaacggttaagacagtaacg
ggatttttacaagacattcatgctgccaccgacgatggttctaaaatcatgacagatttt
gacccgaatatgttaaaaacaccaggaaaatatactatccacttaaatgcagtagatgca
gacgggaataaagctaaaacaatcgatgtaagtcttacagtagaagagaaggtgacgccg
cctaaaccaccgacaccagatgatggcggaaataatacgaatggcagcaatgggacaaat
ggtagtaacaccgatataacggtaaatcctaccaagcaaaatactacggctacaaatgaa
agcatcccagcattaggtgatacaaaatcaactattccagttatcgttggtatgttcctt
ttagctacttcactcgttcttattagacgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
