KEGG   Listeria monocytogenes Finland 1998: LMLG_2476
Entry
LMLG_2476         CDS       T01986                                 
Name
(GenBank) peptidoglycan binding protein
Organism
lms  Listeria monocytogenes Finland 1998
SSDB
Motif
Pfam: Big_3 Bact_surface_Ig-like SdrD_B Ribosomal_L18A DUF4573
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEO38384
LinkDB
Position
877300..883407
AA seq 2035 aa
MIKATRARHYLMLLMAFFLVLGQLNLTALNVFAKENGNDELTYEVQSKLTEDKKSADLTI
KVTPKSDQVKILTIETPDGEKREGQEVSYKAEKNGTTNFLINYQNTSEEKAETKTYTASY
EVSDIVSEDGVNKDSDTEKATEKEDANIQPPSTTNNTKNIKSLKSGQTTVELKIPDYDQT
AWANGDIKEVTATVNFGDSTSTGKKVNFTLPDGMRFVSLPVPSNYQAGTNEDTGVLSYLG
ASDPLGIAITSVEVPNKETAYSQATFGTVSYELSPGTEKASFKFSVRVDAAKYYGPTDLA
DPIKTEVYKGEASTPVASADQAIRAEGNKVVGYADQNHVKTMFRTWYNDQRLSEVLASTD
TTDSYNYTKSYSVVNGSNSLDSRGAAVYIAKNIEVTLYYPEGMEFVNVVNNAGTVLKENS
NVTITNYPSENKVVINNRHLNNSATSNSIYGVKYKVPKGTPAGTYSTAKAPHAVITTYDG
EVFESDALTTNPNDLTTIAPLDTCKVVDTTENKMTLTTANGQLNPNNETWAGSIQINNKK
SAGVKKNQMYQIKFDPNWEAYMVNIPFDSTISGNKISEVQYKTNLNDAFRTFDGALIKNN
NQMYRLDAKAVGLEEGEYFTEVKANVGDFAPGYQSTEASATYRWNSTASYGKIKPGVTSV
QYEGAIWDADDESNTKVSGISTYKVSSAESTVANGTAAFYNKAGTKVKTASAGETINTKA
TLVLHDYPYGTRTVLNDPEVYLHALEGTTIQPSSIKLTDQGGKDVNFTVEQETANNGDKV
YALKTTDVSVGVYVGYPTKHKYLNISYDTTFDVTLNKSINMDAQQVIAWGANVTPATGTN
TFSDLGLDVNKNGRDNDKLLSVNSSTLSIPKQDTVTVETFLSVAGEGDKAAYMEGEDSTV
SYFSPGTDADYTVKITNTSSGNASTFELYIPIPKTGQDFGSKFQSEPFKWDMKLNGALPV
NAEQQDQFDVSYATTATGDNYDSTDIYSNTVADYEKVNMVRIKVKTQINAGETQTFKVPL
KVDETFDSATEGNKIGERDIYNPYYRVITNTFAGSLSGTKVGAELVIGEVAGMLFNDKDV
NGSYEKDKGDEPLANETVELYKWNVSTSEYEPAKVGDKNITATTDSNGKYSFDYSDGVGY
GNYAVKFPDKAGYQYTLKNIGKDTSLNSDVPYSGADRGWAKQINPTLPSSQYTNAGYYAY
NPTQDLKVNLDEKQVQMGRSLEITLPKVASTTGQAAEDTIEPSFFKNIKATTNGYKWTVA
DTKVATVQTLADGSAAVVGVSTNDKTIDVTDLTLTIQDIFGTEQSSTAPVYVIGKEGTVA
QQDGYTIGATDFSLEYKEATELTKAQALTLAKTAAFEEVKNGVNSSAEDCLDLVQVNQTQ
LDAIKNGSNQGGVYPLTYTITKDSKTVSVTIQVTVEDDLTAVNAHDSTIYIGDTWEAEDN
FDSATNKEGDTNVAFSDVTVTGTVNTTVAGAYPVTYTYNGVSKKINVTVKAKQTAVNAHD
SAIYTGDTWNAEDNFDSALDKDGNSVVFANVTVAGNVNTTEAGTNTITYSYDGGSKTITV
TVLENKEGISAHDSTIYVGDAWDAKDNFDSAFDKDGNAVDLEDVTVTEKPTVDTTKAGAY
EVTYKYGKVSKKITLTVKAKLTAVNAHDSAIYIGDTWSAEDNFDSALDKDGNSVAFADIE
VKGTVDTEKVGTYPVTYTYDGVSKTINIQVKDSLTAVNAHDSEIYIGDNWNAKDNFDSAK
DKDGNTVNWKDINVSENPAVDLETVGVYQVTYSYGGVSKTINLTVHPRKTSLEVHDSTMY
TGDKWKAEDNFDNATDKKGDQIPFKDVTVTGQVDSKTAGTYEISYIYDGLKKVARITVIQ
NQAQITVKDSVIPYGGKWEAEANFIGATNRDGVAIPFSKIKVDGKVDVNKAGTYKVIYTY
DPNEGTADAGKKQLSVTANIQVEAEIVKPIKPVDPSKPTDPKKPVKPSTPTKPSTEKTPL
KVVDNKQHTRTYEEAKPLPKTGDQTNTWVIWTGVCLLSMSLLLWVVMRGRKKNYQ
NT seq 6108 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattaaagcaactagagcgcgacattatttaatgctgttaatggcatttttcctagta
ttaggacaattaaatttaacagcccttaatgtgtttgcaaaagaaaatgggaatgacgaa
ctaacttatgaagttcagtctaaattgacagaagataaaaaatcagctgatttaaccatt
aaagtaacaccaaaaagcgatcaggtgaaaatcttgactattgaaacacctgatggagag
aagagagagggccaagaagtaagctataaagccgaaaaaaatggcacaactaacttttta
attaattatcaaaatacaagcgaagaaaaagcagaaactaaaacatatactgcttcttat
gaagtatctgacatagtttctgaagatggagtaaataaagattctgacacagagaaggca
actgaaaaagaagatgctaatattcagcctccttctactacaaataatactaaaaatata
aaatcacttaaatctggacaaacaacagttgaactaaaaataccagattatgaccaaaca
gcatgggcaaatggtgatattaaagaagtaacagcgacagtgaactttggcgacagtact
tctactggcaaaaaagtgaatttcactttaccagatggaatgcgttttgtttctttgcca
gtaccgagtaattatcaggctggtacgaatgaagatacaggcgttttgagttatttagga
gcaagtgatccactaggaatagccattacttcggtggaagtacctaataaagaaacagca
tatagtcaagctacgtttggaacagtaagttatgagctaagtccaggaactgaaaaagcg
agctttaaattttcagtacgggtagatgcagcaaaatattacggaccaactgacttagca
gatccaattaaaacagaagtatataaaggagaggcaagtacacctgttgcttctgcagat
caagcaattcgtgcggaaggaaataaagttgtagggtatgccgatcaaaatcatgtgaaa
actatgtttcgaacttggtataatgatcaaagactatcagaagtccttgcaagtacagat
actaccgactcttataactatacaaaatcatactctgtcgtgaatggatcgaatagttta
gacagtcgtggagcagcagtatacattgctaaaaatatcgaagtaacactttattacccg
gaaggaatggagtttgtaaatgttgtaaataatgctggcacagtgctgaaggaaaattct
aacgtaactattactaattatccaagtgaaaataaggttgtcattaataataggcactta
aacaacagcgccactagtaattctatttatggagtcaaatataaagtacctaaaggaact
cctgcaggaacatacagcacagcaaaagctcctcatgcagttattacaacatatgatgga
gaagtatttgaatcagatgcactgacaactaatcctaacgatttaactactatagcacct
ctagacacttgtaaagttgttgatactaccgaaaataaaatgactttgactacagcaaat
ggtcaacttaatccaaataacgaaacttgggctggtagcattcaaataaataataaaaaa
agtgctggtgtgaaaaaaaatcaaatgtatcaaattaaatttgaccctaactgggaagca
tatatggtcaatatcccttttgatagcactatttcaggaaacaaaatcagtgaagtacag
tataaaacaaatttaaacgacgcttttcgaacatttgatggagcgcttattaaaaataat
aaccaaatgtatcgactagatgcaaaagcagttgggcttgaagaaggggaatatttcaca
gaagtaaaagcaaatgtgggagattttgcgcctggatatcagagcacagaagcttcggct
acttatcgttggaactctactgcttcatacggtaaaatcaagccaggcgttacatctgtc
caatatgaaggcgcaatatgggacgcggatgatgagtccaatacgaaagtatctggcata
tcaacctataaagtttcaagtgcagaaagtacagtagcaaatggtacagcagctttctat
aataaagctggtacaaaggtgaaaacagctagcgcaggagaaacaattaacacaaaagcg
acattagtgttgcatgattacccttatggaacaagaacggtcctcaatgatccagaagtt
tatttacatgctctagaaggtacaacaattcaaccttcttccattaaactaacggatcaa
ggtggaaaagatgttaatttcacagttgaacaagaaacggcaaataatggagataaagta
tacgccttaaaaacaacggatgtgtcagtgggagtatatgttggctatccaactaaacat
aaatatctaaatatcagttacgatacaacgtttgatgtaactctaaataaaagtattaat
atggatgcgcaacaggtcattgcatggggagcaaatgttactccggcaacgggaactaat
actttttcggatttagggctagatgtaaataaaaatggcagagacaatgataaattactt
tctgtcaacagtagtactttaagtattccaaaacaagacacagttactgtagaaaccttc
ttaagcgtggctggagaaggcgataaagcagcttatatggaaggagaagacagtacagtt
tcctacttctcaccaggaacagatgctgattatacagtcaagattacgaacacttctagt
gggaacgcaagtacatttgagctttatatcccaattccaaaaactggtcaagacttcgga
tctaaattccaaagcgagccgttcaaatgggatatgaaactaaatggagcactacctgtt
aatgcagaacaacaagatcaattcgatgtaagttacgcaacaaccgcaacaggagacaat
tatgattccaccgacatatactcaaatactgttgctgattatgaaaaagtaaatatggtt
cgaatcaaagttaaaacacaaattaatgcaggcgaaacacaaaccttcaaagtgccactt
aaagtagatgaaacatttgattcagcaacagaaggcaacaaaattggtgaacgtgatatt
tacaacccatattaccgtgtaattactaatacgttcgctggttcattatctggaacaaaa
gttggtgctgaactagtaattggtgaagtagcaggtatgctatttaatgataaagatgtt
aacggttcgtatgaaaaagataaaggcgatgaaccattagcgaatgaaacagttgagtta
tacaaatggaatgtatccacatctgaatatgaacccgccaaagtaggcgacaaaaatata
actgccacaacagatagcaatggtaaatacagttttgattatagtgatggtgttggttat
ggtaattatgcagtgaaattcccagacaaagctggctaccaatatacattaaaaaatatt
ggtaaagatacttctctaaatagtgatgtaccttacagcggagcagatagaggttgggcg
aaacaaatcaatccaactttaccaagctcacaatatacaaatgcaggttattatgcttat
aatccgacgcaagatttaaaagttaacctagatgaaaaacaagttcaaatgggtcgtagc
ttagaaatcactttaccaaaagtagcctcaacgactggacaagctgccgaagataccatt
gaaccaagcttctttaaaaatattaaagcaacaacaaatggctacaaatggactgttgca
gatacaaaagtggcaacagtacaaacgctagcagatggttcagcagctgtagttggcgtt
tctacaaacgataaaacgattgatgtaacagatttaacgcttactattcaagatattttt
ggtacagaacaaagctctacagccccagtatatgttattggaaaagagggaactgttgcg
caacaagatggttataccataggcgcaactgacttttcattggagtacaaagaagccact
gaattaacgaaagcacaggccctaactcttgcgaaaacagccgcttttgaagaagtaaaa
aacggtgttaattcaagcgcagaagattgtttagacttagtacaagtgaaccaaacacaa
ttagatgccataaaaaatggttctaatcaaggtggcgtgtatccattaacttacacgata
acaaaagatagcaaaacggtttcagtcactattcaagtaactgtagaggatgatttaacg
gcagtgaacgcgcatgattctactatttatataggagatacatgggaagcggaagataac
tttgatagtgcaacaaataaagaaggcgacactaatgtagcatttagtgatgtgacagtt
acaggaactgtaaacactacagtagctggtgcttatccggttacctacacatacaatggt
gtctctaaaaaaattaatgtcactgtcaaagctaaacaaacagcagtcaacgcgcatgat
tccgcgatttatactggcgacacatggaatgccgaagacaactttgatagtgcgcttgat
aaagatggtaattctgtcgtttttgctaatgtaacagtggcaggaaatgtaaatacaact
gaagctggtactaataccatcacttatagctacgatggcggttcgaaaactattacagtt
actgtcttagaaaataaggaaggtatcagtgcacatgactctactatttatgtaggggat
gcatgggatgctaaagataacttcgatagtgcttttgataaagatggtaacgcggttgac
ctagaagatgttacagtcacagaaaaaccaaccgttgatacaacaaaagcaggtgcttac
gaagtcacttacaagtatggaaaagtatcgaaaaaaatcactttaacagtgaaagctaaa
ttaacagcagtcaacgcacatgattccgcgatttacatcggagatacgtggagtgcagaa
gataactttgacagtgcgctggataaagatggcaattccgtcgcttttgctgatatcgaa
gttaaaggaaccgttgatacagaaaaagttggaacatatccagtcacgtacacatatgac
ggtgtctcaaaaacaattaatatccaagtaaaagacagcttaacagcagtgaacgcgcat
gattctgaaatttatataggggacaactggaatgccaaagataattttgacagtgccaaa
gataaagacggaaatacagtaaattggaaagacatcaatgtttcggaaaatccagcagtt
gatttagaaacagttggtgtttaccaagtgacttatagttatggcggtgtttcgaagaca
attaatctgactgtccatccaagaaaaacaagtttagaagttcatgactccacaatgtat
acaggagataaatggaaagcagaagacaactttgataatgctacagataaaaaaggtgac
caaattcctttcaaagatgtcactgtaaccggacaagttgattctaaaacagcaggcacg
tatgaaataagctatatctatgatggattgaaaaaagtagcacgaattactgtaatccaa
aatcaagcacaaatcactgtaaaagatagcgtcattccatatggcggaaaatgggaagca
gaagctaactttataggtgcgacaaaccgagatggtgtagcaattcctttctccaaaatt
aaggtagatggtaaagtagatgtaaataaagctggtacgtacaaagtgatttacacgtat
gatccaaatgaaggaacagctgatgcaggcaagaagcaactttctgtcacagctaacatt
caagtagaagcagaaattgtaaaacctataaaaccagttgatccatcaaaaccaacagat
cctaaaaaaccagtaaaaccatcaactccaacaaaaccatcaacagaaaaaacaccatta
aaagtagttgataacaagcaacatacaagaacatatgaagaagcaaaaccattaccaaaa
acaggtgaccaaacaaatacttgggtaatatggacaggcgtatgcttgctaagtatgagc
ttgcttctatgggtggtaatgagagggagaaagaaaaactatcagtaa

DBGET integrated database retrieval system