Listeria monocytogenes 10403S (serotype 1/2a): LMRG_02265
Help
Entry
LMRG_02265 CDS
T01984
Name
(GenBank) peptidoglycan bound protein
Organism
lmt
Listeria monocytogenes 10403S (serotype 1/2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3
Bact_surface_Ig-like
SdrD_B
Ribosomal_L18A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEO05840
UniProt:
A0A0H3GES0
LinkDB
All DBs
Position
856765..862872
Genome browser
AA seq
2035 aa
AA seq
DB search
MIKATRARHYLMLLMAFFLVLGQLNLTALNVFAKENGNDELTYEVQSKLTEDKKSADLTI
KVTPKSDQVKILTIETPDGEKREGQEVSYKAEKNGTTNFLINYQNTSEEKAETKTYTASY
EVSDIVSEDGVNKDSDTEKETEKEDANIQPPSTTNNTKNIKSLKSGQTTVELKIPDYDQT
AWANGDIKEVTATVNFGDSTSTGKKVNFTLPDGMRFVSLPVPSNYQAGTNEDTGVLSYLG
ASDPLGIAITSVEVPNKETAYSQATFGTVSYELSPGTEKASFKFSVRVDAAKYYGPTDLA
DPIKTEVYKGEASTPVASADQAIRAEGNKVVGYADQNHVKTMFRTWYNDQRLSEVLASTD
TTDSYNYTKSYSVVNGSNSLDSRGAAVYIAKNIEVTLYYPEGMEFVNVVNNAGTVLKENS
NVTITNYPSENKVVINNKHLNNSATSNSIYGVKYKVPKGTPAGTYSTAKAPHAVITTYDG
EVFESDALTTNPNDLTTIAPLDTCKVVDTTENKMTLTTANGQLNPNNETWAGSIQINNKK
SAGVKKNQMYQIKFDPNWEAYMVNIPFDSTISGNKISEVQYKTNLNDAFRTFDGALIKNN
NQMYRLDAKAVGLEEGEYFTEVKANVGDFAPGYQSTEASATYRWNSTASYGKIKPGVTSV
QYEGAIWDADDESNTKVSGISTYKVSSAESTVANGTAAFYNKAGTKVKTASAGETINTKA
TLVLHDYPYGTRTVLNDPEVYLHALEGTTIQPSSIKLTDQGGKDVNFTVEQETANNGDKV
YALKTTDVSVGVYVGYPTKHKYLNISYDTTFDVTLNKSINMDAQQVIAWGANVTPATGTN
TFSDLGLDVNKNGRDNDKLLSVNSSTLSIPKQDTVTVETFLSVAGEGDKAAYMEGEDSTV
SYFSPGTDADYTVKITNTSSGNASTFELYIPIPKTGQDFGSKFQSEPFKWDMKLNGALPV
NAEQQDQFDVSYATTATGDNYDSTDIYSNTVADYEKVNMVRIKVKTQINAGETQTFKVPL
KVDETFDSATEGNKIGERDIYNPYYRVITNTFAGSLSGTKVGAELVIGEVAGMLFNDKDV
NGSYEKDKGDEPLANETVELYKWNVSTSEYEPAKVGDKNITATTDSNGKYSFDYSDGVGY
GNYAVKFPDKAGYQYTLKNIGKDTSLNSDVPYSGADRGWAKQINPTLPSSQYTNAGYYAY
NPTQDLKVNLDEKQVQMGRSLEITLPKVASTTGQAAEDTIEPSFFKNIKATTNGYKWTVA
DTKVATVQTLADGSAAVVGVSTNDKTIDVTDLTLTIQDIFGTEQSSTAPVYVTGKEGTVA
QQDGYTMGAADFSLEYKEATELTKAQALTLAKTAAFEEVKNGVNSSAEDCLDLVQVNQTQ
LDAIKNGSNQGGVYPLTYTITKDSKTVSVTIQVTVEDDLTAVNAHDSTIYIGDTWEAEDN
FDSATNKEGDTNVAFSDVTVTGTVNTTVAGAYPVTYTYNGVSKKINVTVKAKQTAVNAHD
SAIYTGDTWNAEDNFDSALDKDGNSVVFANVTVAGNVNTTEAGTNTITYSYDGGSKTITV
TVLENKEGISAHDSTIYVGDAWDAKDNFDSAFDKDGNAVDLEDVTVTEKPTVDTTKAGAY
EVTYKYGKVSKKITLTVKAKLTAVNAHDSAIYIGDTWSAEDNFDSALDKDGNSVAFADIE
VKGTVDTDKVGTYPVTYTYDGVSKTINIQVKDILTAVNAHDSEIYIGDNWNAKDNFDSAK
DKDGNTVNWKDINVSENPAVDLETVGVYQVTYSYGGVSKTINLTVHPRKTSLEVHDSTMY
TGDKWKAEDNFDNATDKKGDQIPFKDVTVTGQVDSKTAGTYEITYIYDGVKKVAHITVIQ
NQAQITVKDSVIPYGEKWEAEANFIGATNRDGVAIPFSKIQVEGKVDVNKAGTYKVIYTY
DPNEGTADAGKKQLSVTANIQVEAEIVKPIKPVDPSKPTDPKKPVKPSTPTKPSTEKTPL
KVVDNKQHTRTYEEAKPLPKTGDQTNTWVIWTGVCLLSMSLLLWVVMRGRKKNYQ
NT seq
6108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaagcaactagagcgcgacattatttaatgctgttaatggcatttttcctagta
ttaggacaattaaatttaacagcccttaatgtgtttgcaaaagaaaatgggaatgacgaa
ctaacttatgaagttcagtctaaattgacagaagataaaaaatcagctgatttaaccatt
aaagtaacaccaaaaagcgatcaggtgaaaatcttgactattgaaacacctgatggagag
aagagagagggccaagaagtaagctataaagccgaaaaaaatggcacaactaacttttta
attaattatcaaaatacaagcgaagaaaaagcagaaactaaaacatatactgcttcttat
gaagtatctgacatagtttctgaagatggagtaaataaagattctgacacagagaaggaa
actgaaaaagaagatgctaatattcagcctccttctactacaaataatactaaaaatata
aaatcacttaaatctggacaaacaacagttgaactaaaaataccagattatgaccaaaca
gcatgggcaaatggtgatattaaagaagtaacagcgacagtgaactttggcgacagtact
tctactggcaaaaaagtgaatttcactttaccagatggaatgcgttttgtttctttgcca
gtaccgagtaattatcaggctggtacgaatgaagatacaggcgttttgagttatttagga
gcaagtgatccactaggaatagccattacttcggtggaagtacctaataaagaaacagca
tatagtcaagctacgtttggaacagtaagttatgagctaagtccaggaactgaaaaagcg
agctttaaattttcagtacgggtagatgcagcaaaatattacggaccaactgacttagca
gatccaattaaaacagaagtatataaaggagaggcaagtacacctgttgcttctgcagat
caagcaattcgtgcggaaggaaataaagttgtagggtatgccgatcaaaatcatgtgaaa
actatgtttcgaacttggtataatgatcaaagactatcagaagtccttgcaagtacagat
actaccgactcttataactatacaaaatcatactctgtcgtgaatggatcgaatagttta
gacagtcgtggagcagcagtatacattgctaaaaatatcgaagtaacactttattacccg
gaaggaatggagtttgtaaatgttgtaaataatgctggcacagtgctgaaggaaaattct
aacgtaactattactaattatccaagtgaaaataaggttgtcattaataataagcactta
aacaacagcgccactagtaattctatttatggagtcaaatataaagtacctaaaggaact
cctgcaggaacatacagcacagcaaaagctcctcatgcagttatcacaacatatgatgga
gaagtatttgaatcagatgcactgacaactaatcctaacgatttaactactatagcacct
ctagacacttgtaaagttgttgatactaccgaaaataaaatgactttgactacagcaaat
ggtcaacttaatccaaataacgaaacttgggctggtagcattcaaataaataataaaaaa
agtgctggtgtgaaaaaaaatcaaatgtatcaaattaaatttgaccctaactgggaagct
tatatggtcaatatcccttttgatagcactatttcaggaaacaaaatcagtgaagtacag
tataaaacaaatttaaacgacgcttttcgaacatttgatggagcgcttattaaaaataat
aaccaaatgtatcgactagatgcaaaagcagttgggcttgaagaaggggaatatttcaca
gaagtaaaagcaaatgtgggagattttgcgcctggatatcagagcacagaagcttcggct
acttatcgttggaactctactgcttcatacggtaaaatcaagccaggcgttacatctgtc
caatatgaaggcgcaatatgggacgcggatgatgagtccaatacgaaagtatctggcata
tcaacctataaagtttcaagtgcagaaagtacagtagcaaatggtacagcagctttctat
aataaagctggtacaaaggtgaaaacagctagcgcaggagaaacaattaacacaaaagcg
acattagtgttacatgattacccttatggaacaaggacggtcctcaatgatccagaagtt
tatttacatgctctagaaggtacaacaattcaaccttcttccattaaactaacggatcaa
ggtggaaaagatgttaatttcacagttgaacaagaaacggcaaataatggagataaagta
tacgccttaaaaacaacggatgtgtcagtgggagtatatgttggctatccaactaaacat
aaatatctaaatatcagttacgatacaacgtttgatgtaactctaaataaaagtattaat
atggatgcgcaacaggtcattgcatggggagcaaatgttactccggcaacgggaactaat
actttttcggatttagggctagatgtaaataaaaatggcagagacaatgataaattactt
tctgtcaacagtagtactttaagtattccaaaacaagacacagttactgtagaaaccttc
ttaagcgtggctggagaaggcgataaagcagcttatatggaaggagaagacagtacagtt
tcctacttctcaccaggaacagatgctgattatacagtcaagattacgaacacttctagt
gggaacgcaagtacatttgagctttatatcccaattccaaaaactggtcaagacttcgga
tctaaattccaaagcgagccgttcaaatgggatatgaaactaaatggagcactacctgtt
aatgcagaacaacaagatcaattcgatgtaagttacgcaacaaccgcaacaggagacaat
tatgattccaccgacatatactcaaatactgttgctgattatgaaaaagtaaatatggtt
cgaatcaaagttaaaacacaaattaatgcaggcgaaacacaaaccttcaaagtgccactt
aaagtagatgaaacatttgattcagcaacagaaggcaacaaaattggtgaacgtgatatt
tacaacccatattaccgtgtaattactaatacgttcgctggttcattatctggaacaaaa
gttggtgctgaactagtaattggtgaagtagcaggtatgctatttaatgataaagatgtt
aacggttcgtatgaaaaagataaaggcgatgaaccattagcgaatgaaacagttgagtta
tacaaatggaatgtatccacatctgaatatgaacccgccaaagtaggcgacaaaaatata
actgccacaacagatagcaatggtaaatacagttttgattatagtgatggtgttggttat
ggtaattatgcagtgaaattcccagacaaagctggctaccaatatacattaaaaaatatt
ggtaaagatacttctctaaatagtgatgtaccttacagcggagcagatagaggttgggcg
aaacaaatcaatccaactttaccaagctcacaatatacaaatgcaggttattatgcttat
aatccgacgcaagatttaaaagttaacctagatgaaaaacaagttcaaatgggtcgtagc
ttagaaatcactttaccaaaagtagcctcaacgactggacaagctgccgaagataccatt
gaaccaagcttctttaaaaatattaaagcaacaacaaatggctacaaatggactgttgca
gatacaaaagtggcaacagtacaaacgctagcagatggttcagcagctgtagttggcgtt
tctacaaacgataaaacgattgatgtaacagatttaacgcttactattcaagatattttt
ggtacagaacaaagctctacagccccagtatatgttactggaaaagagggaactgttgcg
caacaagatggttacaccatgggtgcagctgacttttcattggagtacaaagaagccact
gaattaacgaaagcacaggccttaactcttgcgaaaacagccgcttttgaagaagtaaaa
aacggtgttaattcaagcgcagaagattgtttagacttagtacaagtgaaccaaacacaa
ttagatgccataaaaaatggttctaatcaaggtggcgtgtatccattaacttacacgata
acaaaagatagcaaaacggtttcagtcactattcaagtaactgtagaggatgatttaacg
gcagtgaacgcgcatgattctactatttatataggagatacatgggaagcggaagataac
tttgatagtgcaacaaataaagaaggcgacactaatgtagcatttagtgatgtgacagtt
acaggaactgtaaacactacagtagctggtgcttatccggttacctacacatacaatggt
gtctctaaaaaaattaatgtcactgtcaaagctaaacaaacagcagtcaacgcgcatgat
tccgcgatttatactggcgacacatggaatgccgaagacaactttgatagtgcgcttgat
aaagatggtaattctgtcgtttttgctaatgtaacagtggcaggaaatgtaaatacaact
gaagctggtactaataccatcacttatagctacgatggcggttcgaaaactattacagtt
actgtcttagaaaataaggaaggtatcagtgcacatgactctactatttatgtaggggat
gcatgggatgctaaagataacttcgatagtgcttttgataaagatggtaacgcggttgac
ctagaagatgttacagtcacagaaaaaccaaccgttgatacaacaaaagcaggtgcttac
gaagtcacttacaagtatggaaaagtatcgaaaaaaatcactttaacagtgaaagctaaa
ttaacagcagtcaacgcacatgattccgcgatttacatcggagatacgtggagtgcagaa
gataactttgacagtgcgctggataaagatggcaattccgtcgcttttgctgatatcgaa
gttaaaggaaccgttgatacagacaaagttggaacatatccagtcacgtacacatatgac
ggtgtctcaaaaacaattaatatccaagtaaaagacatcttaacagcagtgaacgcgcat
gattctgaaatttatataggggacaactggaatgccaaagataattttgacagtgccaaa
gataaagacggaaatacagtaaattggaaagacatcaatgtttcggaaaatccagcagtt
gatttagaaacagttggtgtttaccaagtgacttatagttatggcggtgtttcgaagaca
attaatctgactgtccatccaagaaaaacaagtttagaagttcatgactccacaatgtat
acaggagataaatggaaagcagaagacaattttgataatgctacagataaaaaaggtgac
caaattcctttcaaagatgtcactgtaaccggacaagttgattctaaaacagcaggcacg
tatgaaataacctatatctatgatggagtgaaaaaagtagcacacatcactgtaatccaa
aaccaagcacaaatcactgtaaaagatagcgttatcccatatggagaaaaatgggaagca
gaagctaactttataggcgcgacaaaccgagatggtgtagcaattcctttctccaaaatc
caagtagaaggtaaagtagatgtaaataaagctggtacgtacaaagtgatttacacgtat
gatccaaatgaaggaacagcagatgcaggcaagaagcaactttctgtcacagctaacatt
caagtagaagcagaaattgtaaaacctataaaaccagttgatccatcaaaaccaacagat
cctaaaaaaccagtaaaaccatcaactccaacaaaaccatcaacagaaaaaacaccatta
aaagtagttgataacaagcaacatacaagaacatatgaagaagcaaaaccattaccaaaa
acaggtgaccaaacaaatacttgggtaatatggacaggcgtatgcttgctaagtatgagc
ttgcttctatgggtggtaatgagagggagaaagaaaaactatcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
