Lactobacillus mulieris: PUW59_06815
Help
Entry
PUW59_06815 CDS
T08874
Name
(GenBank) Rib/alpha-like domain-containing protein
Organism
lmul
Lactobacillus mulieris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
Rib
Gram_pos_anchor
RibLong
Cutinase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WEB30445
LinkDB
All DBs
Position
complement(1331020..1335732)
Genome browser
AA seq
1570 aa
AA seq
DB search
MMTKNVKIKGGANNVTIQVIGGPTDRQTWQQVQFDIDKGPTILHNSNELSDEYRDYFIHD
KKFNGHYYNGSDPEALEMWTHINLPTFSYANYGRANLDRQTTMNHLFYDNNWFPASIKNR
TSYEWDDALEFGGNWITRYKHNDGTTQNGPLINLDLNSNDDKNVKYLGDIYTFHYQSANG
YYLGGTKKVQMDFTTVVDSTVTDVPETRLIAGYKAGAAGSDFRRAQENNHLVDNQTYKLI
VNETSQRSDKKIPANAFKVAGPDNISKDYTHEELNQTNNTQEFNYYTDKIDTATQQNILN
SLKVASTTQNGVTVSDPVIDTVNKTVTYNVVYTDTVAEKTTHIIFKDGDTPVKTVEVSGK
PGDKVPVSEEDQKIPDGYELVPGEKVPTEVDFPSDGTTPEDKVVKLTHKTTTVNPDDPKT
PEDTLPENPKVHYPDGVSEKDLNKTVTRRIYEVDPVTKEKVLVKTQEAKLTRTATVDEVT
GKVTKYSDWTTGTWESYTASTKEGYTPDQSTVPEVTVDGDTESTEVVINYVKNPTGKIIF
KDGDKPVKTVEVSGKPGDKVPVSEKDQKIPDGYELVPGEKVPTEVDFPSDGTTPSESVVK
IQKKTPDTPSTDQPTGKIIFKDGDKPVKEVTVPGEAGKTVEVPDTTIPEGYELVPGQEVP
TTIDFPGDGSNPSDKVVELQPKTPTEQTTHIVFKDGDTPVKTVEVSGKPGDKVPVSEEDQ
KIPDGYELVPGEEVPTEVDFPSDGTTPSETVVKIQKKTPDTPSTDQPTGKIIFKDGDKPV
KTVEVPGKPGESVEVPDTTIPEGYELVPGEKVPTTIDFPGDGSNPSDKVVEVQPKTPTEQ
TTHIVFKDGDTPVKTVEVSGKPGDKVPVSEEDQKIPDGYELVPGQEVPTEVDFPSDGTTP
SETVVKIQKKTPDTPSTDQPTGKIIFKDGDKPVKTVEVPGKPGESVEVPDTTIPEGYELV
PGQEVPTTIDFPGDGSNPSDKVVEVQPKTPTEQTTHIVFKDGDTPVKTVEVSGKPGDKVP
VSEEDQKIPDGYELVPGQEVPTEVDFPSDGTTPSETVVKIQKKTPDTPSTDQPAGKIIFK
DGDKPVKEVTVPGEAGKTVEVPDTTIPEGYELVPGEKVPTTIDFPGDGSSPEDKVVKVQP
KTPTEQTTHIVFKDGDTPVKTVEVSGKPGDKVPVSEEDQKIPDGYELVPGQEVPTEVDFP
SDGTTPSETVVKIQKKTPDTPSTDQPAGKIIFKDGDKPVKPVEVPGKPGESVEVPDTTIP
EGYELVPGQKVPTTIDFPGDGSNPSDKTVKLTHKIVVVTPDDPKSSNDPLPDNPSKNYPD
GVTETNLRKRIKRTINVINPNGDIDVTTQLVVFERTATVDQVNGQVSYSDWKQVGEDKSW
PKFEAPDITGYTPSTESVSEVIPNVNNENVTVNITYKADNSGSDRDANTPTDPQPQGQDI
TTNKGTTPSPSDGIKNKGDLPDGTKYSWKETPNTNNGDTTGTVVVTYPDGSKDEVKVTIH
VTEPNKKTGMEDNKSTIVTSSSSANKVKNTANSKQSTLPQTGANTSALAGLGIALMGLAS
MIFINKKKKD
NT seq
4713 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgactaaaaatgtcaagattaaaggtggagctaataatgttactattcaagtaatt
ggtggtccaactgatcgacaaacttggcaacaagttcaatttgatattgataaaggccca
actatcttacacaattcaaatgaactctcagatgaatatcgtgattacttcattcatgat
aaaaaatttaatggtcactactacaacgggtcagatcctgaagctttagaaatgtggacc
cacattaacttgcctacattttcttacgctaactatggtagagctaatttagaccgtcaa
actactatgaatcatttgttctatgataacaactggtttccagcaagtataaaaaataga
acttcatatgaatgggatgatgcccttgaatttggtggaaattggattactcgttacaag
cataatgacggtacaactcaaaacggcccattaattaacttagatttaaatagcaatgat
gacaaaaatgttaagtacttaggtgatatctatacttttcactaccaaagtgctaatggt
tattatttaggtggtactaagaaagttcaaatggacttcactactgtagtggattctact
gtaactgacgttccagaaacacgtttaattgctggctacaaggctggtgctgcgggtagt
gatttcagacgtgctcaagaaaataatcatttggtagataatcaaacttataagttaatt
gttaatgaaacaagtcaacgttcagataagaagattccggcaaatgcttttaaagtagct
ggacctgataacatttctaaagattacactcacgaagaacttaaccagacaaacaatact
caggaatttaattattacactgataaaattgataccgctacccaacaaaacattttaaat
tcattaaaggtagcttcaacaactcaaaacggtgtaactgtttctgatcctgttattgat
acagtaaataagactgtaacttacaatgttgtttatactgatacagtagctgaaaagact
actcatattatcttcaaagatggtgatacaccagttaagacagtagaagtatcaggtaag
cctggagacaaggtgccagtaagtgaagaagatcaaaagatccctgatggttatgaatta
gtaccaggcgaaaaagtaccaacagaagtagacttcccatcagatggtacaacaccagaa
gataaagtagttaaattgactcacaagacaactacagtaaatccagatgatccaaagaca
ccggaagatactttacctgaaaatccaaaagttcattatccagatggcgtaagtgaaaaa
gacttaaacaagacagttactagaaggatttatgaagtagatccagtaactaaggaaaaa
gttttagtaaagacacaagaagctaagttaactagaacagccactgttgatgaagtaact
ggtaaggtaactaagtacagtgattggacaactggaacttgggaaagctacactgcaagt
actaaagagggatacacaccagatcaaagtacagtgccagaagtaactgtagatggtgat
actgaaagtactgaagtggtaatcaactatgttaagaatccaacaggtaagattatcttc
aaagatggagacaagccagttaagacagtagaagtatcaggtaagcctggagacaaggtg
ccagtaagtgaaaaagatcaaaagattccagatggttatgaattagtaccaggcgaaaaa
gtaccaacagaagtagatttcccaagtgatggaacaactccaagtgaatcagttgttaag
attcaaaagaagacaccagacactccatcaactgatcaaccaacaggtaagattatcttc
aaagatggagataagccagttaaggaggtaacagtaccaggtgaagcaggtaagactgtt
gaagtaccagatacaacaattccagaaggctacgaattagtaccaggccaagaagtgcca
acaacaattgacttcccaggcgatggatcaaacccaagtgataaagtagttgagttacaa
ccaaagacaccaactgaacaaacaactcacattgttttcaaagatggtgatacaccagtt
aaaacagtagaagtatcaggtaagcctggagacaaggtgccagtaagtgaagaagatcaa
aagattccagatggttatgaattagtgccaggtgaagaagtaccaacagaagttgatttc
ccaagtgatggaacaactccaagtgaaacagttgttaagattcaaaagaagacaccagac
actccatcaactgatcaaccaacaggtaagattatcttcaaagatggagacaagccagtt
aagacagttgaagttccaggaaagccaggcgaaagtgttgaagtaccagacacaacaatt
ccagaaggttatgaattagtgccaggtgaaaaggtgccaacaacaattgacttcccaggc
gatggatcaaacccaagtgataaagtagttgaggtacaaccaaagacaccaactgaacaa
acaactcacattgttttcaaagatggtgatacaccagttaaaacagtagaagtatcaggt
aagcctggagacaaggtgccagtaagtgaagaagatcaaaagatcccagatggttatgaa
ttagtgcctggtcaagaagtaccaacagaagttgatttcccaagtgatggaacaactcca
agtgaaacagttgttaagattcaaaagaagacaccagacactccatcaactgatcaacca
acaggtaagattatcttcaaagatggagacaagccagttaagacagttgaagttccagga
aagccaggcgaaagtgttgaagtaccagacacaacaattccagaaggctacgaattagta
ccaggccaagaagtgccaacaacaattgacttcccaggcgatggatcaaacccaagtgat
aaagtagttgaggtacaaccaaagacaccaactgaacaaacaactcacattgttttcaaa
gatggtgatacaccagttaaaacagtagaagtatcaggtaagcctggagacaaggtgcca
gtaagtgaagaagatcaaaagatcccagatggttatgaattagtgcctggtcaagaagta
ccaacagaagttgatttcccaagtgatggaacaactccaagtgaaacagttgttaagatt
caaaagaagacaccagacactccatcaactgatcaaccagcaggaaagattattttcaaa
gatggagacaagccagttaaggaagtaacagtcccaggtgaagcaggtaagactgttgaa
gtaccagacacaacaattccagaaggttatgaattagtgccaggtgaaaaggtgccaaca
acaattgatttcccaggcgatggatcaagcccagaagataaagtagttaaggtacaacca
aagacaccaactgaacaaacaactcacattgtcttcaaagatggtgatacaccagttaaa
acagtagaagtatcaggtaagcctggagacaaggtgccagtaagtgaagaagatcaaaag
atcccagatggttatgaattagtgcctggtcaagaagtaccaacagaagttgatttccca
agtgatggaacaactccaagtgaaacagttgttaagattcaaaagaagacaccagacact
ccatcaactgatcaaccagcaggaaagattattttcaaagatggagacaagccagttaag
ccagttgaagtaccaggaaagccaggcgaaagtgttgaagtaccagatacaacaattcca
gaaggctacgaattagtaccaggtcaaaaagtgccaacaacaattgacttcccaggcgat
ggttcaaatccaagtgataagaccgttaagttaactcacaagattgttgttgtaacacca
gatgatccaaaatcttcaaatgatccactaccagataatccatctaagaattatccagac
ggtgtaactgaaaccaatttgagaaaacgtataaaacgtacaattaatgtaattaaccca
aatggtgatattgatgtaactactcaactagttgtctttgaaagaacagcaacagttgat
caagtgaatggtcaagtaagttatagcgattggaagcaagttggtgaagataaatcttgg
cctaagtttgaggctccagatattactggatatactccaagtacggaatctgtttctgaa
gtgattcctaatgtgaataatgaaaacgttactgtaaatattacttacaaagctgataac
tcaggttcagatagagatgctaatacccctactgatccacaaccacaaggtcaggatatt
acaactaataaaggaactactccaagcccatctgatggcattaagaataaaggtgatttg
ccagacggtacaaaatattcttggaaagaaactccaaatacgaataacggtgatacaacc
ggtactgttgttgtaacttatccagatggatcaaaggatgaagtaaaagtaactattcat
gttacagaaccaaataagaagacaggtatggaagataacaagtctacaattgttacttca
tcaagctcagcaaataaggtgaagaatactgctaatagtaagcaaagtactttacctcaa
acaggtgcgaatacttcagctcttgctggtttaggaatcgcattaatgggcttagcaagt
atgatcttcattaataaaaagaaaaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
