Ligilactobacillus murinus: CPS94_07660
Help
Entry
CPS94_07660 CDS
T07549
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lmur
Ligilactobacillus murinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rib
RibLong
aRib
Pectate_lyase_5
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWZ38796
UniProt:
A0AAD0PAH5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1532469..1538945)
Genome browser
AA seq
2158 aa
AA seq
DB search
MLSKNNTNLYSAKLAPKHQKFAIKKFTVGVASVLIGTTFAFYTAPNVLADLSDAQSDPVT
TKDQTNASASKEQASRKDATSSVDKTPAEQAPVVKQPTEPEQTSQTPSQDASHVTDMAQL
KTALNDRNVAEIVLDKDVTNDTDKYVNVDQAKVARKVTVWGSKVDDKTTTLNLGDQSLYF
YNKTEDAEHKWDLTFKNLNVTTNDPHGYGVVSFQNNGKNANVTFDNVKAGGNGVLAYAPN
ATVNLHDVSVTPSYVESSPTANLTADKVDLSGNVDLNAEVNNSYTAKNIEAGGQVTVKSG
ANVVLTTTNSNSNRLQNLTAGSLNVEKGAKLTVRSKTTASNVKVPSSASWSGLVDNSSAV
YVTKGNAKVDGELKVEPFTKDKKSTSVVGAVVLGASGNEENNLVVGSTGKLVVDATQAPN
TRGVYFTHNNHDFGLQPGGQAVFKMGHGVSNAVFNPDNLILNEGSKLVVETYQDNNGVTN
VGFDDTGAGAHSGVITLNLNSSDHSNNSYVTVGNIHGNLTVKQDALLKVVRKVDETSQQA
ATPVLSFGGTGINNGTSILNVDYGSVVLEDALQKDSLAHSNLNYYSYLGINNNEHSPIYP
LGMVSMWGTSSTDRVNLVAPKLFKMVRTGEQKGMLFRLEAEDNKIMLTTDEGKSVPVKYG
TLGNVKYNNGLVSQAKDYRWDLTHLKSVNWFGDFSMNYLNKNQTGTPFGLSPTASVSFKQ
ETPQAAKDDFNNYFNWWSSTNLELGTDLNGFHPFYRPLVVLQNEVQSEKVSYPEHENPGD
VTYKVGATDGDWVKVDATGTLSVTPNATTSVGMHNVPVEVSFASGQKVVVYAPVTVLDSN
SKAVFNGENVLLGEGRPVFTHKASNKALVPAPMQALNKLVVYTKDLKTGKYLPSAVYLPD
KAGEFTDEATGKALVGVKVTWKQVPSPLVAQDSSNTGTESLPAVVNVANDLVDFPKGGRF
PDLGELPVMMTMYGASAKNDVQATSGLEKTLPNASDVVQTEELTPAHHAEVASVAWKTKP
ELTRPDRQAKGVVSVDFVDGTTLNVPVLVNVAPNMAESNTPQGQELTTPLNQVPEAQRGI
SNTSELPTDTKYSWKAPLDVTIPGTRQATVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPGKVPTDAEK
YTPQGQEVETAQGKAPEAQAGVSNKADLPTDTKYSWKAPLDVETPGQHEGTVVVTYPDGS
QDEVPVKVIVKAPTDAEKYAPQGQEVETNQGKQPEAQTGVSNKADLPTDTKYSWKAPLNV
ETPGEQEGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPEKVPTDAEKYTPQSQEVTTAQGKTPEAQE
GVSNKADLPTDTKYSWKAPLNVETPGQHQGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPEKSLTDA
EKYAPQGQEVETAQGKTPEAQAGVSNKGDLPTDTKYSWKAPLDVETPRELKGTVVVTYPD
GSQNEVPVKVVVKAPTDAEKYTPQGQEVETDQDKTPEAQAGVVNKGDLPTETKYSWKAPL
DVTTPGEHEGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPTDAEKYTPQGQEVETAQGKVPEAQAGV
VNKGDLPTGTKYSWKAPLDVTTPGPHVGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPEKSLTDAEK
YTPQSQEVETDQGKAPEAQAGVVNKGDLPTGTKYSWKAPLDVTTPGEHEEKVVVTYPDGS
QDEVPVKVVVKAPEKSLTDAEKYTPQGQEVETAQGKTPEAQSGVSNKGDLPTETKYSWKA
PLDVATPGEHVGTVVVTYPDGSQDEIPVKVVVKAPEKASTDAEKYTPQSQEVTTNTGKTP
EAESVVTNKSDLPTGTKYSWKTPLDVTTPGSHKGTVVVTYPDGSQDEVPVKVTVKAPTDA
EKYTPQGQEVETAQGKNPEAESVVTNKADLPAGTKYSWRAPLDVTTPGSHKGTVVVTYPD
GSQDEVPVKVVVKAPEKASTDAEKYTPQSQEVTTNTGKTPEAESVVTNKSDLPTGTKYSW
KAPLDVTTPGEHEGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVKAPEKALTDAEKYTPQSQEVETAQGK
TPEAESVVTNKADLPAGTKYSWKAPLDVMTPGVHEGTVVVTYPDGSQDEVPVKVVVDGAG
TTADKRKEQTQTKGTNKNVLPQTGEKDTVVQAWFGVLISLLAGMLGAKTLNKKHFQDK
NT seq
6477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatcaaaaaacaatacaaatctttattcagctaaattagcaccgaaacatcagaaa
tttgcgatcaaaaagtttacagttggggtggcatcagtccttattgggacaacatttgcc
ttctatactgcacctaatgttttggccgatctatcagatgcccaaagtgatccagtaacg
actaaagatcaaaccaatgcttcagcctcaaaagagcaagcatcacgaaaagatgcgaca
tcttcagtagataaaacaccagcagagcaagctcctgtagttaaacagcctactgagcca
gagcaaacttctcaaactccaagtcaagatgctagtcatgtaactgatatggcacaatta
aaaactgcgctaaatgacagaaatgtagccgagatcgtattagataaggatgttactaat
gacacggataaatatgtaaatgttgatcaggctaaagtcgcgcgtaaagtgactgtttgg
gggtctaaagtagatgataagacaacgacgctaaacttaggtgatcaatcactatatttt
tacaataagacagaagatgctgaacataagtgggatctgacatttaaaaatctaaatgtg
acgaccaatgatccccatggatatggtgttgtaagttttcaaaataatggtaaaaatgcc
aatgttacctttgataatgtcaaagcaggaggcaatggggtcttggcctatgcacctaat
gcaacggtaaatttgcatgatgtaagtgtgactccaagctatgttgaaagttcacctact
gccaatttaacagccgataaagttgatcttagtggtaatgttgacctgaatgctgaggta
aataatagttatacagcaaaaaatattgaggcaggtggtcaagttacggttaaaagtggg
gctaatgtagttttgacgaccactaactccaatagcaatcggttacaaaatttgacagcc
ggttcattgaacgttgaaaaaggagctaagttaacggtcagatcaaagacgacagcttca
aatgtcaaagtcccttcatctgcttcttggagcggcctagtagataattcaagtgcagtc
tatgtgacgaaaggaaatgctaaagttgatggtgagttgaaagttgagccgtttactaaa
gataaaaagtcgactagtgtggtcggagctgttgttttaggggcttctggcaatgaggaa
aataatcttgtagtgggatcgacaggtaaattagttgttgatgcgacacaagcgcctaat
acccgtggcgtttattttacgcataataatcatgattttggcctacaaccaggaggtcaa
gcagtatttaagatgggacatggcgtttcgaacgctgtctttaatccagataatctgatc
ttaaatgaaggttctaaattagttgttgagacttatcaagataacaatggggtgaccaat
gtaggttttgatgatactggcgcaggtgctcattcaggtgtgatcacattaaacttaaat
agcagcgatcattctaacaattcttatgtgacagttggaaatattcatggaaatttgacg
gttaagcaagatgcgcttttaaaagttgtacgtaaggtagatgagactagtcagcaagct
gcaacgccggtattatcttttgggggaactggaataaataatggaacaagtatattaaat
gtcgattatggttcggtagtgctagaagatgcgctccaaaaagatagtttagcacattcc
aatttgaattattattcatacttagggatcaataataatgaacactcaccgatatatcca
ttggggatggtatcgatgtggggaacaagttcgaccgatcgagtgaatttagtggcacca
aagctttttaagatggtgcgtacgggtgagcaaaaagggatgctctttcggttagaagct
gaggataataaaataatgttaactactgacgaaggaaaaagtgtaccagtaaaatacgga
actttaggcaatgtcaaatataacaatggtctagtttcgcaggctaaagattatcggtgg
gatctgactcatttgaaatcagtcaattggtttggcgatttctcgatgaattatctcaat
aaaaatcaaacagggacaccatttggcttgtctccaacagcaagtgtcagcttcaaacaa
gaaacgcctcaagctgctaaagatgatttcaataactattttaactggtggagttctacg
aatttagagcttggtactgatctcaatggttttcatccattttatagacctttagtagtt
ttacaaaatgaagtccaaagtgaaaaagtatcataccctgagcatgaaaaccctggtgat
gtgacttataaagtaggtgcaacagatggcgactgggtgaaagtcgatgcaacagggact
ttatcagtaacgccaaatgctacaactagtgtggggatgcataatgtgccggtcgaagtt
agttttgctagtggtcaaaaagtagtcgtttatgccccagtaacagtactagatagcaat
tctaaagcagtatttaatggtgaaaatgtattgcttggtgaggggcgccctgtatttaca
cataaagccagcaataaagcattagttccagctccaatgcaagcattaaataaattagtt
gtttatactaaagatctaaaaacagggaaatatttgccaagtgcagtttatcttccagat
aaagcaggcgagtttactgatgaagctacaggtaaggctttagtaggtgttaaagtaact
tggaaacaagtaccgtcccctttggttgctcaagatagctctaatacaggaactgaatca
ctgccagcagtggtcaatgtagcaaatgatctggtcgattttccaaaaggaggtcgtttc
cctgatctgggtgaactaccggtaatgatgacaatgtatggtgctagtgctaaaaatgat
gtccaggcaactagtgggctagagaagacgttacctaatgcaagtgatgttgttcaaact
gaggagcttacaccagcgcatcatgctgaagttgccagtgttgcttggaaaacaaaacct
gagttaacgcgacccgatcgccaagctaaaggggtggtcagtgttgattttgttgatgga
acaacactaaacgttcctgttttagtgaatgttgctcctaatatggctgaatccaacaca
ccacaggggcaggaactgactactccattaaatcaagtaccagaagcacaaagggggata
tcaaatacttctgagctacctacagacacaaaatatagttggaaggctccgttagatgtg
acaatcccaggtacgcgtcaagctacagtagtggtaacctatccagatggaagccaagat
gaagtgccagttaaagtggtagtaaaagcacctggaaaagtgccaacagatgctgaaaaa
tatacgccacaaggccaagaagtagagacagcccaaggtaaggccccagaagctcaggca
ggagtgtccaataaagcggatttaccaacagacacgaagtatagttggaaagcaccgtta
gacgtggaaaccccaggtcagcatgaaggaacagtagtggtaacatatccagacggcagt
caagatgaagtaccagttaaggtaatagtaaaagcaccaacagatgctgaaaaatatgca
ccacaaggccaagaagtagagacaaatcaaggaaaacaaccagaagctcaaacaggggtg
tccaataaagctgatttaccaacagacacgaagtatagttggaaagcaccattaaacgtg
gaaactccaggagagcaagaaggcacagtggtggtgacgtatccagatggcagccaagat
gaagtgccagttaaagtggtagtaaaagcacctgaaaaagttccaacagatgctgaaaaa
tatacgccacaaagtcaagaagtaacgacagcccaaggaaagacaccagaagcccaggaa
ggagtgtccaataaagcggatttaccaacagacacaaagtatagttggaaagcaccgtta
aacgtggaaaccccaggtcagcatcaaggaacagtagtggtaacatatccagacggcagt
caagatgaagtgccagttaaagtggtagtaaaagcacctgaaaaatccttaacagatgcc
gaaaaatacgcaccacaaggccaagaagtagagacagcccaaggaaagacaccagaagct
caggcaggagtgtccaataaaggcgacttaccaacagacacgaagtacagttggaaagcg
ccattagacgtggaaaccccaagagagcttaaaggtacggtagtggtaacatatccagac
ggcagtcaaaatgaagtaccagttaaagtggtagtaaaagccccaacagatgccgaaaaa
tacacaccacaaggccaagaagtagagacagatcaagacaaaactccagaagctcaggca
ggagtggtcaataaaggcgacttaccaacagaaacaaaatatagttggaaggcaccgcta
gacgtaacgactccaggagaacatgaaggaacagtagtggtgacatatccagatggcagt
caagacgaggtaccagttaaagtggtggtaaaagcaccaacagatgctgaaaaatatacg
ccacaaggccaagaagtagagacagcccaaggtaaggttccagaagctcaggcaggagtg
gtcaataaaggagacttaccaacaggcacgaagtacagctggaaagcaccgttagacgtg
acaaccccaggacctcatgtcggtacagtagtggtgacgtatccagatggcagtcaagac
gaagtgccagttaaagtggtggtaaaagcacctgaaaaatccttaacagatgctgaaaaa
tatacgccacaaagtcaagaagtagagacagatcaaggcaaggctccagaagctcaggca
ggagtggtcaataaaggagacttaccaacaggcacgaagtacagttggaaagcaccgcta
gacgtaacgactccaggagaacatgaagaaaaagtagtggtgacgtatccagatggcagt
caagacgaagtgccagttaaagtggtggtaaaagcacctgaaaaatccttaacagatgct
gaaaaatacacgccacaaggtcaagaagtagagacagcccaaggcaagactccagaggct
caatcaggagtatccaataagggcgacttaccaacagaaacaaagtatagctggaaagcg
ccattagacgtggcaaccccaggagaacatgtgggaacggtagtggtgacatatccagat
ggcagtcaagacgagataccagttaaagtggtagtaaaagcacctgaaaaagcgtcaaca
gatgccgaaaaatacacgccacaaagtcaagaagtaacgacaaacacaggcaagaccccc
gaagcagaaagtgttgtgacaaataagtcagacttaccaacaggcacaaagtacagctgg
aaaactcctctagatgtaacaaccccaggatctcacaaaggaacagtagttgtgacctat
ccagatggcagtcaagacgaggtaccagttaaggtaacagtaaaagcaccaacagatgcc
gaaaaatacacgccacaaggtcaagaagtagagacagcccaaggcaagaacccagaagct
gaaagcgttgtgacaaataaagcagacttaccagcaggcacgaagtacagttggagagcc
ccattagacgtgacaaccccaggatctcacaaaggaacagtagttgtgacctatccagat
ggcagtcaagacgaggtaccagttaaagtggtagtaaaagcacctgaaaaagcgtcaaca
gatgccgaaaaatacacgccacaaagtcaagaagtaacgacaaacacaggcaagaccccc
gaagcagaaagtgttgtgacaaataagtcagatttgccaacaggcacaaagtacagttgg
aaggcaccgttagacgtaacaaccccaggagaacacgaaggaacagtagtggtgacctat
ccagatggcagtcaagacgaggtaccagttaaagtggtagtaaaagcacctgaaaaagcc
ttaacagatgccgaaaaatacacgccacaaagtcaagaagtagagacagcccaaggcaag
acccccgaagctgaaagcgttgtgacaaataaagcagacttaccagcaggcacgaagtac
agttggaaagcaccgctagacgtaatgactccaggagtgcacgaagggacagtagttgtg
acctatccagatggcagccaagacgaagtaccagtcaaggtagttgtggatggtgcaggc
acaacagctgataaacgcaaagaacaaacgcaaactaaaggtaccaacaaaaatgtctta
ccacaaactggcgaaaaggacacggtcgttcaagcttggttcggagtacttatctcttta
ctagcaggtatgctgggagctaaaactttaaacaagaaacatttccaagataaataa
DBGET
integrated database retrieval system