Lagopus muta (rock ptarmigan): 125686837
Help
Entry
125686837 CDS
T09141
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
lmut
Lagopus muta (rock ptarmigan)
Pathway
lmut04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lmut00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
125686837 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lmut00536
]
125686837 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lmut00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
125686837 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125686837
NCBI-ProteinID:
XP_048787282
LinkDB
All DBs
Position
Z:52975255..53138334
Genome browser
AA seq
2903 aa
AA seq
DB search
MGRRRWMRLQPCFLWLSWLALCAHGAAGQQKPPPRVRPAGGAGGIYPAAAAVAHREEGAG
SAAAAGRVRRRGQQEALRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSR
PNMCTCASGQISPTCGPKSTQQCSIRCMNGGTCADDRCQCQKGYVGVYCGQPVCEKGCQN
GGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRA
WGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINTVGSYECKCPAG
HRQNEATQKCDDINECSIIPGVCEGGECSNTVGSYFCLCPRGYVSSTDGSRCIDQRTSTC
FSNLVNGRCAQELPGRFTKRQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEHRRLCVDGVPAGGG
SRGGGGTGGNGFLPGGNGNGYSPGGAGFIPIPGNNGFSPGVGGAGVGTGGQTPTGNGPII
TGLTILNQTIDICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCS
NGDCVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAG
FELTTDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLSPNGRYCTDIDECQTS
GICMNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGACIRPFPGAVTK
SECCCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICE
NLRGSYRCNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFST
ETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFSCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDS
RCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGV
CPNGRCVNSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDAC
CCAVGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCM
NGKCRNTIGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDG
YESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGICVNTEGSFQCNCPVGHELSPSREECIDVNECS
LSDNLCRNGNCVNMVGTYQCSCNSGYQATSDRQGCVDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYE
CSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCID
VNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCV
NVPGSFKCTCREGWFGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGF
TCSDVDECAENINLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPALDSKSCQDIDECSFQNICVFGT
CNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLN
PTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVN
STEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSE
ETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYN
GTTCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNICGNIPGFTFDIHTGK
AVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNA
DCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKA
SQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVC
RNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTVDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPP
GYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCF
TNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGI
DDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTGVHCIDTDECSIGNPCGN
GTCTNVIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYEL
REDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCTDENECRTK
PGICENGRCMNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLV
TKSECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRHGQC
INTMGSFRCFCKVGYTTDISSTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYVLQE
DGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSK
GICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQ
HYQWNQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSFKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSAKNP
CNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPVDGDADEENALSPEACYEC
KINGYPKKDSRKKRSLNETIEEVSLESLDMDSPLKMRVNVSRLDSKEHILQLMPAIEPLT
NHVRYIISHGNDDGVFRIHQRDGLSYLHTAKKKSVPGTYTLEITSIPLYKKKELKKLEDS
NEDNYLLGELGEALRMRLWLELY
NT seq
8712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcagacggcggtggatgcgcctgcagccctgcttcctatggctcagctggctggcg
ctctgcgcgcacggagccgccgggcaacaaaagccgccgccgcgggtccgccctgcggga
ggagcgggcggcatctaccccgccgccgccgccgtcgcgcaccgggaggaaggggccggc
agcgccgccgctgcgggccgggtccgccggcggggacagcaggaggcgctccgcgggcca
aatgtgtgtggctctagattccattcctactgctgccctggatggaaaacgctcccagga
ggaaatcagtgcattgttccaatctgcagaaatagctgtggtgatggattttgctctcgc
cctaacatgtgcacttgtgcaagtggacaaatatcacctacttgtggaccgaaatctacg
cagcagtgcagcatcaggtgcatgaacggtggtacctgcgctgatgaccggtgccagtgc
cagaagggctatgttggggtctactgtggacagcctgtctgtgaaaaaggctgccagaat
ggaggacggtgtattggacctaatcgctgtgcatgtgtctacgggtttactggccctcag
tgtgaaagagattacagaacaggtccttgtttcacacaagttaataatcagatgtgtcaa
ggccagctaactggaatagtttgcacgaaaaccctctgttgtgcaaccattgggcgtgca
tggggtcacccctgtgaaatgtgccctgctcagcctcagccatgtcgtcgtggtttcatc
cctaatattcgcactggtgcatgtcaagatgttgatgaatgtcaggctattcctggagtc
tgccaaggaggaaactgcattaatacagtaggttcctatgagtgcaagtgtcctgctggt
cacaggcagaatgaggcaactcaaaaatgtgatgatattaatgaatgcagcatcatccca
ggagtctgtgaaggtggtgaatgttctaacacagtgggaagttatttctgcctctgcccc
cggggatatgtctcatctacagatggctcccgctgtatcgatcagaggacaagtacatgt
ttctccaacctagtgaatggccgctgtgcccaggaacttcctggtagattcaccaaaagg
cagtgctgctgtgagtctggccggtgctgggccattggatctgttccagagatgtgtcct
gttagaggatctgatgaacaccgcaggctttgtgtggatggtgtgcctgctggaggtggc
tccagaggtggtggtggaactggaggaaacggattccttccaggtggcaatggcaatggc
tacagcccaggaggagcaggattcattcccatccctggaaataatggtttctccccaggt
gtaggtggagcaggagtaggaacgggtggtcagacccccactgggaatggcccaataata
acagggctaacaatactcaatcagacaatagacatctgtaagcatcatccaaacctttgt
ttaaatggacgttgtataccaaccatctctagttaccgttgtgagtgcaatatggggtat
aagcaggatgcaaacggtgattgtattgatgttgatgagtgcacgtccaacccatgctct
aatggagattgtgtcaacacacctggttcatattactgcaagtgccatgcgggtttccag
agaactcctaccaagcaagcttgcattgatatagatgagtgcatccagaatggtgtcctt
tgtaaaaatggccgatgtgtaaacactgatggaagttttcagtgtatttgcaatgctgga
tttgaattgactacagatggaaaaaactgtgtggaccatgatgaatgtacaactacaaac
atgtgtttaaatgggatgtgcataaatgaggatgggagttttaaatgcatctgcaaacca
ggatttgttctgtctccaaatgggcggtactgtactgacattgatgaatgtcagacatcg
ggaatttgcatgaatggtcattgcataaatactgaaggatcctttcgatgcgaatgtccg
cctggcttggctgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcaca
tgctatggaggtatcaaaaaaggagcatgcattcgtcccttccctggtgctgtgacaaaa
tctgaatgttgctgtgccaatcctgactatggttttggagagccgtgtcacccctgccct
gctaaaaactcagcggagtttcatggcctgtgtagcagtggaataggcattaccgtggat
ggacgagatattaatgagtgtgcattggatcctgacatttgctcaaatggaatttgtgaa
aacctacgtggcagctatcgttgtaactgtaacagtggctatgagcctgatccatctgga
aggaactgtgtggacattgatgaatgttcagtgaatgggctgctgtgtgataatggcctc
tgtcgaaacactcctggaagttatagctgcacttgtccaaagggctatgtgttcagcact
gagacagacacatgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggtgcc
tgcaggaacaatcttggatctttcagttgtgaatgttcacctggcagcaagctggactct
acaggactgatctgcattgatagcctgaaggggacttgctggcttaatatccaggacagt
cgctgtgaagtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtgctactttagga
gcagcttggggcagcccatgtgagcggtgtgaattagacacagcttgttcaagaggattt
gccagagttaagggtgttacctgtgaagatgtaaatgagtgtgatgtttttcctggagtt
tgtcccaatggacgatgtgttaacagtaggggctcatttcattgtgaatgcccagaagga
ctgacgctggatggaacggggcgagtgtgtttggatatccgcatggagcagtgttacctg
aaatgggacgaagatgaatgcattcagtctgtacctggcaaatttcgtatggatgcctgc
tgttgtgctgtgggtgctgcctggggctctgactgtgaggagtgtccaaagcctggcaca
aaggagtatgaggctctgtgccccagaggtcctggtttttctaacagaggagatattcta
actggcagaccattttataaagatatcaatgagtgcaaggtattccctggtatgtgcatg
aatggtaaatgcaggaatacaattggaagtttcaaatgtaggtgtaacagtgggtttgct
ttagatatggaggaaagaaattgtacagatattgacgagtgccggatctccccagactta
tgtggaagtggtacttgtgttaacactcctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggt
tatgaaagtgggttcatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaat
cctctactgtgtagaggtggcatatgtgtgaatacagaagggagttttcagtgtaactgt
cctgtgggacatgagctgtcaccatcacgtgaggaatgcattgatgtaaatgaatgctca
ctaagtgacaatctctgcagaaatggcaactgtgtgaacatggttggaacataccagtgt
tcctgtaactctggataccaagccacgtctgacagacagggctgtgtagatattgatgaa
tgtatgataatgaatggtggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctacgaa
tgtagctgcagtgatggctatgctctaatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgat
gagtgtgaaaacaatccagatatatgtgacggagggcaatgtactaacattccaggggag
tatcgctgtctctgttacgatggatttatggcttctatggacatgaaaacttgtattgat
gtgaatgaatgtgatttgaattccaacatttgtatgtttggggaatgtgagaacactaaa
ggttccttcatttgtcactgccagctaggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgc
acagatgtggatgagtgtgaaattggtgctcacaattgtgacatgcatgcctcatgtgtc
aatgtaccaggaagttttaaatgtacttgcagagagggatggtttggaaatggcattaaa
tgtattgatcttgatgaatgttctaatggaacacaccagtgcagtgtgaatgctcagtgt
gtgaacacaccagggtcataccgctgtgcctgtgctgagggattcacaggggatggattt
acctgctctgatgttgatgaatgtgcagaaaatattaatctgtgtgaaaatggacagtgt
ttgaatgtccctggtgcgtaccgttgtgaatgtgagatgggattcactcctgccttggac
agcaagtcatgccaagatatcgatgaatgctccttccagaatatatgtgtatttggtacc
tgtaataatctaccaggaatgtttcattgcatctgtgatgatggctatgaactagataga
actgggggaaactgtacagatattgatgaatgtgctgatcccattaactgcgttaatggt
ctttgtgtaaatactcctgggaggtatgaatgtaactgtcctccagatttccagctgaat
cctactggagtgggttgtgtggataatcgtgttggcaattgctacctgaagtatggacca
cgaggggacggaagcctatcctgcaatactgaaattggagttggagtcagtcgttcttcg
tgctgctgctccctgggaaaggcttggggaaacccctgtgaaacatgtcctcctgtaaat
agcacggaatacaatactctttgtccaggaggagaaggattcagaccaaatcccatcact
attattttggaagacattgatgaatgtcaggagctgccaggtctctgccaaggaggaaat
tgcatcaatacttttggcagcttccagtgtgaatgtccaaaaggctactacctcagtgaa
gagacaagaatctgtgaagatattgacgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcct
ggcacctgctacaatactctgggaaactacacctgcatttgccctcctgaatatatgcag
gtcaatggaggacataactgtatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagttataat
ggaaccacctgtgagaatgaactgcccttcaatgtaaccaaaaggatgtgctgctgcacc
tacaatgttgggaaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaaccccaggaacagct
gaattcaagaacatatgtggcaatattcctggctttacttttgacattcatactggaaaa
gctgttgacatcgacgaatgtaaagaaatcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcatc
aatcagatcggcagcttccgttgtgaatgcccaactggattcagctacaatgacctgctc
ttggtctgtgaagatattgatgagtgcagtaatggagacaatctctgtcagaggaacgca
gactgtatcaacagtcctggtagttaccgttgtgaatgtgctgctggttttaaactttca
cccaatggtgcctgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcat
ggtttatgtgtggacatgcagggaagttaccagtgcatatgtcacaatggttttaaggca
tctcaagaccagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaat
ggaacatgtaaaaacactgttggatcatataactgtctgtgttatccaggatttgaatta
actcataataatgactgtatggatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgc
agaaatggccggtgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatat
gaacttactgtagatggcaagaattgcattgatactaatgagtgtgtggcactgcctggt
tcatgctcccctggtacctgtcaaaatttggaaggatctttcagatgcatctgtccacca
ggatatgaagtgaagagtgaaagttgtattgatattaatgagtgcaatgaggatcccaac
atctgtctctttggctcttgtacaaacactccaggaggcttccagtgcatttgtcctaca
ggttttgtcctgtctgataatggacggagatgttttgatacccggcagagcttctgtttc
actaattttgagaatgggaagtgctctgtcccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaag
tgttgctgcagtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctttgcccaaag
gaggaagaagttgcttttcaggacctctgcccatatggtcatgggactattcctggaatt
gacgatacacgtgaagatgttaatgaatgccttgaaagcccagggatttgctcaaatggt
cactgcatcaacactgatggatccttccgctgcgagtgcccaatgggatacaacttagat
ttcactggagtacattgtatcgatactgatgaatgttcaattggcaacccgtgtggaaat
ggtacatgcactaatgtgattggcagttttgaatgcaactgtcatgaaggatttgagcca
ggcccaatgatgaattgtgaagatataaatgagtgtgctcagaaccccttgctgtgtgct
tttcgatgtatcaatacttacgggttctatgaatgcacctgtccagttggctatgaactg
agagaagaccaaaagatgtgcaaagatctggatgaatgtgctgaaggtctccatgactgt
gagtctagaggcatgatgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcct
ggaatgaccaggagacctgatggagaaggctgtacagacgaaaatgaatgccgtaccaag
ccaggtatctgtgagaacggtcgctgcatgaatgttattgggagctaccgatgtgaatgt
aatgaaggattcctgtcaagcccgtcaggcatcgagtgtcttgataaccgccaaggcttt
tgttttgctgaagttctacagacaatgtgtcagatggcctcaagcagccggaatcttgtc
actaaatctgagtgctgctgtgatggaggccggggctggggtaaccagtgtgagctctgc
ccacttcctggaaccacccaatacaagaaactctgtccacatggaccaggatatactaca
gatggaagagatattgatgaatgtaaagtcatgccaaacctttgtagacatggacaatgt
atcaacactatgggctcattccgctgcttttgcaaagttggctatacaactgacatcagc
agcacatcttgtgtggatctggatgaatgctcacagtctcctaaaccatgcaattttatc
tgcaagaattcagaagggagctatcaatgctcatgtcctcgaggctacgtccttcaagaa
gatgggaagacgtgtaaagatcttgatgaatgtcaaactaaacaacacaattgtcagttt
ctctgtgtcaacacccttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggtttcactcaacat
cacacagcttgtattgacaacaatgaatgtggttctcagccatcactctgtggatcaaaa
ggaatttgccaaaacactccaggaagttttacctgtgaatgccaaaggggattttctctg
gattctactggattaaactgtgaagatgtggatgaatgcgatggaaatcatagatgccag
catggctgtcaaaacatcctaggtggatacagatgtggatgcccacaagggtatattcag
cattaccaatggaatcagtgtgttgatgaaaatgagtgttccaatcctaacacatgtggc
tctgcttcttgctacaatacgcttggaagtttcaagtgtgcctgcccttcaggattttct
tatgaccagttctccagtgcatgccatgatgttaatgaatgttcttctgccaagaacccc
tgcaattatggttgttccaacactgaaggtggttatctttgtggctgtccaccaggctat
tacagagttggacagggccactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctg
ccagtggatggagatgctgatgaagaaaatgctttatcccctgaagcatgttatgagtgc
aaaattaacggctatccaaaaaaggacagcagaaagaagagaagtcttaatgaaactatt
gaggaggttagcttggaaagcctggacatggatagtcctttgaagatgagagtcaacgtt
tcaaggcttgacagcaaggagcacatcctacagctcatgccagccattgagcctcttacc
aaccacgtgcgctacatcatctcacatggcaacgatgacggcgtttttcgaatccatcag
agggatggactcagttacttgcacacagctaaaaagaagtcagtgcctggaacatacaca
ctggaaatcactagcattcctctatataagaagaaggagctaaagaaactggaagacagc
aatgaggacaactacctccttggagagcttggggaagctctcagaatgaggctgtggcta
gaactctactag
DBGET
integrated database retrieval system