Listeria monocytogenes SLCC2372 (serotype 1/2c): LMOSLCC2372_0439
Help
Entry
LMOSLCC2372_0439 CDS
T02220
Name
(GenBank) cell wall surface anchor family protein (LPXTG motif)
Organism
lmx
Listeria monocytogenes SLCC2372 (serotype 1/2c)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Bact_surface_Ig-like
PKD
PKD_4
Big_13
DUF4625
Big_3_4
SdrD_B
ChitinaseA_N
Y_Y_Y
He_PIG
HYR
Gram_pos_anchor
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY53774
LinkDB
All DBs
Position
458397..464438
Genome browser
AA seq
2013 aa
AA seq
DB search
MIRKIFIGILSFTILIQTVIVSNFNVVYATTEEHKQEAIKLEKKSTNNNIICIKGAVKDK
EYKLSLPKSFNLDEKKTGKEVEYNKEKNELTIIGTGEEITLYLLASQTGKYELELKEGDK
VQAKLDLIIKNVDEEVAKTVEKSNRQLLRSSISDKLFLQADSSKATLANYTEQITFNYSI
NFLDGSTNLKNGKLVIDFNNSNLELVNYPKDTAANRNIKLTSYSALTGKLTINLVDNISS
GAPFDIPIVVRAGYGAKPGLPMNLKATLSGENSSGGTYTPSEKTTTVNLEESSSNQDYSP
ITAGDNSWAFNLKELSYSLKPGGYTIQWPEIQKKSLENKSFKNLKLEYLKENGGDVISVN
TADPYVIRFGEPFWSQLSTVNGKANVLVNDDEKQVVEYGPINANIYQKIQVSMAAKIPAD
GVEGTEYTGTVNVYDEDVFITSIKIKAEVADSATSIAVDSKVSKTSISEGDIFEWGFMPR
VSSAAPGVNDLEIVAPIPEGIKALSYIPNNNSMASIKKLEYYQNGKWVSMAPQTSSGWDF
SKIDQSVNRIEKLKLTSRDGIINDKDMPPYTHGTIRMQNIGVKAGESFTLRPESITYTDP
DKTSKTIDTTTNSYGKNVQVVEKTSAPAKINGEVFLSSTAGTSGKGFGSTIFFNGDKIAQ
SVRLGSYGSKLENPYIFVVVPKGIDLETMRNFIQQPYRSTLNYTYAPANGTNTLYPKSSA
DVKGKETLSDGSTLYYWEAPDTGLAPGMENCEMLALDLVLKLNKANSGANKVEFGMGSMT
DSSWNLNGAANSGLETKELSSELQSKLPGVTSTKYLSTTRTANIGVSNSIATKMKIKGSQ
DNDFVDVSANTGTTIPGKRVDYNLTFENNGTRSMKNLEIIDILPHKDDQYVLGTGPRGSK
FSVIPTSEIEVLVNGKKSDSATLEYSTSYTPERFDTNGEDVAGDSWQIVAPTNMADVKSF
RIKLPNTEFKVGDEITLNFEAIVPTDAPRNDEIAYNSIAYRIDKETGSGTSKLASEPPRG
GVKSTNPSTDLNIAGNSFSDLNKNGVKDADELGLNAVKLDLYKKNNNEFEKVETVYTSSD
ALDKEKGLFDFNGLNNGTYKIAAHLPNKNADFITTGPNKIVKDSKDDSIGWITVNNSTEF
TIDDLANGNPKNLVGIQIPIYMATPIKGAVVFVNKDGEPKITSYGQDYEIALFDKDGKEV
QSAIKTNSKGEFSFNDVAIKNPADFKLKVTAPTGTNFVYSAKNPLFNMSTKEYTLNSVVP
GVGGVAEIYITETSKPTTKIILDKAVTPNAITIESSDEATEVTNEWTLEDSDGTVVYTGT
GNTIRIPNDEGTYIAKNTATDEAGNTASDEKTFDIDYTVPTLTVNQDASAEVNSTEANIG
WIKPLNVAATDTHDGNITPVVDYSKVKWDVLGTYPVTVTATDASGNKATQTVNLRIVDTT
SPTILITNNPLTYSIENMRKLTEQELYTAAGLIGGDNYDLAPGQAVQPNKQPMVFTSNFS
TIFGDIASVKAGQYQVQVNLADSSGNQAIPQTITINVVDTVGPVIKADNVSYHVNTTKTE
AEFFQDARLDVTDNNDDTTDLIITSNFAEKVNLNKPGKYEVTITATDTKGNQTTKEITVQ
VSKDKPVITADPKISYQGKIEVTEANFLSGVHAEVTDELDGDVKITSDFAEKVDFNKVGT
YTVTLNAKDEYGNTAEPVKVSVSIFNKIAPTFNNADNKTIEAVNELPSLESIFKIEAKDY
LSGNKLKVTYTPEQTIKGNVPGEYSIKVTTKDDSGNIAETTVTLTIKDTTGPSIKMTKST
KKLEVQSKEPNWITFFGIKATDIVDGDVTKNIKVDSSEVNLNKVGTYPIYFTVTDALGNE
SSKLKSTVQIVDTSSPELTIDKLEISYPTGKTISDKQFLQDIGTKVTNSYGTVKVTTNLS
KIVDWNKAGKYKVTVTATNSSGGVAEKTILLTVKNSDSSFIAVPSKDDNKNKPAKNIPKT
GDTLNTELIVMGMMLLLVGGWMFLRRKTKVKTK
NT seq
6042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgattagaaaaatctttatagggattttgtcatttactatcttaatacaaactgtaatt
gtttctaactttaatgttgtttatgcaactaccgaagagcataaacaagaagctattaag
ttagaaaaaaaatcaactaataataatataatatgtataaaaggtgctgtgaaagataaa
gaatataaattatctttaccaaaatcttttaatttagatgagaaaaagacaggaaaagaa
gttgaatataacaaagaaaaaaatgagctaacaattataggaacaggggaagaaataacg
ctatatttacttgcttctcaaacaggaaaatacgaactagaactaaaagaaggggacaaa
gtacaagccaagttagatttaattataaaaaatgtagatgaagaagtcgcaaaaactgtc
gaaaaatcaaatagacagttactacgttcatctatttcggataaattatttcttcaagcg
gattcaagtaaagccacattagctaattatacagaacaaataacttttaactattctatt
aattttctagatggctcaacaaatttgaaaaacggtaaattagtaatagattttaataac
tctaatcttgaactagtgaattatcctaaagacacggcagcaaataggaatataaaatta
acatcttatagtgcgcttacaggtaaattaaccattaacttagtggataatatatctagt
ggtgctccatttgacattccaatcgttgtaagagctggttatggtgcaaagccaggatta
ccaatgaacctaaaagctacactatcaggtgagaacagttcaggtggcacgtatacacca
tcagaaaaaacaaccacagttaatttagaggaaagtagctccaaccaagactatagtcca
attacagcaggtgataatagctgggcttttaatttgaaagaactctcatactcacttaaa
ccaggtggatatactatccaatggcctgaaatccagaagaaaagtttggaaaataaaagt
ttcaaaaatttaaaattagaatatcttaaagaaaatggtggggatgttatatctgttaat
acagcagacccttacgtaattagattcggagagcctttttggtcacagcttagcacagtt
aatggtaaagcaaatgtacttgttaatgatgatgagaaacaagtagtcgaatatggacca
attaacgctaatatttaccaaaaaatacaggtatcaatggctgcgaaaataccggcagat
ggggttgaaggaacagagtatactggtacggtaaatgtatatgatgaagatgttttcatc
acctccattaaaattaaggccgaagttgctgattcagctacatcaatagcagttgatagc
aaggtttctaaaacaagcatatcagaaggcgatatatttgaatggggattcatgcctaga
gtatcttctgcggcaccaggtgtaaatgatttagaaattgtagcaccaattcctgaaggt
atcaaagcattatcatacatccctaataataactcaatggccagtataaaaaaattagag
tactatcagaatggtaaatgggtatcaatggccccacaaacatctagtggttgggatttt
tcaaagattgaccagtccgttaatcgtattgaaaagctaaaacttacatcaagagacgga
attattaatgataaagatatgccgccttatactcatggaacaattcgaatgcaaaatatt
ggtgtgaaagcaggagaaagctttacactccgaccagaatctatcacttatacagaccca
gacaaaaccagtaaaacaattgatacaacgacaaatagttatggaaagaacgttcaagta
gtagaaaaaacctctgctccagcgaaaatcaatggcgaagttttcttatcttcaactgct
ggtacttctggcaagggatttggaagtacaattttctttaatggcgacaaaattgcacag
tcagttcgtttaggctcatacggaagtaaactagaaaatccatatatttttgtagtagta
ccaaagggtatagatctagaaactatgagaaatttcattcaacaaccttatagaagtaca
ttaaattacacgtatgctcctgctaatggaacgaatactctttaccctaaatctagtgca
gatgttaaggggaaagaaactttatcagatggttcaacgttgtattactgggaagcaccg
gatactggtttagcaccgggcatggaaaattgcgaaatgttagcattagatttagttttg
aaattaaataaagcaaacagtggtgctaataaagtagaatttggtatgggttcaatgaca
gattccagttggaatttaaatggtgctgctaattcaggacttgaaacaaaagaattatct
agtgaattacaatccaaacttcccggagtaacatctactaaatacttgtctacaacgaga
acagcaaatataggtgtatctaatagtattgcaactaaaatgaaaattaaaggaagtcaa
gataacgactttgtggatgttagtgcgaatacaggcactacaattccaggtaaaagagta
gattataatttaacatttgaaaataatggtacaagaagtatgaagaacttagaaattatt
gatatacttccgcacaaggatgatcagtatgttctaggcactggcccacgcggatcgaaa
ttttcagttatcccaactagtgaaatcgaagttcttgttaatggaaagaaaagtgattca
gcaactttagaatattcaactagttatacgccggaacgtttcgatacaaacggggaggac
gtagcaggtgattcttggcaaatcgtggctccaacaaatatggcagatgtgaaaagtttc
cgtattaagctaccaaatacagaattcaaagtaggagacgaaatcacactaaactttgaa
gcaatagttccaacagatgctccgagaaatgatgaaatagcgtataattcgattgcttac
cggattgataaagaaacaggctctggtacaagcaaattagcatcagaacctcctcgtggg
ggagtaaaaagtacaaatccatcaacagatttaaacatagccggtaactctttctccgat
cttaacaaaaatggtgtaaaagatgcggacgaactaggtttaaacgctgttaaattagat
ttatacaaaaaaaataacaatgaatttgagaaagtggaaaccgtttatacttcctcggat
gctctagataaagaaaaaggtttatttgattttaatggcttgaataatggaacatataaa
atagctgctcatctaccaaataaaaatgcagactttattactaccggtccaaataaaatc
gtaaaagactcaaaagatgattcgattggctggataacagtcaataactctacagaattc
acaattgatgatttggctaacggaaatcctaaaaatctagttgggattcaaattcctatt
tatatggcaacacctataaaaggcgctgttgtttttgtaaataaagacggagaaccaaaa
atcacatcttatggtcaagattatgaaatagctttatttgataaagatggaaaagaagta
caatcagcaattaaaacgaatagtaagggagaattttcttttaatgatgtagccattaaa
aatccagctgattttaaattaaaagtaactgcaccaactggaacgaattttgtctattca
gcaaagaatcctttatttaacatgtctacaaaggaatatactttaaatagtgtagttcca
ggcgtgggtggggtagcagaaatttatattactgaaactagtaaaccaactacaaagatt
atactagataaggcagttactccaaatgcaattacaattgaatcaagtgatgaagctaca
gaagtaacaaatgaatggacattagaagatagtgatggaacagtcgtttatactggaact
ggaaatacgattcgtattccaaacgatgaaggaacatatatcgctaaaaacacagcaaca
gatgaggctggaaacaccgcttctgatgaaaaaacgtttgatatagattatacagttccg
acattaacagttaatcaagatgcatcagcagaagtgaatagtacggaagcaaatattggt
tggattaagccgctaaatgtagcagcaacagatacgcatgatggaaatatcacgccagta
gtagattatagtaaagttaaatgggatgtacttggaacatacccagttactgttacagca
acagatgcaagtggcaataaagctactcaaacagtaaatttacgcatagtagatactact
tcacctacaattttaataacgaataatccattaacgtattctatcgaaaacatgcggaaa
ttaacggaacaagaattgtacacagcggcaggacttatcggtggagataattatgattta
gcaccaggtcaagcagtccaaccaaataaacagccaatggtatttactagcaactttagt
actatttttggtgatatagctagtgtgaaagctgggcaatatcaagttcaagtgaattta
gcagattctagtggaaatcaagctattccacaaacaattactattaatgtagtagatact
gtgggaccagtaattaaagcagataatgtatcttatcacgttaatacaacaaaaacagaa
gcagaattcttccaagatgctcgtttagatgtgacagataacaatgatgatacaactgat
ttaattattacttctaattttgcagaaaaagtaaacttgaataagcctggtaagtatgaa
gtaaccatcactgctacagatactaaaggcaatcaaacaacaaaagaaataacagttcaa
gtaagcaaggataaaccagtcattactgcagatcccaaaataagttatcaaggaaaaatc
gaagtaacagaagctaactttttaagtggtgtccatgcagaagtaacagatgaattagat
ggtgatgttaaaattactagcgattttgcagaaaaagtagattttaacaaagtaggaaca
tatacagttactttaaatgcgaaagatgaatatggtaatactgcagaacctgtaaaagtg
tcagtaagcatctttaataagatcgcaccaactttcaataatgctgataataaaacaatc
gaagcagtaaatgagttaccatcattagaatctatattcaaaattgaagcaaaagattat
ctttcaggtaataaattaaaagtaacttatacaccagaacaaacaattaaaggcaatgtt
ccaggtgagtactctattaaagtaacaacgaaagatgattcaggcaacatagctgaaaca
actgttactttaacaattaaagatacaacaggaccaagcataaaaatgactaaatcaaca
aaaaaattagaagtacaaagcaaagaaccaaattggataactttctttggaataaaagcg
actgatattgttgatggtgatgttacaaaaaatattaaagtagacagtagtgaagtcaat
cttaataaagtaggaacttatcctatctactttacagttacagatgcacttggaaatgaa
tctagtaaattaaagagcacagtgcagattgtagatacaagtagtcctgagctaacaatc
gacaaactagaaattagttatccaacaggaaaaacaatttctgataaacaatttttacaa
gatattggtactaaagttacaaatagttatggaacagtaaaagtaactactaatctaagt
aaaattgttgattggaacaaagctgggaagtataaagtaactgtaacagcgacaaattca
tctggaggcgttgctgagaaaacgattctattaacagtcaaaaatagtgattcatcgttt
atagcagtaccaagtaaggatgataataagaacaaaccagcaaaaaatatcccaaaaaca
ggagatactttaaatacagagctaattgtcatgggtatgatgttgctacttgttggagga
tggatgttcttaagaagaaaaacgaaagtaaaaacaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
