Liquorilactobacillus nagelii: BSQ50_09940 Help Entry BSQ50_09940       CDS       T06235                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K19088   CRISPR-associated protein Cst1 Organism lng  Liquorilactobacillus nagelii Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lng00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:lng02048]     BSQ50_09940 Prokaryotic defense system [BR:lng02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Subtype I-A factors     BSQ50_09940 SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Cas_CXXC_CXXC DUF7576 Zn-C2H2_12 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AUJ32826 UniProt:  A0A3Q8CPS8 LinkDB All DBs Position complement(2057926..2059647) Genome browser AA seq 573 aa AA seqDB search MQEVIDTDQKICFKSQGGWLENAGIIGLIRILDAEDVSIENNSLYVKKKALNYFAEKYFE FFIKIYGGQTRVARIIDFKVKIEEWQNIDENKADPEIIYNQLDNWYKNCLKYYIASGSFK KISSLFPPDFDSTLALKDCSKDLQKLKKLKKDNQGFNEILQQLIPKLQQFIDYFSVSKVK KYFMAKTLSYIVINNAWSGISFLNPQTKTADLYQDYEDAFVKPAIEYLKADHEKDVYRCA TCGRPIKKQEYSYSFLNGLGYDTNRKTSNAWLFNNDQFMCPLCHLMYSAVSAGFNYDNRH QGIFINQNQDIELLKNANNKIILEMKRAVEKEQIISPWRAFALSFQEMFAKSSSYTLADI QVVSYQNEQYRFNLVPKKIASVLKKSSEKPFSNRQRTVTLLSILNSAYIKNFQGQSSLQI YDAMLKRLLVSANLNSLISDILQLKIVRHQDLHVTVEQIYNLIRINLIYFKEMSNLVLTD EELRKMRGSGKNLGDGYANTNKRQTLAYRLLQALKIQNNDQFMNVLLDAYLYQKKLVPKN FIQKMNSPEEFNQLGYAFIAGLIPNDNKNEEEK NT seq 1722 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaagaagttattgatacagatcaaaaaatttgttttaaatcgcaaggcggttggcta gaaaatgctggaattattggtttgatcagaattttagatgctgaagatgttagtattgaa aataattcattgtacgtaaaaaagaaagcgcttaattattttgctgaaaaatattttgaa ttttttattaaaatctatggaggacaaactcgagtagctagaattatagactttaaggta aagatagaggaatggcagaatatagatgaaaataaagcagatcctgaaattatttataat cagttagataactggtataaaaattgtttgaaatattatattgcctcaggaagttttaaa aaaattagtagtttgtttcctccagattttgatagtacgttagctttaaaagattgcagt aaagacttgcaaaaactgaaaaagttaaaaaaagacaatcagggtttcaatgaaatatta cagcaacttattcctaaattacaacaatttattgattatttttcggtttcaaaagtaaaa aaatattttatggctaaaacactttcatatattgtgattaataatgcatggagtggaatc tcttttttaaatccgcaaactaaaactgctgatttgtatcaggattatgaagatgctttt gttaagccagcaatcgaatatttaaaagcagatcatgaaaaagatgtttatcgatgtgca acgtgtggtcggccaataaagaagcaggaatattcatatagttttttgaatgggttgggt tacgacactaatcgcaaaacaagcaatgcttggctttttaataatgatcagtttatgtgc ccactttgtcatttaatgtattcagcagtatcagcagggtttaactatgataacagacat caaggcatttttattaatcaaaatcaagacatagagttactgaaaaatgcaaataataaa attattttggaaatgaaacgagcagttgaaaaagagcaaattatatctccttggagagca tttgcattatcatttcaagaaatgtttgccaaatctagcagttatacattggctgacatt caggttgtcagttatcaaaatgaacaatatcggtttaatctagttcctaaaaaaattgct agtgttttaaaaaaatctagcgaaaagcctttttcaaatagacaaagaacagttactttg ttgtctattttaaattcagcatacattaagaattttcaaggtcaaagttcacttcagata tatgatgcaatgcttaagcgtttgttggtttcagctaatttgaattcgctgattagtgat attttgcaattgaaaatagttaggcatcaagacttgcatgtcacagttgagcaaatctat aacttaattcgaattaatttaatttattttaaggagatgagcaatttggttttaacagat gaagaactaagaaagatgcgaggcagtgggaaaaatctgggcgatggctatgcaaataca aacaaaagacaaactttagcatatcgtttgttgcaggcgctaaaaattcaaaataatgat caatttatgaatgttcttttggatgcatacctttaccagaaaaaattggtacccaaaaat tttattcaaaaaatgaattcaccagaagaatttaatcaattaggttatgcttttattgcc ggattaattccaaatgataacaaaaatgaggaggagaagtag

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