Liquorilactobacillus nagelii: BSQ50_10220
Help
Entry
BSQ50_10220 CDS
T06235
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
lng
Liquorilactobacillus nagelii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lng00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
lng03000
]
BSQ50_10220
Transcription factors [BR:
lng03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
BSQ50_10220
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
HTH_11
HTH_29
HTH_36
Mga
HTH_24
HTH_DeoR
HTH_Mga
DUF7342
MerR
HTH_23
HTH_28
Rrf2
HTH_5
CggR_N
WHD_MCM8
wHTH-PRTase_assc
DnaD_N
GntR
Coat_F
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUJ32877
UniProt:
A0A3S6R2M1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2111619..2113481)
Genome browser
AA seq
620 aa
AA seq
DB search
MNDRLRMLVIQLSNEKWQTAQQLAQQLEVTPRTIRSYIAKLKENGVLLQASHTKGYRLQN
QTDSQFLNEVSIGPEARRREFLVALLHHGSIDYYHFALEHHVEDTTVAKDISLLNRKLSS
YTAKIAVKDYVAALEANEEQVRQILLDQLYQESATAGFNVQALRHYFHFKFNYDELTQFI
RQQLKQNDLVLNDYNFTNFVFHLLVAIDRNQKLGKTIQPEMQASNQSQKVISVLVVWLRK
SYGLSLLIEDQRYLTLLLDNTAQISWKNHESIRKLAIMVNEILQEINLRYELNLNDEHFV
DRLLLHVANLVNRGHCSQLLQHQIPLVHHIKQTYPLIYDVAVFFVSQLAKKMGLALESDT
EIALIAIHFGLYIEDSLINSDTLTISLISPGYQELRQKIANKISASYGKRVVVKTYSDDQ
RVDKSGLVLTTDPTIQRPGYLLVSNFFNSRDRANVTDKIDHYLQKKSDLRFEYFLSKCLS
EEHFQISRSFADKKSFIEQRGNDLLKTGYIEADFLGDVLKRESMSSTNMLNGVAIPHSLQ
IGANRSIIDITIFPSGVVWDQNAAPVEIVVLSCIKASDQAIFGDFMDHLVKITSNSKLFN
RLKESRSFNDFLHELRTISK
NT seq
1863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacgatcggttgcggatgctggtgatacagcttagcaatgaaaaatggcagacagcg
cagcaactagctcaacaattagaagttaccccgagaacaattagaagttatatcgctaaa
cttaaagaaaatggggtccttttacaggcatcgcatacaaaggggtaccggttgcaaaat
caaactgatagccagtttttaaatgaagtatcaattggaccagaagcacggcgacgagaa
tttttggttgccttgctgcaccatggctcgattgattattatcattttgctttggaacat
catgtcgaggatacaacggttgctaaagatattagtctgcttaatcgtaaattaagttca
tatacagcaaagatagctgtaaaggattatgttgctgccttggaagcaaacgaagaacag
gtacgtcagattttattagatcaactttatcaagaatctgcgacagctggatttaatgtt
caggcattacgccattattttcattttaaatttaattatgatgaattaacgcagtttatt
cgacaacaattaaagcaaaatgatttggttttgaatgactataattttaccaattttgtt
tttcatttattggtggcaattgaccgtaaccaaaagctagggaaaactattcaaccagaa
atgcaggcttcaaaccagtcgcaaaaagtaatctcggttttagttgtctggttgcgcaaa
agctacggtttaagtttattgattgaagatcagcgttatttgacgttgttactcgataat
accgctcaaatttcgtggaagaatcatgaatcaattaggaaattggcaataatggtcaat
gaaattttacaagaaattaatctgcggtatgaactgaacttaaatgatgaacattttgtt
gatcgtttgctgctacatgtagcgaacttagttaatcgaggccattgcagtcaattgttg
caacatcagattcccttggtgcaccacataaaacagacttatcccttaatttatgatgtg
gccgttttctttgtcagtcaattagccaaaaagatgggtttggctttagagtcagacaca
gagattgccctaattgcgattcattttggcttgtacattgaagattcgctaatcaactcg
gatacactaacaatcagtttgatttctccaggatatcaggagttgcgtcaaaaaattgct
aataaaattagtgctagttatggtaagcgggtggttgttaaaacttatagtgatgatcaa
cgtgttgataaaagtggtttggttttaacgaccgatccgacaatacaacgtcctggatat
ttgcttgtttctaatttttttaatagccgtgatcgagcaaacgttaccgataaaattgac
cattatttgcagaaaaaaagtgacttacgttttgaatactttttgagtaagtgtttgagt
gaggaacattttcaaatttccaggtcttttgctgataagaaaagttttatcgaacaacgg
ggcaatgatttgcttaaaacaggttacattgaagctgattttttaggtgatgtccttaaa
agagaatcaatgtcttcaactaacatgcttaatggagttgctattccacattcgctgcag
attggagcaaatcgctcgataattgacattacaattttcccatcaggggtggtgtgggat
caaaatgctgctccagttgagattgtagttttatcttgtatcaaggctagtgatcaagca
atttttggtgattttatggatcacctagttaaaattaccagcaattctaaactatttaat
cggttgaaagaaagccgtagtttcaacgattttctccatgaattgcgaactatcagtaag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
