Liquorilactobacillus nagelii: BSQ50_11405
Help
Entry
BSQ50_11405 CDS
T06235
Name
(GenBank) thiol reductant ABC exporter subunit CydD
KO
K16013
ATP-binding cassette, subfamily C, bacterial CydD
Organism
lng
Liquorilactobacillus nagelii
Pathway
lng02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lng00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
BSQ50_11405
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lng02000
]
BSQ50_11405
Transporters [BR:
lng02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC-BAC subgroup
BSQ50_11405
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
AAA_21
SMC_N
MMR_HSR1
RsgA_GTPase
AAA_29
Mg_chelatase
MeaB
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUJ33098
UniProt:
A0A3Q8CGD1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2369734..2371452)
Genome browser
AA seq
572 aa
AA seq
DB search
MIDKKLMSFPGIRRVLALLLGLALLQAASILGQACFLAKAITNLWEGKSLTEQWNWILAF
VACYLLRHICLLLRTRILDNYAQQQAQRLRQDLLTKVFEQGPQIIQDQGTGNVTTMALEG
IDQVENYLQLILAKVATMTIVPWVLLAAVWLLDWKSGAFLLAIYPLIIIFMIVLGYAAQA
KADHQYHTYQLLSNHFVDSLRGIDTLRYLGLSRRYARSIFKTSERFRKATMSTLRIAILS
TFALDFFTTLSIAVVAVILGIRLINGAILLFPALTILILSPEYFLPIRDFSNDYHATLDG
KNALTAIEEILANKKNEIKMIELPTWRTDSHLTIQQLDFTYAKQTSPTLKQLDLAVTGFQ
KIGIIGLSGSGKSTLINLLGGFLNPDRAQIQIAGKTISSFEQPTWQRQLIYIPQNPYIFR
ATLRENIAFYRPSASIAAIKEAVKVVGLEQLVAELPHGLDTQIGEGARGLSGGQAQRIAL
ARAFLDQQRKILLFDEPTAHLDIETEVELKERMLPLMENHLVFFATHRLHWMQEMDQIVV
LDHGRIAEQGSLAQLQQQQGAFAKLSQSLRSV
NT seq
1719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgataaaaaattaatgtcttttcctggaattcgccgagttttagcgttgttgtta
ggattggcactattgcaagccgcttcgattctggggcaggcttgttttttagccaaagca
attactaatttgtgggaaggaaagtctttaaccgaacaatggaactggatcttagctttt
gttgcttgctatttgttgcgtcatatatgtttgttattgcgtacgcgtatactagacaat
tatgctcagcaacaagcacaacggttgcggcaagatttactaactaaggtttttgagcaa
ggaccgcaaattattcaagatcaaggtaccggtaacgtgacaacaatggctttagaagga
attgatcaagttgaaaattatctgcaattaattttggcaaaagttgcgactatgacgatt
gttccttgggtgttattagcggcagtttggttgcttgattggaaatcaggggctttctta
ttggcgatttatccattgataattatttttatgattgttttgggttatgcagcccaagct
aaagcagaccatcaatatcatacgtatcaattattatcaaatcattttgttgattccttg
cggggaattgatactttacgttatctagggcttagtcggcgttatgctcggagtattttt
aaaacgagtgaacgtttccgcaaagcgacaatgagcactttgcgaattgcaatcttgtca
acttttgctttggatttctttactacactttcgattgcagtagtcgctgtaattttgggt
attaggttaattaatggggcaattttgttatttccggctttgaccattttgattttaagt
ccagagtactttttacctatccgtgatttttctaatgattatcatgctactttagatggt
aaaaatgctttgacagcaatcgaggaaattttagcaaataaaaaaaatgagattaaaatg
attgaattgccaacttggcgaacagatagtcatttgacaattcaacaacttgattttacc
tacgctaagcaaacatcaccgactttaaaacagcttgatttagcagtcacaggtttccag
aagattggaattattggactcagcggttctggaaagtcaactttaattaacctattggga
gggtttttaaatcctgatcgagcacagattcagatagctggaaaaacgatttcgtcattt
gagcaaccaacctggcagcggcaattgatttatattccgcaaaatccttacatttttcgg
gcaacattacgggaaaatattgctttttaccgtccgagtgcttcaatcgcagcaattaaa
gaagcggttaaagtggtcggcttagagcagttggttgcagaattaccccatggcttggat
acccaaattggggagggcgcacgtggtttaagcggtggtcaagcgcaacgtattgcttta
gcccgcgcatttttagaccaacaacgaaaaattctgttatttgacgaaccaacagctcac
ttggatattgaaactgaagttgaattaaaagagcggatgttgccattgatggaaaatcat
ttagtattttttgcgacgcatcggctgcattggatgcaggaaatggatcagattgttgtc
ttagatcacggtcggattgctgagcaaggtagtttagctcaattgcagcaacagcaggga
gcttttgccaagttgagtcaatcattaaggagtgtctaa
DBGET
integrated database retrieval system