Loa loa (eye worm): LOAG_16646
Help
Entry
LOAG_16646 CDS
T02664
Name
(RefSeq) NFX1-type zinc finger-containing protein 1
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
loa
Loa loa (eye worm)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_19
AAA_30
AAA_22
AAA_16
nSTAND3
AAA
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9938484
NCBI-ProteinID:
XP_020307210
UniProt:
A0A1S0ULQ6
LinkDB
All DBs
AA seq
1968 aa
AA seq
DB search
MSSTAEYEWGIVVFGENNKGRITHEMMRSFANMFRHNSSKLGLDLVQLPFFLFTKNMAMV
QSEVEEWFEELESDKVVMLVMLFNDSDSNEVEEKMRRAWKENVLLYTQRSDSLLCCARDG
TEKIICCWIKEICELLNRRFYEGYGNLEEHIINGDQLPLDFVHIENIFLDLRKLEKPLKD
LDLVKYIDTPMLHNRLRIPFADKEQNGRLLAILSVASFTELPDLQTSVVNFVEKILKSGF
VSFMLRENACYIRSVANDECCRTLFIYLQDIMQILYISKINHIQDFDIVCDEFLNFMELI
PEKCWSAIDERLQLTIFTMLQNLTIDISESLAIDLHENREFNVMDSSMKCFDNRVSLDLI
EECESKDYSPAWINYEDVKPPEDFRTLSVYATSNDILHPARPYIRKNIVRGNYSNQEHYL
DVQFRLMREDLVAPLRDGIKLWKQQKGKETFLSYTMDASEELDLLVIRGVSVEGAQLKRS
TGEIIRYVIFQPVSIDNSWCSRLKYGQLVTLSSDEFQDEALLATVAENDPTEFLKGKLGL
RFFDDRSVSRAKIYTLVESISYYEMYHYVLECIKRFNNNYEIPFGRFLLKTETDVHFPSY
LVHQIDKDSHSSSDSLNSEYTDYNEFSSLTKETVIAKEISIFGAKYNVDKLKYTLDGNKV
ASGLDDAQRNALCYALTHEFALIQGPPGTGKTFLGRLIVRILLENMNMWNPKRINPILVV
CFTNHALDQFLDGVLADLIQDKRHSDELPNIVRFGSRCKSEILKRYTKRSVLEAYTNLIS
DAAKLKVNRIKLKRIHLLEMIRSQVAVLTLLKNEILSFKCMQQVMLPEHIQQFNMQRQTM
GKGCSMDEIFSRWLLEGDSGREDCVSIEYDADENCKKGKFSRNDNPEISVFWSMDGAFPN
EWKEEMLGSVPQNDCIAWKEMQELLRINSDVDDYYHSGEWDLDKDPNASAIEPVTIFSDQ
MSGKLKQRANAKYGAELIADLKDVKANILKSSPLTLEEASSVKNLQTLHRHRRWALYMHW
TGKLKVVVNKKLDILICKYQTVMEEVNKEFDLLDEVVLRKALIIGATTTCAAKMKPFLDR
LGCPIVIVEEAAEVLEAHVLTSITNKCQHAILIGDHQQLRPNPAVFALAREYKLDISLFE
RLIRNNFPYAVLERQHRMAPAISNTFMPEFYPLMKNADNVLSYPDVKGCRKNLYFINHSH
EEDVLFSTSHKNSFEGDFMIRLSTYFIQQGYSCSQITLLCAYTAQANYVRTQMLKFNNSS
LPLVETVDNYQGEENDIIILSLIRSQPSNGIGFLGVSNRVCVALSRSRLGLYVIGNMHFL
RSNSLLWHRLCIALANADCIGVGFPAFCAKHDVTQIIHSADEFLIKTPEGGCYCPCDFVR
PCGHICGQPCHRTDPEHRTTCTHPCLKTCSKLFRHLCTKLCGESCGTCQSFENKTFPCGH
ATSVVCYLFEETVCQEKCLKELPCGHRCTKKCSESCKCSYNVLLNCGHTVAATCSEKQKI
KCVVEVEKTFTTCSHRWIVPCQNYKNARCGEKCEKILPCGHRCQSLCGNCTLEGCASCPS
ICGKRLSCGHDCLRTCGTPCEPCIAFCSNQCGHSHCGQQLDILAEQRTRCADLCSFCVQR
CMNSCKHQECQMQCWQVCSISPCSFSCDKKLDCGHTCLSPCGEICPDICVECQGINVPVL
QFQGCKCIVSIEEADLHIRGQTSRKQQYTCPKCGCKLPVNGCFRYARELKEQAIFNERIK
FAKMLTDGLLINLQCDVLKQAEDDLAKIMRIRKKKSHATIEVAEILRLVITRLNTEFYNH
SGIMKWQIMINMLSDMCRLVTYIITEKFTSIPKKRYSNLYILFRDSLGTDNVFSLLEMDL
LRLLIFVKLLETESPSMLEIPVANGLRKISVKYMLGCLANDCIKKMKDLNMCQLKGLLEV
TVKALNWSSDTEQKKASSRFVQYCRNLYEVLNIQPMPGSDLQCLNFPY
NT seq
5907 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttcgacagcggagtatgagtggggaattgtcgtctttggtgagaacaacaaaggg
agaatcacacatgaaatgatgcgctctttcgccaatatgtttcgtcacaacagttccaag
ctgggattggatttagtgcagttaccattttttctatttaccaaaaatatggccatggta
caaagtgaagtcgaagaatggttcgaagaattggaatcggacaaagttgtgatgcttgtg
atgttgttcaatgatagtgattcgaacgaagtagaggagaaaatgcgaagagcttggaaa
gaaaacgtcttgctctatacacagagaagtgatagtttgctttgttgtgcacgtgatgga
actgaaaaaataatatgctgttggatcaaagaaatttgtgaacttttaaataggagattt
tacgaaggttacgggaacctcgaagaacatataatcaatggagatcagctaccacttgat
tttgttcatattgagaatatttttttagatttgcgaaaattggaaaaaccactgaaggac
ttagatttggtgaaatacatcgatactccaatgctgcataatagattacgtattccattc
gccgacaaagagcaaaatggccgactacttgccattctttcagttgcttcgtttacagaa
cttccagatcttcaaacttcagtcgttaattttgtggagaagattctcaaatcgggtttt
gtttctttcatgcttcgtgagaatgcatgttatatacgcagtgttgctaatgacgaatgc
tgtagaactcttttcatttaccttcaagacattatgcagatattatacatttcaaaaatt
aatcacattcaagatttcgatattgtatgtgatgagtttctaaattttatggagttaatt
ccggaaaaatgttggtcagctatcgatgaaagacttcaattaacgattttcacaatgtta
cagaatttaaccatcgatatttctgaatctttggcaatagatttgcatgaaaaccgtgaa
tttaatgtaatggacagcagtatgaaatgttttgataatcgagtgtctcttgatcttatc
gaggagtgcgaaagtaaagattatagtccagcatggatcaattatgaggacgtaaaacct
ccagaagatttccggacattgtcagtttacgctactagcaatgatatacttcacccagct
cgaccttatattcgaaaaaatattgttagaggaaattattcaaatcaagaacattatctc
gatgtacagtttcgtcttatgcgtgaagatttggttgctccattacgggacggcataaag
ttatggaaacaacaaaaaggaaaagaaacttttttgtcatatacaatggatgcaagtgaa
gaacttgacctgttggttataagaggtgttagtgtggaaggcgcgcaactaaaacgaagc
acaggagaaattattcgttacgttatttttcagccagtgagcattgataattcttggtgt
tcacgacttaagtatggacaattggtaaccttgtcaagcgacgaatttcaggatgaggcc
ttacttgctactgttgctgagaatgatcccactgaatttttaaaaggaaaattgggatta
cgttttttcgatgatcgctcagtttcacgagccaaaatttacactttagtcgaatcgatc
tcgtattatgaaatgtatcattatgtcttggaatgcattaagcgtttcaataacaattac
gagattccttttggtcgttttttgctgaaaactgaaactgatgttcacttcccttcatac
cttgttcatcaaatagacaaggattctcacagttcctcggattcgttgaacagtgaatat
accgactataatgagttttcttctttaaccaaagaaactgtgattgctaaagaaataagc
atttttggagcgaaatataatgtggataaattaaaatatacgcttgacggtaataaagtg
gcttctggattagacgacgctcaacgaaatgcgttatgctacgctcttacgcacgaattt
gcattgatccagggacctccgggtacaggcaaaacttttcttggtcgccttattgtacgc
attttgctggaaaatatgaatatgtggaatccaaagcgaataaatcctatactagttgta
tgcttcaccaatcatgctttggatcagttcttggatggtgttttagcagatttaatacaa
gataaacgtcacagtgacgaacttcctaatattgttagatttggttcgcgatgtaaaagt
gaaattttaaaaaggtacacaaaacgatcggtgttggaagcatacactaacttaatttcg
gatgcagcaaagctcaaggtgaatcgaataaagttgaaaagaattcatttattggaaatg
attcggtctcaagtcgctgtactaacacttcttaagaatgaaattctatctttcaaatgc
atgcaacaggtgatgttaccagaacatatccaacaattcaatatgcaacgacagaccatg
ggaaaaggatgttcaatggatgaaatattctctagatggcttctggaaggtgattctggt
agggaagattgtgtcagtatagaatacgatgcagatgaaaattgtaagaagggaaaattt
tcccgaaatgacaatccggaaatatcagttttctggtccatggatggggcatttcccaac
gaatggaaagaagaaatgcttggatcagtcccacagaatgattgcatagcttggaaagaa
atgcaggaactgcttaggattaactcagatgtagacgactattatcattctggtgagtgg
gatcttgataaagatcctaatgcgtccgccatagaaccagtaacaatattctcagatcaa
atgtctggcaaattaaagcaacgtgcaaatgcaaaatacggtgccgagcttattgcagat
ctgaaggatgtgaaggctaatatattaaaaagttcacctttgacattagaggaagcttca
tctgtcaaaaacctgcaaactttacacagacatcgtcgttgggctttatatatgcattgg
accggtaaacttaaggttgttgtaaataaaaaactggatattctcatatgtaagtatcaa
actgttatggaggaagttaacaaggaattcgatcttttggatgaagtcgttctacgaaag
gcactgattatcggcgcaactacaacttgcgctgcaaaaatgaaaccgtttttggatcgt
cttggttgtcctattgtaatagtggaagaagcagctgaagtcctggaagctcacgttttg
acaagcattacaaataaatgtcagcatgctatcttgattggagatcatcagcagttacgt
ccaaatcctgcggtgtttgctcttgctcgtgagtataaattggatatatcattgtttgaa
aggttgatcagaaataatttcccatacgcggtactggaaaggcagcatcgtatggctcct
gctatatcgaatacttttatgccggaattttatcctttaatgaaaaatgccgacaatgtt
ttgagttatccagatgttaaaggctgtcggaagaatttgtattttattaaccactcacac
gaggaagatgtgctcttctctacttcacataaaaattcattcgaaggcgattttatgatc
cgtttatctacttattttattcagcagggctattcttgttcacagatcacgttattatgt
gcctatacagctcaggcaaattatgtaaggacacaaatgttaaaattcaacaactcaagt
cttcctttggttgaaactgttgataattatcaaggagaagagaatgacataatcattcta
tctcttatacgttcacaaccgagtaatggtatcggttttcttggggtttctaatcgcgta
tgtgtagctttgtcacgctccagacttggtctttacgtgataggcaatatgcactttctt
agatctaactcacttctctggcataggctgtgtattgctttggcaaatgctgattgtatt
ggcgttggcttcccagcattttgtgctaagcatgatgttacacagattattcacagcgcg
gatgaatttttaatcaaaactcctgaaggtggttgctattgtccttgtgattttgtacga
ccttgcggtcacatctgtggtcaaccttgtcatcgaacagatccagaacacaggacaaca
tgtactcatccttgtctaaagacatgctcgaaactgttccgacatctttgtacaaaatta
tgtggtgaatcttgcggtacttgtcagtcttttgagaacaagactttcccatgcggtcat
gcaactagcgttgtttgttatctattcgaggaaacagtgtgccaagagaaatgtctgaaa
gaattgccatgtggccatcggtgtacgaaaaaatgcagcgagtcgtgcaagtgctcatat
aatgttttactgaattgtggacataccgttgcagctacttgttctgaaaaacaaaaaata
aaatgtgtagtggaagtagagaaaacatttactacgtgtagtcatcgctggatagtacca
tgtcaaaactacaaaaatgcgcgttgcggtgaaaaatgtgaaaaaattctaccttgtggt
catcgctgtcaatcgctctgtggaaactgcacactggaagggtgtgctagttgtccttca
atttgtggtaaacgactttcttgtggtcacgattgtttgcgtacatgtggaacaccttgc
gagccttgcattgctttttgttcaaatcagtgcggacattcacactgcggtcaacaactt
gatatacttgcggaacaaagaactcgatgtgctgatttgtgcagcttttgcgtgcagcgt
tgcatgaatagctgcaaacatcaagaatgtcaaatgcaatgctggcaagtatgcagcatt
agcccgtgcagtttttcgtgtgacaaaaagcttgattgtgggcatacttgtctcagtcca
tgtggcgaaatttgtccagatatttgcgttgaatgccaaggaataaatgttcctgttctg
cagtttcaaggatgtaaatgtattgttagtattgaggaggccgacctccatatacgagga
cagacatcaagaaagcagcagtatacatgtccaaagtgtggttgcaaactccctgtcaat
ggttgctttcgatatgcaagagaattgaaagaacaagctattttcaatgaaaggatcaag
ttcgcaaaaatgttaactgatggcttattaatcaatttgcagtgtgatgttttgaaacaa
gctgaagatgatttagcaaaaatcatgcgaataaggaaaaaaaaaagccatgctacaata
gaagtagccgaaatattacgtctagttataacgaggcttaacacagagttctacaatcat
tcaggtatcatgaaatggcagataatgataaatatgctttccgatatgtgccggttagtt
acgtacattattaccgaaaaattcacttctattccgaagaagcgctactccaacttgtat
atacttttccgtgattcacttggaacagataatgttttctccttgctggaaatggatctt
ctcaggttattaatttttgtgaaattattggaaacggaatcaccatcgatgttagaaata
ccggtagcaaatgggctacgaaaaatttctgttaaatacatgcttggatgcctcgcaaat
gactgcatcaaaaaaatgaaagatttgaatatgtgtcaactcaagggtttgctagaagta
acggtgaaggcattgaactggtctagtgatacggaacagaaaaaagcttcttcccgattt
gtacaatattgtcgtaatttgtatgaagttttgaacatacaacctatgccgggcagtgat
ttgcagtgtttgaattttccttattaa
DBGET
integrated database retrieval system