Candidatus Lokiarchaeum ossiferum: NEF87_004248
Help
Entry
NEF87_004248 CDS
T09593
Name
(GenBank) 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase
Organism
lob
Candidatus Lokiarchaeum ossiferum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transketolase_N
Transketolase_C
Transket_pyr
Cyclophil_like2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYP47963
LinkDB
All DBs
Position
4962980..4964947
Genome browser
AA seq
655 aa
AA seq
DB search
MPSVQKFPIDMSGYKPVILDLSQPDLSNDEVNQLEKNVQLARDAIIFFTAYAGVKRLGGH
TGGAYDIVPEMLIADSLKIGRNKIHPVIFDEAGHRVAVHYLLAALNGFMPLEDLLHYRQA
YCWLPGHPEKGYTPGIEFSSGRLGHMWSFVNGVALANPTQKILMMGSDGSQQEGTNAEAA
RFAVTNNLEVKLFIDDNDMTIAGHPSNYLAGYNIDRTLKGHGMSSEVCEDPENIRLLYRH
MVRCITTKGPAAVVCKRKMAQGIPGIEDTSKGHDVIPEEAAIAYLTKRGYTKAVEMIQNA
EKEKAIFDYLGSTKEFRKPRDKFGKVVCEILGKMTLKERLHKVRVIDNDLLGSCGLHFVK
NEFPEVFISGGIMERNNYTVAAGFGSTPGRQGITATFSAFLEMLPSEITMARYNDANVLA
HFSHAGVDWMADNNCHFGINNFFADNGIAEKDTTRLYFPADYHQMGAIVKEVFNDPGLRF
VFSTRSPSPFILDENGNRFFDIKNGYKFKPKKDELIREGTDGYIVAYGEMLHRCLDVVES
LKKEGKYVGLINKPTLNKADKAMMAKIGEAPFILVVESQNYKTGLGARFGTWLLESGYSP
VYQHLGVTKLGVTGLWEQIDHQGLDPYNIAKVTRRLVLNTKKGKGKDLTQWLKNE
NT seq
1968 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccttcagtacaaaaatttcccattgacatgagcgggtataaacccgtaattttggat
ttatcacaacctgatttatcaaacgatgaagttaatcaacttgaaaaaaatgtacaattg
gctcgcgatgccatcattttctttactgcttatgctggagtaaagcggctgggtggtcat
actggtggagcctatgatattgttcctgaaatgttaattgcagatagtttaaagatagga
agaaacaaaatccatcctgttatttttgacgaagcaggacatcgggtagctgtgcactat
ttactcgccgctttaaatggctttatgcctcttgaagatttacttcactaccgccaagct
tactgttggcttccaggccatcctgaaaaaggatacactccagggattgagtttagttct
gggagattaggacatatgtggtcctttgttaacggcgttgctctggctaatccgactcag
aaaatactcatgatgggcagcgatggatcccaacaagaaggtactaatgctgaagctgct
cgatttgcagtcaccaataaccttgaagtgaaattattcatcgatgataatgatatgacc
atagcgggacatcctagcaattatttagcaggatataatattgatagaaccctaaaaggc
catgggatgtcttcggaagtatgtgaagatccagaaaatatccgattgctctatcgacat
atggtgcgttgtattactactaaggggccggctgctgttgtgtgtaaaagaaagatggca
caaggcatccctggaattgaagatacttccaagggtcatgatgttattccagaagaagct
gctattgcctatttgacaaagcgaggatatactaaagcagtggaaatgattcaaaatgcc
gaaaaggaaaaagcaatcttcgattatttagggtctacaaaagaatttcgtaaacctcgg
gataaattcggaaaagtagtgtgtgagattcttggaaaaatgaccttaaaagaacggtta
cataaagttcgtgtaattgataatgatttgctcgggtcatgtgggcttcattttgtaaaa
aatgagtttcctgaagtgttcatttctggtggaattatggagcggaataattataccgtc
gcggcagggttcggatccactcctggacgccagggaataactgcgacattttcggccttt
ttagagatgcttccgtcagaaataaccatggcgcgatataatgatgcaaatgttctcgct
cacttttcccatgctggagtggattggatggctgataacaattgtcactttggtattaat
aatttctttgccgacaatgggattgcggaaaaagataccactcgactttattttccagcc
gactatcatcaaatgggggcgattgtaaaagaagtgtttaacgatcctggtttgcgtttt
gtcttttcaacacgatccccttctccttttatcttggatgagaatggaaatcgattcttt
gatataaagaatggttataagttcaaacctaaaaaagatgaattaatccgagaagggacg
gatgggtatattgttgcttatggtgaaatgcttcatcgatgtttggatgttgttgaatcg
ctgaaaaaggaaggtaaatacgtgggattgattaataaaccgacgcttaataaagctgac
aaagccatgatggcgaaaatcggggaagctccatttattttggtggttgaaagccaaaac
tataaaacaggccttggggctcggttcgggacttggttgcttgaatcaggttattctcct
gtttatcaacatcttggggttacaaaattgggtgtgactggtctttgggaacaaattgac
catcaaggcttggatccttacaatattgcaaaagttacccgaagattagtattaaatacc
aagaaaggcaagggcaaagatctcacccaatggttaaaaaatgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
