Candidatus Lokiarchaeum sp. GC14_75: Lokiarch_13660
Help
Entry
Lokiarch_13660 CDS
T04015
Symbol
rapA
Name
(GenBank) RNA polymerase-associated protein RapA
Organism
loki
Candidatus Lokiarchaeum sp. GC14_75
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DUF3670
ResIII
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KKK44954
LinkDB
All DBs
AA seq
1066 aa
AA seq
DB search
MRFINKVQLTYIPSDYWNESIGGFELLSKGRRLPKTSSFFLLWIPSGRTENEDELSEQIK
QIFPTIPSKKLLTCKINLAIPLKIENEKNKIFYDKYFEVANHLGKIMPISPAIKLLYQLD
MAKSTIRGIKDYSNSIKTWAFLTKLVFELLNKGQFIPILDNTDENKYTGQWRILLKSKNE
KNRFDTILRNSTWPAFCLPLNFFSEKGKIKTNGLWHPRYVFSIFMDNIGDTLIRSILIKN
KFQTFNEYYSTEINNEANNETRLGWDYKFLKALTSVNPLFTVEEFYETILPTQIRNWAQS
ARGFTLKHGFMLNLELEYPEKPEDDWPLKFSILSHDGSKIFPINDLLRKDNEKENKILKF
FQNDRQYLETILRALGAASKIFPPIKRVFSSQIRNSIKLTSSEVIDFLKYPKDLLIQSGF
SIVLPDVFTMHGKQRLYIRLKIHSNKNKEKNQGVSSVLPSLFDLKSMVVSKWEVKIGDQM
LTENEFNDLLSSKEPLINFRGKWIMLERQLIEDLIITKSSKKLGFMEAIKFGLTGKIQLE
DNGNEYDVVVEGDFNEMITNLQKIDSFEEIPCPRSFNGKLRHYQDVGLTWMGNMTKYNFG
LCLADDMGLGKTIQIIAFLLYLKEKFPNNPGSVLIICPTSVLFNWHRELNKFAPDLEIVL
HHGAKRVKDASKIPEFLKPHRIYLTSYGTIRNDINFLETINFSGVIIDESQNMKNYASKQ
TKAINRLKSQFRICLSGTPIENRLLELWSLFNFLNPGLLGSRKEFQEKYSLPIERFQNKD
AIKNLQLIISPFILRRIKTDKKVINDLPKKNEIKLYLELNEKQIKLYQELVENTLRDIDQ
PSVDKKRKRGLILGLLVKLKQICNHPYQYLKIKLSQIKKEEELKEIISLSPKMERLLEMT
EEVISNGEKVLIFTQFTQMGTILHKTLEFKHKSKVLYLHGGVPEKKRRVIVDEFQSEDKT
SPSILILSLKAGGTGLNLTQGTTVIHFDRWWNPAVEDQATDRAYRIGQKSVVNVFKFIMH
GTIEEKIDILLEEKRELANKIVLSTGESWISDLNTEKLKELLLLNN
NT seq
3201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtttattaataaagtacaactcacctatattccttcagattactggaatgaatca
ataggtggttttgaattattatctaaaggacgaaggcttcccaaaacttctagctttttt
cttctctggatcccttcaggtcgaactgaaaacgaagatgagctttctgagcaaattaaa
caaatttttccaaccattccctccaaaaaattattgacatgtaaaattaaccttgcaata
cctttaaaaatagaaaatgaaaaaaataaaattttttatgataaatattttgaagttgca
aaccacctaggcaaaattatgccaatttcacccgcaataaagttactttatcaattggat
atggcaaaaagtacaattagaggaattaaagattacagtaattctattaaaacatgggct
tttctaacaaaattagtttttgagcttttaaataaaggtcaattcattcccattttggat
aatacggatgaaaataaatatactggtcaatggcgtatattgcttaaatctaaaaatgag
aaaaatcgttttgataccattctacgtaacagcacttggccagctttttgcctccctcta
aattttttcagtgaaaaagggaaaattaaaacaaacggcctttggcacccaagatacgtt
ttttctatcttcatggataacataggggatactttaattcgttcgatattaattaaaaac
aagttccaaacatttaacgaatattatagtactgaaataaataatgaggcaaataatgaa
acaagattaggatgggattataaattcctgaaagctcttactagcgtgaatcctcttttt
actgttgaagaattttatgagacgatattgcccacacaaattcgaaattgggcacaatct
gccagaggttttactttaaagcacggattcatgcttaacttagaattagaatatcccgaa
aaacctgaagatgattggccattaaaattttctattttatctcatgatggttctaaaatt
ttcccgataaatgatcttttgagaaaagataatgaaaaggaaaataaaattctgaagttt
tttcaaaatgataggcaatacttggaaactatattaagagctttaggtgccgcatccaag
atatttccccccattaaaagggtcttttcttcacaaattcggaactcaatcaaattaact
tcaagtgaagtaattgattttttaaaatatcctaaggatttgttaattcagagtggattc
agtattgttctacctgatgtttttacaatgcatgggaaacaacgattatacattaggtta
aaaattcattcaaataagaataaagaaaaaaatcaaggtgtatcctcagtattaccctca
ttatttgatcttaaatcgatggtagtaagtaaatgggaagttaaaatcggagatcagatg
cttacagaaaatgagttcaacgatttgttaagttcaaaggaacccctgattaattttagg
ggaaaatggattatgctggagcgtcaattaattgaagacttaataatcactaagtcatca
aagaagttaggtttcatggaagcgataaaatttggattaacagggaaaattcaactagag
gataatggaaatgaatatgatgtagttgttgagggagattttaatgaaatgattacaaat
ctacaaaaaattgattcttttgaggaaatcccctgtccgagatcatttaacgggaagctt
cggcattatcaagatgtgggtttgacttggatgggaaacatgacaaaatacaattttgga
ctgtgtttagctgacgatatgggacttggaaaaactatccaaattattgcttttttgctt
tatctaaaagaaaagttcccaaataacccaggtagtgttttaattatatgtccaacctca
gtactttttaattggcatagagaattaaataaatttgctcctgatttagaaattgtgctt
catcacggagcgaaaagagtaaaagacgcatcgaaaattccagagtttttaaaacctcat
cgaatttatctgacctcttatgggactataagaaacgacattaattttttagaaacaatt
aattttagcggtgtgataatagacgaaagccaaaatatgaagaactacgcttctaaacaa
actaaagcaattaatagactcaaaagtcaattcagaatttgtttaagtggtactcccata
gaaaatcgtttacttgagctatggtcactatttaatttccttaatccaggacttttagga
agtagaaaagaatttcaagagaaatattcacttccaattgaacgatttcaaaataaagat
gcaattaagaatttacagctaataatttctccatttatcttacggcgtatcaaaacagat
aagaaagttataaacgatttacctaaaaaaaatgagattaagttgtatcttgagttaaac
gaaaaacaaattaaactctatcaagaacttgttgaaaacacactgagggatattgatcaa
ccatcagttgacaaaaaaagaaaaagaggattaatattaggattattagttaagttaaag
caaatttgtaaccatccatatcaatacctaaaaattaaattatcacagattaaaaaagaa
gaagaattgaaggagataatctctttatcacctaaaatggagagattattggaaatgact
gaggaagtaatttctaatggagaaaaagtattgatttttactcaatttactcagatggga
acaattttgcataagactcttgaattcaaacataaatctaaggttctgtaccttcatgga
ggagtacctgaaaaaaagagaagggtaattgttgacgaatttcaatcagaagataaaaca
agcccttcaatcttgattctttccttaaaagcgggaggaacaggattaaatcttacccaa
ggaactacagtcatccattttgatagatggtggaaccccgcagttgaagatcaagcaaca
gatcgcgcttatcgaattggtcaaaaatcggtggttaatgtgtttaaatttattatgcat
ggaacaatagaagagaaaattgatattttactcgaggaaaagcgagaattggccaataag
attgttttgtcgacgggagaatcttggatttctgatctaaatactgagaaattaaaagaa
ttattgcttttaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
