KEGG   Candidatus Lokiarchaeum sp. GC14_75: Lokiarch_46320
Entry
Lokiarch_46320    CDS       T04015                                 
Name
(GenBank) putative ski2-type helicase
  KO
K03725  putative ATP-dependent RNA helicase [EC:5.6.2.-]
Organism
loki  Candidatus Lokiarchaeum sp. GC14_75
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:loki00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:loki03019]
    Lokiarch_46320
Messenger RNA biogenesis [BR:loki03019]
 Prokaryotic type
  Archeal mRNA degradation factors
   Exosome components
    Others
     Lokiarch_46320
SSDB
Motif
Pfam: DEAD DUF5814 Helicase_C ResIII
Other DBs
NCBI-ProteinID: KKK41029
UniProt: A0A0F8XFR7
LinkDB
AA seq 888 aa
MSKISRKFFMVLDCRVKSKKDLVFNLNFFYLKKYKGKKHNFSYVNEPFFRGTVQFGLDFK
NRIRPLSFNKIEKDGIITPIDPRIFKTFLLSEKNKFIAFSSQSPLESFTSINEMLQNFDF
DKTRVINLTFCKSCLDNHKFTILNKKFQIKSLRNQIICSDCAYNIIFKDVKLRGLITHNK
IDTKLKNFFTHMILKFQDVRKVLTSFQADFNPVANREITLYDIEKKNPIDKKHITLNIED
VMIPQALKTALRKSKVDALLPIQTISLEKGLITENSNQLIIAPTSGGKTLVGELAGISKV
LKDRNHKMLYLVPIVALANLRTSEFKEKYQSLNLTILRKIGESLFEKRDNVDQDLINADV
IVATYEAIDFILRSGNNSILGNFATIIVDEVQTLIDSERGYLLDGFIARLKVLYKDAQFL
YLSATLGEPKLLADKLGCKLVMYNNRPVPIERHLILTLGESQKIKIISKLVKAAFFRKSV
HGFKGQSIIFTNTRKKCEQITSNLLERGIKISSYHSGLTHEERKIIEEDFRSQRISGVVA
TAALAAGVDLPAIQVIFESLAMGIKWLTVAEFEQMLGRAGRLKKHDIGYAYLLIEPGKVY
SPKMKGTEEELAIKLLNGKIKDFELVPDNNKFLTELLAFISMFNLGVKKEVIYLYFEYLI
NDYYSLEAFLTKLLQMKLIKTKNKLIYKPTKLGQAIAKSFLNIETCLKIVDILNKKEKSV
IEIALDLKPIKNVYLSKGVAADLAKNVNMRYRSNNLFSASVLSLMNAEYVKKRKSFSHEF
IEFVSKWIKDIFNCNCKDSPYCDCGKLNLEKMILNLRARDNLTIEEIGSFFEEEYKIIIF
KGDIIDYLENLIYSLKSIKNILKSRFDFKSDFKMEIRDISNLTEQIKY
NT seq 2667 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgagtaaaatttcaagaaagtttttcatggtcctagattgtagagttaaatctaagaaa
gatttggtttttaatctaaatttcttttatttgaaaaaatataaggggaaaaagcataat
ttttcttatgttaatgaaccattttttaggggtactgttcagttcgggttagattttaaa
aatagaatccgaccattaagctttaataaaattgaaaaagacggtatcatcactccaatt
gatccccgtatttttaaaacgtttttactttctgaaaaaaacaaattcattgcattttca
agtcaatctccacttgaaagtttcacatcaattaatgaaatgctacaaaattttgacttt
gacaaaacaagggtcattaatttgactttttgcaaatcctgcttagacaatcataagttt
acaattttaaacaaaaagttccaaatcaaatcattaagaaatcagattatttgctctgat
tgtgcatataacatcatatttaaagatgtaaagcttcgaggtctgattacacacaataaa
attgatacaaaattaaagaatttttttactcatatgattcttaaatttcaggatgtgaga
aaagtactaacctcttttcaggctgatttcaatcctgttgctaatagagaaatcactctt
tatgatatcgaaaagaagaatccaattgacaagaagcatatcaccctgaatattgaagat
gtgatgatccctcaagcgttaaagacagcattgagaaaatcaaaagtggatgctctttta
ccaattcagacaatatctttggaaaagggtctaatcacagaaaattcaaatcaacttata
atagcacctacctcaggagggaaaactttggtaggagaattagcaggaatctcaaaagtg
ttaaaggatcgaaatcataaaatgctataccttgttccaattgtagcattagcaaatttg
agaactagtgaatttaaagagaaatatcaatcattaaatctaacaatattaaggaaaatt
ggtgaatcattatttgagaaacgggataatgttgaccaagacttaattaatgcagatgta
attgttgctacctatgaagcaatagattttattctaagaagtggaaataattccattttg
gggaattttgctactataattgttgatgaagttcagactttaattgactcagaaagagga
tacttattagatggatttattgctcgattgaaagtgctttataaagatgctcaattccta
tatttaagcgcaacgttaggtgaacccaaattattagctgataaattagggtgtaaattg
gttatgtataacaatagacccgtcccaattgaaagacatctaatattaactcttggtgaa
tctcaaaagataaaaattatttcaaaattagtaaaagcagctttctttaggaaatcagtc
catggttttaaaggacaatctattattttcactaatactaggaagaaatgtgaacaaatc
acttcaaatttactcgaaagagggattaaaatttcttcttaccattctggattaactcat
gaggaaagaaaaattattgaagaggattttcgatcccaaagaatatcgggagtagttgct
acagcagcattagctgccggggtagatcttcctgcgattcaggtaatctttgaatcatta
gctatgggaataaaatggttaactgtagcagaatttgagcagatgttggggcgtgcagga
agactaaaaaagcatgatattggttatgcttatttacttatcgaaccaggaaaggtatat
tctcctaaaatgaaagggactgaagaagaactcgctattaaattgttaaatggaaaaatt
aaagattttgaactcgtacctgacaacaataaatttttaacagaactactagcatttata
tcaatgtttaatttaggagtaaaaaaagaagtaatttacctctattttgaatatttaatt
aatgattactatagtttagaagcatttttaacaaagttacttcagatgaaattaataaaa
acaaaaaataaacttatttacaaacctactaaattagggcaagcaatagcaaaatcgttc
ctaaatattgaaacttgtttaaaaattgtagatattttaaacaaaaaagaaaaatcagtg
attgaaatagcattagatcttaaacctattaaaaatgtctatttatctaaaggggtagcc
gcagatttagcaaaaaatgtaaatatgagatatcggagtaataatttattcagcgctagt
gtgttatcattaatgaatgctgaatatgtaaaaaagagaaaatctttctctcatgagttt
attgaatttgtatcgaaatggataaaggatatcttcaattgtaattgcaaggattcacct
tattgtgattgtgggaaacttaaccttgaaaaaatgatccttaatttacgagcaagagat
aatttaacaattgaggagataggctccttctttgaagaagaatataaaattattatcttc
aaaggtgatataattgattacttagaaaatctaatctatagcttaaaaagcataaaaaac
attttaaaaagtagatttgattttaaatccgattttaaaatggaaataagagacatctct
aacctaactgaacaaataaaatattaa

DBGET integrated database retrieval system