Paucilactobacillus oligofermentans: LACOL_0073
Help
Entry
LACOL_0073 CDS
T06755
Symbol
cydD
Name
(GenBank) ABC-type cysteine exporter subunit CydD
KO
K16013
ATP-binding cassette, subfamily C, bacterial CydD
Organism
lol
Paucilactobacillus oligofermentans
Pathway
lol02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lol00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
LACOL_0073 (cydD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lol02000
]
LACOL_0073 (cydD)
Transporters [BR:
lol02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC-BAC subgroup
LACOL_0073 (cydD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
Mg_chelatase
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_21
MMR_HSR1
AAA_23
MobB
SMC_N
ATP_bind_1
nSTAND3
NB-ARC
AAA_18
AAA_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUS25381
LinkDB
All DBs
Position
I:73452..75176
Genome browser
AA seq
574 aa
AA seq
DB search
MLDKRLMKLPGIKKIMVMLAGLAVLQALFIIGQAISLSLAITGLWSGKNLSEVIKWMGTF
AASFVGRQLIELVRDRMLDKFAYSSAQQIRTTLLNKIFKLGPEVVQQVGTGNITTMTLDG
IDQVENYIKLILSKVMNMMLIPWFVLATVFVFDWESGLVLTLVFPLIIIFMIILGYAAKS
KADNQYAKFEMLSNHFIDSLRGISVLKYFGLSKKYADSIYTTSEQFRKATMSTIKVAILS
TFALDFFTTLSIAVVAVLLGLRLINEKIFLFPALSILILTPEYFQPVRNFSSDYHATLDG
KNAMTAIYNIIDNPGNKSESVKINPWTEQSQLTINHLDFNYQDSFGVKNLKLNIQGYNKV
GIIGMSGSGKTTLINLLSGFFTPERSDIQIDNSNLESLNQADWQKQLIYMPQTPYVFHKT
IRENVAFYHPNASDKDVRLAIEAVGLTSFVDELPDHLDTVLGEGSRALSGGQAQRIALAR
ALIDSGRKIMLFDEPTAHLDIETEIDLKDKMLPMMDQRLVFFATHRLHWMKDMDYILVMK
HGELVEQGTLEQLQQNNGPFVELTNAMIGGEADV
NT seq
1725 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctggataagcgattaatgaaactccctggaattaaaaaaataatggtaatgcttgca
ggcttagcggttttgcaggcattatttattatcgggcaggcaattagtttatcgcttgca
attacagggctgtggtcaggaaaaaatttatcagaagtaattaagtggatggggaccttc
gcagcatcctttgtcggacgtcaactgattgagttagtccgtgatcgtatgctggataag
tttgcatattcaagtgcacaacaaatcagaacaacactattaaacaaaatttttaaatta
ggacctgaggtagttcaacaagttggtaccggaaatattactacgatgacgttagatggt
attgatcaagttgagaattatatcaaattgattctatccaaagtgatgaacatgatgttg
ataccatggtttgttttagcgacggtgttcgtttttgactgggaatcagggcttgtttta
acgttagtctttcctttaatcattattttcatgattattttaggctatgcagctaaaagt
aaagcggataaccaatatgctaaatttgaaatgttatctaatcattttattgactcatta
cgaggaatctcagttttaaagtactttggcttaagtaaaaaatatgctgatagtatttat
acaactagtgaacaatttagaaaagcaacgatgtcgacgattaaggttgcaattttatca
acgtttgcactcgatttctttacgaccttgtcaattgccgtagtggcggtgttgttggga
ttgagattgattaatgaaaagatattcttatttccagccttatcgattttgattttaacg
ccagaatatttccaaccagttcgcaatttttctagtgattatcatgcgactttagatggc
aaaaatgccatgacggccatttataatattattgataacccgggaaataaaagtgaatca
gttaaaattaatccgtggaccgagcagtcacaattaacgattaatcatcttgattttaat
tatcaagattcattcggcgttaaaaatttaaagctgaatattcaaggctataataaggta
ggaattatcgggatgagtggttctgggaaaacaactttaattaatttattaagtggtttc
tttactcccgaaagatcagatattcaaattgataattcaaacttagaatctttgaatcag
gcagattggcaaaagcaattaatttatatgcctcaaacaccatatgttttccataaaaca
attcgagaaaacgttgcgttttatcatcctaatgcaagtgataaagatgtaagactggca
attgaggccgttggattaacaagtttcgtagacgaactgcctgatcatttagatacggta
cttggtgaaggatcccgtgcccttagtggtggtcaagcacaacggattgctttggctcgt
gcgctaattgattcaggtcgtaaaattatgttgtttgatgagccaactgctcatttagat
attgaaaccgaaattgatttaaaagataaaatgttaccaatgatggatcagcgcttagtt
ttctttgctacacatcgtcttcattggatgaaagacatggactatattttagtcatgaaa
catggtgaacttgttgaacaaggtacgttagaacagttgcaacaaaataatggtccgttt
gttgaactaacaaatgcaatgattggtggtgaagctgatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
