Paucilactobacillus oligofermentans: LACOL_1188
Help
Entry
LACOL_1188 CDS
T06755
Name
(GenBank) Penicillin-binding protein
KO
K08724
penicillin-binding protein 2B
Organism
lol
Paucilactobacillus oligofermentans
Pathway
lol00550
Peptidoglycan biosynthesis
lol01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lol00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
LACOL_1188
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
lol01011
]
LACOL_1188
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
lol01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
DD-Transpeptidase (Class B PBP)
LACOL_1188
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transpeptidase
PBP_dimer
PASTA
Nup188_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUS26496
UniProt:
A0A0R1RLX7
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(1211829..1213976)
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MNKKSKRTMGHKTTKNRKIFGQWLFFFVGALFLLLIVRFGYIGIMKTAHGVSLENRIDIL
YTQKSVIQARRGRIYDSEKNKIAENTSTYKIYAVLDKSQKTTSGKPLYVTNKSKTAKVLS
KYLGLSKTEVMKILSPSSKTYQVEFGNAGSGISIETKRNIEDENLTGINFVESPAREYSN
GSFASQLIGIAQPKTSTKTGQTKLVGQLGLESIFNKELTGTNGVKKSKEDTSGYQIDGSK
KKAKNGDDIYTTLNTKLQTLLEGKMSEAASASQATSINAVLMNAKTGAIVAATQRPSYNT
DDKTMWRNTLVEDAYEPGSTMKVITMSAAIDSGNFNPNAYYQSGTYSIGGGQITDWNTSG
WGSITYREGFERSSNVAMAHLEQTMGAKTWKQYLDDFGFMKKVNVLGMTNENKGSSPYSG
ALEQANTAYGQGITVNTMQMLQAFSAVANNGKMLKPYFVKKIVDPDTNKVVQKSSKKVVG
TPIKASTAKSVLKYMQDVIYGDKGTGSMYQIDGYRVAGKTGTAQIGSATGYETGSGNYVY
SFVGMAPAKNPKYVMYLTLTKPKNTSTAAENFIASVFNPVMKQALDTDKAKKEKSTQGRV
NVPDVKGQTVETAGTKLTSVGLQYVVLGNGNKVKTQSITSSSVLTSSRIFLMTGGKTTMP
DMDGWSKKDVVTFAKLTKLKLTISGSGYLTSQSIKSMATIQDNQTLTVKFKKNNS
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaatcgaagcgaacgatgggacataaaacaacaaaaaacaggaaaatcttt
ggccagtggctatttttctttgtgggggcgttgtttttattgctcatcgttcgttttggt
tacattggaattatgaaaactgcacatggtgtcagtttagaaaaccgaattgatatttta
tatacacaaaaaagtgtaattcaagctcgccgtggccgtatttatgattcagaaaaaaac
aaaattgcagaaaatactagtacatataaaatttatgcagtcttagataaaagccaaaaa
acgactagcggtaaaccgttatatgttactaataaatcgaaaacggcaaaggtgctatca
aagtatttgggattatccaaaacagaagtaatgaaaattctgtcacctagttctaagacc
tatcaagttgaatttggaaatgcaggttctggaatttcaattgaaactaagcgaaatatt
gaagatgaaaacttaactggaattaattttgtagaaagtccggccagagaatattctaat
ggctcatttgcatcacaattaattggaattgcacagcctaaaactagtactaaaactgga
cagaccaaattagttggtcaacttggtttagagagtatctttaataaagagctgactgga
actaacggtgttaaaaagtctaaagaagacacgtcggggtaccaaattgatgggtctaaa
aagaaggctaaaaatggggatgatatttatacaaccctgaataccaagctacaaacatta
cttgaaggtaagatgtctgaggcagctagtgcatcacaagcaaccagtatcaatgccgta
ttgatgaatgctaaaactggtgcgattgtcgcagcgacccaacggccaagctataataca
gatgataaaacgatgtggcgtaatactttggttgaagatgcttacgaaccagggtcaact
atgaaagttatcacaatgagcgcagccattgattctggaaattttaaccctaacgcatac
tatcaatcaggtacttacagtattggtggtggtcaaattactgattggaatacgagtggc
tggggatcgataacctatcgagaaggatttgaacgatcaagtaatgttgccatggctcat
cttgaacaaactatgggcgctaaaacttggaaacaatacttagatgactttggttttatg
aaaaaagttaatgtgttaggaatgactaatgaaaacaaaggtagttctccatatagtgga
gctttagaacaagccaatacagcatatggacaaggtattacagttaacaccatgcaaatg
ttgcaagcatttagtgctgtggcaaataatggtaaaatgttaaaaccatattttgttaaa
aaaattgttgatcctgatacgaataaagtagttcaaaaaagtagtaaaaaagttgtcgga
acgccaattaaagctagtacagctaaatctgttttgaagtacatgcaagatgttatttat
ggtgataaaggaacaggaagcatgtatcagattgatggctaccgagttgccgggaaaaca
ggaacggcccaaattggttcggctaccggatatgaaactggtagtggtaattatgtgtat
tcttttgttgggatggctccagctaagaatcctaaatatgtgatgtatcttactctgact
aaacctaaaaatacatcaacggctgcagaaaactttatcgctagtgtctttaatccggta
atgaaacaagcattggataccgataaggccaaaaaagagaagtcgacgcaaggacgtgtt
aatgtaccagatgttaaaggccaaacagtagaaactgctggaactaagctaacatcagtg
ggactacagtatgtggtccttggtaatggtaataaagttaagactcaatcaattaccagt
agttcagtattgacgagcagccgaatctttttgatgacaggtggtaaaaccactatgccg
gatatggatgggtggtcaaaaaaagatgttgtaacgtttgctaagttaacaaaattaaaa
ttaacaataagtggtagtggctatttaactagtcaaagtattaaatcaatggcaactatt
caagataaccaaacattaactgttaaatttaaaaaaaataattcatag
DBGET
integrated database retrieval system
