Paucilactobacillus oligofermentans: LACOL_1276
Help
Entry
LACOL_1276 CDS
T06755
Name
(GenBank) Valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
lol
Paucilactobacillus oligofermentans
Pathway
lol00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lol00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
LACOL_1276
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
lol01007
]
LACOL_1276
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
lol03016
]
LACOL_1276
Enzymes [BR:
lol01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
LACOL_1276
Amino acid related enzymes [BR:
lol01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
LACOL_1276
Transfer RNA biogenesis [BR:
lol03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
LACOL_1276
Prokaryotic type
LACOL_1276
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
Val_tRNA-synt_C
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
tRNA-synt_1f
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUS26584
UniProt:
A0A0R1RXK2
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(1301590..1304247)
Genome browser
AA seq
885 aa
AA seq
DB search
MTKETEMSTKYDPKSVEAGRYEQWTSQGLFKPNEDKKAHKYSIVIPPPNVTGKLHLGHAW
DTTLQDMIIRQKRMQGFDTVWIPGMDHAGIATQAKVEARLREQGISRYDLGREKFVEQVW
DWKDEYADIIHQQWAKLGLSLDYDRERFTLDEGLNKAVRKVFVDLYKKDLIYRGEYIINW
DPQARTALSDIEVIHQDDEGAFYHVKYPFTDGTTFNGQDYIEIATTRPETMFGDVAIAVH
PSDERYKDLVGKKVVVPLVNREAEIIADEYVTPDFGTGMVKITPAHDPNDFKVGNRHNLE
RINTMNEDATMNANAGKYDGMDRFEARKAIVKDLEDAGFMLKIEPIVHSVGHSERTGVQV
EARLSTQWFVKMEPLAKESLAGQKGEDRVDFVPARFENTFSSWMENIHDWVISRQLWWGH
QIPAWYHKQTGEVYVGMEAPEDKENWEQETDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDSEDFKRY
FPTDTLVTGYDIIFFWVARMMFQSKEFTGRRPFKNVLIHGLIRDEQGRKMSKSLGNGIDP
MDVIEKYGADALRWFLSTGSTPGQDVRFSYTKMDAAWNFINKIWNASRYVIMNLGEMEEP
KLPDQSEWDLADKFILNQLNTTIAETTRLFDKFEFGEAGRILYNFIWNDFCDWYIEMSKE
KLNGGDAQQQANTRNILAYVLDQTLKLMHPIMPFVTENIWLSMPHTGDSLVNAPYPVVND
EFDNQEASEQMNHLIDLIKAVRNIRNEAGAPMSSSVDLLIKVDTEELGQVFKDNEEYIAR
FCHPDNLEIGTGVAAPKLALSGIITGAEVYIPMAELVDMDEEKAKLAKEIESLSQEVKRS
EKKLGNERFVANAPAEVVAEEKVKQEEWEQKLQAAKDRLTSIENA
NT seq
2658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaagaaactgaaatgtcgactaaatatgatccaaaatcggttgaagctggtcga
tatgaacaatggactagtcaaggcctatttaaacctaatgaagataaaaaagcacataaa
tattcaatcgtaattccacctccaaatgttactggtaaattgcatttaggtcatgcttgg
gatacgacattacaagatatgattattcgtcaaaaacggatgcaaggatttgatactgtg
tggataccaggaatggatcatgctgggattgctacgcaagctaaagttgaagctcgatta
cgggaacaaggtatttcacgatatgatttaggtcgcgaaaaatttgtcgaacaagtttgg
gattggaaagatgaatatgctgatattattcatcaacaatgggctaaacttgggttatca
ttagattatgatcgtgaacgctttaccttagacgaaggacttaataaggcagttcggaaa
gttttcgttgatctttataaaaaagatttaatttatcgtggcgaatatattattaattgg
gatccacaagcacggacagcgttatctgatattgaagttattcatcaagatgatgaaggt
gcgttttaccatgttaaatatccatttacagatggaacgacatttaacggtcaagactat
attgaaattgcaacaacgcgtcctgaaactatgtttggggatgtggcaattgcggttcac
ccaagtgacgaacgctataaagatctagttggtaaaaaagtggttgtgccattggttaat
cgtgaagctgaaattattgcggatgaatatgtgacacctgattttggaactggaatggtt
aaaatcactccagctcatgatcctaatgattttaaggttggaaatcgtcataatcttgaa
cgcattaataccatgaatgaagatgcaaccatgaatgccaatgctggtaaatatgatggt
atggatcgatttgaagctcgaaaagcaattgttaaagatcttgaagacgctggctttatg
ttaaaaattgaaccaattgttcattcagttggtcattcagaacggacaggggttcaggtc
gaagccagactttcaactcaatggttcgttaaaatggaaccattagctaaagaatcactt
gctggccaaaaaggtgaagaccgtgttgattttgtgcctgcacgatttgaaaataccttt
tcaagttggatggaaaatattcatgattgggtaatctcacgtcaattatggtggggacat
caaattccagcttggtatcataaacaaacgggtgaagtctacgttggcatggaagcgcct
gaagataaggaaaattgggaacaagaaacggatgtcctagatacttggttctcaagtgct
ttatggccattttcaacgatgggttggccagatacagatagtgaagactttaagcgttac
ttcccaacagatacgttggttactggttatgatattatcttcttctgggttgctcggatg
atgttccaaagtaaagaatttactggtcgcagaccgtttaaaaatgtcttaattcatggc
ttaattcgtgatgaacaaggtcgtaaaatgagtaagtcattaggtaacgggattgatcca
atggatgtcattgaaaaatatggtgctgacgcattacgctggttcttatcaactggttca
acaccagggcaagacgttcgctttagttatactaagatggatgcggcctggaactttatc
aataagatttggaacgctagccgttatgtcattatgaatctaggtgagatggaagagcct
aaattaccagatcaatcagaatgggacttagcggataagtttattttgaatcaattaaat
actacgattgcagaaactacccgtctctttgataaatttgaattcggtgaagctggtcga
attttatataacttcatttggaacgacttttgtgattggtatattgaaatgtcaaaagaa
aagctaaatggcggggatgcacagcaacaagccaatactcgtaatattttagcttatgtg
cttgatcaaaccttgaagttaatgcatccaattatgccatttgttactgaaaatatttgg
ttaagcatgccacatactggtgattcattagttaatgcaccatatccagttgtgaacgat
gaatttgataatcaagaagctagtgaacaaatgaatcatttgattgatttgattaaagcg
gttcgaaatattcgaaatgaagctggagcaccaatgtctagttcagttgatttattaatt
aaggttgacacagaagaattaggtcaagtgtttaaggacaatgaagaatatatcgcacgt
ttctgtcatcctgataatttagaaattggaaccggtgttgcggcacctaaattagcgctt
agtggaattatcacgggggctgaagtttatattccaatggctgaattagttgatatggat
gaagaaaaagctaaactagctaaagaaattgaaagcctaagccaagaagttaaacgttca
gaaaagaagcttggtaatgaacgatttgttgctaacgctcctgctgaagttgtggcggaa
gaaaaagttaaacaagaagaatgggaacaaaaattacaagcggctaaagatcgtttgact
agtattgaaaatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
