KEGG   Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy (serogroup 1): lpa_01473
Entry
lpa_01473         CDS       T01232                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
lpa  Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy (serogroup 1)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lpa00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:lpa02048]
    lpa_01473
Enzymes [BR:lpa01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     lpa_01473
Prokaryotic defense system [BR:lpa02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    lpa_01473
SSDB
Motif
Pfam: Cas3_I-F_Cas2 Cas3-like_C_2 Cas3_HD DEAD ResIII HDOD HD ATPase_2 EcoEI_R_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADG24312
LinkDB
Position
1170050..1173028
AA seq 992 aa
MMVVFISQCEKKALARTRRVLDAFADRIGDKTWQTVITQEGLLAVKKLLRKTASKNTAVC
CHWIRTRSKTELVWVVGRRQAFNHLGVVPVNFTSKEVIMDKLPIETGHLIANTKAQLLSH
HLFSVGYVAYYLLEKMGVDDYKLRQSAFISGILHDIGKIDPAFQSWVCKKNNKLSENIVP
EDGVHIDSPKRFSFESYPRHHELSWLLSEALLVESCSLSKHQRIQIAHGIYWHHTKPFRR
DDKFIDAEKIFTIFNASLGNMTINDIYFQAKVVLKDVSVFVSKFNISSLMPDFAKIFVLT
ENNLPKFKKYDNILDDLERYKNDIRHNALNNLIRSAVISADRLVSSCSAEDLEEYLAEGS
LKELVDNLEQGDGQLLNGIRSCLEGFEKRFPSSDQNRVQSEVAKKLSNLQKIAKINGLPN
ISVLEGPAGCGKTKISLEWALLTEAKKIIWICPRVQVCLGLLNDLTGSDYLPDCHIEIFT
GEYKKILSGGIAFDDAPETNEDAYFSGDIVITTIDQAVNTVITHHKVVALTDLMQAHVVF
DEFHELIHMPAFNLLFAELLEAKKKRVSQANTLLVSATPHYFFLKEFLDIPSEDIVAIES
FNRSRYLIEFKTYNEKEVLSPLITEDQQSNTFIISNTAQDAQLGYLKHYSTENSVLLHSK
YTKQDKAYWFNQVYESFKRNGNRRFDVLRSGPIIQASLNISCDRMLTELTCAENWLQRLG
RLDRFGVNTEVNHYITVLPESIGREGKQTSHCARFLNQLCIWQSTKAWLKFLKDKLTDNG
EVNINQLYKYYREFYSNPASQKALKEDFLKALKKSVDLINDKVIDPISIPQKTKRTDEII
KISANSLRSDSRFVQMAICRVTETLRYEFINDYAYSEDLDSSLLQTYLTASVESMRGYGE
DNNNLVQYMRKKHHNIKYGSGYKQARNEWDLIKEARSPETPIYLSYTPNDLEHIGGMDVA
HPQAIYYVISDKQPVGAMSIDKLKQHFQKTET
NT seq 2979 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatggttgtcttcatttctcaatgtgaaaagaaagcacttgctagaacccgtcgtgtt
ttagatgcttttgcagaccgtatcggtgataaaacttggcaaacagtaataacccaagaa
ggattgttggcagttaagaagttgttgcgtaaaactgccagtaaaaatacagcggtctgt
tgtcattggattagaacaagatcgaaaaccgagctggtttgggttgtaggtcggaggcaa
gcttttaaccatcttggtgttgtacctgttaattttacatcaaaggaagtcataatggat
aaattgcccattgaaactggtcatttaattgctaacactaaagcccagcttctaagtcat
caccttttttcggtaggctatgttgcctactatttgttggaaaaaatgggtgttgatgac
tataaattgagacaatccgcttttatatctggaatattgcatgatattggaaaaatagat
ccggcttttcaaagttgggtttgtaaaaaaaacaataaactttcagaaaatatagtccct
gaggacggggtacacattgattcacctaagagattctccttcgaaagttatccaagacac
cacgagctttcatggttactaagtgaggcattgcttgttgaatcatgcagtctttcgaaa
catcagcgaatccaaattgctcacggaatttactggcatcatactaagccttttagaagg
gatgataagtttattgatgcggaaaagatattcaccatttttaatgcttcattaggtaat
atgactattaacgatatttactttcaagctaaagtagttttgaaagatgtttccgtattt
gtaagtaaatttaatatctcaagtttaatgccagattttgcaaaaatctttgtattaaca
gagaataatctgccaaaattcaaaaagtatgacaacatattagatgacttagaaagatat
aaaaatgatataagacataacgctttaaataatctaattcgctcagcagttattagtgct
gaccgtttggtatcatcatgctctgcagaggatcttgaggagtatcttgctgaaggctcg
ttaaaggagttagtagataatctcgagcagggagatggtcaattgcttaatggaatccgt
agttgtctcgaaggatttgagaagcgttttccatcaagtgatcaaaatcgtgtgcaaagt
gaagtagctaaaaagttatctaacttacaaaaaattgccaaaattaatgggcttcctaac
attagtgtccttgaggggccggctggatgtggtaaaacaaaaatatctctggaatgggca
ttactcacagaagcaaaaaaaattatatggatttgccctcgagtacaggtttgtcttggt
ttattgaatgacttaacaggatcagactaccttccggattgccatattgaaatctttact
ggcgaatataagaaaatattaagtggtggtatagcttttgatgatgcaccagaaactaat
gaagacgcttatttttccggggatattgttataaccacgattgatcaggctgtgaatacc
gttattacacatcataaagtcgtggctttaactgatttaatgcaggcacatgtcgtattt
gatgaatttcatgaacttattcatatgcctgcctttaatcttctttttgctgagttgctt
gaggctaagaaaaaaagggtctcgcaagcgaatacattattggtctctgctacgccacat
tatttttttctgaaagaatttcttgatattcctagcgaggatattgtggctatcgagagt
ttcaatcgctcgcgctatctaattgaatttaaaacttataatgaaaaagaggtgttaagc
ccacttattactgaagatcaacaaagtaatacttttattattagcaatacagcccaagat
gcacagcttggttatctaaaacactacagcacagaaaacagtgtcttactgcattcgaaa
tataccaaacaggataaagcatattggtttaatcaggtatatgaaagttttaaacgtaat
ggtaaccgacgctttgatgtgcttagaagtggtcctattattcaggcatctctaaatatc
agttgtgatcgtatgttgacggaattgacttgtgcagaaaactggttacagcgtctagga
cgtttagatcgctttggtgttaatacagaggttaatcactatattactgtattacctgaa
agtattggtagggagggcaagcaaacgagccattgtgctagatttttaaaccaactttgt
atttggcaaagcactaaagcttggcttaaatttttaaaagataaattgacggataatggt
gaagtaaatatcaaccaactatataaatattacagggaattttattcaaatccagcatca
cagaaagctctcaaagaggacttcctaaaggcccttaaaaaaagtgtagatttaatcaat
gacaaagttattgaccctatatctatcccacaaaaaacgaaaaggactgatgaaataatt
aaaatatctgctaactcactcaggagtgatagccgctttgtacaaatggctatttgcagg
gtgactgaaacactacgctatgaatttatcaatgattacgcatatagtgaggatcttgat
tcctcattgttacaaacatacctgactgcgtcagttgaaagtatgagaggctatggcgag
gataataataatcttgttcagtatatgagaaaaaaacatcataatattaaatacggctct
ggctacaagcaggcacgcaatgaatgggatttaattaaagaggctcgttctccggagaca
ccgatttatcttagttatactccaaatgatctggagcatatcggtggaatggatgtagca
cacccacaagctatctattacgtaatcagtgataaacagcctgtaggagctatgtcgatt
gacaagctcaaacaacattttcaaaaaactgaaacttaa

DBGET integrated database retrieval system