KEGG   Lactobacillus panisapium: GYM71_05090
Entry
GYM71_05090       CDS       T07602                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
lpai  Lactobacillus panisapium
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lpai00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:lpai03400]
    GYM71_05090
Enzymes [BR:lpai01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     GYM71_05090
DNA repair and recombination proteins [BR:lpai03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     GYM71_05090
SSDB
Motif
Pfam: ADDB_N PDDEXK_1 Dsl1_C HD_assoc
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYN52823
LinkDB
Position
complement(1085934..1089407)
AA seq 1157 aa
MIKILVGRQTDSLQEKVLQAAVDNYQRFPEHETFIIVPNHIKFTTEVRAINRLAVSKGNV
EQSVKNLQVLSFSRLAWFFLKDAEQGLPTQLDNAAAAMILAKIIEQKRDQLHLFKTVSVS
PGLVKQLYDTILQVREGNLDLDEIDEDSLDLETKNKIADLKIIYEAFTSTIATKFSTSNE
VQLQLNEYLASGIDLSKTDFYFSDFSHFSLQECLTVKLLMMHAHSVTLAFKTKIGDINPE
FAQGDYDYVIQRTINQLLNYLKQHDLSYEVEKTPISPQPTKRELLNEFWTGTAYDVGKLD
QVQLVRADNRYAEAYYVAHTIYQQVALKNYRYRDFLVLAPNLHEYETYLIPILRQNHVPF
FDDLQQEMKYHPLVILIENIAQLLARPFQTQNMLAIMKTHLIIPDWYQEESAYIHDVDEL
ENFVLAHGINHNLWKRDFTDYVASEVIRLDKVPDEVAQISKLKDFFVKKLERLLTKLKQE
EDTQKAITTFFNFLTNNKVNQVLEKWREDAQTAGDLQQARQSEQVWDLLITLLHDYLLIN
PTEFDVASFFNVLTNGFKEATFSQIPSTLDAVNLSETGIVQVSGYKQVFIMGATSTGLPA
IQTTPGFLSTENLENLSTAFGEDSYLEDHQQLSNLDQNYQFGICLALASDKVYLSYSVAN
SDNEAVEPSIYYDRLKRAGAIEFQQHNLPEKFQDLLSFLTNPQASLGYLTYLKQANSEID
VDQLLKLTAAKIPTKTAMVLEASQFDNQPADIGAELAQELYGQNLNSSVSQLETFYENSY
EYFLNYGLHLHKRFENEFDIIQAGNYFHETFDRLVKELNQKHLDLADVDETTLSQLLAIA
RAKMMAEAKYKQLANDPFNQFLFKCLDQTTTKVAFNWQKAVQKTPLRAKYSELSFGFGEK
VHGLDLVVPNLAGKHYVNLRGKMDRVDLAQISDKNEYLAQVIDYKSSAKKFNLGLFYQGI
SLQMVSYLDVLLKNQPFFTGKTPLYLLGAFYQTITRQTERLNGKDLYNSHLELKQDNLDG
KTRLKYTGLINYDQALVLDADPELEKNSTTSDLYTGVNSKKDGSLSFRGNAFKDDEIELL
LQYDEELIKDAASQILSGEIKLNPYKYGKGINALTYSDYRDIFFFDAMLKENKYHQVGSL
SKKELLSKIKEKLGEEE
NT seq 3474 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcaagattttagtcggtcggcagacagattctttacaagaaaaagtcctgcaagct
gcagttgataactaccaacgctttccagaacacgaaacttttattatcgttcctaatcat
attaagtttaccacagaagtcagagcaataaacagattagccgttagcaagggcaacgtt
gagcaatcggttaaaaatttgcaggttttatcattttcgcgacttgcctggtttttcctc
aaagatgctgaacagggtttgccaacgcaacttgataatgccgcggctgccatgatttta
gccaagattattgagcaaaagcgtgaccagcttcatctttttaaaacggttagcgtcagt
cccggtttagttaaacagctttatgatacgattttgcaggttagggaagggaaccttgat
cttgatgaaatcgacgaagattctcttgacttagaaacgaaaaataagattgcagacctt
aaaatcatttacgaggcatttactagtacaattgctactaagttttcgacttcaaatgag
gtgcaattgcagctgaatgagtatcttgctagcggaattgatttaagcaagaccgatttt
tattttagtgatttttctcatttttcactgcaggaatgtctgacggtcaaattgttaatg
atgcatgctcatagcgttaccttagcttttaaaaccaaaattggcgacattaaccctgaa
tttgcgcaaggtgattacgattatgtaattcagagaacaattaatcaattactgaattat
ttgaaacagcatgatctgtcttatgaagtagaaaaaactcctatttcgccccagcccact
aagcgggaattgctcaatgagttctggacgggcactgcttatgatgtgggtaaacttgac
caggtgcaattagttcgagcagataaccggtatgccgaggcctattatgttgcccataca
atttaccaacaagtggccctaaaaaactaccgttatcgcgatttcttggtattagcaccc
aatctacatgaatacgaaacatacctgattccgattttacggcagaatcatgtcccattt
tttgatgacttacagcaagaaatgaaatatcatccgttagttattttaattgaaaatatt
gctcagcttttggcacggccgtttcaaacccaaaatatgctggcaattatgaaaacccat
ctaattattccggactggtaccaagaagaatcagcttatattcatgacgtcgatgagctg
gaaaattttgttttggcgcacggaattaaccataatttatggaaacgtgattttacggac
tatgttgcttctgaagtgatcagactagacaaagttcctgatgaagtggctcaaataagc
aaattaaaagacttttttgtgaaaaagctcgaacggttattaactaaacttaagcaggaa
gaggacacgcaaaaagcgattaccactttctttaattttttaactaataataaggttaat
caagtacttgaaaaatggcgcgaagatgcgcaaaccgctggtgacttgcagcaagcacgc
caatctgaacaagtatgggacttgctcattacgttattacatgattacttactgattaat
ccgactgaatttgatgtagccagttttttcaatgttttaaccaacggctttaaagaggct
actttctcccaaattccttctaccttggatgcagttaatctttctgaaacaggtattgtc
caagttagcggctataagcaagttttcatcatgggcgctactagcactggtttgccagcc
attcaaaccaccccaggttttttaagcactgaaaatctagagaatttaagtactgccttt
ggcgaagattcttatttggaagatcaccagcaattaagcaatcttgatcagaactatcag
tttggtatttgtttggccttggccagtgacaaggtttacttatcttattcggtggccaat
tctgacaacgaagcagttgagccttcaatttattatgaccggctcaaacgcgctggtgca
atcgaattccagcaacacaatttaccggaaaaattccaggaccttttaagtttcctgacc
aatccccaggcaagtttaggttacttgacttacttaaagcaggcaaatagcgaaattgat
gttgatcaattattaaaattaacagcagcaaaaatcccaactaagacggcaatggttcta
gaagccagtcaatttgacaaccagccggcagatattggtgctgagttagcccaggaattg
tacggccagaatttaaattcatccgtttcacaactggaaactttttatgaaaattcttac
gaatactttttaaattacggtttgcatttgcataaacgctttgaaaatgagtttgatatt
attcaagccggtaattattttcacgaaactttcgaccgtttggtaaaagaacttaaccaa
aagcacttagatttagccgatgttgacgaaactactttaagtcaattactagccattgct
agagcgaaaatgatggccgaagctaagtataagcagcttgccaatgatccctttaaccaa
tttttatttaagtgtcttgatcaaactaccaccaaggttgctttcaactggcaaaaagca
gtacaaaaaacgcctttacgggcaaaatactctgaacttagttttggttttggcgaaaaa
gtccacggccttgacctggttgttcctaacttggctggcaagcattatgttaatttacgc
ggtaagatggaccgggttgatttggcccaaattagtgacaagaatgaatacttggcgcag
gtgattgattacaagtcttccgcaaagaaatttaatttgggcctcttttaccaaggtatt
tcactacaaatggtttcctatctcgatgttttactgaaaaaccagcccttctttacgggc
aaaacaccactttacttgcttggtgcattttaccaaacaattacgaggcaaactgagcgg
ttaaacggtaaagatttgtacaatagtcatttagagttaaaacaagataatctggatggc
aaaaccaggctaaaatacaccggattaattaattatgaccaagcactagttcttgacgct
gaccctgagcttgaaaaaaacagtaccacctcggatttatataccggtgttaatagtaaa
aaagatggcagtctcagctttcggggtaatgcttttaaagatgatgaaattgagcttttg
ctgcaatatgatgaagagctcattaaggacgccgcaagtcaaattttatccggtgaaatt
aagctcaatccatataagtatggcaaaggtattaacgccttaacttattccgactaccgt
gatattttcttttttgacgcaatgcttaaagaaaacaagtatcaccaggttggcagttta
agtaaaaaagagttattaagtaaaattaaagagaaactgggagaggaggaatag

DBGET integrated database retrieval system