Lysinibacillus pakistanensis: GDS87_02640
Help
Entry
GDS87_02640 CDS
T06280
Name
(GenBank) LPXTG cell wall anchor domain-containing protein
Organism
lpak
Lysinibacillus pakistanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_bind
SpaA
CarboxypepD_reg
bMG3
SdrD_B
Big_1
Ig_DR_A0283-like
Gram_pos_anchor
Y_Y_Y
DUF2606
Cupredoxin_1
fn3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGG49899
LinkDB
All DBs
Position
572924..578755
Genome browser
AA seq
1943 aa
AA seq
DB search
MQRRQQTPTGISLNLEKERNMKKLNLAIIILLLVFQTVLSPISVFADEGEPPVTPPTEST
EDAGTGSDGEGDDPNVTSGDTAEVTVPEDEPTAAPLNVTPLNACVGPQELAGVTLTQFDM
NIGGNAITEGVYTTPLPKDQKADFDVKFNVLLDDLYCAGSYFEFDLPASLIDFNSAFHGS
KQVGNIAYSYTTVGNKVRVELTNNVEIDDVSTTTPAELTMNFQAGFNLISNDIEQELEIP
KVGGGEAKTKFTFLPSTSNEKATKTATDGIPPVVDGNHQMEWTIWLNQAGKNFDSPSLVD
NPTGGHAVVSGSVNVYEYEVDLMGVKMGTETQVVWDGDFSNIVFQDKHAYKIVYKTEVNL
PVEQREGKKTFYNSVTFTNGGIPESVNNVPKDITYGKELEKAKIDAGTNNYTSKWEIRYN
YNQASIPQASAIITDTLPGIHEIDTNTIEVRVMAIDDQGNGTGAGTIVDPSNYNVTPVTN
GFELQFNNAIDKAYKVTYDAKYNGTGLGYYVGTNPTTVTNTVVSGTKNDSKPHTIKEGVL
TKTHVVNFDTKEITWTIDIKADNPNEAINNLTLADVFKITGSKEGTHTLVGDESNITITG
TTGAAPVKTVTDPTDGFTITGINIAAGGKATVTYKTSFAIGNDGEVQSGYGNTATVNWDS
YTVQKEDHYTPATTTVNNGSKAGAFNYLDQLFTWKVKVNINKKDIQGAILTDTIGAGHEF
VANSLKVYEYTLTTGDDTSGTPATTPIDASNYTLDVASDKKSYTLTFNNSLDSTINEKAY
LVEYHTKDSDEILGIGIDETGYTTGNVYSNTATFQTLGSKNYTLEATPVTLPTHVANNLI
KKTATQDNSKQTVSWTLDVNQSHSKLGANVTLEDTPSGNLMLIEGSIKVRKYNVTATSIS
QNGTGAYVDPSTYGITVNKKADGGFILHFANLNEGYQVQYQTIGLGKIGQGFSNDAKLTF
GVEKASNQKDDAKVNANFTFSSSDTSFSMVKGDAQFKKVGVNSETGAEEPLSGVQFQLYK
VIGTNNYLIQTATSGTDGLFSFTNINYGNYKIEEVAAKAPYQKMVAQLFTLDAAKDTKVG
SNVVTKLVNVTPLPGGSCPTFNLTVKNIDGAPVANKQIELIDSNGAVKSTVTTGIDGKVA
IPSTVQAGEYKVKDSDGIDYGKVIVKFGAGGCQGEVQPINSCPIFTITVNDEQNNPRPNV
TVTLKNASNTVITTATTDGNGKITIPSTTPSGTYKLYEGTVFLGNVEVSYQNGKCEATIT
QAPTCEVFTLTVNDVDGKPRQGVTVEIKDKNNPNAIVPQPLSATDANGKVTIQNIKPGEY
EVYENGTKIGEFTVDTGCEETVQPIPACSVFTLTVKDEDGILAEGTEVTITNTATKDSFT
AIVGKNGKVTFPSATTPSGKFEVSITASGKVLDEFDVTYSGNCEDTAEKPRACDIFTITV
KDTDGSLKGNTKVVIEDSNGNVVTTGQTDANGEIQLPQNQSPGMYTVYEETDSGVKGDEI
GKVKVTYTDGCKGVVQKNACPVFTLTINDKNLKPVGANVLIVIKNQAGDVVTSGKTDASG
KIVFEDKTKLQQGQNYVVFNEAGIKLGDITVSYADNICGATVQVPNNACPIFTLTVQDLY
GYGRPNVAFTIKDLYHNTIASGKTNEQGVGTVPYTVQPGIYNVYEGNVLLGTITVTDGCS
GLVKPSYTGGGGWIPPNPDPGKPVDPKPNPGKPGEPTDPTTNPGKPGKPTDPTTNPGKPG
KPTDPTTNPGKPGEPTDPTTNPGEPGEPTDPTTNPGKPGEPTDPTTNPGKPGEPTDPTTN
PGKPGEPTDPTTSPGKPGEPTNSNNSATPGKTEASKPSVQNVIDQGKKLPPYNPTKATKD
TLDAYNDFLNKYSLLTKEEQKDVAESLDIDKIKTDAKRLEDQLKAQGKLPQTDGADQTAL
TLIGVALVLGALFFLRRRKAEIK
NT seq
5832 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacgtcgtcagcaaacaccaacaggtatctctctgaacttagaaaaggagagaaac
atgaagaaattaaatttagcaataattatattgctgctagtctttcaaacagtgctttca
ccaatttcagtgtttgcagacgagggggagcctcctgtgacaccgccaactgaatctacc
gaagatgctggaactggttctgatggcgagggagatgacccaaatgtaacaagtggagat
acggctgaggtgacggttccggaggatgaacctactgcagctccactgaatgttacacct
ttaaatgcttgtgtaggcccacaagaactagcaggtgtgacattaactcagtttgatatg
aatattgggggaaatgcaattactgaaggtgtttatacaacgccattaccgaaagatcaa
aaggctgactttgatgtcaaatttaatgtattattagatgatttatactgtgcagggagt
tattttgaatttgatttaccagcttctttaatagactttaatagtgctttccatgggagc
aaacaagttggtaatattgcttattcatatacgactgtaggtaataaagtcagagttgaa
ctgacaaataatgtagaaattgacgatgttagtactacaactccagccgaattgactatg
aactttcaagcaggatttaatcttatttctaatgatatcgaacaagaattagagattcca
aaggttggtggtggagaagctaaaacaaaattcacatttttaccatcgacatctaatgaa
aaggctacaaagacagctactgacggtatccctccagtagtggatggtaatcatcagatg
gaatggaccatttggctcaaccaggcaggtaagaattttgacagcccaagtttagttgat
aatccaactggtgggcatgctgttgtatcaggttcggttaatgtgtatgaatatgaagta
gatttaatgggcgtgaagatggggactgaaacccaagttgtatgggatggtgatttcagt
aatattgtttttcaagataaacatgcctataaaattgtttacaaaacagaagtgaattta
cctgttgagcaaagagaagggaaaaaaacgttttacaatagcgtaaccttcactaacggt
ggtatacctgagtctgtaaataatgttccaaaggatatcacatatggaaaagagttagag
aaagcgaaaatagacgcaggaactaacaactatacgtcaaaatgggaaattcgctacaat
tacaatcaagcaagtattccacaagcgagtgcgataatcacggatacacttccaggaatt
catgaaatcgacacgaatactattgaagtacgagtaatggcaatagatgatcagggtaat
ggtactggagcaggaacaatagttgaccccagcaactacaatgttacaccagttacaaat
ggctttgagcttcagtttaataacgccatagataaagcctataaagtcacatatgatgct
aagtacaatggaactggtcttggatactatgtgggaacaaaccctacaacggtaacaaat
acggtggttagtggcacgaaaaatgattcaaaaccacatacaattaaagaaggcgtgtta
acaaaaacgcacgtagttaattttgatacaaaagaaattacttggactatcgacattaaa
gcagataatccgaacgaagcgattaataatttaacattggcagacgtatttaaaattact
ggaagcaaagaggggactcatacacttgtaggggatgaaagtaatattacaattacagga
acaacaggtgcagcgccagttaaaacagttactgatcctacagatggcttcacaattact
ggtattaatatagcagcaggtggaaaagcaactgttacgtataaaacatcatttgctatt
ggtaatgatggtgaagtgcagagtggttatggtaatacggcaacagtaaattgggatagt
tatactgtacaaaaagaagatcattatacacctgctactacaacggtaaacaatggtagt
aaagctggggcatttaattatcttgatcaattattcacatggaaagtaaaggtgaatatt
aacaaaaaggatattcaaggagctattttaacagatacaattggtgcaggacatgaattc
gtagcaaattcattaaaggtatatgaatatacattaactactggtgatgatacgagcggt
acaccagctactacgcctatcgatgcatcaaactacacattagatgttgcgtcagataaa
aagagttatacattaacatttaataattcattagatagtactataaacgaaaaagcctat
ttagtggaatatcatacaaaagattctgatgaaattctaggaattggtattgatgaaact
ggatatacaacagggaatgtttatagcaatacagcaacattccaaacattaggctctaaa
aattatactctagaagccacgccagtgacgcttccaacacatgtagcaaataacttgatt
aaaaagacagctactcaagataattctaagcaaactgtttcttggacattggatgtgaat
caatctcattcaaagttaggagcaaatgtgacattggaagacacaccatctggcaattta
atgcttattgaaggttcaatcaaggtgagaaaatacaatgttactgcaacaagtatttct
caaaatggtacgggtgcatatgtagacccaagtacttatggaataactgttaataagaaa
gcggatggtggctttatccttcactttgctaatctaaacgaaggctatcaggtgcaatat
caaacaattggtttaggtaaaataggccaaggcttcagcaatgatgctaaattaacattt
ggtgttgaaaaggctagcaatcaaaaagatgatgcaaaggttaacgctaattttacattt
agtagttcagatacgtcattttctatggtaaaaggtgatgcacagtttaaaaaagttgga
gttaactcagaaactggtgctgaagagcctctatcaggtgtacaattccaattatacaaa
gttattggtacaaataattacttgattcaaactgcaacatcaggtactgatggcttgttt
agctttacaaacatcaactatggaaattataaaattgaagaggtagcagcgaaggcgccc
tatcaaaaaatggtagctcaattatttacacttgatgcagcaaaagatacaaaagtaggt
tctaatgtagtaacgaaactggtaaatgttacaccgcttccaggtggttcttgcccaacg
tttaacttaacagtgaaaaatattgatggagcacctgtagctaataagcaaattgaatta
atagacagtaatggtgcagtaaaatcaacagtgactacaggtattgatggtaaagtagca
attccatcaacagttcaagctggagaatacaaagtaaaagatagtgatggtattgactat
ggtaaggttattgtgaaatttggtgctgggggatgccagggagaggtacagccaataaat
tcatgtccaatattcacaattacggtaaatgatgaacaaaataatccacgtccaaatgta
acagtaacattaaaaaatgcaagtaatacagttattacgactgcaacaacagatggcaat
ggtaaaattactattccatctacaacaccgtcaggaacgtataaactttatgaaggtact
gttttcttaggaaatgtagaggtaagctatcaaaatggtaagtgtgaggctacaattaca
caggcacctacctgcgaggtatttacattaactgtaaatgatgtagacggtaaaccacgt
caaggtgtcacggtagaaattaaggataaaaacaatccaaatgctatagttccacaacct
ttaagtgcaactgatgctaatggtaaggtgactattcaaaacattaagccaggtgaatat
gaagtatatgaaaatggtacaaaaatcggagaatttacagttgatactggctgtgaagaa
actgttcaaccaataccagcatgttcagtattcacgctaacagtgaaagatgaggatggt
attttagcagagggtacagaagtaacaattacaaacacagctacgaaagattcgtttaca
gccatagttggcaaaaacggtaaggtaacattcccatcagcaacaacgccttctggcaaa
tttgaagtgagtattacggcatcagggaaagtacttgatgaatttgatgtaacgtattca
ggcaactgtgaggatactgctgagaaacctcgtgcatgtgatattttcacaattacagta
aaagatacagatggtagcttgaaaggaaatacgaaagttgtcattgaagatagcaatggc
aatgttgtgacaactggtcaaacagatgctaacggtgaaattcagttaccacaaaatcaa
tcaccaggtatgtacacagtctacgaggagacagatagcggtgtaaaaggtgatgaaatt
ggaaaagtaaaagtcacttatacagacggctgtaaaggtgtagttcagaaaaacgcttgt
ccagtatttacactaacaattaatgataaaaaccttaagcctgttggtgcaaatgtttta
atcgtcattaaaaatcaagctggagatgtagtgacatctggtaaaactgatgcatctggt
aaaattgtatttgaagataagacgaagctacagcaaggacagaattacgtcgtatttaat
gaagctggtattaaattgggtgatattaccgtaagctatgcggataatatttgtggagct
accgtgcaagttccaaataatgcgtgtccaattttcacattaacagttcaagatttatat
gggtatggtcgtccaaatgtagcattcacaattaaagatttatatcataacacaattgct
tctggtaagacgaatgaacaaggtgtaggaacagtcccttatacagttcaaccaggaatt
tacaatgtttatgaaggcaatgtgttattaggtacaattacggtaactgatggatgctca
ggattggtaaaaccatcttatacaggaggtggtggttggataccgccaaatccagatcca
ggcaagccagttgatccaaaaccgaacccaggcaaaccaggtgaaccaacagatccaaca
acaaacccaggtaaaccgggtaaaccaacagatccaacaacaaacccaggtaaaccgggt
aaaccaacagatccaacaacaaacccaggcaaaccgggtgaaccaacagatccaacaaca
aatccaggcgaaccgggtgaaccaacagatccaacaacaaacccaggtaaaccgggtgaa
ccaacggatccaacaacaaatccaggcaaaccgggtgaaccaacggatccaacaacaaat
ccaggcaaaccgggtgaaccaacagatccaacaacaagcccgggcaaaccaggtgaacca
acaaattcaaataattcagcgactccaggaaaaacagaagcatctaaaccttctgttcaa
aatgtcattgatcaaggtaaaaagttaccgccatataatccaactaaagcaacaaaagac
acgctagatgcgtataatgatttcctcaataaatatagtttattaacaaaagaggaacag
aaagatgttgcggaatctctggatattgacaaaattaaaacggatgcaaaacgactagaa
gatcagttaaaagcacaaggtaaactaccacagacagatggtgcagatcaaacggcactt
acactgattggtgtagcacttgtacttggtgcattattcttcctacgtcgacgtaaagct
gaaatcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system