Lysinibacillus pakistanensis: GDS87_08745
Help
Entry
GDS87_08745 CDS
T06280
Name
(GenBank) GTPase
Organism
lpak
Lysinibacillus pakistanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Dynamin_N
MMR_HSR1
FeoB_N
RsgA_GTPase
Aida_N
HEPN
EF-hand_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGG51040
LinkDB
All DBs
Position
1882247..1885858
Genome browser
AA seq
1203 aa
AA seq
DB search
MNDFDQQLEGLLKQAALQYIIYQHNGDTERMDKTSLFARKLQQKEYVIGFAGHFSAGKSS
MINALSGENLLASSPIPTSANIVKVHKSEEDYAIVYMHNEKPVKFEAGYDFKTVKELSKN
GDLVSQIEIGHSASTLPFGVTVMDTPGVDSTDDAHRMSTESALHIADIVFYTMDYNHVQS
ELNFQFTKQLMKYNPNVYLIVNMIDKHKENELSFEEFKATVHQSFAAWGVIPKGVFFTSL
REPEHPHNDFEAVKKIVMDSMNDWQDQLVLTATNTLRLLQSEHDTYLMEERQDRLEIDED
VLSADDWANHKDILEQYNKLNRQVELFSVEAWNETFEEERKELLANAAIMPADLRDKLRL
YLESQQEGFKVGGLFTAKKKTEEERNRRKEDAYSAYQNVAHAQITGHLRGLMKKVLKDVG
ALNEERASAIDAYPFALPFSLIEQQVQVGALLTGDAVLNFANRVAEATKRYFIQESDQWK
DAQATLLESVATETAAPSKLKMAGMQAKVNAIQAVLEIEGYQQYSASVMHQASNEIRKQA
NQQLTNWDNAFKQDLAEIRLFDETMLKPKEQAVQQEEVQQAVSATSLPIEGVIKRALHTA
KAVKEVQGFAEVASYLENKVERLQKKDFTIALFGAFSAGKSSFSNALMGAKVLPVSPNPT
TAAINKIRPVTPDHPHETADVQLKNAEQMLEDIKGSYAAIGLSVSSMEEAFNRADEGLAV
QLSDERLNVHKSFIRAYKEGFPTFKSELGKVLRVNREEFEKFVAQENKSCFVDNIDFYYD
SPLTRMGVTLVDTPGADSINARHTGVAFEYIRNADAILFITYYNHAFAKADREFLIQLGR
VKDAFELDKMFFIVNAIDLATTEEEQEDVKGYVRSELQRFGIRFPRLYGVSSLLALKEKV
EEAELSSGMPPFEDAFYTFLNDELSALAVQALAEEVDKTEQRLGDLIAQTEENLKRKDER
LEELTTLEQHIKSKFNTLNTSMVESETKQELDELLYYVLQRVYYRYPEFFKEGYNPSTFA
AMPAQQALEHALKEVLQSLRFDFTQEMRVTNFRLSQFISKKMQLRFKDEVRELKELNRSF
SFLGFEAAEPDLLDFEGPFTDNAKYSSVKTHFRNAKAFFEKNEKVKLSEALEALTKPDAQ
NYLDAQKVSLMTWAISYIAEEAERLRLHIYHQALEQIATERLVLQEESRLASWKTIYAQL
QYA
NT seq
3612 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgattttgatcagcaattggaggggctgttaaaacaagcagcgttacaatacata
atatatcagcataatggcgatacagagcgtatggataaaacctcactttttgcacggaaa
ttacagcaaaaagagtatgttattggatttgcaggccatttctcagcaggaaagtcgagt
atgattaatgcactttctggtgaaaatttacttgcatctagcccgattccaacgagcgct
aatatagtgaaggtccataaatcagaggaagattatgcgattgtctatatgcacaatgaa
aagcctgtcaagtttgaagcaggctatgattttaaaactgtgaaagaactaagtaaaaat
ggagatctagtatctcaaattgaaatcgggcacagtgcatcgacattaccattcggtgtc
acagtgatggatacaccaggggtggactccacagatgatgcacaccgtatgtctacagag
tcagctcttcatattgctgatatcgtattttatacaatggactacaatcacgtgcaatct
gaattaaatttccaatttacaaagcagttgatgaagtacaatccaaatgtttatttaatc
gttaatatgattgataagcataaggaaaatgaattaagctttgaggaatttaaagctact
gtccatcaatcatttgccgcttggggagttattcctaaaggtgtgtttttcacttcttta
agagagcctgagcaccctcacaatgattttgaggctgtgaagaaaattgtgatggatagt
atgaatgattggcaggatcagcttgtactaactgcaacaaatacactgcgtttattacaa
agcgagcatgacacttatttaatggaagaaagacaggatcgtttagaaatagatgaagat
gtattaagtgcggatgactgggcaaaccataaggacattttagagcaatataataagctt
aaccgtcaagttgagttattttccgtagaggcatggaacgagacatttgaagaggagcgt
aaggagttacttgcaaatgcagccattatgcctgccgatttacgagataaattacgtttg
tatttagagagccagcaggaaggttttaaggtaggtggcttatttacggctaagaaaaaa
acggaagaagaacgtaaccgtcgtaaagaagatgcctatagtgcctatcaaaatgtagca
catgcacaaattacaggccatttaaggggcttaatgaaaaaggttttaaaggatgttggt
gcactaaatgaagagcgagcttcagcaattgatgcctatccatttgctctaccattttca
ctgattgaacagcaggtgcaagtaggtgctttattaacaggagatgccgtattaaacttt
gctaatcgtgtagcggaggcaacaaagcgctactttattcaagaatcagatcaatggaag
gatgcacaagcaacattattagagtcagtagcaacagaaacagcggcaccatctaaatta
aaaatggcaggaatgcaggcaaaggtaaatgctattcaggctgtgcttgaaattgaaggc
taccagcaatatagtgcaagtgttatgcaccaggcgagcaatgaaattcgtaaacaagcg
aatcagcaactgacaaactgggacaacgcattcaagcaggatttagcagaaattcgatta
ttcgatgaaacgatgctgaagccaaaagagcaagctgttcaacaagaagaggtgcagcaa
gctgtgagtgcaacaagtcttcctattgaaggtgttattaaacgagctttgcatacagcg
aaagccgttaaagaggttcaaggctttgccgaagtagcaagttacttagagaataaggta
gagcgattgcaaaagaaagattttaccatcgcattatttggtgcatttagtgcagggaaa
tcttcattctcgaatgccctaatgggtgctaaggttttaccagtttcaccaaaccctaca
acagcggccattaataaaatacgtcctgtaactccagaccatccacatgaaacagctgat
gtacagctaaaaaatgctgagcaaatgctagaggatataaaaggctcctatgcagcaatc
ggactttctgtttcctcaatggaagaagcatttaaccgtgcggatgaaggacttgctgtg
cagctttctgatgagcgtttaaatgtccataaatcatttattcgtgcatataaagaaggg
ttcccaacatttaaatctgaacttggcaaagtgttacgtgttaaccgagaagagtttgaa
aaatttgttgcgcaagaaaacaaatcatgttttgttgataatattgatttttattatgat
agtccactaacacggatgggtgttacactagttgatacgcctggagctgactctattaat
gcacgtcatacaggtgttgcatttgagtatatccgaaatgctgatgcaatcttgtttatt
acttattacaatcatgcctttgcaaaagcagaccgtgaatttttaattcagcttggtcgt
gtaaaagatgcgttcgagctagataagatgttctttattgttaatgccattgatttggca
actacagaggaagaacaagaggatgtaaagggctatgtacgttcagaattgcagcgcttt
ggcatacgcttccctcgactttacggtgtttccagtttgttggcgttaaaggaaaaagtt
gaagaagctgaattatcttctggtatgccaccatttgaggacgctttctataccttttta
aatgatgagttaagtgcattagcagtgcaggcacttgcagaggaagttgataaaacggag
caacgtttgggcgatttaattgcacaaacagaggaaaacctaaagcgcaaggatgaacgt
ttagaggaattaacaacacttgaacagcatatcaaatccaagttcaatacacttaataca
agtatggtagaaagtgaaacgaagcaagagctggatgaattattatactatgttctacaa
cgcgtatactatcgttatccagagttctttaaagaaggctataatccttcaacatttgca
gcaatgccagcacagcaagcattggagcatgctttaaaggaagttttacaaagcttacga
tttgatttcacacaagaaatgcgtgttacgaacttccgtttatcacaatttatcagtaag
aagatgcaattgcgctttaaggacgaagtacgtgaattaaaagaattaaaccgtagcttc
tcgtttttaggctttgaagcagctgagccagatttacttgattttgaggggccgtttact
gataatgcaaaatattcaagcgtaaaaacgcacttccgtaatgctaaagcattctttgag
aaaaatgaaaaggtgaaattaagtgaggcgttagaggccttaacaaagccagatgcacaa
aattatctggatgctcagaaagtatcattaatgacatgggccatttcctacattgctgag
gaagcggagagattgcgtctgcatatttaccatcaggcacttgagcaaattgctacagaa
agacttgtactgcaagaagaaagtcgattggcttcttggaaaacgatttacgcgcaatta
caatacgcatga
DBGET
integrated database retrieval system