Leeuwenhoekiella palythoae: LDL79_05645
Help
Entry
LDL79_05645 CDS
T07563
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18989
multidrug efflux pump
Organism
lpal
Leeuwenhoekiella palythoae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lpal00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lpal02000
]
LDL79_05645
Transporters [BR:
lpal02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
LDL79_05645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Tctex-1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UBZ11599
LinkDB
All DBs
Position
1334060..1337569
Genome browser
AA seq
1169 aa
AA seq
DB search
MAKNTYKEFSISSWAIDNKMTVYVITAIILLSGLAAYYSMPREAFPEIIETKIYVSSVNP
GNAAEDVEKFITEPLEEEFNDIAGIKEITSTTLQDYSIIIVEFEEDVDVNVAKTKVKDKV
DLVKAETTWPTLDNGAKVEPNIFDLNISEEQPILNINLTGDFQVQQLKDYAEYLQDKIEL
LPQIKEATVRGAEEQEVEVAVDIYKMTASKVSFDNIINAIRSENNTISAGNVISDGLRKN
IRVLGEIQDPKELNNIVVKRDGGNIFLKDIATVRFKEKDATTYAREYGQPVVMLDVKKRA
GKNMIEAVESIKKIVAEEEANYYPESLHISLTNDQSIKTENQVDDLVNNIIFGVILVVVV
LMFFLGFRNALFVGFAIPLSMFMSLTILSSLGFTLNTMVLFGLVMGLGMLVDNGIVVVEN
VYSLMDQGMPRLKAAKQGLGEIAWPIIASTATTLAAFFPLGLWPGTIGKFMIYFPITLSV
VLSSSLFVALIINSMLTSRFMKTEEEDMSKKSLVRNSLILTAVGAIFLIVGFVIDSGGFR
GIGNLLLLIAILLWAYKYFLAGAVRYFQFESLRKLENFYERFLKYALRGRKAYVFFFGTV
IMLFLSFVLVGIAQPNVLFFPENEPNQIITYIEYPEGTAIEKTNQLTKQIEERIFDAIKK
YEDADGYNYMVESAISQVGQGAGNPQTDGGQSNEMPHKGKVTLSMRDFKLRRGVSSSTVL
SEVRDAVKGFPGASVIVEKDANGPPVGYPINIEISGEDYEEMLLAAENMRTYIEDLGIGG
IEELKLDVNKSKAELGVTVSREKAGQLGISTAQVGQTLRRSVYGEEASTYKEGDDDYEIN
VRFNEDYRYDENALFNQPVTFRNNQGQIIQVPISALVDKKSSAAFSAIKRKDLKRVITLY
SNVLTEQGFNATQIVEQLKQDLAGYETPNGIEYSFTGEQEEQADNMSFLLMALGIAMGSI
LLILVAQFNSLSKPVIILMAVVLSLVGVFLGLIIFQMDFVILMTMMGIISLAGIVVNNAI
VLIDYTQILIDRKKEELGIEDDEYLTREEYFRITVAGGKSRLRPVLLTAITTVLGLIPLA
VGLNIDFFGLFTDYDAGIYIGGDNVIFWGPLAWTVIFGLVFATFLTLVIVPVMFYLTNRA
KVKFSEKRKVREEQKQQAKLAAASEDSES
NT seq
3510 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaaaacacttataaagaatttagcatatcgtcttgggcaatagacaataagatg
accgtttatgtaattacggcgatcatcttacttagtggtctggcagcctattacagtatg
cctcgtgaagcattccccgaaatcatagaaaccaagatctatgtaagttcggtaaacccg
ggtaatgccgccgaagatgttgaaaaattcatcaccgaaccactcgaagaagagtttaac
gacatcgccgggattaaagagatcacctctactacccttcaggattacagtattatcatt
gtagagtttgaagaagatgtagatgtaaatgtggctaaaactaaggttaaggataaagtt
gatttggttaaggcggaaaccacttggcctacgttagataatggtgccaaagtagagcct
aatatttttgaccttaatatttcagaagaacaacctattctgaacatcaaccttaccgga
gactttcaagtgcagcaacttaaagattatgctgaataccttcaggataaaatagaattg
cttccgcagatcaaagaagctaccgtacgcggtgccgaagagcaagaagtagaagtagcg
gtggatatttataaaatgaccgcttctaaagtaagttttgataacatcatcaatgccatt
cgctctgaaaacaataccatttctgcaggtaacgtgatttctgatgggttgcgaaaaaac
attcgggttttaggcgaaattcaagatcctaaagaacttaataacattgtcgtaaaacgc
gatggcggaaatatttttcttaaagatatcgccaccgtgcgctttaaagaaaaagacgcg
accacttacgcacgtgaatatgggcagccggttgtgatgcttgatgtaaaaaaacgcgcc
ggaaaaaatatgatcgaagcggttgaatctattaaaaagatcgtcgctgaagaagaggcc
aattactatcctgagtcgttacacattagccttaccaatgaccaatcgatcaaaacagag
aatcaggtagatgacctggttaacaacatcatttttggggtgattctggttgtggtggta
ttgatgtttttcttaggatttagaaacgcattgtttgttggatttgcaattccactttct
atgtttatgtccttaaccattttatcaagtttaggttttaccctgaatacgatggtgctc
tttggtctcgtaatgggacttgggatgctggtagataatggtattgtggttgtggagaac
gtgtattctttgatggatcaaggtatgccgcgtttaaaagctgcaaaacaaggtcttggg
gagatcgcttggcccattatcgcttcaacagcaaccacgcttgcagcctttttcccacta
ggtttatggcccggaactattggtaagtttatgatttacttccccatcacgctctctgtg
gtgttgagttcgtctttattcgttgcgcttatcatcaactcgatgctgacttcgcgtttt
atgaaaaccgaagaagaagatatgagcaaaaagagcttggtgcgcaacagtttaattctg
actgccgtaggtgccattttccttattgtaggttttgtaattgattcaggcggatttaga
ggaatcggaaacttattgcttctgatcgcgattttgctttgggcttataaatatttctta
gcaggtgcggtacgctattttcagtttgaatcgcttcgaaaattagagaacttctatgag
cgtttcttaaaatatgcgctgcgcggaagaaaagcatacgtgtttttcttcggaaccgta
attatgttattcttatcctttgtattggtggggatcgcacaacctaatgtgttgttcttc
cctgaaaatgaacccaatcaaatcatcacctatatagaatatcctgaagggacggcgatt
gaaaaaaccaatcaacttaccaagcaaatcgaggagcgcatttttgatgctattaaaaag
tatgaagatgctgacggatacaactatatggtagaaagcgccatttcacaagtaggtcaa
ggtgccggaaacccacaaaccgatggtggccagagtaatgaaatgccacataaaggtaaa
gtaacgctgtctatgcgtgactttaaattgcgccgcggagtgagcagtagcactgtactt
tctgaagtgcgtgacgcggttaaaggattccccggagcttcggttattgtagaaaaagat
gctaatggtccaccggtaggatatcctatcaatattgagatcagcggtgaagattatgaa
gaaatgctactcgctgccgaaaacatgcgtacctatattgaagatctaggcataggtggt
attgaagaacttaaactggatgtcaataaatctaaagctgaacttggtgtgactgtaagt
cgtgagaaagccggtcagcttggtatttctaccgctcaggtagggcaaactttgagacgt
tcggtgtacggtgaagaagcttctacctataaagaaggagatgatgattatgagatcaac
gtgcgttttaatgaagattatcgttatgatgagaatgctttattcaatcaaccggtaacc
tttagaaataatcaaggtcagatcattcaggtgcctatttcggcattagttgataaaaag
tcttcagcagcatttagtgctatcaaacgtaaagaccttaagcgagtgatcaccttatat
tcaaatgtgcttaccgagcaaggctttaatgctactcaaattgttgagcagttgaaacaa
gacctcgcaggctatgaaactcctaacggaattgaatacagttttacgggtgagcaagaa
gaacaagcagacaacatgagcttcttattgatggccttaggtattgctatgggctcgatc
ttgcttattctggtagcgcagtttaactcactttcaaagccggttatcatcttgatggcg
gtagtcttaagtttagtgggtgtattcttaggtttgatcattttccaaatggattttgtc
atcttaatgacaatgatgggtattatctcactcgctggaatcgtggtgaacaatgcgatc
gtacttatagactatacgcagatcttgatcgatcgtaaaaaagaagaattaggtattgaa
gatgatgagtatctaacccgtgaagaatactttagaattacggttgcaggtggtaaatca
cgtttacgccctgtattgctaacggcaattactacagtgctcggattgattccgctggca
gttggtttaaacattgatttcttcgggctctttactgattatgacgcgggtatctacata
ggaggtgataacgtgatcttctggggacctctggcgtggacggtaatcttcggtttggtt
ttcgcaaccttcctaaccttggtaatcgtaccggtaatgttctaccttactaatcgtgct
aaagttaaattttcagaaaaacgaaaagtacgtgaagaacaaaaacaacaggctaaatta
gctgctgcttcagaagattcagaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system