Lacipirellula parvula: PLANPX_4046
Help
Entry
PLANPX_4046 CDS
T06590
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lpav
Lacipirellula parvula
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Inhibitor_I78
Gly-zipper_Omp
DUF6531
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBO34434
UniProt:
A0A5K7XC80
LinkDB
All DBs
Position
4528668..4534031
Genome browser
AA seq
1787 aa
AA seq
DB search
MSDIECGYFCACPLCRNGTPTKLAFVVGQLTNNILECCTEYPYGTLELEYFAGGIEACNW
ATSHPQVSCAYWGGSDIAIQAPLVNLAIYGLTGIDQHAGMTNGGVYSFGYFKHQPSSSIE
CFDSHVLPYGDCDMCEACEPPAGSAVVYGMHGESDRECYKITTCAETIPCAQESANCPPM
PYIGAPTTCCQESDSECGCESGESDECSSCEVEVSPHLIEIFGCCPSFTWQCPEYRSASS
GGSDSSGGGNCNSGDCNSTPTRGTFSDNALSDLAGLFQYVRDITRPVIPSLQTGPAGMSP
AWGFTTYRIAPPDAGSLQPPLSLMYNSVHANQDSAYGFGWSNALELRIEGDPSESVVSLT
NGSGLRLNYGATTAGAYLPPPKIPLALSGDSGTSTFVATQPDGTALQFDNSSPHRLSSIT
SSGGAKWTVMYDGTPERMRSILDPSNRRTTLSYDGNGKIASIVLPDGRETLFTVTAGKLA
STTTPEGCITQFNYLTQDVGGEDFIHLNSIVDPAQHATTYSYDSSGWCNQIAHADGSVVS
ISYLDWNNAVVEMVGSLSESTSTWIKYNSARNVASCQTIGGLPTTFIWDNGIVAGVQDPR
GYLTTFTYKQLLSSARVLDSVTNPDGGVYTIQYDASDRVESLIDARGNRSTITWDGFKRT
ELRDAIGNRWTYVYDGLSRVCGKINPLGERITFHYDTLGNRDFTQNALGEVSTSTYENGQ
RKSIQNAAGYITTFIRDDMNRVVRKIDARSYATTFTYGINCRISRIENALGVRTSFQYDE
MNRLRATVNGLGERTTFGYDGLGNSNSMQNPLGSVTTQLYDANRRVVGVVNALGCVSTLS
YDASGNLRSIENPLGYRTTTQYDSMNRPRAQMDARGNVTTFQYDLRGSRTSLENALGQRT
TTSYTPLNRVEALEEPSGAITTFNYDAAARQKAIWNSRSYATTFNYDGVGRLKSDINSLG
YRATYSYDAAGRRVAVQNSRGFSTTTQRDSVGNVVATVDPLGYCTTTTYDPLNRRISVLN
GQGHVSTMSYDAAGRVTGTQNPLGFRTTFAYDAAGRRLAIWDAENNRTTTVYDAAGRTQA
IVNALGCRTTMQYDLAGRRETLQDANGYRTTFEYDAGGNVSVEVDPLGRRTSFSYSATVQ
LKSKQDPRNVRITYVYDSVGRQTEQVFSSGLRYTFTYDSMGNRLTMIDGSGASAYEYDAL
NRLSVAVTPSGQRITYGYDPAGNRASMVEPTGGRFTYAYDAVEQLTAIDNPFAERTTITY
DEVGRQKSTLFANGMQTSNTHDGAGRLTQIDYWRDTSSNANWVNWELPDWVAMDLSDWLE
FELEGSGILDQVVYQHDNVGNRTAVAEHNGSVTTFIYDTTYRLTHEHRTGIAAYQITHSY
DSVGNRKVEVADGLRTTFNYDPSNQLTTSTDPSGATTSYSYDNAGNLTQEASAAGTTVNT
WNDDCHLVKVTQPGNVVTTMGYNAYGLRVTRESEGGITKSLWDLQNVLTESNEDDAILAT
YTLAPRSYGKLLSLNRGGTSSHFALSDALGSVIGLTSSTGSISDSYRYKAYGTPIYASGT
TVNPFRWGGRSGYHFDSGLDEYYVRSRYYSQATVRWVSHDLAGVFAGLNKYLYCWNVPTR
FLDPSGRFGVDDACEFANQKGQGRDAVDCACWLAGLLDIVPYPPVGANPVIELADCLCNG
LTSFRVYCGCGSVQDSSFLASAALTGIDCLSLPVGTAAGCAVGCLVGGLVGMPLVLIGGP
VFGCSIGSAIGCYFGDFLFDVGALIGQLELSDSELGDGFDACQRAVG
NT seq
5364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagacatcgaatgcgggtacttctgtgcgtgtcctctctgtcgcaatgggacgcct
accaagttagcgttcgttgtcgggcaactcacaaacaacatccttgagtgctgtacggaa
tacccctacggtacgctggagttggagtattttgcgggcggtattgaggcatgcaactgg
gcgacttcgcatccgcaagtatcgtgcgcgtattggggtggcagcgacatagcgattcag
gctccgctagtaaatttagctatttacgggctgactggaatcgatcagcacgcggggatg
acgaacggtggcgtgtacagcttcggctacttcaaacatcagccttcctcgtcaattgaa
tgctttgacagtcatgtacttccatatggcgactgcgacatgtgtgaggcttgcgagcca
ccagcgggctccgctgttgtctatgggatgcatggagagtccgacagggagtgttacaaa
attacaacttgcgctgagactataccttgcgctcaagaatcagcaaattgccctccgatg
ccctacattggagcgccgaccacttgctgccaagagagcgacagtgaatgcgggtgtgaa
tccggcgaaagcgacgagtgcagctcatgtgaggttgaagtctccccccacttgatcgaa
atattcggatgttgtccgagttttacctggcagtgccccgaatatagatcagcctcttct
ggaggctctgacagctcaggaggcggcaactgcaacagcggcgattgcaattccaccccg
acgagagggactttctcagacaatgcactgtcggatttggcgggactatttcagtatgtg
cgagacattactcggcctgtaatcccctcgcttcaaaccggcccagctgggatgagtcca
gcgtggggatttacgacctacaggattgcaccgcctgacgcgggatcgcttcaacctccg
ttgtccctcatgtacaattcagtacatgcaaaccaagattccgcttacgggtttggctgg
agcaacgcactggagctgagaattgaaggcgatccttcagagtcagttgtgtcgttgacg
aatggaagcggactacgcctcaactatggcgccacgacggcaggcgcatacctgccgccc
ccaaagatcccgcttgcattgagcggagattccggcaccagtactttcgtcgcgactcaa
cccgatggaactgccctgcagttcgataattcatctccgcatcggctgtcttccattact
agttccggcggcgcgaaatggaccgtaatgtacgacggcacccctgagaggatgagatct
atcctggatcccagcaatcgacggacaaccttaagctacgacgggaatggaaaaattgcg
tcgatcgttctaccagacggtcgggaaactctattcactgtgaccgctggaaagctggcc
agcacaacgacgccggaaggttgcatcacgcagttcaactatctcacgcaagatgttggc
ggcgaggattttattcatctaaattcgatagtcgatccagctcagcatgcaacgacatac
agctatgacagcagtggctggtgcaatcagattgctcacgctgacggatcagtcgtatca
attagttatttggactggaataacgccgtcgtcgagatggttggttcgctaagcgaatca
acgagtacatggataaagtacaatagcgctcggaacgtcgcgagttgccagacaattgga
gggttgccgaccaccttcatttgggacaacggcattgttgccggcgtccaagacccgaga
ggttatctcactaccttcacgtacaagcaattgctgtcttcagcacgcgtcctcgactcg
gtcactaaccctgatgggggtgtttacacaattcagtatgacgcaagcgatcgtgtagag
tctctaattgatgcacgtggaaatcgcagcacaattacatgggatgggtttaagcgaact
gagcttcgcgatgcgattggcaatcgatggacctatgtctacgacgggcttagccgtgtc
tgcggaaaaatcaatcctttgggagaacgaatcacctttcactacgacacccttggcaat
cgcgattttacgcaaaacgccctcggggaagtatcgacttctacctacgaaaacggacaa
cgcaagtcgattcagaatgctgcgggatatatcacaaccttcatccgagacgacatgaat
cgggtggttcggaaaattgacgctcgcagttacgcgacaacatttacttatgggattaac
tgcaggatatcgcgtatcgagaacgcacttggagtgcgtacatcctttcagtatgacgaa
atgaatcgtctgcgagccacagtcaatggccttggtgaacgcaccacattcggctacgac
ggtttaggaaactcaaactctatgcaaaacccgcttggaagtgttaccactcaattatac
gacgccaatcggcgtgtcgtcggagttgtgaatgctttgggctgcgtgtcgacgctctcg
tacgacgcatctggaaatctgaggtccatcgagaatccgctgggatatcgtactacaacg
caatacgattcgatgaaccggcctcgtgctcagatggatgcaaggggcaatgtcacgaca
ttccaatacgacctaagagggagcagaacgagtttagaaaacgcgctcggccagcgaacc
acaacatcttacacgccgctcaatcgcgttgaagcgctcgaggagccttctggagcgatc
accaccttcaattatgacgctgcggcgcggcaaaaagcgatttggaactcccgcagctat
gcgactacgttcaactacgatggcgttggacgcctaaaatccgatataaattcgctcggc
taccgagcgacctacagctatgacgcggctggaaggcgagttgccgtgcaaaactcgcga
ggattttcaacgacgacccagcgcgattccgttggcaatgtcgtcgcaacggtagatcct
ttgggttactgcaccactaccacctacgaccctctcaatcgtcgcatcagcgttttgaat
ggccaaggtcacgtttcgacgatgtcatacgacgcagccggaagagttactgggacgcaa
aatccgctcggcttccgcacgacattcgcctacgacgcagcgggccgtcggctggcgatc
tgggatgcggagaacaatcgcacgacaactgtttatgacgccgctggtcgcactcaggct
attgtcaatgccctcggatgccgtacgacgatgcaatacgatttagccggccgccgcgag
actctgcaggatgccaatgggtatcgcacaactttcgaatacgacgcaggtgggaatgtg
tccgttgaagttgacccattagggcgtcgcaccagcttcagttactctgcaactgtccag
ctgaagtcgaagcaggatcctcgaaatgtgcgaatcacctacgtttacgattcagtcggg
cgccagacagagcaagtttttagcagtggattgcgatatactttcacttacgactcgatg
ggcaatcgcttgacaatgatcgacggcagtggggcatccgcttatgaatatgatgcactt
aatcgtctttcggttgcagttactccttccggacagcggattacgtatggatacgatccc
gctgggaatcgggcaagcatggtagagccgaccggcggtaggttcacatatgcttacgat
gccgtcgagcaattgacagcgattgataacccattcgctgagcggactactattacctat
gacgaggttggcaggcagaagtccactttattcgctaacggaatgcagacgtccaacacg
catgacggtgccggacggctgactcaaatcgattattggcgagatacatcgagcaacgcc
aattgggtcaattgggaattgcctgactgggtcgcaatggatttatcagattggctggaa
ttcgagctagaaggctccggaattctggatcaggtggtttatcaacacgacaacgtgggt
aatcgaactgcggttgcagagcataatgggagtgtgactacatttatctacgacaccacc
tatcgcttgactcatgaacatcgcacgggaatcgccgcataccaaatcacacattcgtac
gacagcgttggaaatcgaaaagtagaagttgccgatggactacgaacgaccttcaattac
gatccctctaaccaattaaccactagtactgatccatcaggcgctactacgtcatattca
tacgataacgctggcaatctaacgcaagaagcgagtgcggccggaacaacggtcaacact
tggaatgatgattgtcatctagtcaaggtgacgcaaccgggtaacgtcgtcaccacgatg
ggctacaatgcgtatgggctgcgcgtcacgagggaaagcgagggtggaatcaccaaaagc
ctttgggacctgcagaacgtcttgacagaatccaacgaggacgatgcaattttggctaca
tacacgctcgccccccggtcgtatggaaagctattgagtcttaatcgcggcggcacctcg
agccatttcgcactatcagatgcattgggatccgtcattggattaactagttctaccgga
agcattagcgattcttataggtacaaagcttacggaactccaatctatgcgtcaggaacc
actgtcaacccttttcgctggggtggtagatcgggatatcactttgacagcggcttagac
gagtactatgtccggtctcgttactatagccaagcgacggtacgctgggtgtcccacgat
cttgctggggtttttgccggtctcaataagtatctttactgctggaacgtcccaacgcgt
ttccttgatccttcaggtcgctttggcgtcgacgacgcttgtgaattcgccaaccagaaa
ggacaggggagggatgcggtggactgcgcatgctggttggcagggctattggatatcgtg
ccttatcctccagttggtgctaatcctgtaattgaattggctgattgcctctgcaatggg
ttgactagttttcgcgtatattgtggatgtggctcagtccaagattcatcattcctcgcc
tcggctgcgcttaccggtatcgattgtttatcgttgccggtcgggacagcagctgggtgc
gccgtaggttgcttagtgggcggtctagttggaatgccactagtgcttataggcggtcca
gttttcggatgctccatcggctcagccataggttgctatttcggtgatttcctatttgac
gtgggcgcgcttatcggccaacttgagttatctgatagtgaattaggcgatggcttcgac
gcttgccaacgcgccgttgggtaa
DBGET
integrated database retrieval system