Lactiplantibacillus plantarum B21: SH83_12795
Help
Entry
SH83_12795 CDS
T03680
Name
(GenBank) cell wall anchor protein
Organism
lpb
Lactiplantibacillus plantarum B21
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJO75163
LinkDB
All DBs
Position
complement(2728346..2732380)
Genome browser
AA seq
1344 aa
AA seq
DB search
MRYTRGKWRVTNPKVWLFSSVLILGWRIVPTVAQASEAETVTMSSHSVQLETDSQDQLTE
VARISKTAVTRDRHSVTAQSSKSADRTSSEQSATTGTVEAVSPTTSEAQQRSTQQDKTAV
EQQASDSTAASAGASTNQASAATSSDQAPAANSTGTHHAIDMASSASALGADSGAHSESL
SEAQRSGGQGKTIDSDLSGTVHSQSSVSTVTTATPVNSNSSLESDKFASTRSRAVAATDQ
MSSRVEKRALNKTNVTKSINIPVATKQPSKQRTVTASSFLTTAKNLADKNYLDQYAKQHG
QAALIALIQDWLSTYRIIALTGITIVNSSFDGSVATISGGLHVINTGATIRSGQDDEWET
IINGGLSVTNNTITFTTTNGLVDRPVANQDMDFTKPRPTGNGAIKGLPSVTVDSSLINAQ
EFSQAQINISDFYDQLVTAGTILSATNGGTLSKMLIGESGTADLGSYQGHHYYAVNIDLN
DWHSGIRTTGFNNDDVVIYNVVTAAPALTIGGGFSSSTPNLVWNFNHAMRIQNTTMITGK
IVAPHAVFTTNQNVDSAAVLQYGYGDVDSAIRETITSQNEHNYGFGQVVTDDPLDYLIAV
IKSDGTSIDTLAGFRHLLATGQLKITITDAAGTRLSGLNAVDTHIAGQHRYLITYQFGDQ
TATTWLNVQPSHEPIIPISRIPEYSAITRTINYQDERTGAVLAGPVIQNVRVVRFAIFNA
KTHELLGYDTNGDGIVDTSDGTIAWLLVPPTDQDWVQVVSPDLSAQGYQAPDIPVVAGQT
VIINGGDRTMNTNVIVKYQQQTHIATTQRTVTRTINYIDGGTLQPIASLHAVVQTVKYQL
LAVVAHDGTILGYDTNGDGQIETQLADEAWLIVGSGPWFGAVKSPDLSHEGYAAPDLKVV
PEQMVAGVDDKDVTINVYYRLATQAVTVYQNKRRVISYIDRQTHQSIATTVQQLVIYQRT
AIIEKKTGKCLGYDLNGDGLVDTSQADYAWILVGSGQFAAVTSPTLVVQGYTDPDIRTVA
AQTVAITDPDLMTTIVTYDHRIITVTPGNPARPGQPVDPDNPNILFPDEGGDTDLTHTVT
RIIHYVYEDGTTAAASVLQTVQFQRNAMIDLVTGEVTYQEWVPVSVTEMAGVISPIVAGA
TTTLTEVAAQQVSVTTADQVVVVTYKKSAIKPEEPGQPEQPSQPEEPGQPEQPSQPEEPG
HPEQSSQPEEPGQHEQPSQPEEPGQSEKPGELQKPSQPADSEQPDGLSDQANLSRNQAEQ
SRTSQPSQAESDQSVVQTNQQKTAASVSGIGWVSAPAVSKRTTKHHRMTTLPQTDEQNTQ
LSLLGMIGLALSSILGWLKIKSRD
NT seq
4035 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgatatacacggggcaaatggcgcgtaaccaatcccaaggtttggttgttttctagt
gttttaattttaggttggagaattgtgccgacagtggctcaagcaagtgaagctgagacg
gttaccatgtcgagtcattcggtgcagttagaaacggatagtcaagaccaattaacagaa
gtagcacggatttcaaaaactgcggtaactcgtgaccgccacagtgtgaccgcccagtcc
agcaagtcagctgacaggactagttcggagcaatctgctacgactggcactgttgaggcg
gtcagtccaacgactagtgaagcccaacagcggtcaacacagcaagataaaacagctgtt
gaacaacaggcaagtgactcaacagcagcttctgcgggtgccagtactaatcaggcgtca
gccgcaacaagttctgatcaggcgccagcagccaactcaactggcactcatcatgcgatt
gatatggccagttcagctagcgcactaggtgctgacagtggggcccattctgaaagttta
tctgaggcgcaacgctcaggtggtcaaggtaagacgatcgattcagatttatcagggact
gttcattcacagtcatcagtgagtaccgtgacgacagctacccctgtgaactcaaattca
agcctagaaagcgacaagtttgcttccacacggagccgagctgtagcggcaactgatcaa
atgagcagcagggttgagaaaagggcattgaataaaacaaatgtcactaagtcaataaac
ataccagttgcaacaaagcagccgagcaagcaacggacagtcaccgcttcgtcgtttttg
acaacagcaaagaacttagccgataagaactatcttgatcagtatgccaaacagcatggg
caagcggctttgattgctttgatccaagattggttgtccacgtatcgaattattgcactt
acaggaattacgattgtgaatagttcgtttgatggtagtgtggctacgattagtggtggc
ttgcacgttatcaatacgggggcgacaattcgttctggtcaggatgatgaatgggagacc
atcataaacggtggtttgtcagtgacaaacaatacaatcacgtttacaactaccaatgga
ttggtggaccgtcccgtagctaatcaggatatggattttacgaagcctcggccaacagga
aatggtgcaatcaaaggtttaccgagcgttacggttgattcttcgttaatcaatgcgcaa
gaatttagtcaagctcagatcaatattagtgacttttatgatcaactagttactgcaggg
accattttatcggcaactaatggtggcacgttgagtaagatgctgattggtgagtctgga
actgctgatttgggctcttatcaaggacaccattattatgccgtgaatattgatttgaat
gactggcacagtggtattcggaccactggttttaataatgatgatgtggttatttataac
gtcgtcacggcagcaccagcgttaaccattggtggcggtttttctagtagtacaccgaat
ctagtctggaacttcaatcatgccatgcgtattcagaataccacgatgataactggtaaa
atcgtggcaccacatgctgtctttacaactaatcaaaatgttgattcagcggccgtttta
caatatggatatggcgatgttgacagtgctattcgagagacgattacgagccaaaacgag
cataattatggttttggtcaagtggttactgatgacccgttggattacttaattgcagtg
attaagtcggatggtacgagcattgatactttagctggttttcgccatctactagcaacc
gggcaactgaagatcacgattacagatgcggctgggacacgtttatcagggttgaatgca
gttgatacacatattgcgggccagcatcgctatctaattacttaccaatttggcgatcag
actgcaacgacttggttgaacgtccaaccatcgcatgagcccataatacctatcagccgg
ataccggaatattcagcgataacgcggacgatcaattaccaagatgagcgaactggggcg
gtgcttgctggcccagttatacaaaatgtacgggtcgtgcgatttgccatttttaatgct
aaaactcatgaattgctcggctatgatacaaacggcgacggaattgttgatactagtgat
gggacaattgcatggctgttagtaccgccaacggatcaagattgggtacaggttgtctca
ccagacttatctgcgcagggttatcaagctcctgatattccggtagttgcggggcaaaca
gtgatcattaatggtggtgatagaacgatgaatacaaatgtaattgtcaagtatcagcaa
caaacgcatattgcaacgacgcagcgaacggttacccggacgattaactatatcgatggt
ggaacactgcaacccatcgcgtcactacatgctgttgttcaaacggttaagtatcaatta
ttagctgtggttgctcatgacggaacgatacttggctacgataccaacggggacggacag
attgagacacaattggcagatgaagcatggttgattgttggttcagggccgtggtttggc
gcggttaagtcgccagatctgagccatgagggctacgcagcgccggacctaaaagtagtg
ccggagcagatggttgctggggtcgatgataaagatgttacgatcaatgtttattaccga
ctagcaactcaggccgttacggtgtatcaaaataaacggcgcgttatcagctatattgat
cgacagacccatcaatcgattgccacgaccgtccagcaattggttatttaccaacgaaca
gcaattattgaaaaaaagactggcaaatgtttaggctatgatttaaacggtgatggatta
gttgatacgagtcaagctgattatgcgtggattttagttggcagtggtcaatttgccgcg
gtaacgtcaccaacgctagtcgtccaaggctatactgatccggacataaggactgtagcg
gctcaaacggtcgcgattactgatccggacctgatgacgacaatcgtgacttatgaccat
cgtattattacggtaacaccaggcaatcctgctcgaccaggacagccagttgatcctgac
aatccgaatatcttgtttccagatgagggtggcgacaccgatttaacgcacaccgttact
agaatcattcactatgtttatgaggatggcacgacagccgcagcctcggtcctacaaacc
gtccaatttcaacgcaatgcgatgattgatttagtgacgggcgaagtgacataccaagaa
tgggtaccagtctcggtaacggaaatggcgggcgttatttcaccaattgtagcgggtgcc
acgaccacattaacagaagtggcagctcagcaggtgagtgtcacaactgccgatcaggtt
gtagtggttacttacaagaaatcggcaatcaaaccggaagaaccgggtcaacctgagcaa
ccaagtcaaccagaagagccgggtcaacctgagcaaccaagtcaaccggaagaaccgggg
caccctgagcaatcaagtcaaccagaagagccggggcaacacgagcaaccgagtcaaccg
gaagaaccgggtcaatccgaaaaaccaggggaactgcaaaaaccgagtcagccagctgat
tctgagcaaccagatggattaagtgatcaagccaatttgagtcgtaatcaggctgaacaa
tcacggacgtcacagccatcacaagcagagtcagatcaaagcgttgtgcagacgaatcag
cagaaaacagctgcgtccgtttcaggtattggttgggttagtgcaccggcggtatcaaaa
cgtaccactaagcatcatcggatgacgacccttccccagacggacgagcagaatacgcaa
ttatcactcttggggatgattggattagcattgagttcaattttaggttggctgaagatt
aagtcccgcgattaa
DBGET
integrated database retrieval system