Lolium perenne (perennial ryegrass): 127293128 Help Entry 127293128         CDS       T08650                                  Name (RefSeq) phytochrome A type 3   KO K12120   phytochrome A Organism lper  Lolium perenne (perennial ryegrass) Pathway lper04712   Circadian rhythm - plant Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lper00001]  09150 Organismal Systems   09159 Environmental adaptation    04712 Circadian rhythm - plant     127293128 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c PAS_9 HisKA PAS_4 PAS_8 PAS_10 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  127293128 NCBI-ProteinID:  XP_051178643 LinkDB All DBs Position 4:82269658..82276568 Genome browser AA seq 1128 aa AA seqDB search MSSSRPASSSSSRNRQSSRARVLAQTTLDAELNAEYEESGDSFDYSKLVEAQRDAPPVQQ GRSEKVIAYLQHIQKGKVIQTFGCLLVLDEKTFNVIAFSENAPEMLTTVSHAVPSVDDPP RLGIGTNVRSLFSDQGATALHKALGFADVSLLNPILVQCKTSGKPFYAIVHRATGCLVID FEPVKPTEFPATAAGALQSYKLAAKAISKIQSLPGGSMEVLCNTVVKEVFDLTGYDRVMA YKFHEDDHGEVFAEITKPGLEPYLGLHYPATDIPQAARFLFMKNKVRMICDCRARSIKVI EAEALPFDISLCGSALRAPHSCHLQYMENMNSIASLVMAVVVNENEEDDEAESEQPAQQQ KKKKLWGLLVCHHESPRYVPFPLRYACEFLAQVFAVHVNREFELEKQLREKSILRMQTML SDMLFREASPLTIVSGTPNIMDLVKCDGAALLYGGKVWRLHNAPTESQIHDIAFWLSDVH RDSTGLSTDSLHDAGYPGASALGDMICGMAVAKINSNDILFWFRSHTAAEIRWGGAKNDP LDMDDSRRMHPRLSFKAFLEVVKMKSLSWTDYEMDAIHSLQLILRGTLNDASKPKREASL DNQIGDLKLDGLAELQAVTSEMVRLMETATVPILAVDGNGLVNGWNQKAAELTGLRVDDA IGRHILTLVEESSVPVVQRMLYLALQGKEEKEVRFEVKTHGPKRDDGPVILVVNACASRD LHDHVVGVCFVAQDMTVHKLVMDKFTRVEGDYKAIIHNPNPLIPPIFGADEFGWCSEWNA AMTKLTGWNRDEVLDKMLLGEVFDSSNASCLLKNKDAFVSLCVLINGALAGEETEKAPFG FFDRSGKYIECLLSANRKENEGGLITGVFCFIHVASHELQHALQVQQASEQTSLKRLKAF SYMRHAINNPLSGMLYSRKALKNTDLNEEQMKQVHVADNCHHQLNKILADLDQDNITEKS SCLDLEMAEFVLQDVVVAAVSQVLIACQGKGIRVSCNLPERFMKQSVYGDGVRLQQILSD FLFVSVKFSPVGGSVEISSKLTKNSIGENLHLIDLELRIKHQGLGVPAELMAQMFEEDQE QSDEGLGLLVCRNLLRLMNGDVRHLREAGVSTFILTAELASAPTAMGQ NT seq 3387 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtcttcgtcaaggcctgcttcaagttcttccagcagaaaccgccagagctcccgggca agggtattagcacaaacaacccttgatgctgaactcaatgctgaatatgaagaatctggt gactccttcgactactccaagctggttgaagcccagagggacgctccacctgtgcagcaa gggcggtcggagaaggtcatagcctacttacagcacattcagaaaggaaaggtaatccaa acgtttggttgcctattggtccttgatgagaagaccttcaatgtcattgcgttcagtgag aacgcaccagaaatgcttactacagtcagccatgcggtacccagtgttgatgacccccca aggctgggtattggcaccaatgtacggtctcttttcagtgaccaaggtgccacagcactg cataaagcactagggtttgctgatgtttctttgctgaatcctatcctagtacagtgcaag acctcaggcaagcctttctatgccattgttcatcgagcaactggttgtttggtgatagac tttgagcctgtaaagcctacagaatttcctgccactgctgctggtgctttgcagtcttac aagcttgctgccaaggcaatctccaagatccagtcattgccaggtggaagcatggaggtg ctatgcaatactgtggttaaggaagtttttgaccttacagggtatgatagggttatggct tacaagttccatgaagatgaccatggtgaggtcttcgccgagatcacaaagcctggtctt gagccttatctaggcctgcactatccagccactgatatccctcaagcagccagatttctt ttcatgaagaacaaagtacggatgatttgtgattgccgtgcgagatccataaaggtcatc gaagctgaggcactcccctttgatattagcttgtgtggttcagcactcagggcaccacac agttgccaccttcagtatatggagaacatgaattcgattgcatcccttgtcatggctgtt gtggttaatgagaatgaagaggatgatgaagctgagtctgaacaaccagcgcaacagcag aagaagaaaaaactatggggcctccttgtttgccaccatgagagcccaagatatgtccct tttccgctgcgttatgcttgtgagttcttagctcaggtgttcgctgtccatgtcaacagg gagtttgaattagagaagcagttgcgtgagaagagcatactgaggatgcaaaccatgctc tctgatatgctgttcagagaagcctctcccctgactattgtatcagggacacccaatatc atggacctagtcaaatgtgatggtgctgctctcctgtatgggggcaaagtatggcgtctg cataatgctccaaccgagtctcagatacatgatatcgccttctggctatcagatgttcac agggattccactggcctgagtactgacagcctccatgatgctggctatcctggagcttct gctcttggtgatatgatatgtggaatggcagtggctaagatcaactccaatgatattctt ttttggttcaggtcacatacagctgccgaaatcagatggggaggtgcaaagaatgatccg ttggacatggatgacagcagaaggatgcaccctaggttgtctttcaaagccttccttgaa gttgtcaagatgaagagcttgtcttggactgactatgagatggatgctattcattcattg caacttatacttcgagggacactgaatgatgccagcaagccaaagcgggaagctagttta gataaccagattggtgatctaaaacttgatgggcttgctgaactgcaggcggtgaccagt gaaatggttcgtctaatggaaacagcaactgttccaatcttggcagtagatggcaatggg ctggtcaacgggtggaatcagaaagcagcggagttgactgggctaagagttgatgatgca ataggaagacacatacttacacttgtggaggagtcctctgtaccagttgtccagaggatg ctatatctagctctgcagggtaaagaagagaaagaagttcgatttgaggtaaagacccat ggcccgaagagggatgatggtccagttatcttggttgtgaatgcttgtgccagtcgggac cttcatgatcatgttgttggagtgtgctttgttgcccaggatatgactgtccataagttg gtgatggacaagtttactcgggttgagggtgactacaaggcaatcattcacaacccaaac ccactcattcctcctatatttggtgctgacgaatttggatggtgttctgagtggaatgct gcaatgaccaagctgactgggtggaacagagatgaggtgctcgataagatgcttctcggc gaagtgttcgacagtagcaatgcctcctgccttttgaagaacaaagatgcatttgtaagt ctatgtgttcttatcaacggtgcattagctggcgaagaaacagaaaaggctccattcggc ttctttgaccgaagcggaaagtacattgagtgtcttctatcagcaaacagaaaagaaaat gagggtggtctcatcactggagtattctgttttattcatgttgctagtcatgagctgcaa catgcattacaggtgcagcaagcctcggaacagacatcactaaaaaggctgaaggctttc tcctacatgagacatgcgatcaacaaccctctctcaggcatgctatactctaggaaagca ttgaagaacacagatttgaatgaagaacagatgaagcaggtccatgtcgcagataattgt caccaccaactaaacaagatacttgcggacttggatcaagataacatcaccgaaaaatct agctgcttggatttggagatggctgaatttgttttgcaagatgtggtggtggctgctgtt agtcaagtactgatagcttgccagggaaaagggatcagagtctcttgcaacctgccagaa agattcatgaagcaatcagtctatggcgatggtgttcgactccagcagatcctctctgac ttcctgtttgtttcagtaaagttctctcctgttggaggttctgttgagatttcttctaag ctgacgaagaacagcatcggagaaaatcttcatcttattgaccttgaacttaggatcaag caccagggattaggagtccctgcagagctcatggcacaaatgtttgaggaggaccaggag cagtcagacgagggcttgggcctcctagtttgtagaaacctgttgaggctcatgaatggt gatgtacgccatctaagggaagctggcgtgtcaaccttcatcctcaccgccgaacttgct tccgctccaactgcaatgggacaatga

DBGET integrated database retrieval system