KEGG   Lolium perenne (perennial ryegrass): 127300348
Entry
127300348         CDS       T08650                                 
Name
(RefSeq) phytochrome A type 5
  KO
K12120  phytochrome A
Organism
lper  Lolium perenne (perennial ryegrass)
Pathway
lper04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lper00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    127300348
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS_2 GAF
Other DBs
NCBI-GeneID: 127300348
NCBI-ProteinID: XP_051186408
LinkDB
Position
5:158160255..158176478
AA seq 619 aa
MSSSRPISSSSSRNGQSSRARVLAKTELDAELNAAYEESGEYFDYSKMVEGQRTAPPVQP
GRPERVIAYLQHIQNGKMIQPFGCLLALDEKSFSVIAFSENAPEMLTTVSHAVHSVDDPP
RLVIGTNLRSLFTDQGATALHKALGFADVSLLNPVSVQCKTSGKRFYAIAHRATGCLVVD
FEPVKSTEFPGTAVGDLQSYKLAAKAISKIQSLPGGSMKVLCNTVVKEIFDLTGYDRVMA
YKFHEDEHGEVFAEIRKSGLEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMNNRVRMICDCHARSIKVI
EDEALPFDISLLDSALRAPHGCHVQYMENMSSIASLVMAVVVNDNEEDDEIDSEQPAQQQ
QQQQKKKLWGLLVCHHESPRYVPLPLRYACEFVAHVFSVHINNEFELEEKLHEKRILRVQ
TVLYEMLFREVSPLTIVLGTPNIMDLVNCDGAALLYGGKVWRLCNAPTESQIRDISLWMS
EVHRDSTGLCTESLHDAGYPGASALCDRICGMVVAKINSKDALFWFRSCTADVIRWGGAN
NDPSGMDGSRKLQPRLSFKAFLEVVKMKSLSWTDYEMDAIHSLQLILRGMFNDTIKPTWE
ANLDNQIVDMKHDGLAEFR
NT seq 1860 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcttcgtcaaggcctatttccagttcttccagcaggaacggccagagctcccgggca
agggtattagcaaaaacagaacttgatgctgagctcaacgctgcatatgaagaatctggt
gaatacttcgactattccaagatggttgaaggccagcggaccgctccacctgtgcagcca
gggcggccggagagggtcatagcctacttgcagcacattcagaatggaaagatgatccaa
ccatttggttgcttgttggcccttgatgagaagagcttcagtgttatcgcgttcagtgag
aacgcgccagaaatgctaacaacggtcagccatgcagtacacagtgttgatgatccccca
aggctagttattggtacaaatctacggtctcttttcactgaccaaggtgccacggcactg
cataaggcactagggtttgctgatgtttctttgctcaaccctgtctcagttcaatgcaag
acctcaggaaagcgtttctatgccattgctcatcgagcaactggttgtttggtggtagac
tttgagcctgtgaagtctacagaatttcctggcactgctgttggggatttgcagtcttac
aagcttgctgccaaggcaatctccaagatccagtcactgccaggtggaagcatgaaagtg
ctatgcaatactgtggttaaggaaatctttgatcttacaggatatgatagggttatggct
tataagtttcatgaagatgagcatggcgaggtctttgccgagatcagaaagtctggtctt
gagccttatctaggtctgcactatccagccacggatatcccgcaagcatccaggtttctt
ttcatgaataacagggtaaggatgatttgtgattgccatgcgagatccataaaggtcatc
gaagatgaggcactcccctttgatattagcttgttggattcagcactcagggccccacac
ggttgtcacgttcagtatatggagaacatgagctcgattgcatcccttgtcatggctgtt
gtggttaatgataatgaagaggatgatgaaatcgattctgaacaaccagcacaacaacaa
caacagcagcagaagaagaaactatggggcctccttgtttgccaccatgagagccccagg
tatgtccctttgccgctgcgttatgcttgtgagttcgtagcacatgtgttttctgtccat
atcaacaacgagtttgaattagaggaaaagttgcatgagaagaggatactgagggtgcaa
acagttctctatgagatgctgttcagagaagtctctcccctgactatagtattagggaca
cccaatatcatggacctggtcaactgtgatggtgctgctcttttgtatgggggcaaagta
tggcgcctgtgtaatgctccaactgagtctcagatacgtgatatttccttatggatgtca
gaagttcacagggattccactggcctgtgtacagagagcctccatgatgctggctatcca
ggagcttctgctctctgtgataggatttgtggaatggtagtggctaagatcaactcaaag
gatgcccttttttggttcaggtcatgtacagctgatgtgatcagatggggaggtgcaaac
aatgatccgtcgggcatggatggcagcagaaagttgcagcctaggttatctttcaaagca
ttccttgaagttgtcaagatgaagagtttgtcttggactgattatgagatggatgctatt
cattcgttgcaacttatacttcgagggatgttcaatgataccatcaagccaacctgggaa
gctaatttagataaccagattgttgatatgaaacatgatgggcttgccgaatttagataa

DBGET integrated database retrieval system