Lytechinus pictus (painted urchin): 129255367
Help
Entry
129255367 CDS
T09066
Name
(RefSeq) laminin subunit beta-1-like
KO
K06243
laminin, beta 2
Organism
lpic
Lytechinus pictus (painted urchin)
Pathway
lpic04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lpic00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
129255367
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
Laminin_N
LAMININ_IV_B
EGF_LMN_ATRN
LAMB1
F5_F8_type_C
Fez1
DUF6664
Laminin_II
CCDC113_CCDC96_CC
GatC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129255367
NCBI-ProteinID:
XP_054749702
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(14512945..14561302)
Genome browser
AA seq
1804 aa
AA seq
DB search
MSVPYRFNCSSSFTYYGYMLRSINLLISLNFFFFVSAVVNYGQQIPPQQIPASSACEGDS
CYAGDLLIGREDKLYASSTCGLNGAEPFYIVSHLENRNREIFYCDSRTPWQQGVNELNHE
IKHVVTSMDNSQKKQRWWQSENGLEQVYIQFDLEAVFHFTHLIMTFKSFRPRAMIIERSS
DFGHTWKPYRYFAYDCEGSFPEVSRAPIRNISQVICESRYSAVEPSTGGEVIFRVLPPNI
PIEDPYSREVQDMIKVTNLRINITELHFLGDHLFDDGDEVFNKYYYALYEMVVRGSCHCF
NHASSCQPADGMESKLQMVNGQCECIHNTEGKNCERCKPEYNDQPWRPAGLQGENNECKR
CNCNDHANSCHFDEAVYQLTNGASGGVCDNCLHNTVGRNCEQCKPFFYMHPDRDIRDPNI
CVPCNCDPAGSENGGECASHTQGDMVAGMCLCKRYVTGQRCDACQDGYWELREDNPEGCR
ECACNLLGSENNMGCDKTTGNCRCKRYVTGQNCDRCYEGYYGLSADLYGCKQCECDPGGS
YNNSCNQVSGQCPCRRNIGERQCNTVNSGYFYVNMDYYTYEAEYARAVADLSLVDYYPRM
REVDYIGWTGPGFMRIHEGGGIEFTVSNLPMSGDYDLILRYEPLLPGVWEDVRITINRPG
EIPTQSVCGNTIPQDDLLVTSLPSGSRHVVLSNPVCLETGKTYTIRVDFTRYSSDNQDSN
AQILLDSLVVMPRATIYPIFQGPDPIEQYRREQWEYYRCGEAHMAAHHATLSDICKELMF
SMSALAFDGALPCQCDPAGSLSNICDETGGQCQCKPNVIGRTCNQCAPGTYGFGPEGCTP
CNCDGTGSLNEFCNQLTGQCPCRPNTYGQQCNECQPGYWNFPNCQRCNCNGHADLCDPRT
GECIDCQSNTAGFECERCKRGYYGDPTRGSALPCQACLCPGGAGSGNQFAETCQLDQGTQ
TVQCDCFAGYTGIRCDQCDNNYFGNPTEPRGVCNLCNCNGNTLSSTPGNCDARTGRCLKC
LYNTAGFNCEECAPGFYGDAIQRTCRDCQCNVLGTDRSQCDLDNNCGVCDPVSGQCPCLP
NVLGQQCDRCAQDHWKLASGTGCEACNCCSYGAVSSRCDEFTGQCACRSGFGGRECCDCE
ANFWGDPREGCYECDCDPQGSATSQCERGTGQCVCLPGVTGYRCDQCARGTTGELPRCEP
CGECFDEWDRIVLLLRNETYDLIARAQNIKVSGVSGVYDREFNRLEDLVEYAESLIRGAP
SVTENDVVNIQSELDDIRDTLERYHEEVLGLEDMQRRTRGNIARANRELDLLEREADELK
ADAENLQRESYDFGTANVEGAMNSILRSQNLSRAAEDRVDGTQPTLDQSEAVRQEVENLI
GERNAALEQERQGYLDRLDDVDNQLTGLEGLLTGLNEKICGSPGDSCDNCGGAGCGQCGG
LGCGGSVQKAEEAHRRAREADQKLDQKEEEANSMLDEMMQAKNKTGEAQELAQQAYDLAL
LAKQEAEEGQINIKDLIKNITDFLGRVKSEPEDVRMLVNDTLNTKISLSPEEIEDLAEQI
EDIIATLENIDEIIAATRDDLERVNDLKERADAAREFAEEVLASAEGVRRALDQARDAQD
VADQAIRNATQDINDAQDALVQIESEAGNAKDKSDGLLDKIEDMKEQLERVQLKVTDNKE
KVNQAVNLAQMAENQAQDAAGRVDAIEQDFNQTSDEVMAKVAEVDEAKGRADDLFLNVIA
FEEKITEDYEELLGMQQTFNNNNATLHDLTAEINALNMKMMQILQDIQEKAAYYRSCTES
PTPP
NT seq
5415 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgttccctatagatttaattgttcttcatcatttacatattatggttatatgtta
agatctattaaccttttgatttctctaaactttttttttttcgtttcagctgtagtcaac
tatggccagcaaattcctcctcagcaaatccctgccagtagcgcatgtgaaggagacagt
tgttatgcaggtgacttgcttataggtcgtgaagacaaactctatgcctcttcaacttgt
ggtctgaatggggcagaaccattttacattgtcagccatcttgaaaatcgaaatcgtgag
atcttttactgtgactcgaggacaccatggcaacaaggtgtcaacgagctcaaccacgaa
atcaagcatgtggtaacatccatggacaactcacagaagaaacaaaggtggtggcagtca
gagaatggcttagaacaggtctacatccagtttgaccttgaagcagtcttccatttcacc
catctcatcatgaccttcaagtcatttagaccaagggccatgatcatagagagatcttca
gattttggacatacatggaagccatataggtactttgcctatgattgtgaaggaagtttt
cctgaagtgtctagagcacccatcaggaatatcagccaggtgatctgtgagagtagatac
tcagcagttgaaccctcgactggaggggaggtgattttccgtgtgctaccacccaatatc
cccatagaagatccttacagcagagaagtacaggatatgattaaggtgaccaatctcaga
atcaacatcactgagcttcattttcttggagatcacctctttgatgatggtgatgaagtc
ttcaacaagtactattatgccttgtatgagatggttgtaagaggtagctgtcactgtttc
aaccatgcctctagctgtcaaccagcagatggtatggagagtaaactacagatggtgaat
gggcagtgtgaatgtattcataatacagaagggaagaactgtgagagatgtaagcctgaa
tacaatgaccaaccatggagacctgctggattacaaggcgaaaataatgagtgcaagaga
tgtaactgcaatgaccatgcaaacagctgtcattttgatgaagcagtataccagctgact
aacggtgcgagtggtggtgtatgtgataattgcctgcacaatactgttggtcgcaactgt
gaacaatgcaagccgttcttctacatgcatccagatcgtgacatcagggatcctaacatc
tgtgttccatgtaactgtgatcctgctggttctgagaatgggggtgagtgtgctagccac
acccaaggtgacatggtagctgggatgtgcctgtgtaaacgctatgtgactggtcaacga
tgtgatgcctgtcaggatggatactgggaacttagggaagataatccagaaggttgcaga
gaatgtgcctgtaaccttcttggatctgagaataacatgggatgtgataagactactggt
aactgcagatgtaagagatacgtcactggccagaattgtgacaggtgctatgagggatat
tatggcctgagtgctgatctttatggatgtaaacaatgtgagtgtgacccaggcggttcg
tacaacaactcgtgcaaccaggtttcaggacaatgtccatgccgacgtaacattggagaa
cgacaatgcaacactgtcaactcaggctatttttatgtcaacatggattattacacatat
gaagcggagtatgcacgagctgtcgccgatctttccttggttgactattatcctcgtatg
agagaagttgattacattggttggactggtcctggatttatgaggatacatgaaggaggt
ggtattgagtttactgttagtaatcttccaatgtctggtgattatgatcttatcctcaga
tatgaaccattgcttcctggagtttgggaagatgtaaggatcactattaatcgtcctggt
gagatcccaacacagagtgtatgtggtaatactattcctcaagatgaccttcttgttaca
tccttgccatcaggaagcagacatgttgtcttgagtaatccagtgtgtcttgagactggg
aagacatatactatccgtgtagacttcacacgatacagctctgataaccaggacagcaat
gcacaaattctacttgactcattggttgtgatgccaagggctaccatctatcccatcttc
caaggaccagatccaattgagcaataccgtcgtgagcaatgggaatattatcgttgtgga
gaagctcacatggctgctcaccatgcaactctatctgatatctgtaaagaactcatgttc
agcatgtctgcacttgcctttgatggtgcacttccttgccaatgtgatcccgctggctca
ctgagcaacatatgtgatgagactggtggacagtgtcagtgtaaacccaatgtgattggc
cgtacatgcaatcagtgtgctcctggaacatatggctttgggcctgaaggttgtactcct
tgtaactgtgacggaactggttcattgaatgagttctgtaatcagctaacaggtcagtgc
ccctgcagacccaatacatatggacagcaatgtaatgaatgtcaaccagggtactggaac
ttccccaactgtcaacgttgtaattgcaatggacacgctgacctttgtgatccacgtaca
ggagagtgtattgattgccaaagcaacaccgctggatttgaatgtgaaagatgcaagcga
ggttactatggggatcccacaagaggctccgcattgccatgtcaggcatgtctttgtcca
ggaggagctggtagcgggaatcaatttgctgagacttgccagctagaccagggaactcaa
actgttcagtgtgattgttttgctggatacacaggtatccgctgtgatcagtgtgataat
aactactttgggaacccaactgagcccagaggtgtttgtaacctgtgtaactgtaacggt
aatactctatctagtacaccaggcaactgtgatgcaaggactgggcgatgtttgaaatgt
ctttataacactgctggtttcaactgtgaagaatgcgccccaggattctatggggatgca
atccaacgaacatgcagagattgccaatgtaatgtccttggaactgaccgttcacagtgt
gaccttgataataactgtggtgtttgtgaccctgtctctggtcaatgtccatgtctacct
aatgtacttggtcaacagtgtgaccgctgtgctcaagaccattggaagttggccagtggt
acaggatgtgaggcatgcaattgctgttcatatggagctgtctcatcaagatgtgatgag
ttcactggtcagtgtgcctgtaggtctggctttggtggaagggagtgctgtgactgtgaa
gctaacttttggggagatcctagggaaggatgctatgaatgtgactgtgatcctcaagga
tctgctaccagccaatgtgaacgaggtacaggacagtgtgtatgtctaccaggagtaaca
ggatataggtgtgaccagtgtgcccgtggtactactggagaactaccacgttgtgaaccc
tgtggagagtgctttgatgagtgggatcgtatcgttcttcttcttaggaatgagacttat
gatttgatcgcacgcgcacaaaacatcaaggtatctggagtatctggtgtctatgatcga
gagtttaatcgtcttgaagatctagtagagtatgctgaatctttgatccgaggtgctccc
tctgtcacagaaaatgatgtagttaacattcagagtgaactggatgatatcagagatact
cttgaacgttaccatgaggaagtattagggttagaagatatgcaaaggcgtacacgtggc
aacattgctcgtgctaatcgtgaacttgaccttctggaaagagaagctgacgaacttaaa
gcagatgctgagaatttacagagggaaagttatgattttggaacagcaaatgtagaaggt
gccatgaacagcatcctgagaagtcaaaacctatcgcgtgctgctgaggatcgtgttgat
ggaacccaacctactctagaccaatcagaagcagttcgtcaagaggtagaaaacttgatt
ggtgaacggaatgctgcccttgagcaagagagacaagggtatctggatagattggatgat
gtggataatcaattgactggattagaaggacttctgacaggactcaatgaaaagatctgt
gggtcacctggagattcttgtgataattgtggaggagctggctgtggtcagtgtggagga
ctgggatgtggaggatctgtacagaaagcagaagaagcacacagacgagcaagagaagca
gaccagaaacttgatcagaaagaagaggaggctaatagcatgctggatgagatgatgcaa
gctaaaaacaagactggtgaggcacaggagttagcccaacaagcatatgatctagctctc
ttagctaaacaagaagcagaagaaggacaaatcaacatcaaagatctcatcaaaaatatc
acagacttcctaggacgagttaaatcagagcctgaagatgttagaatgcttgtcaatgac
acactcaataccaagatttctctttcaccagaagaaattgaagaccttgcagaacagatc
gaagatattattgcaaccttggagaatattgatgagatcatcgcagctactagagatgac
cttgaacgtgtcaatgacctcaaagaaagagcagatgctgccagggagttcgctgaagaa
gtactggcttctgctgaaggtgttagacgtgctttagatcaagctagggatgcacaggat
gtagctgatcaagcaatcaggaatgctactcaagacatcaatgatgcacaagatgctctt
gttcagattgaatctgaagctggcaatgctaaagataaatctgatggtcttcttgataag
atagaagatatgaaagagcagctagaacgtgtacagctcaaggtcacagataacaaggaa
aaggtcaaccaagctgttaacttggcacaaatggctgagaatcaagcccaagatgctgca
ggcagagttgatgctatcgagcaagacttcaatcaaacatcagatgaggtcatggcaaag
gtcgctgaggtcgatgaagcaaaaggtcgtgcagatgatcttttcttaaatgtcatcgca
tttgaagaaaagattactgaagactatgaagagcttttgggtatgcaacagacctttaac
aacaacaatgccaccctacacgacctaacagccgaaatcaatgcattgaatatgaaaatg
atgcagatactacaagatatacaagaaaaggcagcttactacaggagctgcacagagagt
cctacacccccataa
DBGET
integrated database retrieval system