Limulus polyphemus (Atlantic horseshoe crab): 106463560
Help
Entry
106463560 CDS
T08968
Name
(RefSeq) neurogenic locus Notch protein-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
lpol
Limulus polyphemus (Atlantic horseshoe crab)
Pathway
lpol04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lpol00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
106463560
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank
Ank_2
EGF_3
Notch
Ank_4
Ank_3
NODP
NOD
Ank_5
EGF_2
EGF_DL_JAG
JAG1-like_EGF2
cEGF
FXa_inhibition
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106463560
NCBI-ProteinID:
XP_022246808
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2249 aa
AA seq
DB search
MPRGFPVYGARLLLSRAASRWDVIGFKNIPQGPTTLQASSLGWLNGYRGINCDINIDDCP
GNLCQHGAKCIDGINSYTCQCPPNYTGPYCSKDVDECSLKPTVCKNGATCTNTIGGYSCI
CVNGWTGADCRENIDDCAGAACFNGATCHDRVGSFFCQCAPGKTGLLCHLDDACASNPCH
SGAICNTNPTDGSYRCSCPSGFQGNDCTEDVNECEEGSPCEHGGVCVNTPGSFTCNCTKG
FTGPRCEININECDSNPCQNDGTCLDERGGFRCVCMPGYTGNQCELDIDECTPNPCLNGG
ICSDRINSFRCLCPIGFSGRKCELNDDDCLSQPCRNGATCRDGIASFICDCLPGFTGPSC
DTNINDCHSSPCHHGECVDGINSYRCNCNPGYTGFLCQTQINECLSNPCQHDGLCEDLIN
GYQCRCRPGTFGPNCEHDINECFSNPCRNGATCEDRINSYTCKCASGFTGVHCETNIDEC
ASSPCANGGKCIDLANGFKCDCPRGYFDARCLSDVNECASNPCLNGGTCEDEVNKYICHC
KQGYGGHRCEQDIDECQSNPCQHGGSCHDALASYSCTCLLGYSGQNCEINIDDCASSPCL
NGGSCIDLVNAYECVCEVPYSGHKCEEELDPCNPNKCKNGAMCTPSSNYLDFACTCELGY
TGRFCDEDINECTISSPCRNGATCVNTNGSYTCTCAKGYEGRECLINTDDCASFPCQNGG
TCLDGIGEYTCLCIDGFGGKVCETDIDECASNPCENGATCNDYVNSYTCTCALGFSGTNC
QINDQDCTTSSCMNGGTCIDGINAYTCHCSNGYTGSNCQFHINECDSSPCKNGATCVDHV
GYYTCHCPFGYTGLQCEGMIDWCSTKPCMNGAMCKQNKNMYQCVCRPGWTGALCDVSMVS
CSDAALQKGIEVKDLCKNNGKCENIGNSHRCGCRKGYEGSYCQHEIDECASQPCQNGATC
HDMIGQYRCDCLPGFQGLNCEFNVDDCDPNPCRNGGTCHDLVNKFVCSCPHGTMGILCEI
DVNECFEGACHHGGSCVDKVGGYECRCPPGFVGPRCEGDVNECLSNPCSNPGAQDCVQLI
NDYRCECKPGFMGQHCETKVDFCSSNPCLNGGMCSSGDKGPVCICPIEFWGDNCSNTNTT
CASNPCKNGGQCRPHRGGYTCICPQGTSGKHCDVDIYDECLSSPCFNEGECIDSIGKFEC
ECPTNWNGLRCESFDPSFRGGIGRVVTSGTFQKSLEEEKKLCTFNKCRSKAGDHRCDEEC
NSLACNFDGGDCSLGLNPWENCTAAINCWDVFRNEECNIECNNIECLFDGFDCTKKLSPC
NEMYDSYCQMNYANARCDHGCNNEECNWDGLDCEEDLPRLANGQLVLTLLIDPMDFETTK
ISFLREIGRALHTNVKFKLDKKGNEMIYPRRTKHTDAISPNRGRTGIDVHLEIDNRQCLK
SVYSECFQSAAEAARFLAASRSRHSLDTAFHIEKIQSTDELEELHGPEVTYPNMVYIVIG
VIVIILLGLLLGVLVTTQRKRARGVTWFPEGFFRNNSVQKQQARRRGPDGQEMRNIHKQM
SAQRMDANDNSGIPSDIGGWSDDDMGDHPPVKRTKSDHSPDPSFGDTHTVMTTTDYDDND
PRPWTQQHLDAADVRNPDILAFSPPHGDSELEPGNVDVRGPGGLTPLMLASFRGGGLDTG
EDVEEDDGSVSMIQDLLSQGAKINMITERTGETSLHLAARYARADAAKRLLDAGADANSQ
DNTGRTPLHASISADAQGVFQILLRNRATNLNARMHDGSTPLILASRLAIEGMVEDLINA
EADINAADDLGKTALHWAAAVNNVDAVRVLLAHGANRDVQDTKEETPLFLAAREGSYEAA
RVLLEHFANRDITDHMDRLPRDVALERVHHDIVRLLDEYVPQGPLTSHVPTSSTSMVPPP
TVIGSTRSTKAKKRSKVNSMVGMAMQNGDHSSQNSEREIRRKVSLKKQGTEGQPNLHCLN
TFDSHPFNGLHPAFDDGQSLALSHPNLAGLDNSATKQQTSYNECINPQIYESVGGMAGQL
IYMNDGTVPHVQTVQGVTSHLQRQNSMPSSLTVSQVQSTHNYTGSPSIKQRPLLPTSPTH
MAAMRTAHQQKNAHIQPQQSANHIYDYIMTDIRQVLGSSGQKSNPPDPATGQQQVPYSHP
FQFPTPPSQHSYGGSEATPQHYLHHPETYLTPSPESPGQWSSTSPHSAQSDWSEGICSPV
NMNILQPVEHQHPHHQTQNTLSTPEAVFL
NT seq
6750 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctcggggctttcctgtatatggggctcggctccttttgtcacgagctgcatctcgg
tgggacgtgattggttttaaaaacattccacaaggtcccactacacttcaagccagctca
ttggggtggctgaatggttacaggggcatcaactgtgatatcaatattgatgattgtcca
gggaatttgtgccagcatggcgccaagtgcattgacggaatcaacagctatacttgccag
tgtccaccaaattatacagggccttactgcagtaaagatgtagacgaatgttcgttgaaa
ccgacagtctgtaaaaatggagctacctgtaccaacacaattggtggttactcgtgtatt
tgtgttaatggttggaccggggccgactgcagagaaaacatcgacgattgcgcaggcgca
gcgtgtttcaatggcgccacctgccatgaccgtgtaggatcatttttctgtcagtgtgct
ccaggaaaaacagggcttctgtgtcacctagatgatgcctgtgcaagtaatccttgtcac
tctggtgctatttgtaacacgaatcccacagatgggagttaccgatgttcatgccctagc
ggtttccaaggaaacgactgcaccgaggacgtcaatgagtgtgaagaaggctcaccttgt
gaacatggaggagtatgtgttaacactccgggttccttcacctgcaactgtactaaggga
tttactggtccaagatgtgaaattaacatcaatgaatgtgattctaacccgtgtcagaat
gatggcacatgtttagatgaaaggggcgggtttcgctgtgtttgtatgccgggatacact
ggaaatcaatgcgagttggacattgatgaatgtacacccaacccttgtcttaatggagga
atctgtagtgacagaatcaacagttttaggtgcctctgtccaataggtttttctggaagg
aagtgtgaattgaatgatgatgattgccttagtcagccttgtcgaaatggtgctacttgt
agagatggcattgcaagttttatttgtgattgtctaccaggtttcacgggaccaagttgt
gacacaaacatcaacgactgtcactcttctccatgccatcatggagaatgtgtggatggg
atcaacagttacaggtgtaactgtaatcctggctatacaggtttcctctgtcagacccag
atcaacgagtgtctgagtaacccctgtcagcatgatggtttgtgtgaggaccttatcaat
ggttaccagtgtcgttgtcgacctggtacgtttggaccaaactgtgaacatgacatcaat
gaatgcttttccaatccttgtcgaaatggtgctacctgtgaagacagaattaactcttac
acatgcaagtgtgcttctggttttacaggtgtccactgtgaaacaaacattgatgaatgt
gcaagcagtccttgtgcaaatggtggaaaatgtattgaccttgcaaatggctttaaatgt
gactgtcccaggggatattttgatgcacgctgtctttcggatgtgaatgagtgtgcaagc
aatccatgtttaaatggtggcacatgtgaagatgaagttaacaaatacatctgccactgc
aagcaaggatatggaggtcatcggtgtgagcaggacatagatgaatgtcagtccaaccct
tgtcaacatggtgggagttgtcacgatgcccttgctagctactcttgtacctgcctacta
ggttatagtggacagaactgtgaaatcaatattgatgactgtgccagcagtccttgtctg
aatggtgggtcctgtattgatttggtaaatgcctacgagtgtgtgtgtgaggtcccttac
agtggtcacaagtgtgaagaggaattggatccatgcaacccaaacaaatgtaaaaatgga
gcaatgtgcactccttcctcaaactacttggatttcgcttgcacttgtgaacttggctac
acaggtagattttgtgatgaagacatcaacgagtgtaccatttcttccccttgtcgcaat
ggagctacatgcgtcaacaccaacggttcttacacctgcacatgtgctaaaggatatgaa
ggaagagagtgcctgattaacacagatgattgtgcatcttttccatgccaaaatggagga
acctgtctagatggtattggagaatatacatgtctctgtatcgatggctttgggggaaaa
gtttgtgaaactgatattgatgaatgtgccagcaacccttgtgaaaatggagccacctgt
aatgattacgtcaacagttacacttgtacttgtgcacttgggtttagtggaacaaattgt
cagattaatgatcaggattgtacaacaagttcctgtatgaatggaggaacttgtatagat
ggaatcaatgcctacacttgtcattgtagtaatggatatacaggatcaaattgccagttc
cacattaacgaatgtgattctagtccctgtaagaatggagcaacctgtgtcgaccacgtg
ggatattatacatgccactgtccttttggttacactgggcttcagtgtgagggaatgatc
gactggtgcagcactaagccttgtatgaatggagctatgtgtaagcagaataaaaacatg
tatcagtgtgtttgccggcctggatggacaggagcgctttgtgacgtgtcgatggtgtct
tgttccgatgctgctctgcagaaaggtattgaggtgaaggatttgtgtaaaaacaatggc
aaatgtgaaaacattggaaacagccatcgttgcggctgtcgtaaaggatatgaagggagt
tactgtcaacatgaaatcgatgaatgtgcttctcaaccatgccagaatggtgccacttgc
catgacatgattggacaatacagatgtgactgtcttcctggtttccaaggcttgaactgt
gaattcaatgtagatgattgtgatcctaatccttgtcggaatggagggacctgccatgac
ctcgtcaataaatttgtgtgctcttgcccccatggtaccatgggtatcctgtgtgagatt
gatgtaaatgagtgctttgagggagcttgtcaccatggaggatcttgtgttgataaagtt
ggaggctatgaatgtcggtgtccaccaggattcgttggacctaggtgtgaaggtgatgtg
aatgaatgcctctcaaacccctgcagtaatcctggtgctcaggattgtgtgcagttaatc
aatgactatcgttgtgagtgcaagcctggttttatgggtcaacactgtgagaccaaagtg
gacttttgctcatctaatccatgcttaaatggagggatgtgtagtagtggtgacaaggga
cctgtttgtatttgtcctattgaattttggggagataactgcagcaatactaacaccaca
tgtgccagcaatccttgtaagaatggaggacagtgccgaccccatcgtggtggatacacc
tgtatttgtccacagggaaccagtggcaaacactgtgatgttgacatctatgatgagtgt
ttgtcctcaccgtgctttaatgaaggagagtgtattgacagtattggtaaatttgaatgt
gaatgtcctacaaactggaacggacttcgatgtgaaagttttgatcccagcttccgtggt
ggaattggaagagtggtgacttctggaaccttccagaagtctctagaggaagagaaaaaa
ctctgtacctttaataagtgcaggtctaaagctggagaccaccgttgtgatgaggaatgt
aatagtttggcatgtaattttgatggaggagactgttctttaggactcaatccttgggag
aattgtactgcagccatcaactgttgggatgtgtttcgtaatgaggagtgtaacatagaa
tgtaataatattgaatgtctgtttgatggatttgactgcaccaaaaaactttcaccatgc
aatgaaatgtatgacagctactgccagatgaattatgctaatgcaaggtgtgaccacggg
tgtaataatgaggaatgtaactgggatggtctagattgtgaggaagacctcccacggtta
gcaaatggtcaactggttttaactcttttgattgatccaatggattttgagactactaaa
atatctttcctgagggaaattggtcgtgcattgcatactaatgtgaagtttaaattggat
aaaaagggaaatgagatgatttatccaaggaggacaaaacatacagatgctatctctcca
aatcgtggacgaactgggattgatgttcatctggaaattgataacagacagtgtctcaag
tcagtgtacagtgaatgtttccagtcagcagccgaggctgctcggtttcttgctgcatcc
cgttctcgacattccctggatacagcttttcacattgaaaagatccaaagcacagatgaa
ttggaagaactccatggtcctgaagtcacttacccaaatatggtgtacattgtgattgga
gtgatagtgataatcttgctaggattacttcttggggtgttagttaccactcagaggaag
cgtgcacggggtgttacctggtttccagaaggatttttcagaaacaatagtgtccagaag
caacaggcacgacgtcgaggcccagatggacaagaaatgagaaacatccacaaacaaatg
tctgctcaaagaatggatgccaatgataacagtggcataccttccgacattggtgggtgg
agtgatgatgacatgggtgatcatcctcctgtaaagagaaccaaaagtgatcattcacca
gatcctagttttggagacactcacactgtaatgacaacaaccgattacgacgataatgac
ccccgaccttggactcagcagcatcttgatgcggcagatgttcgcaatcctgatattctt
gctttttcacctccacatggagacagtgaactagaaccaggaaatgttgatgtcagaggt
ccaggaggtcttacacctctgatgttagcatcttttcgaggaggtggtttggatacagga
gaagatgtagaggaagatgatggatctgtcagcatgattcaggaccttctctcacaaggt
gccaagatcaacatgataacagaacgaacaggtgagacatctcttcacttggctgcaaga
tatgcaagagcggatgctgctaaaagactgttagatgcaggtgctgatgctaactctcag
gacaacactggtcgaactcctttacatgcatccatatctgctgatgcacagggagtcttc
cagatcctgttgagaaacagagccacaaacttgaatgctcgaatgcatgatggatcaacg
ccactaattctagcctcgaggctggcaatagaaggaatggtggaagacttaataaatgcc
gaagctgacataaatgctgctgatgaccttggaaaaacagcactgcactgggcggcagca
gtaaacaatgtggatgctgtccgagtgttgctggcccacggagcaaacagagatgtccag
gataccaaagaagagacacctctcttcctagcagccagagaaggaagttatgaagctgcc
agagtgctcttagaacactttgctaatcgagacatcaccgaccacatggatcgtttgcca
agagatgtagctctggagcgtgtgcatcatgatattgtgagattattggatgagtacgta
ccccagggtcctctgacgtctcatgtacctactagctctacatctatggttcccccaccc
acggtcattggttccaccaggtctactaaagctaagaaaaggtcaaaagtcaacagtatg
gttggaatggccatgcaaaatggagatcattcttcccagaatagtgagagagaaataaga
agaaaagtgtccttgaagaagcaaggaacagaagggcagcccaacttgcactgtttgaac
actttcgattcgcaccctttcaatggcctacatccagcatttgatgatggacagagctta
gcactgtctcacccaaatctagcaggtttagacaactcagccacaaaacaacaaacttcc
tacaatgaatgtataaatccacagatatatgagtctgtgggtggaatggctggtcagttg
atatatatgaatgatggaacagtgccacatgtgcagacagtgcagggtgtcacatctcac
cttcaacgacagaattctatgcccagtagcctgaccgtatcacaggtacagtcaactcat
aactacactggttctccttcaatcaagcaacgaccattactcccaacctctcccacccac
atggcagccatgaggactgcccatcaacagaaaaatgcacatattcaacctcagcagagt
gccaaccatatctatgactacatcatgactgacattcggcaggtgttgggttccagtggt
cagaaatcaaacccaccagaccctgcaactggccagcaacaagtgccttatagccaccca
tttcagtttccaacccctccatctcaacatagttatggtggctcagaggccactcctcaa
cattatctacatcacccagagacttacttaaccccctctcctgaatcacccggtcagtgg
tcaagcacttcccctcattcagctcaaagtgactggtctgaaggcatctgtagcccagta
aatatgaatatcttacagcctgtggaacaccaacatcctcaccaccaaactcaaaataca
ctttccaccccagaagctgtgtttctttag
DBGET
integrated database retrieval system
