Limulus polyphemus (Atlantic horseshoe crab): 106470152
Help
Entry
106470152 CDS
T08968
Name
(RefSeq) FRAS1-related extracellular matrix protein 1-like
KO
K23380
FRAS1-related extracelluar matrix protein 1/2
Organism
lpol
Limulus polyphemus (Atlantic horseshoe crab)
Pathway
lpol04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lpol00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
106470152
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04091 Lectins [BR:
lpol04091
]
106470152
Lectins [BR:
lpol04091
]
C-Type lectins
Lecticans
106470152
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_3
Frem_N
Cadherin_4
Lectin_C
Calx-beta
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106470152
NCBI-ProteinID:
XP_013786136
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2063 aa
AA seq
DB search
MTSFWEHPTLWLVFGLVWILKLHSCFHVQTRDIDVAIGRGVFLQPQDLIFHGIGADDICR
LEVVSVEPMSQRVGVLEPKIFDCFFKPDRVRYTHFGLPFIKQDIIKLYAYKLSVNNTISR
SVTLTINIKSVKFDVTVVKAPLVVEDFFGVSEPISQKNLEFLYNKQDGASCKVRFSVHQS
SWPAYGQIVIGHQRRFIDVIKVDCDDLVQVDLQYEHLKPPTPDTDYILLLVETSDPHLNG
GGLVTEWVTLPVEIKSGFPNLPPKASFSSTFLMAVQQFILTPITPNVLSASDGETPKGKL
IFNVSTELTPDVGFIVHLSDHTQPIYSFRQSDIENGDIAYKPSTKPVSADQTLSIKFIVL
DAEFKESDPVELHIFIRSSTASFPRVSVSSGLVLLEGQSRPLLPQNLEVVDKDNIEEVQV
FVSGGLKHGQLKVGGKSYISFTLADLIGGHVVYHHDDSDSSKDTIHLRVTDKSQSTLVAF
PVTVLPKDDDPPVLTVNVGLQLVQGGLTIITPTLLNATDQDSEDQYITYVVKKKAEFGVL
WKKHVWEVVGVEVQNFTQGDINNELIYYHHLGNKGSMDSFEVILMDGSDPPNKSFPYKVL
VGINPASNEPPQRHPNCSLHLEVKEDVVGILTQDMLHYVDLDSKPSEVVFTVTSSPRFIG
SFALSDAGKFVSVAGQVSLKKNFTLPSLTYFTQEEIRHHKVAYMPPASDVGPNPQTLQVV
MSVSDRQGNTVTGQFFNITILPVDNQAPKLYTGHILVQEGSSTLLSTNEVSVHDLDTLSS
KLMISLFTVPLHGSLLRGGQVLRVGDLLSLDDILTLQVEYSHDGSESISDSFTVGVSDGK
HFVSGNVLVDVEPVNDQNPVWKRGLKTEVTVNEGGSVVLTPDVLAASDLDSDDLSLIFSL
TEAPYYGSLMVGKKATNRFMQRNVTKGEVLYVHNGREIGEKGKQDALIFVVSDRPFPRLF
DQPKHTVTVLILPMNNRPPQIHFQRAVLVEEGQQAVIDDKIISVSDADTQISMLRCFVTK
EPDFGFLENTRPLIEYETERRGRVAHTFLFEDVQAGYIYYIQSKHKGLEPEADFFEVMVS
DGVFNTSSVLVSIKIIPVNDEVPLVTLKNLTVPEGGLARLDPDTLTVTDRDFPGNIITVR
IETAPKSGSLVQVVHLDHANMERDLPFVELTLDGFYQNVHYRHSGNENFFDWFTLAVSDG
KNTVSKTAYVSVTPLNDEPPRVFKNIGGEVDNQGNLLLSSALLLAIDEDTPPEQLIYHVT
TPPNLGILQKLQRKWLWTVLDPMNFSQEEISNNLIRYSYQGLSTSLKQDSFQYSVGDGVH
QTKVFLFPILLADFHNRTTEFRLNGTVVPFGSHVTVSRNSFGDVMEDLEAEDFFIVTRTP
QYGHLEISSSAGEPIGQFSLQELLDGQVIYNHTVQDIQTELDSFDFMVVKGNREITGIFP
IKISPIIDYSVVLTTLKKLKVFQNGTAVISSNHLEARGDQLAPEDVHFIVVEYPHFGILL
KNNRDIVQNFSQEDINKGNVSYKKESSNFTTSDNFVFQLSSKNTIAHKSEDGKQTNFRIL
CLRKILENGEYGFTLTTRNLMAVGEDSNVEELQYELIGLPQNGFLRVKSYSQPVTSFTQL
DVNEKNVRYVIHDSKVNAMNDSFTFRIVSNGKSEKEHSIVLHWSVAQFSLPEYRVCENQK
YFIVEILRRGSLNGSSFVTVLAIDQTAQAKKDYIPDKANIIQFDPGTTIAVWNIEVIQDG
LVEAPIEQIQIVLFDPINTVINDVGRVALISIHDESWNDCQTTTGKNSGVAPDWSSIPKN
IPDTSGWGNYPLCSSFYTGLLHFNPTIREFQECNGEDWVLWKPTSKDSSHKLSSKEVVGM
SPVKKIDSSSKPPGVLLPMTNRSSSETPPHEFHYIASFQRGSDVQHRDTVLSGGLPKNND
NKVVHKTTKSHSSECPDDWRLYGNLCYGFLRGQISGKEALNSCRKRYDGQVAAVQSLEHN
KWLLQLAEGRPFWIGLQYNRRNARWGYKGLSEVPFVNWKPRFPKVSRKGRVKHRCVLVRG
TGQWINRNCAGHHHNIVCSRPPG
NT seq
6192 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttcattttgggaacatcctacattatggttagtgtttggactggtatggattttg
aaactacattcatgttttcatgttcagacaagagacatagatgttgctattggccgagga
gttttcctacagcctcaagacttgatatttcatggcattggtgctgatgatatttgtagg
ttggaggtagtttctgtggaaccaatgagtcaaagagttggcgtattggaaccaaagatc
tttgactgtttcttcaaacctgacagggtgagatacacccacttcgggttaccttttata
aagcaggacattattaagttatatgcttacaagctttctgttaacaacactatctctcgc
tcggttacactgacgatcaatataaaaagtgttaaatttgatgtaacagttgttaaagct
ccactggtagtggaagatttctttggtgtatcagaacctatatcgcagaaaaatcttgag
ttcttgtacaataaacaggatggagcatcttgcaaagttcgtttttcagtccatcaaagc
agttggcctgcatatggtcaaattgtaattggacatcagagaagattcattgatgtaata
aaagttgactgtgatgacttggtgcaagttgaccttcaatatgagcatctaaaaccacca
actccagatacagattatatcttattgttggtggaaacaagtgatcctcaccttaatgga
ggtggtttggtgacagagtgggtcactttaccagtggaaattaaatcaggatttccaaat
cttccaccaaaggcttctttttctagtacatttctgatggctgttcagcagtttatactt
actccaatcacaccaaatgtcctttcagcctcagatggggagactccaaaaggaaaatta
atatttaatgttagtacagaactcacaccagatgttggctttattgtacatttgtctgac
cacacacaaccgatttattcatttcgccagagtgatattgaaaatggagatatagcttat
aaaccctcaactaaacctgtctcagcagaccagactttatcaattaaatttatagtgtta
gatgcagagtttaaggaaagtgatccagtagagcttcatatttttatacggtcatcaaca
gcatcatttcctcgagtgtctgttagctctggcttagtgcttcttgaaggtcagtcacgt
ccacttctgccacagaaccttgaagttgtggataaagataatatagaagaagttcaagtg
tttgtgtcagggggtttgaaacatggtcagctgaaagtaggtggaaagtcgtatatttct
ttcactcttgcagatctaattggtggccatgtggtataccatcatgatgacagtgactct
tctaaagataccattcatctaagagtgactgataagtcacaatctactttggtagcattc
ccagttacagttcttccaaaagatgatgacccaccagtattaacagtaaatgtgggtttg
cagttagtgcaaggtgggttaactataataactcctaccctgctgaatgccactgatcaa
gactcagaagaccaatacattacatatgttgtgaagaaaaaagcagaatttggagttctg
tggaaaaaacatgtatgggaagtagtgggagtagaagttcagaacttcacacaaggggac
ataaacaatgaacttatttattatcatcaccttggaaacaagggctcaatggattcattt
gaagtaatattgatggatggaagtgatcctcccaacaaatcttttccatacaaggttctt
gtgggaattaatcctgctagtaacgaacctcctcagcgtcatcccaattgttctcttcat
cttgaagttaaggaagatgtggttggaattttgacccaagacatgttacattatgttgat
cttgattcaaaaccaagtgaagtagtttttactgttacaagttctcctcgatttatagga
tcatttgcattgtcagatgcaggaaagtttgtttctgttgctggtcaggtgtcattaaag
aaaaatttcacccttccaagcttaacatattttactcaagaggaaataaggcaccacaaa
gtggcatatatgccaccagcatctgatgtagggccaaacccccaaaccctgcaggtggtc
atgtcagtttctgatcgtcaaggaaatactgttactggccagtttttcaacattactatt
ttgcctgttgataatcaggctcctaaactttacacaggacacattctggtacaagaaggg
tcttcaacacttctttcaacaaatgaggtgtctgtgcatgatctggacaccttatcttca
aagcttatgatcagtctttttactgttcctcttcatggctcacttttgcgaggtggccag
gtactgcgggtaggagaccttctttctctagacgatattctgacccttcaagtggaatat
tctcatgatggttctgaatccatatcagacagtttcactgtaggtgtcagtgatggtaaa
cattttgtttctggaaatgttttagtagacgttgagcctgtaaatgatcaaaatcctgtt
tggaagagggggttgaagaccgaagtgactgttaatgagggtggctctgttgttttaaca
ccggatgttcttgctgctagcgatcttgacagtgatgatttatccctcatcttcagtttg
actgaagccccatattatggttccttgatggttggaaaaaaagccacaaatcgtttcatg
caaagaaatgtcactaagggagaggttttgtatgttcataatggaagagaaattggtgaa
aaaggaaaacaggatgctctaatctttgttgtttcagacagaccatttcccagacttttt
gaccagcccaagcacactgtaacagttcttatactacctatgaacaaccgcccaccacag
attcattttcagagagctgtcctagtggaggaaggacaacaagcagttattgatgataaa
ataatttctgtaagtgatgcagacactcagatatctatgttaaggtgttttgtgactaaa
gaaccagattttggttttctggagaacacaagacctttgattgaatatgaaacagaaagg
agaggacgagtggcacacacattcttgtttgaagatgttcaagcaggctacatatattat
atacagtctaaacacaaagggttggaaccagaagcagatttttttgaggtgatggtgtct
gatggagtatttaacacttcttcagttttggtcagcattaagataattcctgtaaatgat
gaagttcctttggtgactcttaagaacttaactgtacctgagggaggattagcaagattg
gaccctgatactttgacagtgactgacagagacttcccaggtaacataataactgtaagg
atagagacagctcctaagtcaggatcactggtccaggttgtacatttggatcatgctaac
atggagagagatttaccatttgttgaactaacacttgatggattctaccaaaatgtccat
tacaggcatagtggtaatgagaatttctttgactggtttactttggcagttagtgatgga
aaaaatacagtttcaaaaacagcatatgtttctgtgacacctctgaatgatgaacctcct
cgggtttttaagaatattggaggtgaagtggataatcaaggaaatttgttattgtccagt
gcattgttactagcaattgatgaagatacacctccagagcaattgatatatcatgttact
acacctccaaaccttggaattcttcaaaagcttcaacggaagtggttgtggactgttctt
gatcccatgaatttcagtcaagaagagattagtaacaaccttatcagatactcatatcaa
gggttaagcacttctttgaagcaagacagttttcagtactctgtgggtgatggtgttcat
caaaccaaagtatttttgtttcctatcctcttggctgactttcacaacagaacaacagag
ttcaggttaaatgggacagttgttccttttggaagtcatgttacagttagtagaaactcc
tttggtgatgttatggaggacctggaagctgaagatttttttattgtaacacgtacacca
caatatggtcacttggagataagttcaagtgcaggagagccaattggtcagttctctttg
caagagttacttgatggacaagttatatataaccacactgttcaagatatacaaactgaa
ttggatagttttgattttatggtagtcaaaggaaatagagagattactggtatatttcca
atcaaaatttctcctattattgattattctgtggttttgactactttaaagaaattaaaa
gtgtttcagaatgggacagcagtaatatcatcaaatcatcttgaggccagaggtgatcaa
ttagctccagaagacgtgcattttattgttgtagaataccctcattttggtattttactg
aagaacaacagggacattgtacagaacttcagccaagaagatatcaataagggaaatgtc
tcgtataagaaggagtcatctaactttaccacatcagacaattttgttttccagttgtct
agtaagaatacaatagcacataaatcagaagatggaaagcaaacaaattttcgaattttg
tgtttgagaaagattttggaaaatggagaatatggtttcaccctaacaactagaaatttg
atggctgtcggtgaagattcaaatgtagaagaactacaatatgagcttataggcttgcca
caaaatggttttctcagagtgaaatcttatagtcaaccagtaacatctttcactcaatta
gatgttaacgaaaaaaatgtccgttatgtgatccatgacagtaaggttaatgccatgaat
gacagttttacctttagaatagttagtaatggaaaaagtgaaaaagaacacagcatcgtt
ctacactggtctgtggctcagttttctttgccagaatatagggtgtgtgagaaccagaaa
tatttcatagttgaaattttaagacgaggatcattgaatggatcttcttttgtgacagtt
ttagcaatagaccaaacagcacaggcaaaaaaagactatattccagataaagctaatatc
attcaatttgatccaggtacaacaatagctgtttggaatattgaggtaatccaagatgga
ttggtagaagctccgattgaacagattcagattgttctctttgatcctatcaatacggtg
ataaatgatgttggacgtgttgcattaatcagcatacatgatgagagttggaatgattgt
cagacaacaactggaaaaaatagtggtgttgcacctgactggtccagtattccaaagaat
attcctgatacctcaggatggggaaactatcctctttgcagctccttctacacagggctt
ttacacttcaaccctaccatcagagaattccaggaatgtaatggagaagattgggttctc
tggaagccaacgtccaaagactcgtcgcataagttgtcatctaaggaagtagttgggatg
tcaccagtaaagaaaatagattcatcttcaaaacctcctggtgtattgttacccatgact
aatagatcctcatcagaaacaccaccacatgagtttcattacattgcttcttttcagaga
ggctctgatgtccaacatagggatacagttttgtctggtggtttgccaaaaaataatgac
aataaagtggttcacaaaacaacaaaatcccattcttcagaatgtccagacgattggaga
ttgtatggaaacctctgctatggttttcttcgtggacaaatatctggtaaagaagcacta
aattcgtgtagaaaacgatatgatggacaggtggcagctgttcagtcactggaacataat
aaatggctccttcagttagcagaaggtagacctttctggattggcttacagtacaacaga
agaaatgctagatggggatacaaaggtttgtctgaagtaccatttgtcaactggaaaccc
cgatttcctaaggtttctcgaaagggtcgagtgaaacatcgatgtgttttggtcagaggg
actggccaatggattaacaggaactgtgcaggccatcatcacaatattgtttgctctaga
cctccgggttaa
DBGET
integrated database retrieval system