Limosilactobacillus portuensis: PRK60_08140
Help
Entry
PRK60_08140 CDS
T08838
Name
(GenBank) DUF1542 domain-containing protein
Organism
lpor
Limosilactobacillus portuensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1542
FIVAR
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCT60519
LinkDB
All DBs
Position
complement(1572275..1580080)
Genome browser
AA seq
2601 aa
AA seq
DB search
MTAKTDQATTESSAKTMTPAQSDDQTTAQAQTKTEDQASVDAKTDASDSTKTQPNADKQT
ATESKTDQASEDQAAKTNNDQATSTKKAAADDNASTTAKDQSTTTDQTAVKNEENNDAKA
NDNKTTNLSLTKGSVLKAQAAKASLVQTKAATNDEDTITVNTAQELIDAIQKGTATTINI
GKNIDLGEKTSSQYTNTNISNKRNIIIQSADGKHYTVDFNGYGFNMYSNDYGVTFKDLDL
YGRSYFGIVRSAGSYTFDNVNYTGSQLIYTDSGYNTTVNFDGNVTAHSVGSYTSPLNNKS
QVSQGGNTQQVIQFAAGTNTINFNSGSNVTLTTTNSNVLEVDKGTTTINVKNGAQVSLNP
HTQNGPEQLNGMSMDSIARGIASNGDTTLNIDQGGNLDINLTKNTEDKYLSGALYLNSGA
TINVNGNLNINSDGTPYYRSQGWDDPVYINGNAIINVNGGSFKANATKMGDYKGSVVTSN
GNSTIAINHHGTFDVTGDGTQATGVSLGSGSTFTSTQPELFNISMPDGATAIKNGKVQFK
GVKTSADGQPIGEIDITYASDGTPTVTKVTSYDEAATTATRTAGNNAKNKINLVAAGEEV
NLSNVSFVKNADGTYTMSGNANTADNKGAYVYVSVNGTVHQVAPTDSQTLWTAGETGDPT
SSQVPYTAETGTDGKFTVNLGKLKDTDQVSVYGAKDFVTSDTDTKTVSDWMTSSYRDQLQ
KLVDEAPTVEAGSNFTNATDNLKTTYTSAISDGSTLLQNSSATSEQLEAAANAITTAKTA
LNGDLNKVKQDLQAAVDAAPGFENTSATYYNATPAKQKAYTDAISAGSDALKAQNPTVES
LTDALNKINDAKAALDGQPTNKQDLQAAVNNSKDVKDSNNYTNADQAAKTAYDDAVTAAQ
SVLDNKNATQAQVTQALQDLNTANGKLNGDAKTDAANRQALEDAVKDAPNVRNTPAYYNG
DSKVQDAYNKAITDGQAVLDNKDATPAEVKNALDAITNAKKALDGQPTNKDALQDAVNKS
KGIKDSNNYANADQNEKTAYDNAVTAAQGVLDNENATQAQVNQALKDLNTANSKLNGDAK
TDAANRVALEEAVKEAPVVEKTYSKYYNGTEKAQNDYKNAVSEGQKVLDNPSATAAQIKT
ALDNINAAKDALDGDPTDKTTLQNGVDNAVDLDKSNADAQAKKAYTDALDKAKQVLADPN
ATQQAVKEANTALTNAKTALDNSSALQNAKNALQQAVDAKSTTEKTPAYYNANSDKQQAY
NTAISAGTDALKVQNPTVESLTTELNKINEAKNALDGKATDTSKLKAAVDNANTVKASND
YKDASADYQKQYDDAVKAGQQLLDPTTAPSPLTQADVDRAAKAITDAQSALTTSATTNVK
DAKEKATADLTTAVDAAKKAIDQDTNLTEDERNAAKAQVDQDASAAKEAINKATTNNAVT
SAATAGKVTIDKTVANAAIDNAAAGKNKAIDGSSLTDEEKNGIKDQVAQAVKNAKGEISA
ADTEQKVTTAQKNGVDEINGIKVPSTSTQKDEAKGNINKAADDAKKEIDQDSNLTDDQKQ
AAKNQIDSDAKNAQKAIDDAKTDTDVNNAINGGKLAIDKTAANAAIDNAAAGKNKEIANS
PLTTDEQNKLHDQVAKEVKTAKDNINSATIPTEVTTAKDNGVKAINGVKIPTTSPEKDKA
KENLDKQVQDAKDAIDKDDNLTDDQKQAAKDQIDTDAKNAQDAIDNAKNDADVNNAADNG
KLAIDKTVADAAIDNAVAGKIKDVKAPLTTDEQKTLTDLIKETGENAKQNIASATTPAEV
TTAQENGVKAINDINVPTSSSVKDNATAAIDKANTAAKTAKDNINKATTNDAVKDAENNG
VDSIKGITFTNLDDAKKAANNAIDNALTNKTNEINNASNLSQNEKQDLISKATDAATTAK
DNIAKATTNDAVTDAQNKGIEAIANITVPSLDETKQKAINAIKQVQESKNKQISDAKNLN
ADQQKSLTDQVNKIADDAIAQINDSSVTTNDSVATICDNAIDQITNLFIPTLDGAQKDAT
NAIETAKNAKIDEINNAQNLSDQEKQDLTDQVNQAADDATKAIKDATTNDAVKDAETKGL
NDINNIKVPSLAEKQQEAKNAVAKAADAKNQAIDNSNLTSDEKTALKKQVSAAQAAANKA
IDDASTDAGVTKAQNDGIDNINKIAIPETSDAKAKATTDLKDAVDNAKKAIDQDTNLTND
QKQAAKDAIDQDAKTAQEAINNANTDSDVKKATDNGQLAIDKDVANAAIDNAAAGKKAEI
AKSPLTDAEKQALDQQVDQQVQTAKSNIAKATTTDEVTTAQNNGIDNINNIKIPSVPTTN
LTDAKNAANTAIDNAAAAKKNAIKAAQDAGTITAEQATDLNQQVDRAANEAKQAINNATT
VSQVEQAQTSGIQTINNINIPSITDAKDAAKNAIDQAAKNKDAEIDASNLSDQEKADLKN
EVKVIADTAKKSIDSVDNAAEVNNAMNAGIAAINSIKVATSSDNQNGQSGNNGSTIDNGS
GEATNNNGSQAGSVTGATTSQSNGAKVSATGLNVKNNVNKQAAQLPQTGNQTNTSLGVVG
LAAASLACLFGFTKLGKKKED
NT seq
7806 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaccgctaagactgaccaagctacaaccgaatcatcagctaagacgatgacacctgca
caatctgatgatcaaacaactgctcaagcacaaacaaagactgaagatcaggcaagtgtt
gatgcgaagacagatgcttctgatagtaccaagactcaaccgaatgccgacaagcagaca
gctactgaatcaaagaccgaccaagcttctgaagatcaagcagctaagacaaataacgat
caagctacttcaacaaagaaggcagcagcggatgataatgcttcaaccactgctaaggat
caatcaaccacgactgatcaaacagctgtaaagaatgaagaaaacaatgacgctaaggcg
aacgacaacaaaactactaacttaagtcttactaagggaagcgttcttaaggcccaagca
gcgaaggcttccttagtgcaaacgaaggcagctactaacgatgaagatacgataaccgtt
aatactgcccaagaattgattgatgcaattcaaaagggaaccgcaacgacaattaatatt
gggaagaatattgatttaggtgaaaagactagcagccagtacaccaataccaatatttct
aataaacgtaacatcataattcaatctgctgatggtaagcactatactgtagactttaac
ggttatggctttaacatgtacagtaacgattatggagttactttcaaagacttagattta
tatggtagaagttatttcggtattgttagaagtgctggatcatatacttttgataatgtt
aactacaccgggtcacaattaatttatactgattctggatataacacgacagttaacttt
gatggtaatgttactgctcattcagtgggttcatataccagtccactaaataataagtct
caagtcagccagggtggtaatactcaacaggtaattcaatttgctgctggaacaaatacg
attaactttaattctggaagtaatgttaccttaaccactactaattcaaacgttcttgaa
gttgataagggaacaacaacgatcaacgttaagaatggtgcccaagtttccttaaatcca
catactcaaaatggaccagaacaacttaatgggatgagtatggatagtattgcccgtggg
attgcttcaaatggtgatactactttgaacattgatcagggtggtaacctagacattaac
ttgacaaagaataccgaagataagtatctttctggtgctctttacttgaattctggtgca
acgattaatgttaatggtaatttgaacattaattctgatggtacaccatattaccgctct
caaggctgggatgatccggtttacatcaacggtaatgccatcatcaatgttaatggtggt
tcattcaaggctaatgctactaaaatgggtgattacaagggttcagttgttacttcaaat
ggaaattcaacgatcgccattaatcaccatggtacctttgatgtaactggtgatggcacc
caagctactggtgtatcacttggtagtggtagtacctttacttcaactcaaccagaatta
tttaacatttcaatgccagatggcgccactgcaattaagaacggtaaagttcaatttaag
ggtgtaaagacctcagctgatggtcagccaattggtgaaatcgacattacttatgctagt
gatggtaccccaactgttactaaagttactagttatgatgaagctgcaactacagcaact
agaactgctggtaataatgccaagaataagattaacttagttgctgctggtgaagaagtt
aacttatctaatgtaagttttgttaagaatgctgacggaacttacaccatgagtggtaat
gcaaataccgctgataataagggcgcatatgtttatgtatcagtaaatggcacagttcac
caagttgctccaacagattcacaaactctttggacagctggagaaactggagatccaact
tcttctcaagttccttacactgctgaaacaggaacagatggcaaattcactgttaacctt
ggcaaattaaaagatactgatcaagtttcagtatatggagctaaggactttgtaactagt
gatacagacactaagactgtttctgactggatgactagctcttaccgtgatcaattgcaa
aagttagttgatgaagctcctactgttgaagcaggctctaactttaccaatgctactgac
aatcttaagactacttatactagtgcaattagtgatggtagtactcttcttcaaaattct
agcgctacttcagaacaacttgaagctgcagctaatgccatcaccactgccaagactgct
ttaaacggtgatctcaacaaggtaaaacaagatcttcaagctgctgttgacgcagctcca
ggctttgaaaatacctctgcaacttattacaatgcaactcctgctaagcagaaggcatat
acagatgcaattagtgccggtagtgatgccttaaaggctcaaaatccaacagttgaaagc
ttaacagatgcattaaataagattaacgatgcaaaggctgcattagatggtcaaccaacc
aataagcaagatcttcaagctgcagttaataattctaaagacgtcaaggacagtaacaac
tacactaatgctgatcaagcagcaaagacagcatatgatgatgcagtaacagctgctcaa
agcgttttggacaacaagaatgcaactcaggctcaagtaactcaagcattgcaagatcta
aatactgccaatggcaaattgaacggagatgccaagacagatgccgctaacaggcaagct
cttgaagatgcagtgaaggacgcaccgaacgtaagaaatactccagcatactacaatgga
gatagcaaagttcaagatgcatacaataaggcaattactgatggacaagcagttttagat
aataaggatgccactccagcagaagtcaagaatgcattagatgcaattactaatgctaag
aaagcattagatggccaaccaacaaataaagatgcccttcaagatgcagttaataaatct
aaaggtatcaaggacagcaataactacgctaatgctgatcaaaatgaaaagacagcatac
gacaatgcagtaacagctgctcagggcgttttagacaacgaaaacgcaactcaagctcaa
gtaaatcaagcattaaaagatcttaatactgccaatagcaaattgaacggagatgccaag
acagatgctgctaacagggttgctcttgaagaagcagtaaaagaagcaccagtagttgaa
aagacttattctaagtactataacggcactgaaaaagcacaaaatgactataagaatgct
gtatcagaaggtcaaaaagtattagataatccaagtgctacagcagctcaaataaagaca
gctttagataatattaatgctgcaaaagacgcgttagacggagatccaacagataaaact
actttacaaaatggtgtagataatgcagtagatctggataaaagcaatgccgatgctcaa
gctaagaaagcttacactgatgcacttgataaggctaaacaagtattggcagatccaaat
gcaacacaacaagcagtaaaagaagcaaacaccgcattaactaatgcaaagacagcatta
gacaatagctcagcattacaaaatgccaaaaatgcattgcaacaagcagtagatgccaag
tcaactacagaaaagaccccagcatactacaatgccaattctgataagcaacaagcatat
aacacagcaattagtgctggtactgatgcattaaaggttcaaaatccaacagttgaaagc
ttaacaactgaattgaataagattaatgaagcaaagaacgcattagatggtaaggcaact
gacaccagcaagcttaaagcagcagtcgataatgccaataccgtaaaagcaagcaatgac
tacaaagatgctagtgctgattatcaaaagcaatacgatgatgcagtaaaagcaggtcaa
caattattggatccaactacagcaccatctccattgactcaagccgatgttgatagagca
gctaaggcaattacagacgcacaaagtgctttaactactagtgctacaactaatgttaag
gatgctaaggaaaaagctactgctgatttaactactgctgttgatgcagctaagaaggca
atcgatcaagataccaacttaactgaagatgaaagaaatgcagctaaagctcaagtagat
caagatgctagcgctgcaaaagaagctatcaataaggcaaccactaacaatgctgtaact
tctgctgcaactgcaggtaaagttaccatcgataagactgtcgcaaatgctgcaattgac
aacgctgctgctggcaagaataaggctatcgatggatcttcattaactgatgaagaaaag
aacggcattaaagatcaagtagctcaagcagtaaagaatgctaagggtgaaatttctgcc
gctgatactgaacaaaaagtaactactgctcaaaagaatggtgttgatgaaatcaacggt
attaaagttccgtcaacttcaactcaaaaagacgaagcaaaaggcaacatcaataaagcg
gctgatgatgctaagaaggaaattgatcaagacagcaacttaaccgatgatcaaaagcaa
gcagctaagaatcaaatcgatagcgatgctaagaatgctcaaaaggcgatcgatgacgct
aagactgatactgatgtcaacaatgcaattaatggtggtaagcttgctatcgataagaca
gcggcaaatgctgccattgacaacgcagcagctggcaagaacaaagaaattgctaactct
ccattaactactgatgagcaaaacaagttgcatgatcaagtagctaaggaagtaaagact
gcaaaagacaacatcaatagcgcaactattccaactgaagtaactactgctaaggataat
ggtgttaaggcaattaacggtgttaagattccaacaacttcaccagaaaaagacaaggcc
aaagaaaaccttgataagcaagttcaagatgctaaggatgccatcgataaggacgacaac
ttaaccgatgatcaaaagcaagccgctaaggatcaaattgatactgacgctaagaacgct
caagatgccatcgacaacgctaagaacgatgctgatgtcaataatgccgctgataacggt
aagcttgcaattgataagacagtcgccgatgctgcaatcgataatgcagtggctggtaag
attaaggacgttaaggcgccattaactactgatgagcaaaagaccttgactgatttgatc
aaggaaactggtgagaatgctaagcaaaatattgctagtgcaactactccagcagaggta
acaaccgctcaagaaaatggcgttaaggctattaacgacattaatgttccaacctcttct
tctgttaaggacaatgctactgcagcgattgataaggctaatactgcagctaagacagct
aaggataatatcaataaagcaacaaccaacgatgcagttaaggacgctgaaaataatggt
gttgacagtattaaaggcattactttcactaacttggatgatgccaagaaggcagccaat
aacgctatcgataatgcattaactaacaagactaatgaaattaacaatgcttctaactta
tctcaaaatgagaagcaagacttgattagcaaggcaaccgacgcagcaactactgccaag
gacaacattgctaaggcaactactaacgatgctgtaactgatgcccaaaacaagggaatt
gaagcaattgctaatataactgttcctagtcttgatgaaactaagcaaaaagcaatcaat
gccatcaagcaggttcaagaatctaaaaacaagcaaattagtgatgctaagaacttaaat
gcagatcaacaaaagagtttaactgatcaggttaataaaattgctgatgatgcgattgcg
cagattaatgattcttcagtcactactaatgattcagttgctacaatctgtgataatgca
attgaccaaatcactaacttgtttatcccaaccttagatggtgcccaaaaggatgcaact
aatgcaatcgaaactgctaagaacgctaagattgatgagatcaataatgctcagaacttg
tctgatcaagagaaacaagatttgactgatcaggtaaatcaagctgcggatgatgctact
aaagcaatcaaggatgcaacaactaatgatgctgttaaggatgctgaaactaagggcttg
aatgatattaacaacatcaaggttccaagtttggctgagaagcaacaggaagctaagaat
gcggttgctaaggctgccgatgccaagaatcaggcaattgacaattccaatttgacatca
gacgaaaagactgccttgaagaagcaagttagtgccgcccaagcagctgctaataaggcg
attgatgatgcttcaactgatgctggggtaactaaggcacagaatgatggtattgataac
atcaacaagattgctatcccagaaacttcagatgccaaggccaaagcaacaactgacctt
aaggatgctgttgataatgctaagaaggcaattgatcaagatactaacttgactaatgac
caaaagcaagcagctaaggacgcaattgatcaggatgctaagactgctcaagaagcgatc
aataatgctaatactgatagtgatgttaagaaggctactgataacggtcaattagcaatt
gacaaggatgttgctaatgcagcaattgataacgctgccgctggtaagaaggctgaaatt
gctaaatcaccattaactgatgctgaaaagcaagccttagatcagcaagttgatcaacaa
gtacaaacagctaagagcaatattgctaaggctacgactactgatgaagtaactacggca
cagaacaatggtattgataacattaataatattaagattccatcagtgccaacaactaac
ctgacagatgctaagaatgctgccaatactgccattgacaacgctgccgcagccaagaag
aatgccatcaaggctgcccaagatgctggtactattaccgctgagcaagcaactgatttg
aatcagcaagttgatcgggctgctaatgaggctaagcaagcaatcaacaatgccacaaca
gtaagtcaggttgaacaagcccaaaccagtggtattcagacgattaacaacattaatatc
ccaagcattactgatgctaaggatgctgctaagaacgcgattgatcaggctgctaagaat
aaggatgctgaaattgatgcaagcaacttaagcgatcaggaaaaggccgatttgaagaat
gaggtcaaggtaattgctgacaccgctaagaagagcattgatagtgttgataatgctgct
gaagtaaacaatgcaatgaatgccggaattgcagcaattaatagtattaaggttgctact
agttcagataaccaaaatggacaatcaggcaacaacggtagtaccattgataatggttca
ggtgaagctacgaataataatggtagtcaagccggttcagtaactggtgctacaacaagt
caatcaaatggtgcaaaggtttctgctactggtctaaatgttaagaataatgttaataag
caagcagctcaattgccacagactggtaaccaaactaatactagtcttggtgtagttggc
ttagcagctgctagtcttgcctgtctcttcggctttaccaagttaggtaagaagaaggaa
gactag
DBGET
integrated database retrieval system
