KEGG   Limosilactobacillus portuensis: PRK60_09455
Entry
PRK60_09455       CDS       T08838                                 
Symbol
addA
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddA
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
lpor  Limosilactobacillus portuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lpor00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:lpor03400]
    PRK60_09455 (addA)
Enzymes [BR:lpor01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     PRK60_09455 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:lpor03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     PRK60_09455 (addA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 DEAD PDDEXK_1 AAA_30 ResIII AAA_22 AAA_16 BP28CT KMP11
Other DBs
NCBI-ProteinID: WCT60763
LinkDB
Position
1867177..1871037
AA seq 1286 aa
MATFNPTPSQQRAIDDRGKNILVSASAGSGKTAVLVERAIKLIREGIHVDRMLMVTFTDA
AAKSMRDKIREALQEAVRQPVHNAEEQQQQRQMVNEINRLATADISTIHAFCLKLIKRYY
YLIHLDPQFRLLTDDTERLLLQKEIWQQVSEKLYESSLEQASDERASFSELVTNFSNDRD
ARGLDDLVLKLYETANAQPEPENWLHGLADNYFLGNDSITNTKFYQEQLKPVVKNNLEQL
VNDYAELSIRMADLGYDKPAEIIKGDQEHISNLITCLDQDQWGDIRAAFQGVKYARMSGG
AKKKDPEYETYQSLIKTRNGLKEQLKSLVTDYFEYDEQRFRQIANHAAGILNELSAVTIE
FSRAYQQAKLNRHVLEFSDLEHYAYQILTPPADQPDWVTLVNELREHYQEIMIDEYQDTN
PLQEKILMQLANPDQQNLFMVGDVKQSIYRFREADPTLFLTKYENYRKGKGGESIVLAEN
FRSMQNVTGFTNVLFEQLMDRQVGEIDYDKDAHLKYAATYYDENPDNRVTPAEVLLYDAN
VNPKLPQEDDKLTGELRMVAMRIKQMVANKELIFDKKTQQMRPVQYGDIVLLERTKNINN
TLMEQFNELEVPLTVHDVESYFQATEVRVMMALLKIIDNPKQDIPLVAVLRSPIVGLSNK
ELAFIRLQNRRADFYTALMTCQSNFENHSLQQSSALNPDQLTRLQQKITTFIEQLTEFRQ
VAQQQTLVNLIWHIYQETGYLDYVGAMPGGQQRQANLHALYERAHTYEQSSFKGLYQFTR
FIEKMQEHDQDLGVAPTQLDTNTVNVMTIHGSKGLQFPVVFLINTSHHFNNVAVRENAVV
DPNSGVGIKVMDQQRLVYDTPQRQIILNSIQQGERAEDLRVLYVALTRAEQRLVITASFN
ETRRGQKLVEAWNSWQKAFQSSQQLLGSQLRINAKSFMDWIGLALARYSNQFNAAKLSIS
GDDITDKGIVLEESPLNTGKKFTGMATEPFFIAKTFTATDVDQQLEKLTSPINVTGDEDL
QSLKSLSAEEIDQILAFRYPHEVATKTTAYQSVTDVKRVFEDPDNREMGQWDYEQQRKAK
NRGLYLRNDFATPQFIQQGDRSPAATEVGTATHLVFQKLPLDGKEITLAQVRNEIRQLVK
DRLINSAVAPFINAEGIAAFFQTDPGRQVIANGQKYHREEPFAMIMNGHELFKEVQAKDD
ERILIHGIIDGYLETPKGIILVDYKTDHIDPQYREFELAKITGRYRGQLELYRQALNIMK
PIPVVQMGLYLVELGEFIPFEIEGRP
NT seq 3861 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaacatttaatccaacaccgagtcaacaacgggcaatagatgatcgcggaaagaat
attcttgtttctgcctcagcagggtcaggaaaaacagcggtcctagttgaacgtgctatt
aaattgatcagagagggaattcatgttgatcgaatgttgatggtgacctttacggacgcc
gcggcaaagagtatgcgggataaaattcgtgaagcacttcaagaagcggtgcgtcagcca
gtgcataacgcggaagaacagcaacagcagcgccaaatggttaatgaaattaatcggtta
gccacagctgatattagtactattcacgctttttgcctaaagctaattaaacgctactat
tacttaatccatttagatccccagttccgattattaacagatgacactgagcggctcctc
cttcaaaaagaaatttggcaacaagttagtgaaaaactatatgaatcatcacttgagcaa
gctagtgacgagcgggcaagttttagtgaactggtgactaatttttctaatgaccgtgac
gcacgggggttagatgatctagttttgaagttatatgaaacagcaaatgctcaaccagaa
ccggagaactggttacacggactagctgataattatttcctgggaaatgattcaattacg
aataccaaattttatcaggaacagttaaaaccagttgttaagaataatttggaacagtta
gtgaatgactacgccgaattgagtatccgaatggcagacctcggttatgataaaccagct
gaaattatcaaaggtgaccaggaacacatcagtaatttgatcacatgtttggatcaagac
cagtggggagacatcagagccgcgtttcaaggagttaaatatgcccggatgagtggtggc
gcaaagaagaaagatcctgaatatgagacttaccaatccttaataaagacacgaaacggg
cttaaagaacaactgaaatccttagtgacggattattttgaatacgatgagcaacggttc
cgacaaattgctaatcatgcggccgggattctaaatgaattatcagcggttacaattgaa
ttttcacgagcttatcaacaagcaaaattgaaccgtcatgttttagaatttagcgatttg
gagcactatgcttaccaaattttaacgccaccggcagatcagccagattgggttaccctt
gttaatgaattacgtgaacactatcaagaaatcatgattgatgagtatcaggatacgaac
ccacttcaagaaaagatcttgatgcagttagctaatccagatcagcaaaacttattcatg
gttggtgatgtgaagcagtcaatctaccgttttcgtgaagcagatccgactcttttcctt
acaaaatatgaaaattaccgtaaaggaaagggtggcgaatcaattgttctagcagagaac
ttccggtcaatgcaaaatgtgactggttttacaaatgttttatttgaacaattgatggat
cgtcaggttggtgagattgattatgataaggatgctcacttaaagtatgctgcaacttac
tatgatgaaaatccagataatcgagttactcctgctgaggtactactttacgatgctaat
gttaatcctaagcttccccaagaagacgataagctaactggagaactacgaatggttgcc
atgcgaattaagcagatggtagctaataaagaattaattttcgataaaaagacacagcaa
atgcggccggttcaatatggggatattgttctcctcgagcgaacaaagaacattaataat
actttaatggagcaatttaacgagctggaagttccgttgacagtccatgatgttgaaagc
tattttcaagcaacggaagttagggtaatgatggcattgttaaagattattgataatcct
aagcaggacattccattagttgcagttcttcgttcaccgattgttggccttagtaataaa
gagttagctttcattcgtcttcaaaaccgtcgagcagacttttatacggcattaatgacg
tgtcagagtaactttgaaaatcacagtcttcagcaatcatcagcgttgaatccagatcaa
ttaacacgtcttcagcaaaaaataactactttcattgagcagttaaccgaatttcggcaa
gtagcccaacaacaaactttagttaacttaatttggcacatttatcaggaaactggttac
ttagactatgttggtgcaatgcctggtgggcaacaacgacaggccaatcttcatgcacta
tatgaacgggcgcatacttatgagcaaagtagttttaaggggctttaccagttcacgcgc
tttattgaaaaaatgcaggaacatgatcaggatctcggggtggcgccaacacaattagac
acgaataccgttaatgtaatgacgattcatggaagtaagggccttcaatttccggttgtt
ttcttgattaatacaagccaccattttaataatgtggcagttcgggaaaatgcggttgtt
gacccgaattctggagttggtattaaggtaatggatcaacaacggctggtttatgatacg
ccccagcgacaaattattttaaatagtattcagcagggagaacgagcagaagacttacgg
gtcctttacgttgcactaacccgagctgaacagcgactagtcattacggcatcgtttaac
gaaacgcgaaggggccaaaaactagttgaagcatggaatagttggcaaaaggcatttcaa
agcagccagcaattgcttggctcgcagttacggataaacgcgaagtcttttatggactgg
attggtttagctcttgcacggtattctaaccagtttaatgccgctaagttaagcatttca
ggggatgacataacagataagggaattgttctggaagagagtcctcttaatacagggaaa
aagtttaccgggatggcgacagaaccatttttcattgccaaaactttcaccgcaactgat
gttgatcaacaactggaaaagttaactagtccaatcaacgtaacgggtgatgaagatttg
caatcactcaagtccctgtcagcagaagaaattgatcagatccttgcttttcgttatcca
catgaagttgcaaccaaaacgacggcctaccaatcagttacggatgtaaaacgggtgttt
gaagatccggataatcgtgaaatgggccagtgggattatgaacaacaacgaaaggcgaag
aaccgcggactatatttaagaaacgattttgcgacaccacagtttatccaacagggtgat
cggtcgccagcagcaacagaggttgggacagctacccacctggtatttcaaaaattgcca
ctggatggcaaagagatcacgttggctcaagttcgtaatgagatccggcagctggtcaag
gatcgcctaattaactctgcagtagcaccgtttattaatgcggaagggattgctgcattt
ttccaaacagatccaggacgacaggttatcgctaatggtcaaaagtatcatcgagaagaa
ccctttgcgatgataatgaatggccatgaactatttaaagaggttcaagcaaaagatgat
gagcggatcctaattcatgggattattgatggctatttagaaactcccaaaggaattatt
ttagttgattacaaaactgatcatattgatccccagtatcgagaatttgaactagctaaa
attactggtcgttatcgtggtcagctagagttataccgacaagcattaaatattatgaag
ccaataccggttgttcagatgggactctacctggtagaattaggtgagtttattccattt
gaaatcgagggacggccgtaa

DBGET integrated database retrieval system