Limnobaculum parvum: HYN51_05170
Help
Entry
HYN51_05170 CDS
T05491
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
lpv
Limnobaculum parvum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Pertactin
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWH88002
UniProt:
A0A2Y9TWL2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2638349..2641642)
Genome browser
AA seq
1097 aa
AA seq
DB search
MKHKGNVCSESDRILLPVFRKTLLASLLLPLISPAVWAVDRTASVTDGSSVVISGIYSSA
TDNTNLIYVTNPNSTVSNNGPTSFESSAYLTGVMVENGGALNLDGALFNLENANASISAT
GIGTEVALSNIQITGGQIGISGADGAKISLNNSTMTSAGGKLIDITDMNTAGTMLTGVNN
TFIASSGYNSGIYLENSTAILNKTTFTTSADSVFSQLINASSNTNLTLNDLNVTATIGSQ
NAGITSDSSTLNMSDATINQTGGRSAISLSSPSGQGMTTLTNVNVTAVLDENINYRAIND
VSGNVGLVYLDGGTLKIKGGAYDVTNGDGINSNQWRSLKAGELDVSEAKITTHGNKSVGI
RTMGKTAIDNVDIITNGDNSPALLVSGYSSKDSSYAVVDASNMTITTAGVGSQGISTDLY
GRITVADSAITTSGESSSLLLANNISNITANNIRAESTGVGAHGINVQNGSTILVKDSQV
STSGANADGIYAATANMTNGSYSPMGFGQDVSVQLDNTSLNSALGNGLTANGINLNVDVI
NGSKVTGGNGILINAISDIPNGTLLTSTVNMTADNQTILTGDIQAEQDNIANLSLTNGSI
WDGAARNANNISVDGSSLWNLTGDADVASLNLGGQVNYTPGNSYRASGTDFSTLTVRGDM
TGNGGLLNMNVALGDDNSQSDKLVVQGNTSGDTAIQVKNAGGTGAQTINGIQLVSVAGQS
DGSFALKGRAVAGAYEYQLAKNQNDGGWYLHSGAIPEPTPEPKPTPTPEPTVDPVPTPNP
TPLSPTIRPEAGSYMANMAAASKMFNLRLEDREGRAENSSMWLRQQGDRTKFRDNSGQIK
TATNTYVVQGGGEVAQTQFSDTDRLGVGLMLGYGKSDSQSRNHRSGYNSRGQVDGYSGGV
YATWYQDAKTLDGLYVDSWVQYSMLNASVDGEQLSSESYDINGWSASVESGYRIPVYQGE
NGNVFVTPQAQITWSGINADDHKEANGTRVTSDDNNNVQTRLGVKLSRDGVSDMDKGSDK
LFTVYTEANWLHNTEQAGATMDGVAIKQAGSANIGELKLGAEGQLNKYINLWTNVAQQLG
DDGYSDTAVTVGFKYKF
NT seq
3294 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcacaaaggaaatgtatgttctgaaagtgatcggatcttattgcccgttttccgt
aaaacactattagccagtttgttattaccgttaataagccctgccgtatgggcagttgat
agaacagccagcgttactgatggcagcagcgttgtcatctctggaatttatagtagcgct
actgataatactaatctgatttatgttacaaatccgaacagcacagtaagcaataatggg
ccaaccagttttgaatcatcggcttatttaaccggtgtcatggttgaaaacggcggtgca
ttgaatttagatggcgcattattcaatttagaaaatgcgaatgcgagtatttctgcgaca
gggattggtactgaagttgctctaagtaatattcagataacgggtggtcagataggtata
tctggtgcagatggtgcaaaaatatcgttaaataactcaacgatgacatctgccggtggc
aaacttatcgatataacagatatgaacactgccggtacaatgctaactggtgttaacaat
acctttatagcatcttcaggttataattcgggtatataccttgaaaattcaacggctatt
ctgaataagactacctttacgacctcagctgattcagtatttagtcagttaataaatgcc
tcctctaatactaaccttacgcttaatgacttaaatgtaacggctacgattggctcacaa
aatgctgggataactagtgattcttctaccctaaatatgagtgatgctacgattaaccag
accggtggacgtagtgcaataagtttgtcttcgccgtcagggcagggaatgacaacatta
actaacgttaatgtcacggctgtgcttgatgaaaatattaactatagggcgattaatgat
gtcagtggtaacgttggtttagtttatttagacggcggtacacttaagattaaaggtggg
gcctatgatgtcactaatggtgacggcataaatagtaatcagtggcgttctttgaaggcg
ggtgagcttgatgttagcgaggctaaaataacgacccatggaaataaaagcgttgggata
cgcactatgggtaaaaccgccattgataatgttgacattatcactaacggagacaattcc
ccggctttactagttagcggttattcgtctaaagattctagctacgctgttgttgatgca
tctaatatgaccataactactgcgggagtgggtagccaaggtatttccaccgatctatat
ggccgcattacggtggcagactctgctattaccacgtcgggtgaatcatcaagcctgcta
ttggctaacaatatttcaaacattacggcgaataatattcgggccgagtcaacaggcgtt
ggcgctcatggtatcaatgttcaaaatggcagtactattctggtaaaagacagccaggta
tcaaccagcggcgctaatgctgatggaatttatgctgctactgccaatatgactaatggt
tcttatagccctatgggttttggccaagatgtcagtgtccagttagataacacgtcgtta
aatagtgcgttaggcaacgggctcaccgccaacggtatcaacctgaatgtcgatgtgata
aatggttctaaagtgacaggcggcaacggtattctgattaatgcgatctccgatattccc
aacggtacgttgttgacaagtaccgtcaatatgacggcggataaccagactatcctaacc
ggcgatattcaggccgagcaggataatattgccaatttatccctgaccaatggctcaatc
tgggacggtgctgcgcgcaatgccaacaatatcagtgttgacggcagcagcctgtggaac
ctgaccggtgatgctgatgtggcttcgctgaaccttggtggacaggtcaattatacgcca
ggcaacagctatcgcgcatcgggtactgacttcagcacgctaacggtgaggggggatatg
accggtaacggcgggcttctcaacatgaacgtggcgctgggggatgataattcacaaagc
gacaagttagtggttcagggcaacaccagcggtgatactgctattcaagttaaaaatgcg
ggcggtaccggtgcacaaacgattaatggtatccaactggtgtcggttgccggccagtca
gacggtagctttgcgctgaaaggccgtgcggttgcgggtgcctatgaatatcagttggct
aaaaatcaaaatgacggtggctggtatctccattctggggcaataccggaaccgacccca
gaaccgaagccaacaccgacaccagaaccgacggtggatccagtgccgacacctaatcca
acgccgctttcaccaacgattcgtccggaagccggtagctacatggcgaatatggcggca
gccagcaagatgtttaatctgcgtttagaagaccgtgaaggtcgggcagagaactccagc
atgtggctgcgtcagcagggagaccgtaccaagtttagagataacagcgggcaaattaaa
accgccaccaatacctatgtggtacagggcggcggtgaagtggcgcaaactcagttttcg
gataccgatcgtttaggcgttggcttgatgttaggttacggtaagtcagacagccagagt
cgtaatcaccgcagtggttataactcccgaggccaagtcgatggttacagcggcggcgtt
tacgccacgtggtatcaggatgcgaaaacgctggacggtctgtatgtcgacagttgggta
caatacagcatgttaaatgcctcggtggacggtgagcagctatccagtgaaagctacgat
attaatggatggagcgcctcggttgaaagcggctatcgtattccggtttatcagggtgaa
aacggcaatgtgtttgtgaccccacaggcgcagatcacgtggagcggtatcaacgctgac
gatcataaggaagccaacggcacccgcgtgacctctgatgacaacaataatgttcagacg
cgtctgggcgtgaagttatcccgtgatggcgtgagcgatatggacaaaggcagcgacaaa
ctgtttaccgtgtataccgaagccaactggctgcacaacaccgaacaggcgggtgccacc
atggacggcgtggctattaaacaggcgggaagcgcgaacattggtgaactgaagctgggg
gccgaaggccaactgaataagtacatcaacctgtggactaacgtggcccagcaactgggt
gatgatggttatagcgacacggcggttaccgttggatttaaatataagttctag
DBGET
integrated database retrieval system