Limnobaculum parvum: HYN51_09700
Help
Entry
HYN51_09700 CDS
T05491
Name
(GenBank) O-antigen assembly polymerase
KO
K02853
enterobacterial common antigen polymerase [EC:
2.4.99.27
]
Organism
lpv
Limnobaculum parvum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lpv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
lpv01005
]
HYN51_09700
Enzymes [BR:
lpv01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.27 O-antigen polymerase Wzy
HYN51_09700
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
lpv01005
]
O-antigen repeat unit
HYN51_09700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WzyE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWH88803
UniProt:
A0A2Y9TYI0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3685687..3687057)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MEPAQFGGLFVVYLISLIFILTLTYKEFRTVRFNFNILFSLLYLLTFYFGFPLTCVLVFQ
FDVQVVAVDSLLNALLSATCFYAIYYVCYKTRLLKPSDKPRPALFTMNRVETNLTWILLA
LVAITTVGIFFLQNGFLLFKLEKYSQIFSSDVSGVALKRFFYFFIPAMLVVYFLKENTRS
WFLFLISTVAFGVLTYVVVGGTRANILIAFSLFLFIGIARGHITLWMLVMAGVAGVVGMF
WLALKRYGMNVSGAEAFYTFLYLTRDTFSPWENLALLLQNYDKIEFQGLAPIVRDFYVFI
PSWLWPDRPNLVVNTANYFTWEVLDYHAGLAISPTLIGSLVVMGGVWFIPLGAVLVGLII
KWFDWVYEKGRTETNRYKGAIMQAFCFGAVFNIIVLAREGLDSFVSRVVFFALIFGLCLI
IAKLLYWVFDTCGMIRQRVRCSLSSGQVKIDNAKAG
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacctgcacagtttggtggtttgtttgttgtttacctgatatcactgatatttatt
ctgactttaacttataaagagtttagaacggtacgctttaactttaacatattattttca
ctgctttatttattgaccttctattttggcttcccgctgacgtgtgtgctggtttttcag
tttgatgtacaagtggttgcagtggattccttacttaatgcgttactttcagcaacctgt
ttttatgctatttattatgtttgctataaaacccgattattaaagccgagtgataagcct
cgtcctgcgctatttaccatgaatcgtgttgaaaccaatctaacttggatactgttagcg
ttggtagcgataactaccgttggaatattcttcctgcaaaatggttttttactgtttaag
ttagaaaaatatagccagattttctccagtgatgtttctggtgtagcactaaaacgtttt
ttctatttctttattcctgccatgctggttgtctatttcctcaaggaaaatacccgtagc
tggtttttgtttttaattagtaccgtcgcctttggcgttttgacctatgttgttgtcggt
gggacgcgggcaaatatcctaattgctttctctctattcctgtttatcggcattgctcgc
gggcacatcacattgtggatgctggtaatggcgggtgttgctggtgttgttggcatgttc
tggttggcgttaaaacgttatggcatgaacgtatctggtgcggaagcattttataccttc
ttgtatctcactcgagatacgttctccccgtgggagaatttggcattacttttgcaaaat
tacgacaagatagagtttcagggcttggctcccattgttcgtgatttctatgtgtttatt
cccagctggctatggcccgatcgacctaatttagtcgtgaatacggcaaattattttacc
tgggaagtattggactatcacgctggcctggcgatatcaccaaccttgataggctctctg
gtggtgatggggggcgtttggtttatccctctaggggcggtgttggtaggtttaattatt
aaatggtttgactgggtatatgagaagggtcggactgaaactaaccgctataaaggtgcc
attatgcaggcattttgctttggtgcggtttttaacattattgtattagcccgggaaggt
ttagattctttcgtttcccgagttgttttctttgcactgatatttgggctatgtctgata
attgctaagctgctgtattgggtgtttgacacctgcggcatgatacgccagcgagtccgt
tgttctctgtcttctggtcaggtaaaaattgataatgcgaaagcaggttag
DBGET
integrated database retrieval system
