Limnobaculum parvum: HYN51_10805
Help
Entry
HYN51_10805 CDS
T05491
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
lpv
Limnobaculum parvum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Pam3_gp18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWH89004
UniProt:
A0A2Y9U036
LinkDB
All DBs
Position
complement(215418..218714)
Genome browser
AA seq
1098 aa
AA seq
DB search
MLKKINNRRLTALSISILSTMSLPAFANITYNNITLNEPLYWTPLRDNDSLGINSSSLLH
TGSEGSLTVVGPMTGGSITIDKSSFADNINMKQSYSNINFSMTDSTIDSLEFLELVTGST
INLTNVESNGNDSAIRLGNINNSNNTINIKNFNKAFLIDLEGSNSKINIEDTKILSGLSL
FGENNTLNFKNSEILFNISLNGNNNTYNFDNLISSDRIPKTLIVLGGNSLENNNNTATLS
NTILNTSNESSFDVLYFNKSGSNNTFNIINSTFHDDNPVTANDSALIVVSGASSAHNNVT
NSTINTGNGYIFLDLTPQGGNAFIASNSTLTGAIMAEADQTSTIGLSSNSIWNLTGEKSV
GNRLHIDDSQVNIGSSTLIANILKTNNSKINLGNAGTLTVNSDTDFVTSQVTMADNSLLN
VNGYITLDNATLTTGAGSKIASNTLNIINGSNLTLNSQSTLTSSGGITLNSGTLNVLSGN
SLNTSDVALAANSNLNLTGATLETSGSTSLNNSAFTATSGSTLNTMALALAENSKLNLTG
SVLNTQGNLNLNNSGLSAQSGSTLNIADLALAENSKLNLTGSVLNTQGNLNLNNSGLSAQ
SGSTLSIADLAMAANSRLSLNASTLSSTGNIALDSSLFTMDSGSHLTTNDVTLTNNATLL
MLRTSDVTAKSIQLNNGNLAIGNGQVTTESLSTGGGEASSQITPQALSVSNARIRINVDG
HLTANSATGTYNTTIASIGSIGQYDGREMITTNGGGAIFDDGDGYDLGIFRYDLVQQGNS
WYLQERKHDLSSSARAVASLSQASLTSWNAETDSVHQRMTVSRRDNDQGSAWGSYLGAHT
STQLSNGEKASQSVNGFSLGVDKRLNTDLGSYLLGVAVSRGISNIDHMINSSYGNSHDVN
MQAYTSYSNPLGFFLDGLVSYSVINSKITTVSLDDEHSDGSLDTHGFGASLKGGYHYVLP
NTAFIEPYVRASMLNIADKSYSLDNGLRVTNNQYKSLQGELGVDIGKTFALGDSMEQTLR
PYVKVAYQQEFKDNNTIDVNNYTISNNIDGSGGKVGTGLEYTIKRNFGAYVTANYGSKTG
DTGTDTHLTGTAGLRYNW
NT seq
3297 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaaaataaataacagacggcttacagctttatcaatatctattttaagtaca
atgagtcttcccgctttcgccaatatcacttataacaacattaccctcaatgaacctctc
tactggacacctttacgcgataatgactccttaggtataaactcatcatcgcttctacat
accggaagtgaaggctcactaacggttgttggcccaatgactggagggagcatcaccatt
gataaatcaagttttgctgacaatattaatatgaagcaaagctattccaatataaacttc
agcatgactgacagcaccatagattcattggaattcctcgagttagtgaccggctcgacg
attaacttaaccaatgttgagtctaatggtaatgatagtgcgattcgtttgggaaatatc
aataatagcaataacaccattaatataaaaaacttcaataaagcatttttgattgattta
gaaggatcaaattctaaaataaacattgaagacacaaaaattctatccggcctttcatta
ttcggagaaaacaacacattaaatttcaaaaacagtgagatactgtttaacatttctctc
aatggcaataataatacctataacttcgataatcttatttcctcagatagaatacccaaa
accctgatagtcctcggtgggaattcattagaaaacaataacaatacagcaaccctatca
aacacgattttgaatacctcaaatgaatccagttttgatgtcctttattttaataaatca
ggtagtaacaatacgttcaatatcatcaacagtacatttcacgatgataatccagttacc
gctaatgattccgcactgatcgttgtctctggggcgagtagcgcacataataatgtgact
aattccaccatcaatactggaaatggttatatcttccttgatttaaccccacaaggagga
aacgcctttattgccagcaatagtacattgaccggtgccattatggccgaagccgatcaa
acctcaacgattggtttgagcagcaatagtatctggaatttaaccggggaaaaatctgtc
ggtaaccgacttcatattgatgacagccaagttaacattggtagttctacactcatcgcc
aatattctcaaaacaaacaatagtaagattaatcttggcaatgcaggcacccttaccgtt
aatagcgatacggatttcgtgacatctcaagttacaatggcagataacagtctattgaat
gttaacgggtatataacgttagataacgccacattgactaccggtgctggcagcaagatc
gcttcgaacacgttaaatatcattaacggaagtaacctaacgctgaacagccaatctaca
ctgacctcttctggaggtattaccttaaacagcggtacattaaacgtactatcgggtaat
tccctcaacacttcggatgtagcattagcggcaaacagtaacctgaaccttaccggcgca
accctggaaaccagcggaagcacttcgctaaataactcagcgttcaccgccacttcaggc
agtacgctaaatactatggcactggcattagcagaaaatagtaagctgaatttaaccggt
tctgtcctgaatactcaagggaaccttaacctaaataacagcggattaagtgcacaatct
ggcagcacactgaatattgccgatttagcattagcagaaaatagtaagctgaatttaacc
ggttctgtcctgaatactcaagggaaccttaacctgaataacagcggattaagtgcacaa
tctggcagcacactgagtattgccgatcttgctatggcagcgaacagtcgtctgagcctt
aatgcttctaccttgagttctacaggaaatatcgcattggatagcagcttattcaccatg
gattccggtagccatctcaccaccaatgatgtgaccttaaccaacaacgctaccctactg
atgttaagaacatcagacgttacggctaaaagtattcagcttaataacggtaatttggct
atcggtaatggtcaggtgaccaccgagtcattgagtaccggaggcggtgaagccagcagc
caaataacgccacaggcactcagtgtcagtaatgccagaatacgtatcaacgtagacggc
catctaaccgctaacagcgcaaccggtacctacaatacgaccattgccagcattggttct
attggtcagtatgatgggcgagaaatgatcaccaccaacggtggcggggccatttttgat
gatggtgatggctatgaccttggtatcttccgttacgatttagtacagcagggcaatagc
tggtatttacaggaaagaaaacatgatctttcctcttcggctcgtgccgtagccagttta
agtcaagcatcgttaaccagttggaatgccgaaactgactcagttcatcagcgcatgacc
gtctcccgacgagataacgaccaaggttccgcttggggaagctatctgggagcgcatacc
agcactcaattgtctaacggggaaaaggccagccaaagcgttaatggtttcagcctcggt
gtcgataaacgccttaatactgatttaggctcttatctactcggtgtggcagtcagccgc
ggtatttccaatattgaccacatgataaacagcagttacggcaacagccatgacgtaaat
atgcaggcttacacctcttacagtaatccgttgggattcttccttgatgggctggtttcc
tactctgtcatcaatagtaaaatcacgaccgtctcactggatgatgaacattccgatggc
agtctggatacgcatggatttggcgcatcgctgaaagggggatatcactacgttctaccg
aataccgcgtttattgagccttatgtccgcgcttcaatgctcaatatcgcagacaaaagc
tactcgctggataacggtcttcgcgtcaccaacaatcagtacaaatcgttacagggtgag
ctaggcgtagacatcggtaaaaccttcgcattaggcgattctatggagcaaaccctacgc
ccctatgtaaaagtcgcttatcagcaagagtttaaggacaacaatactatcgacgtcaac
aactataccatcagcaataatattgatggctctggcggaaaagtcgggacagggttggag
tatacaatcaagcggaacttcggcgcttatgtcaccgctaactatggttctaaaacaggc
gataccggaaccgatacccacttaaccggcaccgctggcctgcgctataactggtag
DBGET
integrated database retrieval system
