Lactobacillus paragasseri: LpgJCM5343_00350
Help
Entry
LpgJCM5343_00350 CDS
T05840
Name
(GenBank) helicase
Organism
lpw
Lactobacillus paragasseri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
Helicase_C
SWI2_SNF2
DEAD
AAA_22
SLFN-g3_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD47682
LinkDB
All DBs
Position
35449..37818
Genome browser
AA seq
789 aa
AA seq
DB search
MKMGNFVEEVNDQIKNNLSNSLILTSSWIKEYEQNWQPIKNNPHLLLRKSKKISPNQMQK
EALANLDALVKEQAKRALVVSATGTGKTYLGAFAVKEYKPKKFLYLVHREQIAKKALESF
YQVIGGKKRDYGLLTGNKHDFDKKYLFGTVQTVSQEQILGQLNPEEFDYILIDEAHRVAA
PTYQKILNHFTPKFLLGMTATPERMDKQNIYEIFDYHLAYEIRLKDALNEQMLTPFHYVG
VEDYTVGNQIITETSKLKDLVAEKRVEYVLKQLNYYGYCGEKAKGLVFCSRQEEARELAK
LFSQAGHPSRALTNEDSQKRRAEVTQQLENGELEYIFTVDLFNEGIDIPSLNQIVMLRNT
QSSIIFIQQLGRGLRKFPGKDYVTVIDFLGNYKNNYLIPIALNGDKSRDKDQAIRESKLP
QVIDVSTITFTEIASQRILASLEKIKLDSMHELRQSYEDLKEKIGKVPLLCDFYQYGTTA
PTVFAKNHALAHYGAFLKKMGEEVNLDDYQNAVLSFVTKELLFGKRPHELLLLESCLNKN
ISKADFIKLLKNKNCYVSKDVLESVEKILSLEFFDVKQGKATKKEQYGIYPLIKKENGEY
HLSNQLFQALNDNQQFKILFKDVLKTGLELSKEYDSQSQFTLYKQYDRKDVCRLLNWPKD
VSAPMYGYRVGEKETPIFITYQKDSKKKRNARYQNTLENGHSLRWYTRTPRHLDSDEVQR
LLYTDEMKLHLFVKRSDAAGKEFYYLGTADIQKDSVKEEKIGLKQKSAVGMNLVLNHPLK
QSIYNLLFS
NT seq
2370 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatgggcaattttgtcgaagaagttaacgatcaaattaaaaataatttaagtaat
agcttgatacttactagttcttggattaaggaatacgagcaaaattggcaaccgatcaaa
aataatccgcatcttctattaagaaaatccaagaaaatatcacctaatcaaatgcaaaaa
gaagctttagcgaatttagatgctttagtaaaagaacaagcaaaacgtgcccttgttgtt
tcagcgacaggaaccgggaaaacatatttgggtgcttttgcagttaaagaatataagcca
aaaaagtttctttatttagttcaccgagaacaaatagccaaaaaggctttagagagtttt
tatcaagtaattggtggcaagaaaagagactatggcttattaactggaaataaacatgat
tttgataaaaaatatctttttggaacggttcaaactgtaagtcaggaacaaatactcgga
caattaaatccagaagaatttgactatattttaattgatgaagctcatcgagtggcagca
ccaacttatcagaagattttgaatcattttacaccgaaatttttattgggaatgacggca
acacccgaacgaatggataagcaaaatatttatgaaatatttgattatcacttagcttat
gaaattaggctgaaagatgccttaaatgagcagatgctcacgccttttcattatgtgggc
gtcgaagattatacagtgggaaaccagattattactgaaactagtaaattaaaagactta
gttgctgaaaaacgagtagagtatgtacttaaacagcttaattactacggctattgcgga
gaaaaggcaaagggcttagtattttgcagtcggcaagaagaagcaagagagctggcaaaa
ttatttagtcaagctggtcatccgtctcgtgcgcttactaatgaggatagtcaaaaaagg
cgtgctgaagtaacgcagcagttagaaaatggtgaattagagtatatttttaccgttgat
ctatttaatgaaggaatcgatattccgtcgctcaatcaaattgttatgttacgaaatact
caatcaagtattatttttattcagcaattaggtcgaggcctgcgtaaatttccgggaaaa
gattatgtcacagttattgatttcctgggaaattataaaaataattatctaattccaatt
gctttaaatggtgataaaagtcgtgacaaagatcaagcaattagagaaagtaaattacca
caggtaattgatgtttcaacaattacctttaccgagattgcttctcagagaattttagct
tcgcttgaaaagataaaactagacagtatgcatgaactaaggcagtcgtatgaagatttg
aaagaaaagattggtaaagtgccactcttatgcgatttttatcaatatggtacgactgcg
ccaacagtttttgctaaaaatcatgctctagcacattatggtgcttttttaaagaagatg
ggagaagaggtaaatttggatgattatcagaatgcagttctatcttttgtaaccaaggag
ttgctattcggaaagagaccgcatgagttgctactcttagaaagctgcttaaataaaaac
atcagtaaagctgattttattaaattacttaagaacaaaaattgttatgtcagtaaagat
gtacttgagtcggttgagaaaattctgtcgcttgaattttttgatgttaagcagggaaaa
gctaccaagaaagagcaatatggaatttatcctttaattaaaaaagaaaatggagaatat
catttatccaatcaattatttcaggcattaaatgataatcagcaatttaaaatactattt
aaagatgtgctaaagacaggtttagaactgtcaaaagaatatgattcacagtctcaattt
actctgtataagcaatatgatcgtaaagatgtctgccgtttattaaattggcctaaggat
gtttcggctccaatgtatgggtatcgtgtgggagaaaaagagacaccaatttttatcact
tatcaaaaagactctaagaaaaagcgtaatgctcgctatcaaaatactttagaaaatggt
catagtttacgttggtatacccgcacaccgcgtcatttagattcagatgaagtgcagcgc
ttgttatatactgatgagatgaaattacacctatttgtgaagcgaagtgatgcagcagga
aaagaattttattatttaggaacagcagatatccaaaaagactcagtcaaagaagaaaaa
attggacttaagcaaaagagtgcagttggtatgaacttagttctcaatcatcctttaaag
caatcaatttacaatttgctttttagttag
DBGET
integrated database retrieval system