Lactobacillus paragasseri: LpgJCM5343_07890
Help
Entry
LpgJCM5343_07890 CDS
T05840
Symbol
lysR
Name
(GenBank) LysR family transcriptional regulator
Organism
lpw
Lactobacillus paragasseri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysR_substrate
HTH_1
HTH_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD48436
LinkDB
All DBs
Position
816376..817224
Genome browser
AA seq
282 aa
AA seq
DB search
MNLKQLKYFLVVAEERQITSAAKKLFIAQPPLSYQLKQLEKEIGAQLFIRNAHGMELTEE
GKAFQKYAEKIVDLSLTATSQIRQIKTGELGKIRIGVISSCGGVVPNKQFKKLIEYYPNV
SFEIHEANTFGIIEQLQDGIIDLGIVRTPFNLEGLNFKDFHQEPMVAVTNNNDFDRGKIE
HLSQLKGKPIILYRRFQEIFNRSFRHQGIRPFYAVTCDDARTAIHWADEGLGIALVPQSI
AQTYAKSSIVSIKHAHWVTHLNIVWRKDRQVTPLMEKIIEMF
NT seq
849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatctaaaacaattaaaatattttttagtggtagctgaagaaagacagattacatcg
gctgctaaaaaattatttattgctcaaccaccattgagttatcaattgaaacaattagaa
aaagaaattggggcacaactttttattagaaatgctcatgggatggaattaactgaagag
gggaaggcttttcaaaagtatgctgaaaaaattgttgaccttagcttaactgcgacaagt
cagataaggcaaattaaaacaggtgaattaggtaaaattcgaattggagttatttcttct
tgcggaggagttgttccgaataagcaatttaagaaattaattgaatattaccccaatgta
tcttttgaaatacatgaagcaaatacctttggaattattgaacaattgcaagatggaatt
attgatttaggaattgtaagaactccgtttaaccttgaaggattgaattttaaagatttt
catcaagagccgatggttgcagttacaaataataatgactttgatagaggaaagattgaa
catttaagtcaattaaaaggtaagccaattattttatatcgtcgttttcaggaaatattc
aatcggagttttcgtcatcaagggattcgacctttctatgcagtaacttgcgatgatgcc
cgaacggcaattcactgggctgatgaaggcttaggaattgctttagttccccaatcaata
gcgcagacatacgcaaaaagtagtattgtttcaattaaacatgcgcactgggttactcat
ttaaatattgtatggcgtaaggatagacaagttacaccgttaatggaaaaaattattgaa
atgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
