Lactobacillus paragasseri: LpgJCM5343_15790
Help
Entry
LpgJCM5343_15790 CDS
T05840
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lpw
Lactobacillus paragasseri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
MucBP_2
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Amelogenin
RHH_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD49226
LinkDB
All DBs
Position
1650955..1656051
Genome browser
AA seq
1698 aa
AA seq
DB search
MSHKNDLSFIAKLNGKEKFSLRKLSVGLVTVALGTTFFLESSNTAHAAEVNTTSQNVTSQ
ESTSDSLKSRTLNIQKTKASEDSTTSTKTVQNNEQTSVNQTSKNSEATFRQETNLFATKS
EKANTTQASAQAINFEEKIQTTTDQNQSTAVSITGDDANKSMMANVTQGTIRVHINQNKE
NHITINNGQKITVSIAATNNLLRFSTPPSKINDFEISTSQTNTNKIFTFTYTGSDDGILS
NFNPTFYFTADNDATKQYKDIHGTYPDFNLPVTVTLFNNQKFTQNLPIKITPYKDLVVTK
EILHGFVMGPKLIGTPGQDGYPGNNGSYTENGATYYGPEPSAAADVPADKQKSARLMQYA
LEWNYGSAKDPSLNPLMNVLANIKFNNGQEILPSTIKAFKIPADMEVVDSEGQRVPINKY
YGNLATLPEDTNFEKFLRDSISSDKKQITIDQKGNFTVNGVDYSTMGPYFIQLDTLLNPN
AIDNWASNPDSGVGPSITTPIVNENDWKHSGSGSTTNTSTQTYTDFKFDPAVDRVVRIYF
IDENTDKEIPDTVRSIIAKTNSTVDNPTSNIINDLKKQGYVLDKQATNGETSDFSKNLKN
YNISNQNFKTDSLENNYNSQKINIKDKSLKYYVYLYHGTTPVSDKKTIKETINYVYANGT
QEGKTAANPYDKTVSYTRTGTNDLVTDHITWEKWQPDSSFNAVESPNANDKNYTLVDKDE
IPVIKLNIDNDGKITIENNVPLIYTVHYYAPEHARLTFYDDTENQNLSDYLTKNGQKASL
TDTYSELDNNSSKQPISFTDADNIVNFLKNNHYIFTGVSGNGSITNSDYSKIAYGNFDND
ETKDQEFILHFKHALDNQNETAVVAEKVNYVYENGPHAGKTVVDAATSPIDQKITYTRTR
TVDLVNDPKGENTKWSNWTPDKAFIENFNLPEKVSGLDNQEKIYSLDLAQVKATKDGKVF
DYSSLKLPFETSELSNDKTINLKVTIPYTLAENITVNYIDDTTGKTLESKSLSGKPNTEA
NYSTKDTIDKYVAQNYVLVNDPTNQAPLSFDNDELPNNQNYEVHFKHGIGPVSNKKTVTE
TIHYIYKDGSPAAKDATNQLTFTETGTKDLVTGTTDTKWTAPQTFASVTSPTISGYTPDQ
LKIDAIKVDHNSQNIEKTVIYNADKQGAVLRFYDDTEGKFIDFAKDLKTDGTSKSTISFT
IPSNYDFSNYNFVAVNVGNDPKNITTKLSGDTLSDVTYGKFDTNDQVDQYFIAHFTHKTN
DVKENKSISEKVVLYAENGPKKGQALQTIELGNTGFTRNGQKDLVTNQVSWETWTIENNS
HAVSLPVTFSTVYKIDPTNITQTTPVSKKFEINNQIVSPLTFNATTDQDLIKSLANSTEF
MVKVPYELTENVNVTYIDDTTGKTLETKSLSGAPNTNSQYSTKDTIDKYVANNYVLISDP
TDQKNIFYDNDEKPNNQNYDVHFKHAFKEINNSKTVNETITYIYDNGKEAAPTYNTSVEF
TQAGKLDLVTNKEELNDWSPVSNTFIAVTSPVIKNYTADQKQIAAQAVQPNSSDLSFQVV
YTAVPVQPTKPTEPTKPVQPTKPTVPTKPVQPTKPTIPTKPVQPAKPTIPTKPVQPAKPA
KSTQTQLVRKNNETKSPISSHLALPTNAASHETKKTEENNLPQTGAKPNDASLIGLAFGA
TSFLLGLVGSELKRKRKN
NT seq
5097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacataagaatgatttatcttttattgctaagcttaatgggaaagaaaagtttagc
cttagaaaactttcagttggattagttactgttgcattaggtacaacattctttttagaa
agttctaataccgcgcatgctgctgaagtaaacactacaagtcaaaatgttactagccaa
gaaagtacttccgattctctcaaatcgcgcactttaaatattcaaaaaactaaagcttca
gaagattccacaactagcactaaaactgttcaaaataatgaacaaacttctgtaaatcaa
actagtaaaaatagtgaagctacttttaggcaagaaactaacttattcgctactaagtca
gaaaaagcaaacactacacaagcatcagctcaagcaattaattttgaagaaaaaattcaa
actaccactgatcagaatcaatctacagctgtaagtattacaggtgatgacgctaataag
tcaatgatggctaatgttactcaaggaacaattagagttcatattaatcaaaataaagag
aaccacattactattaataatggacaaaaaatcacagtttcaatcgctgccactaataac
ttgttacgctttagtactcctccttctaagattaacgactttgagataagcacatcacaa
acaaataccaataaaatctttacttttacttatactggtagtgatgatgggattctatca
aattttaatccaaccttttattttacagctgataatgacgcaactaagcaatataaggac
attcacggtacttacccagacttcaatttacctgttaccgtaactttatttaataaccaa
aaatttactcaaaacttaccaatcaagattactccatataaagatctagttgtaaccaaa
gaaattcttcacggttttgttatgggaccaaaattaattggaacccctgggcaagacggt
tatcctggtaataatggttcttataccgaaaatggtgcaacttattatggaccagaacca
agtgccgcggcagatgttcctgctgataaacagaaatctgctcggctaatgcaatacgca
cttgagtggaattatggttctgctaaagatccaagtttaaatccattaatgaatgtttta
gctaacataaaatttaataatgggcaagaaattcttccatctactattaaggctttcaag
attccagcagatatggaagtcgttgattctgagggtcaaagagtaccaattaataagtac
tatggtaaccttgcaactcttcctgaagacaccaactttgaaaaatttttaagagactca
atttctagcgacaaaaaacaaattactattgatcaaaaaggcaattttacagttaacggc
gtagattattctacaatggggccttactttattcagttagataccctattaaaccctaac
gctattgacaattgggcaagtaatccagattccggtgtggggccttcaattactactcca
attgttaatgaaaatgattggaaacactccggttcaggaagtacaactaatacctctact
caaacttataccgacttcaaatttgatcctgcagttgatcgtgttgttagaatctacttc
attgacgaaaacaccgataaagaaattccagataccgtaagatcaattattgctaaaact
aattctactgttgataacccaactagcaatattatcaatgatcttaagaaacaaggctac
gtgttagataaacaagcaactaacggtgaaacaagtgatttcagcaagaatctgaaaaat
tacaatataagtaatcaaaactttaagacagattctttagaaaataactacaacagtcaa
aagattaatatcaaagataaatcacttaagtattacgtttacctttaccatggtactaca
ccagttagcgacaaaaagacaataaaagaaacaattaattacgtttatgctaacggtact
caagaaggaaaaacggccgcaaatccttatgataagactgtaagttatactcgcactgga
actaacgatttagttaccgaccacattacgtgggaaaagtggcaacctgattccagtttc
aatgctgtagaatcacctaatgcaaatgataagaattataccttagttgataaagatgaa
atcccagtcattaagttaaatatcgacaatgacggtaagattactattgaaaataatgtt
ccattaatttacacagttcattactatgccccagaacatgcacgccttactttctacgat
gatactgaaaatcaaaacttatctgattatttaaccaaaaatggacagaaggcctcatta
actgatacttattctgaattagacaataattcaagcaagcagcctatctcatttactgat
gcagataatatcgttaactttttaaagaacaatcactacatctttaccggtgtttctggt
aatggttctatcacaaattctgattattcaaagatcgcttatggaaacttcgataatgat
gaaactaaggatcaagagtttattcttcattttaagcatgcattagataatcagaatgaa
actgctgtagttgcagaaaaagttaactatgtctatgaaaatggtccccacgcaggtaag
acagtggttgatgctgcaacttctccaattgaccaaaaaattacttacacaagaactaga
actgtagaccttgtcaatgatcctaaaggtgaaaatactaaatggtctaactggacacct
gataaagcattcattgaaaactttaatttaccagaaaaagttagtggtcttgataaccaa
gaaaaaatttattcattagatttagctcaagttaaagctacaaaagatggtaaagtgttc
gactactcttcacttaaactgccatttgaaacatcagaattgagtaatgataagactatt
aatctaaaagtcactattccatatactttagctgaaaatattacagttaactatattgat
gacacgactggaaaaactttagagagtaagtcattatcaggtaagcctaatacagaagcc
aattattcaactaaggatactattgataaatatgtcgctcaaaactatgttctagttaac
gacccaaccaatcaagcccctctttcatttgacaacgacgaacttcctaataatcaaaat
tatgaagttcatttcaaacatggaatcggtcctgtttctaacaagaagacagttaccgaa
actattcactatatttataaagatggttccccagctgctaaagatgctactaaccaactc
actttcactgaaactggtacaaaagatttagttactggcacaactgatacaaaatggact
gctccacaaactttcgcttcagtcacttctccaacaatttctggctatactccagatcaa
cttaaaattgatgctattaaagttgaccataactctcaaaatattgagaagacagtcatc
tacaatgctgataagcaaggtgctgttcttcgcttctatgatgatactgaaggaaaattc
attgactttgctaaagaccttaagacagatggaacaagcaaatctactatttcatttact
attccatccaattacgatttttcaaactataactttgttgcagtaaacgtaggtaatgat
cctaaaaatataactactaagttgtcaggcgatacgttgtctgatgtaacttacggcaag
tttgatactaatgatcaagtcgaccagtacttcatcgctcactttactcataagacaaat
gacgttaaagaaaataagtctatttctgaaaaagttgtcctttatgccgaaaatggtcct
aagaaaggtcaagctctccaaactattgaattaggtaataccggtttcactagaaatgga
caaaaagacttggttacaaatcaagtttcttgggaaacatggacaatagaaaataatagt
cacgctgtttctctaccagtgacattttcaactgtttataagattgatcctactaatatt
actcaaactacacctgtttccaagaagtttgaaattaataatcaaatagtatctccacta
accttcaatgctacgacggatcaagatttgattaaatctttagcaaacagtacagaattt
atggttaaagttccgtatgaattaactgaaaatgttaatgtaacttatattgatgatact
actggtaaaacattagaaactaagagcttatctggtgcgcctaatacaaattcacaatat
tctactaaagatacaattgataaatacgtagctaataattacgttttaatcagtgatcca
actgatcaaaaaaacattttctatgataatgatgaaaagcctaacaatcaaaattatgat
gttcactttaaacacgcctttaaagagatcaataattctaagactgttaacgaaactatc
acctatatttatgataacggcaaagaagctgcaccaacttataatacttctgtagaattt
actcaagctggaaagctcgatttggtaaccaacaaggaagaattgaatgattggtctcca
gtttctaatacctttatcgcagttacctcaccagtcattaagaactatactgccgatcaa
aaacaaattgctgcacaagcagttcaaccaaatagtagtgacctttcgttccaagttgtt
tacactgctgttccagttcaacctaccaaaccaaccgagcctactaagccggttcaacct
acaaagccaactgtacctactaagccggttcaacctactaaaccaactatacctactaaa
ccggttcaacctgctaaaccaactatacctactaaaccggttcaacctgctaaaccagct
aaatcaacacaaacccaattagtaagaaagaacaacgaaacaaaatcacctatttcttct
catttagctttaccaacaaacgctgctagtcacgaaactaagaaaactgaagaaaacaac
ttacctcaaactggcgctaagccaaatgatgctagcctaatcggtttagcctttggcgct
acttcattcttacttggtctagttggcagtgaacttaaacgaaagagaaagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
